MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAFF 311018 chromosome

Total Repeats: 79269

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007705	GAT	2	6	26	31	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007705	GCA	2	6	396	401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621658
3	NC_007705	GCC	2	6	416	421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621658
4	NC_007705	TGT	2	6	471	476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	84621658
5	NC_007705	GCA	2	6	480	485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621658
6	NC_007705	CGG	2	6	516	521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621658
7	NC_007705	TTC	2	6	581	586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	84621658
8	NC_007705	GAT	2	6	592	597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	84621658
9	NC_007705	CAG	2	6	644	649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621658
10	NC_007705	CGA	2	6	667	672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621658
11	NC_007705	TTC	2	6	680	685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	84621658
12	NC_007705	TTC	2	6	713	718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	84621658
13	NC_007705	GCC	2	6	744	749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621658
14	NC_007705	ATC	2	6	755	760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84621658
15	NC_007705	CCG	2	6	851	856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621658
16	NC_007705	CGA	2	6	919	924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621658
17	NC_007705	AAG	2	6	944	949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84621658
18	NC_007705	TGG	2	6	993	998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84621658
19	NC_007705	ACT	2	6	1119	1124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84621658
20	NC_007705	TGC	2	6	1275	1280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621658
21	NC_007705	CCA	2	6	1490	1495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_007705	CAC	2	6	1589	1594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_007705	GGA	2	6	1823	1828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	84621659
24	NC_007705	ACC	2	6	1845	1850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	84621659
25	NC_007705	GTG	3	9	2025	2033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84621659
26	NC_007705	CAG	2	6	2085	2090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621659
27	NC_007705	CTA	2	6	2099	2104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84621659
28	NC_007705	CTG	2	6	2115	2120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621659
29	NC_007705	TGC	2	6	2140	2145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621659
30	NC_007705	GGC	2	6	2205	2210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621659
31	NC_007705	ATC	2	6	2223	2228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84621659
32	NC_007705	GCT	2	6	2252	2257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621659
33	NC_007705	AAG	3	9	2542	2550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84621659
34	NC_007705	CGA	2	6	2582	2587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621659
35	NC_007705	CAG	2	6	2702	2707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621659
36	NC_007705	GTT	2	6	2802	2807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007705	CGC	2	6	2971	2976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_007705	CTG	2	6	3090	3095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007705	CGG	2	6	3175	3180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007705	CAG	2	6	3356	3361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007705	CTT	2	6	3490	3495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007705	TTG	2	6	3538	3543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007705	ATC	2	6	3555	3560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007705	GAT	2	6	3729	3734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007705	GTT	3	9	3768	3776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007705	TCG	2	6	4031	4036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621660
47	NC_007705	CAA	2	6	4182	4187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84621660
48	NC_007705	GGC	2	6	4227	4232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621660
49	NC_007705	TGC	2	6	4235	4240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621660
50	NC_007705	GTG	2	6	4350	4355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84621660
51	NC_007705	GCG	2	6	4387	4392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621660
52	NC_007705	GTG	2	6	4393	4398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84621660
53	NC_007705	CCG	2	6	4403	4408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621660
54	NC_007705	AGA	2	6	4874	4879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84621660
55	NC_007705	GAC	2	6	4920	4925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621660
56	NC_007705	CAC	2	6	4947	4952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	84621660
57	NC_007705	TGT	2	6	5195	5200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007705	CGA	2	6	5224	5229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621661
59	NC_007705	TGC	2	6	5283	5288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621661
60	NC_007705	GGT	2	6	5374	5379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84621661
61	NC_007705	CGA	2	6	5392	5397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621661
62	NC_007705	CGA	2	6	5416	5421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621661
63	NC_007705	GAA	2	6	5501	5506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84621661
64	NC_007705	TGC	2	6	5538	5543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621661
65	NC_007705	CGG	2	6	5548	5553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621661
66	NC_007705	CGA	2	6	5560	5565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621661
67	NC_007705	CGG	2	6	5584	5589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621661
68	NC_007705	GGT	2	6	5611	5616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84621661
69	NC_007705	CAG	2	6	5672	5677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621661
70	NC_007705	AGC	2	6	5712	5717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621661
71	NC_007705	CAC	2	6	5740	5745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	84621661
72	NC_007705	CGA	2	6	5863	5868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621661
73	NC_007705	CGA	2	6	5887	5892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621661
74	NC_007705	GGC	2	6	5906	5911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621661
75	NC_007705	CGC	2	6	5949	5954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621661
76	NC_007705	TGG	2	6	6000	6005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84621661
77	NC_007705	CAA	2	6	6058	6063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84621661
