MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAFF 311018 chromosome

Total Repeats: 11429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007705	GATG	2	8	40	47	25 %	25 %	50 %	0 %	84621658
2	NC_007705	CCCG	2	8	85	92	0 %	0 %	25 %	75 %	84621658
3	NC_007705	GTCG	2	8	835	842	0 %	25 %	50 %	25 %	84621658
4	NC_007705	CGAT	2	8	843	850	25 %	25 %	25 %	25 %	84621658
5	NC_007705	GCCG	2	8	1253	1260	0 %	0 %	50 %	50 %	84621658
6	NC_007705	TGCC	2	8	1282	1289	0 %	25 %	25 %	50 %	84621658
7	NC_007705	CCTG	2	8	1724	1731	0 %	25 %	25 %	50 %	84621659
8	NC_007705	GGAC	2	8	1760	1767	25 %	0 %	50 %	25 %	84621659
9	NC_007705	CCCG	2	8	1854	1861	0 %	0 %	25 %	75 %	84621659
10	NC_007705	CTGC	2	8	1974	1981	0 %	25 %	25 %	50 %	84621659
11	NC_007705	CCGT	2	8	1992	1999	0 %	25 %	25 %	50 %	84621659
12	NC_007705	TGCG	2	8	2434	2441	0 %	25 %	50 %	25 %	84621659
13	NC_007705	CGAA	2	8	2467	2474	50 %	0 %	25 %	25 %	84621659
14	NC_007705	GCCT	2	8	4854	4861	0 %	25 %	25 %	50 %	84621660
15	NC_007705	CCCG	2	8	5018	5025	0 %	0 %	25 %	75 %	84621660
16	NC_007705	CGAA	2	8	6342	6349	50 %	0 %	25 %	25 %	84621661
17	NC_007705	GCAG	2	8	7147	7154	25 %	0 %	50 %	25 %	84621661
18	NC_007705	GCCG	2	8	8325	8332	0 %	0 %	50 %	50 %	84621662
19	NC_007705	ACCC	2	8	9450	9457	25 %	0 %	0 %	75 %	84621663
20	NC_007705	GCAA	2	8	9853	9860	50 %	0 %	25 %	25 %	84621664
21	NC_007705	TGGG	2	8	9892	9899	0 %	25 %	75 %	0 %	84621664
22	NC_007705	GTCG	2	8	11711	11718	0 %	25 %	50 %	25 %	84621665
23	NC_007705	CGTT	2	8	12439	12446	0 %	50 %	25 %	25 %	84621666
24	NC_007705	GGTG	2	8	12536	12543	0 %	25 %	75 %	0 %	84621666
25	NC_007705	GAAG	2	8	12906	12913	50 %	0 %	50 %	0 %	84621667
26	NC_007705	GTGC	2	8	14556	14563	0 %	25 %	50 %	25 %	84621669
27	NC_007705	GATC	2	8	14750	14757	25 %	25 %	25 %	25 %	84621670
28	NC_007705	GGTG	2	8	15793	15800	0 %	25 %	75 %	0 %	84621671
29	NC_007705	CATC	2	8	15925	15932	25 %	25 %	0 %	50 %	84621671
30	NC_007705	GTTG	2	8	17203	17210	0 %	50 %	50 %	0 %	84621673
31	NC_007705	GTTG	2	8	17489	17496	0 %	50 %	50 %	0 %	84621673
32	NC_007705	GGCT	2	8	17833	17840	0 %	25 %	50 %	25 %	84621673
33	NC_007705	CGGC	2	8	18070	18077	0 %	0 %	50 %	50 %	84621673
34	NC_007705	CGTG	2	8	18720	18727	0 %	25 %	50 %	25 %	84621674
35	NC_007705	TGGC	2	8	19127	19134	0 %	25 %	50 %	25 %	84621674
36	NC_007705	GCCG	2	8	19168	19175	0 %	0 %	50 %	50 %	84621674
37	NC_007705	CGGC	2	8	19310	19317	0 %	0 %	50 %	50 %	84621674
38	NC_007705	CGGG	2	8	20723	20730	0 %	0 %	75 %	25 %	84621675
39	NC_007705	GATC	2	8	20733	20740	25 %	25 %	25 %	25 %	84621675
40	NC_007705	GCCG	2	8	20798	20805	0 %	0 %	50 %	50 %	84621675
41	NC_007705	GAGC	2	8	20967	20974	25 %	0 %	50 %	25 %	84621675
42	NC_007705	AGCA	2	8	21876	21883	50 %	0 %	25 %	25 %	84621675
43	NC_007705	AGCG	2	8	22207	22214	25 %	0 %	50 %	25 %	84621676
44	NC_007705	GCAG	2	8	22224	22231	25 %	0 %	50 %	25 %	84621676
45	NC_007705	GCGT	2	8	22325	22332	0 %	25 %	50 %	25 %	84621676
46	NC_007705	CGTG	2	8	22658	22665	0 %	25 %	50 %	25 %	84621677
