MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Methanosphaera stadtmanae DSM 3091 chromosome

Total Repeats: 4595

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007681	AT	3	6	86	91	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007681	AT	3	6	120	125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007681	TA	3	6	353	358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007681	AT	4	8	449	456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007681	CT	3	6	597	602	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_007681	AT	3	6	725	730	50 %	50 %	0 %	0 %	84488832
7	NC_007681	AT	3	6	1202	1207	50 %	50 %	0 %	0 %	84488832
8	NC_007681	AT	3	6	1858	1863	50 %	50 %	0 %	0 %	84488832
9	NC_007681	CA	3	6	2240	2245	50 %	0 %	0 %	50 %	84488833
10	NC_007681	TA	3	6	2274	2279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007681	AT	3	6	2294	2299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007681	AT	4	8	2765	2772	50 %	50 %	0 %	0 %	84488834
13	NC_007681	TA	3	6	3012	3017	50 %	50 %	0 %	0 %	84488834
14	NC_007681	AT	4	8	3378	3385	50 %	50 %	0 %	0 %	84488834
15	NC_007681	GT	3	6	3635	3640	0 %	50 %	50 %	0 %	84488835
16	NC_007681	TA	3	6	3773	3778	50 %	50 %	0 %	0 %	84488835
17	NC_007681	AT	3	6	4649	4654	50 %	50 %	0 %	0 %	84488836
18	NC_007681	AT	3	6	4746	4751	50 %	50 %	0 %	0 %	84488836
19	NC_007681	TA	3	6	5239	5244	50 %	50 %	0 %	0 %	84488836
20	NC_007681	AT	3	6	5295	5300	50 %	50 %	0 %	0 %	84488836
21	NC_007681	AT	3	6	5351	5356	50 %	50 %	0 %	0 %	84488836
22	NC_007681	AT	3	6	6023	6028	50 %	50 %	0 %	0 %	84488836
23	NC_007681	TA	3	6	6547	6552	50 %	50 %	0 %	0 %	84488836
24	NC_007681	AT	3	6	6753	6758	50 %	50 %	0 %	0 %	84488836
25	NC_007681	CT	3	6	6999	7004	0 %	50 %	0 %	50 %	84488836
26	NC_007681	TA	3	6	7097	7102	50 %	50 %	0 %	0 %	84488837
27	NC_007681	TG	3	6	7404	7409	0 %	50 %	50 %	0 %	84488837
28	NC_007681	AT	3	6	8453	8458	50 %	50 %	0 %	0 %	84488838
29	NC_007681	AT	3	6	8586	8591	50 %	50 %	0 %	0 %	84488838
30	NC_007681	AG	3	6	9045	9050	50 %	0 %	50 %	0 %	84488838
31	NC_007681	AT	3	6	9171	9176	50 %	50 %	0 %	0 %	84488838
32	NC_007681	TA	3	6	9873	9878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007681	AT	3	6	11276	11281	50 %	50 %	0 %	0 %	84488839
34	NC_007681	AT	3	6	11719	11724	50 %	50 %	0 %	0 %	84488840
35	NC_007681	TG	3	6	12859	12864	0 %	50 %	50 %	0 %	84488841
36	NC_007681	AT	3	6	13840	13845	50 %	50 %	0 %	0 %	84488843
37	NC_007681	AT	3	6	14901	14906	50 %	50 %	0 %	0 %	84488843
38	NC_007681	GA	3	6	15035	15040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007681	AT	3	6	15115	15120	50 %	50 %	0 %	0 %	84488844
40	NC_007681	AG	3	6	15216	15221	50 %	0 %	50 %	0 %	84488844
41	NC_007681	TA	3	6	15430	15435	50 %	50 %	0 %	0 %	84488844
42	NC_007681	TG	3	6	15850	15855	0 %	50 %	50 %	0 %	84488844
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44	NC_007681	AG	3	6	16184	16189	50 %	0 %	50 %	0 %	84488844
45	NC_007681	CT	3	6	16212	16217	0 %	50 %	0 %	50 %	84488844
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47	NC_007681	AT	3	6	17478	17483	50 %	50 %	0 %	0 %	84488845
48	NC_007681	TA	3	6	17697	17702	50 %	50 %	0 %	0 %	84488846
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50	NC_007681	AT	3	6	18019	18024	50 %	50 %	0 %	0 %	84488846
51	NC_007681	TA	3	6	18326	18331	50 %	50 %	0 %	0 %	84488846
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53	NC_007681	AT	4	8	18652	18659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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59	NC_007681	AT	4	8	22041	22048	50 %	50 %	0 %	0 %	84488849
