MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanosphaera stadtmanae DSM 3091 chromosome

Total Repeats: 2130

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007681	TAAAA	2	10	73	82	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007681	TTTTA	2	10	439	448	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007681	AATTT	2	10	2826	2835	40 %	60 %	0 %	0 %	84488834
4	NC_007681	TAAAC	2	10	2921	2930	60 %	20 %	0 %	20 %	84488834
5	NC_007681	ATATT	2	10	3417	3426	40 %	60 %	0 %	0 %	84488834
6	NC_007681	CTAAA	2	10	3429	3438	60 %	20 %	0 %	20 %	84488834
7	NC_007681	TTTAA	2	10	4296	4305	40 %	60 %	0 %	0 %	84488836
8	NC_007681	TAATT	2	10	4775	4784	40 %	60 %	0 %	0 %	84488836
9	NC_007681	TTATT	2	10	4954	4963	20 %	80 %	0 %	0 %	84488836
10	NC_007681	AATTT	2	10	5191	5200	40 %	60 %	0 %	0 %	84488836
11	NC_007681	TGCAT	2	10	5202	5211	20 %	40 %	20 %	20 %	84488836
12	NC_007681	AACAT	2	10	5953	5962	60 %	20 %	0 %	20 %	84488836
13	NC_007681	TGATA	2	10	6105	6114	40 %	40 %	20 %	0 %	84488836
14	NC_007681	ATTTA	2	10	7202	7211	40 %	60 %	0 %	0 %	84488837
15	NC_007681	TTATC	2	10	8048	8057	20 %	60 %	0 %	20 %	84488838
16	NC_007681	TATTT	2	10	8142	8151	20 %	80 %	0 %	0 %	84488838
17	NC_007681	CTTTT	2	10	8250	8259	0 %	80 %	0 %	20 %	84488838
18	NC_007681	TTGAC	2	10	8262	8271	20 %	40 %	20 %	20 %	84488838
19	NC_007681	ATATA	2	10	8388	8397	60 %	40 %	0 %	0 %	84488838
20	NC_007681	TTACT	2	10	8627	8636	20 %	60 %	0 %	20 %	84488838
21	NC_007681	ATATC	2	10	10819	10828	40 %	40 %	0 %	20 %	84488839
22	NC_007681	TAACA	2	10	10942	10951	60 %	20 %	0 %	20 %	84488839
23	NC_007681	TGGAA	2	10	13828	13837	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007681	GATTT	2	10	14043	14052	20 %	60 %	20 %	0 %	84488843
25	NC_007681	ATTAT	2	10	14965	14974	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007681	CAAAC	2	10	20572	20581	60 %	0 %	0 %	40 %	84488848
27	NC_007681	TATTT	2	10	21007	21016	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007681	TTTTA	2	10	23560	23569	20 %	80 %	0 %	0 %	84488851
29	NC_007681	ATTTA	2	10	23989	23998	40 %	60 %	0 %	0 %	84488851
30	NC_007681	TAGGA	2	10	24287	24296	40 %	20 %	40 %	0 %	84488852
31	NC_007681	GTTTT	2	10	25132	25141	0 %	80 %	20 %	0 %	84488852
32	NC_007681	TTTAT	2	10	25274	25283	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007681	ATAGT	2	10	26969	26978	40 %	40 %	20 %	0 %	84488854
34	NC_007681	TTGTT	2	10	27605	27614	0 %	80 %	20 %	0 %	84488855
35	NC_007681	TAATA	2	10	28054	28063	60 %	40 %	0 %	0 %	84488856
36	NC_007681	TTGTT	2	10	29841	29850	0 %	80 %	20 %	0 %	84488858
37	NC_007681	AAAAT	2	10	31883	31892	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007681	ATTAA	2	10	33157	33166	60 %	40 %	0 %	0 %	84488860
39	NC_007681	CTACA	2	10	33392	33401	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_007681	AACTA	2	10	36763	36772	60 %	20 %	0 %	20 %	84488864
41	NC_007681	TGTGG	2	10	37073	37082	0 %	40 %	60 %	0 %	84488864