47	NC_007705	CCGG	2	8	22671	22678	0 %	0 %	50 %	50 %	84621677
48	NC_007705	TCGA	2	8	22807	22814	25 %	25 %	25 %	25 %	84621677
49	NC_007705	GTCT	2	8	22933	22940	0 %	50 %	25 %	25 %	84621677
50	NC_007705	CGCC	2	8	24321	24328	0 %	0 %	25 %	75 %	84621679
51	NC_007705	CGCC	2	8	24518	24525	0 %	0 %	25 %	75 %	84621679
52	NC_007705	CAGC	2	8	24679	24686	25 %	0 %	25 %	50 %	84621679
53	NC_007705	CGCC	2	8	24906	24913	0 %	0 %	25 %	75 %	84621679
54	NC_007705	CTGC	2	8	25074	25081	0 %	25 %	25 %	50 %	84621679
55	NC_007705	GCGT	2	8	25093	25100	0 %	25 %	50 %	25 %	84621679
56	NC_007705	CAGC	2	8	25710	25717	25 %	0 %	25 %	50 %	84621680
57	NC_007705	CTTC	2	8	26227	26234	0 %	50 %	0 %	50 %	84621681
58	NC_007705	TTAT	2	8	26361	26368	25 %	75 %	0 %	0 %	84621681
59	NC_007705	GCCC	2	8	26797	26804	0 %	0 %	25 %	75 %	84621681
60	NC_007705	TGCC	2	8	26835	26842	0 %	25 %	25 %	50 %	84621681
61	NC_007705	GCAC	2	8	27393	27400	25 %	0 %	25 %	50 %	84621682
62	NC_007705	GGGC	2	8	27924	27931	0 %	0 %	75 %	25 %	84621683
63	NC_007705	TCGA	2	8	28078	28085	25 %	25 %	25 %	25 %	84621683
64	NC_007705	GGGC	2	8	28128	28135	0 %	0 %	75 %	25 %	84621683
65	NC_007705	GCCG	2	8	28506	28513	0 %	0 %	50 %	50 %	84621683
66	NC_007705	GCCG	2	8	29536	29543	0 %	0 %	50 %	50 %	84621684
67	NC_007705	CGGC	2	8	30042	30049	0 %	0 %	50 %	50 %	84621684
68	NC_007705	GATG	2	8	30099	30106	25 %	25 %	50 %	0 %	84621684
69	NC_007705	CTTG	2	8	30721	30728	0 %	50 %	25 %	25 %	84621685
70	NC_007705	GCCG	2	8	30787	30794	0 %	0 %	50 %	50 %	84621685
71	NC_007705	ACGC	2	8	31831	31838	25 %	0 %	25 %	50 %	84621686
72	NC_007705	GGCT	2	8	32706	32713	0 %	25 %	50 %	25 %	84621687
73	NC_007705	CTGC	2	8	32882	32889	0 %	25 %	25 %	50 %	84621687
74	NC_007705	TGGC	2	8	32987	32994	0 %	25 %	50 %	25 %	84621687
75	NC_007705	TGGA	2	8	33794	33801	25 %	25 %	50 %	0 %	84621687
76	NC_007705	TTCT	2	8	33950	33957	0 %	75 %	0 %	25 %	84621688
77	NC_007705	GATT	2	8	34128	34135	25 %	50 %	25 %	0 %	84621688
78	NC_007705	CATG	2	8	34164	34171	25 %	25 %	25 %	25 %	84621688
79	NC_007705	CCCG	2	8	35431	35438	0 %	0 %	25 %	75 %	84621689
80	NC_007705	GTGC	2	8	35665	35672	0 %	25 %	50 %	25 %	84621689
81	NC_007705	CGAA	2	8	36437	36444	50 %	0 %	25 %	25 %	84621689
82	NC_007705	GTAG	2	8	36516	36523	25 %	25 %	50 %	0 %	84621690
83	NC_007705	CTGG	2	8	36918	36925	0 %	25 %	50 %	25 %	84621690
84	NC_007705	CGGC	2	8	37471	37478	0 %	0 %	50 %	50 %	84621690
85	NC_007705	GCGA	2	8	37560	37567	25 %	0 %	50 %	25 %	84621690
86	NC_007705	GATC	2	8	37640	37647	25 %	25 %	25 %	25 %	84621690
87	NC_007705	TTTG	2	8	38282	38289	0 %	75 %	25 %	0 %	84621692
88	NC_007705	ACGC	2	8	38889	38896	25 %	0 %	25 %	50 %	84621692
89	NC_007705	GTGC	2	8	39120	39127	0 %	25 %	50 %	25 %	84621693
90	NC_007705	GCCG	2	8	39240	39247	0 %	0 %	50 %	50 %	84621693
91	NC_007705	CCTT	2	8	39862	39869	0 %	50 %	0 %	50 %	84621694
92	NC_007705	AGGA	2	8	39905	39912	50 %	0 %	50 %	0 %	84621694
93	NC_007705	GGGC	2	8	42311	42318	0 %	0 %	75 %	25 %	84621697
94	NC_007705	ACGC	2	8	42539	42546	25 %	0 %	25 %	50 %	84621697