60	NC_007681	AT	3	6	22192	22197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007681	AT	3	6	22291	22296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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65	NC_007681	TA	3	6	25218	25223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007681	TA	3	6	25259	25264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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69	NC_007681	AT	3	6	26053	26058	50 %	50 %	0 %	0 %	84488853
70	NC_007681	AT	3	6	26071	26076	50 %	50 %	0 %	0 %	84488853
71	NC_007681	TA	3	6	26234	26239	50 %	50 %	0 %	0 %	84488853
72	NC_007681	GA	3	6	26320	26325	50 %	0 %	50 %	0 %	84488853
73	NC_007681	TA	4	8	26551	26558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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100	NC_007681	TA	3	6	41179	41184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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106	NC_007681	AT	3	6	42755	42760	50 %	50 %	0 %	0 %	84488869
107	NC_007681	AT	3	6	43015	43020	50 %	50 %	0 %	0 %	84488869
108	NC_007681	TA	3	6	43044	43049	50 %	50 %	0 %	0 %	84488869
109	NC_007681	AT	3	6	43374	43379	50 %	50 %	0 %	0 %	84488870
110	NC_007681	TA	4	8	43487	43494	50 %	50 %	0 %	0 %	84488870
111	NC_007681	AT	3	6	43734	43739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007681	AT	4	8	44156	44163	50 %	50 %	0 %	0 %	84488872
113	NC_007681	TA	3	6	44264	44269	50 %	50 %	0 %	0 %	84488872
114	NC_007681	TA	3	6	44754	44759	50 %	50 %	0 %	0 %	84488872
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116	NC_007681	AT	3	6	45035	45040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007681	AT	3	6	45082	45087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007681	TA	5	10	45551	45560	50 %	50 %	0 %	0 %	84488873
119	NC_007681	AT	3	6	45669	45674	50 %	50 %	0 %	0 %	84488873
120	NC_007681	AT	3	6	46140	46145	50 %	50 %	0 %	0 %	84488873
121	NC_007681	TA	3	6	46669	46674	50 %	50 %	0 %	0 %	84488873
122	NC_007681	AT	3	6	46847	46852	50 %	50 %	0 %	0 %	84488873
123	NC_007681	TA	3	6	46996	47001	50 %	50 %	0 %	0 %	84488873
124	NC_007681	TA	3	6	47200	47205	50 %	50 %	0 %	0 %	84488873
125	NC_007681	TA	3	6	47550	47555	50 %	50 %	0 %	0 %	84488873
126	NC_007681	TA	5	10	47615	47624	50 %	50 %	0 %	0 %	84488873
127	NC_007681	TA	3	6	47719	47724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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129	NC_007681	TA	3	6	47902	47907	50 %	50 %	0 %	0 %	84488874
130	NC_007681	AT	3	6	47909	47914	50 %	50 %	0 %	0 %	84488874
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132	NC_007681	AT	3	6	48479	48484	50 %	50 %	0 %	0 %	84488874
133	NC_007681	TA	3	6	48748	48753	50 %	50 %	0 %	0 %	84488874
134	NC_007681	AT	4	8	49045	49052	50 %	50 %	0 %	0 %	84488874
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136	NC_007681	AC	3	6	50442	50447	50 %	0 %	0 %	50 %	84488876
137	NC_007681	CA	3	6	50453	50458	50 %	0 %	0 %	50 %	84488876
138	NC_007681	CA	3	6	50468	50473	50 %	0 %	0 %	50 %	84488876
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142	NC_007681	TA	3	6	52330	52335	50 %	50 %	0 %	0 %	84488876
143	NC_007681	AT	3	6	52392	52397	50 %	50 %	0 %	0 %	84488876
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149	NC_007681	AT	3	6	54279	54284	50 %	50 %	0 %	0 %	84488878
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