MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanosphaera stadtmanae DSM 3091 chromosome

Total Repeats: 28502

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007681	AAT	2	6	721	726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488832
2	NC_007681	CAA	2	6	741	746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84488832
3	NC_007681	CCT	2	6	874	879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	84488832
4	NC_007681	AGA	2	6	948	953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84488832
5	NC_007681	GCT	2	6	958	963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84488832
6	NC_007681	CAA	2	6	1045	1050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84488832
7	NC_007681	AGT	2	6	1092	1097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	84488832
8	NC_007681	ATG	2	6	1190	1195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	84488832
9	NC_007681	AGT	2	6	1297	1302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	84488832
10	NC_007681	TCC	2	6	1326	1331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	84488832
11	NC_007681	CAA	2	6	1342	1347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84488832
12	NC_007681	TGC	2	6	1434	1439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84488832
13	NC_007681	AGA	2	6	1443	1448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84488832
14	NC_007681	TTA	2	6	1474	1479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488832
15	NC_007681	TCT	2	6	1513	1518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	84488832
16	NC_007681	GAA	2	6	1525	1530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84488832
17	NC_007681	AAG	2	6	1541	1546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84488832
18	NC_007681	ATA	2	6	1573	1578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488832
19	NC_007681	TGT	3	9	1581	1589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	84488832
20	NC_007681	CAA	3	9	1603	1611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84488832
21	NC_007681	GAA	2	6	1651	1656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84488832
22	NC_007681	AGA	2	6	1720	1725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84488832
23	NC_007681	TTA	2	6	1736	1741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488832
24	NC_007681	AAT	2	6	2032	2037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488833
25	NC_007681	CTA	2	6	2204	2209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488833
26	NC_007681	TTG	2	6	2228	2233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	84488833
27	NC_007681	TAT	2	6	2536	2541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488834
28	NC_007681	TCA	2	6	2633	2638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488834
29	NC_007681	ATG	2	6	2660	2665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	84488834
30	NC_007681	CAT	2	6	2781	2786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488834
31	NC_007681	TGG	2	6	2857	2862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84488834
32	NC_007681	CAA	2	6	2961	2966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84488834
33	NC_007681	TGT	2	6	3041	3046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	84488834
34	NC_007681	CAA	2	6	3081	3086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84488834
35	NC_007681	AGC	2	6	3103	3108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84488834
36	NC_007681	ATA	2	6	3174	3179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488834
37	NC_007681	CAA	2	6	3222	3227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84488834
38	NC_007681	TAA	2	6	3304	3309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488834
39	NC_007681	TTC	2	6	3529	3534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	84488835
40	NC_007681	TTA	2	6	3604	3609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488835
41	NC_007681	ACC	2	6	3654	3659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	84488835
42	NC_007681	ATT	2	6	3820	3825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488835
43	NC_007681	TCT	2	6	3835	3840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	84488835
44	NC_007681	CAA	2	6	3875	3880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84488835
45	NC_007681	TAG	2	6	3894	3899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	84488835
46	NC_007681	ACT	2	6	3900	3905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488835
47	NC_007681	CAA	2	6	3926	3931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84488835
48	NC_007681	TAC	2	6	3935	3940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488835
49	NC_007681	TAA	2	6	3987	3992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488835
50	NC_007681	TAT	2	6	4148	4153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488835
51	NC_007681	CTA	2	6	4181	4186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488835
52	NC_007681	TCC	2	6	4278	4283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	84488836
53	NC_007681	AAT	2	6	4376	4381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
54	NC_007681	ATA	2	6	4391	4396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
55	NC_007681	TCA	2	6	4410	4415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488836
56	NC_007681	TTG	2	6	4507	4512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	84488836
57	NC_007681	TAA	2	6	4636	4641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
58	NC_007681	ATT	2	6	4853	4858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488836
59	NC_007681	TAA	2	6	4870	4875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
60	NC_007681	TTA	2	6	4923	4928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488836
61	NC_007681	TGT	2	6	4972	4977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	84488836
62	NC_007681	ATC	2	6	5003	5008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488836
63	NC_007681	TAT	2	6	5020	5025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488836
64	NC_007681	AAT	2	6	5030	5035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
65	NC_007681	TAT	2	6	5045	5050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488836
66	NC_007681	TAA	2	6	5074	5079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
67	NC_007681	ATA	2	6	5104	5109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
