MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Methanosphaera stadtmanae DSM 3091 chromosome

Total Repeats: 1080

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007681	TTTAAT	2	12	1143	1154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488832
2	NC_007681	CTTTTA	2	12	2709	2720	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	84488834
3	NC_007681	TTATCT	2	12	7714	7725	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	84488838
4	NC_007681	TTTTCT	2	12	8783	8794	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	84488838
5	NC_007681	TGGTAT	2	12	15086	15097	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	84488844
6	NC_007681	AACTTA	2	12	19672	19683	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	84488848
7	NC_007681	ATAAAA	2	12	19978	19989	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	84488848
8	NC_007681	ATAAAA	2	12	20121	20132	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	84488848
9	NC_007681	TTTTAA	2	12	22079	22090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488849
10	NC_007681	TTTAAA	2	12	22812	22823	50 %	50 %	0 %	0 %	84488850
11	NC_007681	TATGCA	2	12	27034	27045	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	84488854
12	NC_007681	ACAATC	2	12	28674	28685	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	84488856
13	NC_007681	AAGAAC	2	12	32816	32827	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	84488860
14	NC_007681	AACAAG	2	12	33693	33704	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	84488861
15	NC_007681	GAAAGA	2	12	34249	34260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84488861
16	NC_007681	AAAACA	2	12	36455	36466	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	84488863
17	NC_007681	TGATTT	2	12	36568	36579	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	84488864
18	NC_007681	CAGGAA	3	18	38436	38453	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	84488866
19	NC_007681	ATTATG	2	12	38820	38831	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	84488866
20	NC_007681	GTACAC	2	12	40542	40553	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	84488867
21	NC_007681	TCCATG	2	12	41035	41046	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	84488867
22	NC_007681	TCTTTT	2	12	43513	43524	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	84488870
23	NC_007681	ATATTA	2	12	45718	45729	50 %	50 %	0 %	0 %	84488873
24	NC_007681	AGCAAA	2	12	52676	52687	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	84488876
25	NC_007681	CAGCTA	2	12	52714	52725	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	84488876
26	NC_007681	TTATGT	2	12	54170	54181	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	84488878
27	NC_007681	TCCTGT	2	12	54477	54488	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	84488878
28	NC_007681	TATTGT	2	12	56655	56666	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	84488878
29	NC_007681	ATCCAT	2	12	58343	58354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488878
30	NC_007681	TTTCCA	2	12	58393	58404	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	84488878
31	NC_007681	TACCAG	2	12	59306	59317	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	84488878
32	NC_007681	GATAAT	2	12	64589	64600	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	84488881
33	NC_007681	ATCACT	2	12	65277	65288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488882
34	NC_007681	TCAAGT	2	12	67331	67342	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	84488883
35	NC_007681	CTGTAA	2	12	69354	69365	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	84488885
36	NC_007681	ACTAAT	2	12	73184	73195	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	84488888
37	NC_007681	GAAATA	2	12	76041	76052	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	84488891
38	NC_007681	ATATTA	2	12	80077	80088	50 %	50 %	0 %	0 %	84488895
39	NC_007681	AATATA	2	12	81413	81424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488896
40	NC_007681	TCAATA	2	12	84331	84342	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	84488899
41	NC_007681	GGTTTT	2	12	88921	88932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	84488904
42	NC_007681	GAATTA	2	12	90899	90910	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	84488906
43	NC_007681	TATATT	2	12	92136	92147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488907
44	NC_007681	ATTTTC	2	12	92382	92393	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	84488907
45	NC_007681	TAGTAT	2	12	95626	95637	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	84488912
46	NC_007681	TAATTC	2	12	96040	96051	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	84488912
47	NC_007681	TAAATG	2	12	97655	97666	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	84488913
48	NC_007681	ATAATG	2	12	99896	99907	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	84488914
49	NC_007681	TTTGTT	2	12	104388	104399	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	84488919
50	NC_007681	GTACAG	2	12	105925	105936	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	84488921
51	NC_007681	TGAAGA	2	12	106673	106684	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	84488922
52	NC_007681	CCATCA	2	12	107851	107862	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	84488923
53	NC_007681	CAAATA	2	12	109722	109733	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	84488926
54	NC_007681	TAATTA	3	18	110015	110032	50 %	50 %	0 %	0 %	84488926
55	NC_007681	AATGTA	2	12	116318	116329	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	84488934
56	NC_007681	CAGGTT	2	12	116468	116479	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	84488934
57	NC_007681	GCTTCA	2	12	116653	116664	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	84488934
58	NC_007681	ATGAAA	2	12	119292	119303	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	84488937
59	NC_007681	TGCTGG	2	12	119628	119639	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	84488938
60	NC_007681	TGGTGA	2	12	120993	121004	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	84488939
