MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Erythrobacter litoralis HTCC2594 chromosome

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007722	GAAGGT	2	12	100	111	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007722	GAAGGT	2	12	604	615	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007722	GAAGGT	2	12	856	867	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007722	GAAGGT	2	12	1108	1119	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007722	GAAGGT	2	12	1360	1371	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007722	GAAGGT	2	12	1612	1623	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007722	GAAGGT	2	12	2116	2127	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007722	GACCGT	2	12	2530	2541	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007722	GCGGAA	2	12	74950	74961	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_007722	TGATAT	2	12	168550	168561	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007722	CGCAAG	2	12	175148	175159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_007722	CTGTCG	2	12	192550	192561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007722	TTCTGC	2	12	221701	221712	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007722	TGGGGG	2	12	268624	268635	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007722	GGCGAT	2	12	532373	532384	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_007722	CGGGCA	2	12	609294	609305	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007722	CAAGCG	2	12	614132	614143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007722	CACCGC	2	12	626774	626785	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_007722	ATCGCG	2	12	631313	631324	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007722	TGGGGA	2	12	633950	633961	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007722	GAGCGA	2	12	693510	693521	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_007722	GGTCCC	2	12	737486	737497	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
23	NC_007722	CAACGG	2	12	776751	776762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007722	CAGGTC	2	12	835174	835185	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007722	TCCTGC	2	12	865549	865560	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_007722	GATGGC	2	12	865875	865886	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_007722	GTGCCT	2	12	929228	929239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007722	CGGACC	2	12	942030	942041	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_007722	TGAACC	2	12	942044	942055	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007722	GGCGAA	2	12	959881	959892	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_007722	AACCTA	2	12	997279	997290	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007722	CTTTTC	2	12	1037135	1037146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007722	GGCGCT	2	12	1075805	1075816	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007722	AGAGCC	2	12	1227171	1227182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007722	CAGGCC	2	12	1404694	1404705	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_007722	GCCCTC	2	12	1426996	1427007	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_007722	TGGAAG	2	12	1464664	1464675	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007722	GGCCGG	2	12	1506711	1506722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007722	GAGATG	2	12	1579003	1579014	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007722	AAAGCA	2	12	1638652	1638663	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_007722	CGCAAG	2	12	1640540	1640551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007722	TCGCTT	2	12	1675825	1675836	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_007722	CTCATT	2	12	1702224	1702235	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007722	CGCTGC	2	12	1702312	1702323	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45	NC_007722	CTTGCG	2	12	1722926	1722937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007722	GCGATT	2	12	1807632	1807643	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_007722	CTGCGG	2	12	1952021	1952032	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_007722	CCCCTA	2	12	1982714	1982725	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_007722	TCTGCT	2	12	2027632	2027643	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007722	GCCCAG	2	12	2038554	2038565	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
51	NC_007722	AGTCCA	2	12	2109495	2109506	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007722	CTGCGC	2	12	2115199	2115210	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_007722	CGGCGC	2	12	2141545	2141556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_007722	CGTGCT	2	12	2220402	2220413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_007722	TCTTAT	2	12	2258424	2258435	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_007722	GGGCGC	2	12	2335629	2335640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007722	ACGGGG	2	12	2336756	2336767	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_007722	GAGGGT	2	12	2344352	2344363	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007722	GCACCT	2	12	2346513	2346524	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
60	NC_007722	TCCCCC	2	12	2403959	2403970	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
61	NC_007722	TCGATT	2	12	2403992	2404003	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_007722	CGCTTG	2	12	2524540	2524551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007722	CGCTTG	2	12	2524605	2524616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007722	CGCTTG	2	12	2524670	2524681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007722	CTCCGA	2	12	2549055	2549066	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_007722	GTTTTT	2	12	2600091	2600102	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007722	GCCGGG	2	12	2674185	2674196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007722	TCGGCA	2	12	2685236	2685247	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007722	GGGGGT	2	12	2859784	2859795	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007722	CACAGC	2	12	2865890	2865901	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_007722	CGATTG	2	12	2898842	2898853	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_007722	CGATAT	2	12	2904156	2904167	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_007722	CCCCCG	2	12	2904460	2904471	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
74	NC_007722	CTTGAG	2	12	2950818	2950829	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_007722	ATCGGT	2	12	3005345	3005356	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_007722	GAAATT	2	12	3035155	3035166	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007722	TCTTTC	2	12	3035392	3035403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007722	GAAGGT	2	12	3051742	3051753	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007722	GAAGGT	2	12	3051994	3052005	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007722	GAAGGT	2	12	3052246	3052257	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.