95	NC_007705	GCAC	2	8	42734	42741	25 %	0 %	25 %	50 %	84621697
96	NC_007705	ACGC	2	8	42944	42951	25 %	0 %	25 %	50 %	84621697
97	NC_007705	GCCG	2	8	43226	43233	0 %	0 %	50 %	50 %	84621697
98	NC_007705	TGCG	2	8	43327	43334	0 %	25 %	50 %	25 %	84621697
99	NC_007705	TGCT	2	8	44075	44082	0 %	50 %	25 %	25 %	84621698
100	NC_007705	CCCG	2	8	44278	44285	0 %	0 %	25 %	75 %	84621699
101	NC_007705	GGGC	2	8	44788	44795	0 %	0 %	75 %	25 %	84621700
102	NC_007705	GCCG	2	8	46357	46364	0 %	0 %	50 %	50 %	84621701
103	NC_007705	GGCA	2	8	46731	46738	25 %	0 %	50 %	25 %	84621702
104	NC_007705	CCCA	2	8	46995	47002	25 %	0 %	0 %	75 %	84621702
105	NC_007705	GTGC	2	8	47956	47963	0 %	25 %	50 %	25 %	84621704
106	NC_007705	AGCA	2	8	48339	48346	50 %	0 %	25 %	25 %	84621705
107	NC_007705	GTCC	2	8	48400	48407	0 %	25 %	25 %	50 %	84621705
108	NC_007705	GTTG	2	8	48517	48524	0 %	50 %	50 %	0 %	84621705
109	NC_007705	GCCA	2	8	49547	49554	25 %	0 %	25 %	50 %	84621706
110	NC_007705	GCGT	2	8	50208	50215	0 %	25 %	50 %	25 %	84621706
111	NC_007705	ACCG	2	8	50218	50225	25 %	0 %	25 %	50 %	84621706
112	NC_007705	ATGC	2	8	50505	50512	25 %	25 %	25 %	25 %	84621706
113	NC_007705	GAGT	2	8	50521	50528	25 %	25 %	50 %	0 %	84621706
114	NC_007705	GCGT	2	8	51244	51251	0 %	25 %	50 %	25 %	84621708
115	NC_007705	CTGG	2	8	51776	51783	0 %	25 %	50 %	25 %	84621709
116	NC_007705	GCGA	2	8	51811	51818	25 %	0 %	50 %	25 %	84621709
117	NC_007705	GCTG	2	8	51898	51905	0 %	25 %	50 %	25 %	84621710
118	NC_007705	GCCT	2	8	52132	52139	0 %	25 %	25 %	50 %	84621710
119	NC_007705	ACCG	2	8	52291	52298	25 %	0 %	25 %	50 %	84621710
120	NC_007705	TCAG	2	8	52903	52910	25 %	25 %	25 %	25 %	84621711
121	NC_007705	CTGC	2	8	53372	53379	0 %	25 %	25 %	50 %	84621711
122	NC_007705	TTTG	2	8	53716	53723	0 %	75 %	25 %	0 %	84621712
123	NC_007705	ACGC	2	8	54323	54330	25 %	0 %	25 %	50 %	84621712
124	NC_007705	GTGC	2	8	54554	54561	0 %	25 %	50 %	25 %	84621712
125	NC_007705	TCGG	2	8	55322	55329	0 %	25 %	50 %	25 %	84621713
126	NC_007705	AGCC	2	8	55717	55724	25 %	0 %	25 %	50 %	84621713
127	NC_007705	CCGC	2	8	56227	56234	0 %	0 %	25 %	75 %	84621713
128	NC_007705	TGGC	2	8	56483	56490	0 %	25 %	50 %	25 %	84621714
129	NC_007705	CAAG	2	8	56610	56617	50 %	0 %	25 %	25 %	84621714
130	NC_007705	CCTT	2	8	56695	56702	0 %	50 %	0 %	50 %	84621714
131	NC_007705	GGAT	2	8	57102	57109	25 %	25 %	50 %	0 %	84621714
132	NC_007705	GCCG	2	8	58565	58572	0 %	0 %	50 %	50 %	84621716
133	NC_007705	CATC	2	8	58894	58901	25 %	25 %	0 %	50 %	84621716
134	NC_007705	CGGC	2	8	59736	59743	0 %	0 %	50 %	50 %	84621717
135	NC_007705	CGGG	2	8	59870	59877	0 %	0 %	75 %	25 %	84621717
136	NC_007705	CGAG	2	8	60458	60465	25 %	0 %	50 %	25 %	84621717
137	NC_007705	CGAG	2	8	61019	61026	25 %	0 %	50 %	25 %	84621717
138	NC_007705	TCAT	2	8	61372	61379	25 %	50 %	0 %	25 %	84621718
139	NC_007705	TTCG	2	8	62446	62453	0 %	50 %	25 %	25 %	84621719
140	NC_007705	CGAT	2	8	62658	62665	25 %	25 %	25 %	25 %	84621719
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