78	NC_007705	GGC	2	6	6080	6085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621661
79	NC_007705	GAC	2	6	6185	6190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621661
80	NC_007705	CGG	2	6	6288	6293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621661
81	NC_007705	TCG	2	6	6372	6377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621661
82	NC_007705	CGC	2	6	6425	6430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621661
83	NC_007705	TGC	2	6	6576	6581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621661
84	NC_007705	CGA	2	6	6688	6693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621661
85	NC_007705	ACC	2	6	6717	6722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	84621661
86	NC_007705	CAT	2	6	6724	6729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84621661
87	NC_007705	TGA	2	6	6732	6737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	84621661
88	NC_007705	CTT	2	6	6784	6789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	84621661
89	NC_007705	GCC	2	6	6841	6846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621661
90	NC_007705	GCG	2	6	6938	6943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621661
91	NC_007705	CGA	2	6	6958	6963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621661
92	NC_007705	GCC	2	6	6964	6969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621661
93	NC_007705	CTG	4	12	6995	7006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621661
94	NC_007705	GCC	2	6	7084	7089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621661
95	NC_007705	TGG	2	6	7233	7238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84621661
96	NC_007705	CCG	2	6	7243	7248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621661
97	NC_007705	GAA	2	6	7259	7264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84621661
98	NC_007705	TGC	2	6	7275	7280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621661
99	NC_007705	GCG	2	6	7299	7304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621661
100	NC_007705	CAA	2	6	7378	7383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84621661
101	NC_007705	GCT	2	6	7423	7428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621661
102	NC_007705	AAG	2	6	7439	7444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84621661
103	NC_007705	AGC	2	6	7491	7496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621661
104	NC_007705	ACC	2	6	7505	7510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	84621661
105	NC_007705	GCC	2	6	7562	7567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621661
106	NC_007705	CGC	2	6	7610	7615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621661
107	NC_007705	CCA	2	6	7665	7670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_007705	GAC	2	6	7724	7729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007705	GCC	2	6	7781	7786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621662
110	NC_007705	GCT	2	6	7787	7792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621662
111	NC_007705	CGC	2	6	7829	7834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621662
112	NC_007705	GGC	2	6	7907	7912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621662
113	NC_007705	GCC	2	6	7953	7958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621662
114	NC_007705	TGT	2	6	8026	8031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	84621662
115	NC_007705	ACT	2	6	8032	8037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84621662
116	NC_007705	CGT	2	6	8040	8045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621662
117	NC_007705	CTG	2	6	8053	8058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621662
118	NC_007705	CGC	2	6	8123	8128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621662
119	NC_007705	GAA	2	6	8214	8219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84621662
120	NC_007705	CCA	2	6	8225	8230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	84621662
121	NC_007705	GTG	2	6	8259	8264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84621662
122	NC_007705	GAG	2	6	8280	8285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	84621662
123	NC_007705	CTG	2	6	8286	8291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621662
124	NC_007705	CCG	2	6	8294	8299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621662
125	NC_007705	CTG	2	6	8410	8415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621662
126	NC_007705	GCA	2	6	8443	8448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621662
127	NC_007705	GCG	2	6	8454	8459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621662
128	NC_007705	TGC	2	6	8504	8509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621662
129	NC_007705	GGC	2	6	8537	8542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621662
130	NC_007705	CGG	2	6	8677	8682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007705	CCA	2	6	8806	8811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	84621663
132	NC_007705	GCC	2	6	8827	8832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621663
133	NC_007705	GGT	2	6	8837	8842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84621663
134	NC_007705	CGT	2	6	8954	8959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621663
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137	NC_007705	TCG	2	6	9022	9027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621663
138	NC_007705	CGG	2	6	9056	9061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621663
139	NC_007705	CGC	2	6	9116	9121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621663
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142	NC_007705	CAT	2	6	9209	9214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84621663
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144	NC_007705	CTG	2	6	9300	9305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621663
145	NC_007705	ATG	2	6	9408	9413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	84621663
146	NC_007705	TCG	2	6	9707	9712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_007705	CGG	2	6	9814	9819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_007705	TGT	2	6	9865	9870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	84621664
149	NC_007705	GTC	2	6	9903	9908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621664
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172	NC_007705	ATC	2	6	11013	11018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84621664
173	NC_007705	ATC	2	6	11139	11144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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251	NC_007705	CAG	2	6	15362	15367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621671
252	NC_007705	GCT	2	6	15586	15591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621671
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256	NC_007705	AGC	2	6	15933	15938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621671
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