61	NC_007681	TTAACT	2	12	121609	121620	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	84488940
62	NC_007681	AAATGA	2	12	126240	126251	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	84488943
63	NC_007681	AGCACC	2	12	129608	129619	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	84488944
64	NC_007681	CCTTTT	2	12	130650	130661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	84488946
65	NC_007681	CCATAT	2	12	130726	130737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488946
66	NC_007681	CATAAT	2	12	131943	131954	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	84488947
67	NC_007681	ATTTGT	2	12	134244	134255	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	84488949
68	NC_007681	ACAAAC	2	12	140800	140811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84488955
69	NC_007681	AAAGAA	2	12	145392	145403	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	84488957
70	NC_007681	AAATAT	2	12	145661	145672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488957
71	NC_007681	ATTGTT	2	12	145710	145721	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	84488957
72	NC_007681	AGCAGA	2	12	154633	154644	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	84488963
73	NC_007681	TTGTAT	2	12	154927	154938	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	84488964
74	NC_007681	TTTATC	2	12	156709	156720	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	84488966
75	NC_007681	TATAAA	2	12	157257	157268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488967
76	NC_007681	TAAAAT	2	12	159209	159220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488969
77	NC_007681	TAAGTT	3	18	159944	159961	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	84488970
78	NC_007681	TTTACT	2	12	160008	160019	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	84488970
79	NC_007681	GTTGTG	2	12	162030	162041	0 %	50 %	50 %	0 %	84488970
80	NC_007681	TAACAT	2	12	162118	162129	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	84488970
81	NC_007681	TTTTAT	2	12	163208	163219	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	84488970
82	NC_007681	GGTATA	2	12	167555	167566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	84488971
83	NC_007681	TAACAA	2	12	167583	167594	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	84488971
84	NC_007681	AATGGT	2	12	170527	170538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	84488974
85	NC_007681	AACATT	2	12	171714	171725	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	84488974
86	NC_007681	TGATTA	2	12	172506	172517	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	84488974
87	NC_007681	AAACAT	2	12	173160	173171	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	84488974
88	NC_007681	CAAACA	2	12	174011	174022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84488974
89	NC_007681	ATTTGT	2	12	174375	174386	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	84488974
90	NC_007681	TATGCA	2	12	174850	174861	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	84488974
91	NC_007681	TAACAG	2	12	175157	175168	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	84488974
92	NC_007681	GTTGAG	2	12	181152	181163	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	84488977
93	NC_007681	CATAAA	2	12	182805	182816	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	84488978
94	NC_007681	CTAAAT	2	12	182890	182901	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	84488978
95	NC_007681	ATTTAC	2	12	185735	185746	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	84488979
96	NC_007681	CAAATA	2	12	189558	189569	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	84488983
97	NC_007681	TGAATA	2	12	191167	191178	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	84488983
98	NC_007681	AATAGA	2	12	191677	191688	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	84488983
99	NC_007681	TTTAAA	2	12	192878	192889	50 %	50 %	0 %	0 %	84488983
100	NC_007681	GTATCA	2	12	195095	195106	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	84488983
101	NC_007681	GACTTG	2	12	195711	195722	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	84488984
102	NC_007681	TATCAA	2	12	195978	195989	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	84488984
103	NC_007681	AATTAT	2	12	197178	197189	50 %	50 %	0 %	0 %	84488985
104	NC_007681	ATTAAT	2	12	197922	197933	50 %	50 %	0 %	0 %	84488986
105	NC_007681	ATGCAA	2	12	200898	200909	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	84488989
106	NC_007681	ATAGAA	2	12	201023	201034	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	84488989
107	NC_007681	ATAGAT	2	12	201206	201217	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	84488989
108	NC_007681	ACAGGA	2	12	202848	202859	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	84488991
109	NC_007681	TCAAAT	2	12	204024	204035	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	84488991
110	NC_007681	GCAATA	2	12	207929	207940	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	84488995
111	NC_007681	TTGCAT	2	12	210910	210921	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	84488998
112	NC_007681	AGAAGG	2	12	212913	212924	50 %	0 %	50 %	0 %	84489000
113	NC_007681	ACTTGG	2	12	213825	213836	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	84489000
114	NC_007681	TATAAA	2	12	216592	216603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84489002
115	NC_007681	TATTGA	2	12	217242	217253	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	84489002
116	NC_007681	TTTCAC	2	12	218215	218226	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	84489003
117	NC_007681	TGGTTT	2	12	218543	218554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	84489004
118	NC_007681	TGTATC	2	12	219005	219016	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	84489005
119	NC_007681	TGTTGA	2	12	219736	219747	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	84489006
120	NC_007681	TATGGA	2	12	221879	221890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	84489008
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