42	NC_007681	TTATT	2	10	38031	38040	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007681	GTTAT	2	10	38418	38427	20 %	60 %	20 %	0 %	84488866
44	NC_007681	AATTA	2	10	38841	38850	60 %	40 %	0 %	0 %	84488866
45	NC_007681	AAGAT	2	10	38907	38916	60 %	20 %	20 %	0 %	84488866
46	NC_007681	GATTG	2	10	39014	39023	20 %	40 %	40 %	0 %	84488866
47	NC_007681	ATAGA	2	10	39093	39102	60 %	20 %	20 %	0 %	84488866
48	NC_007681	TTTGT	2	10	39289	39298	0 %	80 %	20 %	0 %	84488866
49	NC_007681	ATTAC	2	10	40037	40046	40 %	40 %	0 %	20 %	84488867
50	NC_007681	ATATT	2	10	41634	41643	40 %	60 %	0 %	0 %	84488868
51	NC_007681	TCATC	2	10	43589	43598	20 %	40 %	0 %	40 %	84488870
52	NC_007681	ACTAA	2	10	44371	44380	60 %	20 %	0 %	20 %	84488872
53	NC_007681	ATTGT	2	10	44878	44887	20 %	60 %	20 %	0 %	84488872
54	NC_007681	ATCTA	2	10	45072	45081	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_007681	TAATA	2	10	45126	45135	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007681	TAATA	2	10	45151	45160	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007681	TAGTT	2	10	46160	46169	20 %	60 %	20 %	0 %	84488873
58	NC_007681	GAAAA	2	10	46927	46936	80 %	0 %	20 %	0 %	84488873
59	NC_007681	TAATT	2	10	50206	50215	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007681	AATAC	2	10	52404	52413	60 %	20 %	0 %	20 %	84488876
61	NC_007681	ATTTT	2	10	53988	53997	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007681	ATTTA	2	10	54579	54588	40 %	60 %	0 %	0 %	84488878
63	NC_007681	ATTGT	2	10	55392	55401	20 %	60 %	20 %	0 %	84488878
64	NC_007681	GTTAT	2	10	55402	55411	20 %	60 %	20 %	0 %	84488878
65	NC_007681	TGTTA	2	10	55476	55485	20 %	60 %	20 %	0 %	84488878
66	NC_007681	TTAAA	2	10	55610	55619	60 %	40 %	0 %	0 %	84488878
67	NC_007681	TAATA	2	10	55818	55827	60 %	40 %	0 %	0 %	84488878
68	NC_007681	ATTTA	2	10	55914	55923	40 %	60 %	0 %	0 %	84488878
69	NC_007681	ATTGT	2	10	57067	57076	20 %	60 %	20 %	0 %	84488878
70	NC_007681	GTATT	2	10	57724	57733	20 %	60 %	20 %	0 %	84488878
71	NC_007681	CATAT	2	10	59220	59229	40 %	40 %	0 %	20 %	84488878
72	NC_007681	ATTTA	2	10	59868	59877	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007681	TATCA	2	10	60418	60427	40 %	40 %	0 %	20 %	84488879
74	NC_007681	ATTTT	2	10	60854	60863	20 %	80 %	0 %	0 %	84488879
75	NC_007681	TCTTT	2	10	60945	60954	0 %	80 %	0 %	20 %	84488879
76	NC_007681	ACTTA	2	10	63317	63326	40 %	40 %	0 %	20 %	84488880
77	NC_007681	TTTCT	2	10	64469	64478	0 %	80 %	0 %	20 %	84488881
78	NC_007681	AATTA	2	10	64501	64510	60 %	40 %	0 %	0 %	84488881
79	NC_007681	TTATT	2	10	64656	64665	20 %	80 %	0 %	0 %	84488881
80	NC_007681	TTATC	2	10	65555	65564	20 %	60 %	0 %	20 %	84488882
81	NC_007681	TTTGA	2	10	65584	65593	20 %	60 %	20 %	0 %	84488882
82	NC_007681	ATATT	2	10	66136	66145	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007681	ATTTT	2	10	66245	66254	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007681	AGCTA	2	10	67096	67105	40 %	20 %	20 %	20 %	84488883
