MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Syntrophus aciditrophicus SB chromosome

Total Repeats: 37908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007759	GAA	2	6	188	193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85857846
2	NC_007759	CTG	2	6	674	679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85857846
3	NC_007759	GAA	2	6	857	862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85857846
4	NC_007759	TCG	2	6	906	911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85857846
5	NC_007759	GCC	2	6	954	959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	85857846
6	NC_007759	GCC	2	6	1000	1005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	85857846
7	NC_007759	GCC	2	6	1145	1150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	85857846
8	NC_007759	GAA	2	6	1167	1172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85857846
9	NC_007759	CAT	2	6	1210	1215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	85857846
10	NC_007759	CGA	2	6	1231	1236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85857846
11	NC_007759	GAA	2	6	1247	1252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85857846
12	NC_007759	CAA	2	6	1438	1443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	85857846
13	NC_007759	CTC	2	6	1511	1516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	85857846
14	NC_007759	CTG	2	6	1795	1800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85857847
15	NC_007759	ATC	2	6	1879	1884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	85857847
16	NC_007759	AGC	2	6	1885	1890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85857847
17	NC_007759	GAT	2	6	1969	1974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85857847
18	NC_007759	TGA	2	6	2034	2039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85857847
19	NC_007759	ATG	2	6	2057	2062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85857847
20	NC_007759	ATG	2	6	2138	2143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85857847
21	NC_007759	ATT	2	6	2293	2298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	85857847
22	NC_007759	TGA	2	6	2427	2432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85857847
23	NC_007759	TCT	2	6	2499	2504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	85857847
24	NC_007759	CGG	2	6	2518	2523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	85857847
25	NC_007759	GCG	2	6	2552	2557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	85857847
26	NC_007759	AAT	2	6	2572	2577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	85857847
27	NC_007759	CGA	2	6	2597	2602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85857847
28	NC_007759	ACG	2	6	2624	2629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85857847
29	NC_007759	GAG	2	6	2653	2658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	85857847
30	NC_007759	GAA	3	9	2713	2721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85857847
31	NC_007759	ATT	2	6	2937	2942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	85857848
32	NC_007759	CAC	2	6	3032	3037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	85857848
33	NC_007759	GTG	2	6	3050	3055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	85857848
34	NC_007759	CAT	2	6	3127	3132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	85857848
35	NC_007759	GCC	2	6	3188	3193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	85857848
36	NC_007759	TGA	2	6	3201	3206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85857848
37	NC_007759	CGT	2	6	3283	3288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85857848
38	NC_007759	CTC	2	6	3375	3380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	85857848
39	NC_007759	CGA	2	6	3433	3438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85857848
40	NC_007759	AGG	2	6	3574	3579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	85857848
41	NC_007759	TAT	2	6	3580	3585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	85857848
42	NC_007759	CAA	2	6	3610	3615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	85857848
43	NC_007759	TCT	2	6	3714	3719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	85857848
44	NC_007759	ACC	2	6	3740	3745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	85857848
45	NC_007759	AGG	2	6	3748	3753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	85857848
46	NC_007759	CAA	2	6	3811	3816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	85857848
47	NC_007759	GAA	2	6	3826	3831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85857848
48	NC_007759	CTG	2	6	4028	4033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85857848
49	NC_007759	AGC	2	6	4066	4071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85857848
50	NC_007759	CGG	2	6	4073	4078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	85857848
51	NC_007759	AAG	2	6	4165	4170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85857848
52	NC_007759	TGG	2	6	4182	4187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	85857848
53	NC_007759	GGC	2	6	4202	4207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	85857848
54	NC_007759	AGG	2	6	4356	4361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	85857848
55	NC_007759	ATG	2	6	4365	4370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85857848
56	NC_007759	ATT	2	6	4397	4402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	85857848
57	NC_007759	CTG	2	6	4445	4450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85857848
58	NC_007759	GCC	2	6	4510	4515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	85857848
59	NC_007759	GAA	2	6	4565	4570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85857848
60	NC_007759	TCC	2	6	4584	4589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	85857848
61	NC_007759	GCT	2	6	4651	4656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85857848
62	NC_007759	AAG	2	6	4667	4672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85857848
63	NC_007759	GAT	2	6	4778	4783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85857848
64	NC_007759	CGG	2	6	4873	4878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	85857848
65	NC_007759	TTC	2	6	4892	4897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	85857848