68	NC_007681	TAA	3	9	5212	5220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
69	NC_007681	CTA	2	6	5398	5403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488836
70	NC_007681	ATT	2	6	5408	5413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488836
71	NC_007681	TTG	2	6	5445	5450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	84488836
72	NC_007681	AAC	3	9	5519	5527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84488836
73	NC_007681	TTA	2	6	5535	5540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488836
74	NC_007681	GTT	2	6	5566	5571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	84488836
75	NC_007681	ATA	2	6	5580	5585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
76	NC_007681	CTT	2	6	5623	5628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	84488836
77	NC_007681	TAA	2	6	5662	5667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
78	NC_007681	ATC	2	6	5690	5695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488836
79	NC_007681	TAT	2	6	5773	5778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488836
80	NC_007681	ATA	2	6	5791	5796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
81	NC_007681	ATA	2	6	5858	5863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
82	NC_007681	AAT	2	6	5941	5946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
83	NC_007681	ATA	2	6	6000	6005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
84	NC_007681	TCA	2	6	6036	6041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488836
85	NC_007681	AAT	2	6	6088	6093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
86	NC_007681	TCA	2	6	6135	6140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488836
87	NC_007681	AAT	2	6	6157	6162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
88	NC_007681	TAT	2	6	6166	6171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488836
89	NC_007681	CAT	2	6	6197	6202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488836
90	NC_007681	AAT	2	6	6232	6237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
91	NC_007681	TAA	2	6	6409	6414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
92	NC_007681	TCA	2	6	6564	6569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488836
93	NC_007681	TAT	2	6	6620	6625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488836
94	NC_007681	TTC	2	6	6638	6643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	84488836
95	NC_007681	TTA	2	6	6678	6683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488836
96	NC_007681	ATG	2	6	6723	6728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	84488836
97	NC_007681	TAA	2	6	6952	6957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
98	NC_007681	ATA	2	6	6969	6974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
99	NC_007681	TCA	2	6	6978	6983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488836
100	NC_007681	TAA	2	6	7012	7017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
101	NC_007681	TAT	2	6	7036	7041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488836
102	NC_007681	ATT	2	6	7085	7090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488837
103	NC_007681	CTG	2	6	7120	7125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84488837
104	NC_007681	TAA	2	6	7184	7189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488837
105	NC_007681	ATC	2	6	7196	7201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488837
106	NC_007681	TAA	2	6	7265	7270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488837
107	NC_007681	CTT	2	6	7303	7308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	84488837
108	NC_007681	CTT	2	6	7327	7332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	84488837
109	NC_007681	CCA	2	6	7359	7364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	84488837
110	NC_007681	TAA	2	6	7381	7386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488837
111	NC_007681	ATC	2	6	7421	7426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488837
112	NC_007681	CTG	2	6	7438	7443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84488837
113	NC_007681	CAA	2	6	7444	7449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84488837
114	NC_007681	TAA	2	6	7646	7651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488838
115	NC_007681	TTG	2	6	7656	7661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	84488838
116	NC_007681	ATC	2	6	7962	7967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488838
117	NC_007681	AAT	3	9	7983	7991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488838
118	NC_007681	ATC	2	6	7992	7997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488838
119	NC_007681	TCA	2	6	8119	8124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488838
120	NC_007681	TTA	2	6	8152	8157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488838
121	NC_007681	CAC	2	6	8321	8326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	84488838
122	NC_007681	TTG	2	6	8441	8446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	84488838
123	NC_007681	ATT	2	6	8565	8570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488838
124	NC_007681	TTA	2	6	8572	8577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488838
125	NC_007681	GTA	2	6	8599	8604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	84488838
126	NC_007681	ATC	3	9	8643	8651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488838
127	NC_007681	ATT	2	6	8653	8658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488838
128	NC_007681	GAT	2	6	8693	8698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	84488838
129	NC_007681	TTG	2	6	8706	8711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	84488838
130	NC_007681	TCT	2	6	8718	8723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	84488838
131	NC_007681	TGC	2	6	8772	8777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84488838
132	NC_007681	TTA	2	6	8800	8805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488838
133	NC_007681	ATT	2	6	8811	8816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488838
134	NC_007681	TAA	2	6	8867	8872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488838
135	NC_007681	TAC	2	6	8918	8923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488838
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