85	NC_007681	ATGTA	2	10	67717	67726	40 %	40 %	20 %	0 %	84488883
86	NC_007681	AACTT	2	10	68258	68267	40 %	40 %	0 %	20 %	84488884
87	NC_007681	CTGTG	2	10	68739	68748	0 %	40 %	40 %	20 %	84488884
88	NC_007681	GAGTT	2	10	70970	70979	20 %	40 %	40 %	0 %	84488886
89	NC_007681	TAAAT	2	10	71136	71145	60 %	40 %	0 %	0 %	84488886
90	NC_007681	TATAT	2	10	72202	72211	40 %	60 %	0 %	0 %	84488887
91	NC_007681	ATTAT	2	10	73629	73638	40 %	60 %	0 %	0 %	84488888
92	NC_007681	GTATT	2	10	73744	73753	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007681	TATTT	2	10	74859	74868	20 %	80 %	0 %	0 %	84488890
94	NC_007681	ATTCT	2	10	75801	75810	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_007681	AATAT	2	10	76513	76522	60 %	40 %	0 %	0 %	84488891
96	NC_007681	TCTTT	2	10	76735	76744	0 %	80 %	0 %	20 %	84488892
97	NC_007681	TGTAT	2	10	76841	76850	20 %	60 %	20 %	0 %	84488892
98	NC_007681	ATTAA	2	10	78050	78059	60 %	40 %	0 %	0 %	84488893
99	NC_007681	ATATG	2	10	80064	80073	40 %	40 %	20 %	0 %	84488895
100	NC_007681	TAAAT	2	10	81712	81721	60 %	40 %	0 %	0 %	84488896
101	NC_007681	AATTC	2	10	84828	84837	40 %	40 %	0 %	20 %	84488900
102	NC_007681	AAAAG	2	10	85290	85299	80 %	0 %	20 %	0 %	84488900
103	NC_007681	ATTTA	2	10	85479	85488	40 %	60 %	0 %	0 %	84488900
104	NC_007681	AATAT	2	10	86228	86237	60 %	40 %	0 %	0 %	84488901
105	NC_007681	GTGCT	2	10	88160	88169	0 %	40 %	40 %	20 %	84488903
106	NC_007681	TCATT	2	10	89090	89099	20 %	60 %	0 %	20 %	84488904
107	NC_007681	TGTTT	2	10	89975	89984	0 %	80 %	20 %	0 %	84488905
108	NC_007681	ATTTT	2	10	90738	90747	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007681	ATTAA	2	10	91364	91373	60 %	40 %	0 %	0 %	84488906
110	NC_007681	TAAAT	2	10	91879	91888	60 %	40 %	0 %	0 %	84488906
111	NC_007681	TTTTC	2	10	92221	92230	0 %	80 %	0 %	20 %	84488907
112	NC_007681	ATGTT	2	10	92258	92267	20 %	60 %	20 %	0 %	84488907
113	NC_007681	ATGTA	2	10	92318	92327	40 %	40 %	20 %	0 %	84488907
114	NC_007681	ATTTT	2	10	92645	92654	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007681	AACAT	2	10	93422	93431	60 %	20 %	0 %	20 %	84488909
116	NC_007681	ATGAT	2	10	94138	94147	40 %	40 %	20 %	0 %	84488910
117	NC_007681	TGATT	2	10	95372	95381	20 %	60 %	20 %	0 %	84488912
118	NC_007681	TTTTA	2	10	96118	96127	20 %	80 %	0 %	0 %	84488912
119	NC_007681	ATATT	2	10	99066	99075	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007681	ATATG	2	10	100059	100068	40 %	40 %	20 %	0 %	84488914
121	NC_007681	TACAT	2	10	101876	101885	40 %	40 %	0 %	20 %	84488916
122	NC_007681	ACTTT	2	10	103303	103312	20 %	60 %	0 %	20 %	84488917
123	NC_007681	ATAAA	2	10	104010	104019	80 %	20 %	0 %	0 %	84488919
124	NC_007681	ATTTT	2	10	104510	104519	20 %	80 %	0 %	0 %	84488919
125	NC_007681	TTTAG	2	10	104714	104723	20 %	60 %	20 %	0 %	84488920
126	NC_007681	CATAA	2	10	104953	104962	60 %	20 %	0 %	20 %	84488920
127	NC_007681	ATTTC	2	10	105215	105224	20 %	60 %	0 %	20 %	84488920
128	NC_007681	AATAT	2	10	108159	108168	60 %	40 %	0 %	0 %	84488923