66	NC_007759	AAT	2	6	4904	4909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	85857848
67	NC_007759	CCT	2	6	5197	5202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	85857848
68	NC_007759	GAT	2	6	5216	5221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85857848
69	NC_007759	CAC	2	6	5245	5250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	85857848
70	NC_007759	AGA	2	6	5388	5393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85857849
71	NC_007759	TTA	2	6	5432	5437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	85857849
72	NC_007759	CCG	2	6	5484	5489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	85857849
73	NC_007759	TCG	2	6	5555	5560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85857849
74	NC_007759	GAC	2	6	5686	5691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85857849
75	NC_007759	TCC	2	6	5694	5699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	85857849
76	NC_007759	GGC	2	6	5700	5705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	85857849
77	NC_007759	GGA	2	6	5742	5747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	85857849
78	NC_007759	ACG	2	6	5795	5800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85857849
79	NC_007759	TTC	2	6	5822	5827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	85857849
80	NC_007759	CTG	2	6	5848	5853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85857849
81	NC_007759	CGA	2	6	5885	5890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85857849
82	NC_007759	ACC	2	6	5895	5900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	85857849
83	NC_007759	GAA	2	6	5965	5970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85857849
84	NC_007759	TTA	2	6	6014	6019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	85857849
85	NC_007759	CAT	2	6	6063	6068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	85857849
86	NC_007759	GTC	2	6	6085	6090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85857849
87	NC_007759	GTA	2	6	6127	6132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85857849
88	NC_007759	CAA	2	6	6153	6158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	85857849
89	NC_007759	GGC	2	6	6159	6164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	85857849
90	NC_007759	CGA	2	6	6276	6281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85857849
91	NC_007759	GTC	2	6	6427	6432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85857849
92	NC_007759	CAA	2	6	6459	6464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	85857849
93	NC_007759	TCA	2	6	6497	6502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	85857849
94	NC_007759	ACA	2	6	6512	6517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	85857849
95	NC_007759	TCA	2	6	6536	6541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	85857849
96	NC_007759	AGG	2	6	6560	6565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	85857849
97	NC_007759	GAA	2	6	6673	6678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85857849
98	NC_007759	GGA	2	6	6765	6770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	85857849
99	NC_007759	ATC	2	6	6772	6777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	85857849
100	NC_007759	GAA	2	6	6856	6861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85857849
101	NC_007759	TGG	2	6	6863	6868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	85857849
102	NC_007759	GAT	2	6	6954	6959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85857849
103	NC_007759	GTG	2	6	6976	6981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	85857849
104	NC_007759	GGA	2	6	7079	7084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	85857849
105	NC_007759	GGC	2	6	7140	7145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	85857849
106	NC_007759	TTC	2	6	7148	7153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	85857849
107	NC_007759	CCA	2	6	7193	7198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	85857849
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109	NC_007759	CGA	2	6	7275	7280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85857849
110	NC_007759	GCG	2	6	7313	7318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	85857849
111	NC_007759	AGG	2	6	7367	7372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	85857849
112	NC_007759	CGG	2	6	7514	7519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	85857849
113	NC_007759	GGA	2	6	7585	7590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	85857849
114	NC_007759	ATC	2	6	7657	7662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	85857849
115	NC_007759	TGG	2	6	7745	7750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	85857849
116	NC_007759	GAA	2	6	7780	7785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85857849
117	NC_007759	ATA	2	6	7790	7795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	85857849
118	NC_007759	TCT	2	6	7868	7873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	85857850
119	NC_007759	CGG	2	6	7882	7887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	85857850
120	NC_007759	TGG	2	6	7963	7968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	85857850
121	NC_007759	GCC	2	6	7996	8001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	85857850
122	NC_007759	TGA	2	6	8179	8184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85857850
123	NC_007759	ACC	2	6	8206	8211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	85857850
124	NC_007759	GTC	2	6	8220	8225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85857850
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126	NC_007759	CAT	2	6	8346	8351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	85857851
127	NC_007759	GAG	2	6	8362	8367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	85857851
128	NC_007759	TGC	2	6	8369	8374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85857851
129	NC_007759	GAT	2	6	8386	8391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85857851
130	NC_007759	CAG	2	6	8401	8406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85857851
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132	NC_007759	GGC	2	6	8499	8504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	85857851
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