129	NC_007681	AGATA	2	10	108318	108327	60 %	20 %	20 %	0 %	84488923
130	NC_007681	TGTAA	2	10	108809	108818	40 %	40 %	20 %	0 %	84488925
131	NC_007681	ATTTA	2	10	110462	110471	40 %	60 %	0 %	0 %	84488928
132	NC_007681	AACTT	2	10	111444	111453	40 %	40 %	0 %	20 %	84488930
133	NC_007681	CTTTC	2	10	111591	111600	0 %	60 %	0 %	40 %	84488930
134	NC_007681	ATATA	2	10	113196	113205	60 %	40 %	0 %	0 %	84488930
135	NC_007681	ATATT	2	10	114175	114184	40 %	60 %	0 %	0 %	84488931
136	NC_007681	AATTA	2	10	118330	118339	60 %	40 %	0 %	0 %	84488937
137	NC_007681	GATGT	2	10	118617	118626	20 %	40 %	40 %	0 %	84488937
138	NC_007681	TAAAT	2	10	119071	119080	60 %	40 %	0 %	0 %	84488937
139	NC_007681	TAGTG	2	10	120030	120039	20 %	40 %	40 %	0 %	84488938
140	NC_007681	ACAAG	2	10	121033	121042	60 %	0 %	20 %	20 %	84488939
141	NC_007681	ACATT	2	10	121777	121786	40 %	40 %	0 %	20 %	84488940
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160	NC_007681	ATTAA	2	10	133687	133696	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_007681	TATTT	2	10	137588	137597	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_007681	ATTTT	3	15	137658	137672	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_007681	TATTT	2	10	146432	146441	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_007681	TTTTA	2	10	146548	146557	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_007681	GGTAT	2	10	147401	147410	20 %	40 %	40 %	0 %	84488958
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205	NC_007681	ACTGT	2	10	161499	161508	20 %	40 %	20 %	20 %	84488970
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207	NC_007681	TATTT	2	10	166249	166258	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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209	NC_007681	TTTAT	2	10	166398	166407	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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243	NC_007681	ATTTA	2	10	198079	198088	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_007681	ATAAA	2	10	207335	207344	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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263	NC_007681	GTATG	2	10	218015	218024	20 %	40 %	40 %	0 %	84489003
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269	NC_007681	TTCTA	2	10	223514	223523	20 %	60 %	0 %	20 %	84489009
270	NC_007681	ATACC	2	10	223957	223966	40 %	20 %	0 %	40 %	84489009
271	NC_007681	TTTAT	2	10	224945	224954	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_007681	TGACA	2	10	225848	225857	40 %	20 %	20 %	20 %	84489010
273	NC_007681	ATATT	2	10	226870	226879	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_007681	GTGTA	2	10	228704	228713	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
275	NC_007681	TATAT	2	10	230667	230676	40 %	60 %	0 %	0 %	84489014
276	NC_007681	TAAAA	2	10	232737	232746	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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