MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salinibacter ruber DSM 13855 plasmid pSR35

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007678	CCGTT	2	10	7175	7184	0 %	40 %	20 %	40 %	83816885
2	NC_007678	GTTTG	2	10	12275	12284	0 %	60 %	40 %	0 %	83816862
3	NC_007678	TGGTG	2	10	12658	12667	0 %	40 %	60 %	0 %	83816862
4	NC_007678	AAGTG	2	10	13186	13195	40 %	20 %	40 %	0 %	83816862
5	NC_007678	ACGCG	2	10	17916	17925	20 %	0 %	40 %	40 %	83816866
6	NC_007678	GTAAC	2	10	19500	19509	40 %	20 %	20 %	20 %	83816858
7	NC_007678	CGGCG	2	10	19636	19645	0 %	0 %	60 %	40 %	83816858
8	NC_007678	CGGGT	2	10	19782	19791	0 %	20 %	60 %	20 %	83816858
9	NC_007678	CGTGA	2	10	19961	19970	20 %	20 %	40 %	20 %	83816859
10	NC_007678	ATGAC	2	10	20100	20109	40 %	20 %	20 %	20 %	83816859
11	NC_007678	GGAGG	2	10	21930	21939	20 %	0 %	80 %	0 %	83816874
12	NC_007678	GTCGC	2	10	23148	23157	0 %	20 %	40 %	40 %	83816863
13	NC_007678	GCCGC	2	10	23467	23476	0 %	0 %	40 %	60 %	83816863
14	NC_007678	TCCCT	2	10	23852	23861	0 %	40 %	0 %	60 %	83816881
15	NC_007678	TGGCA	2	10	24083	24092	20 %	20 %	40 %	20 %	83816881
16	NC_007678	GACTG	2	10	24495	24504	20 %	20 %	40 %	20 %	83816887
17	NC_007678	AGCGG	2	10	24805	24814	20 %	0 %	60 %	20 %	83816887
18	NC_007678	TCTCT	2	10	25100	25109	0 %	60 %	0 %	40 %	83816871
19	NC_007678	GAGCC	2	10	25951	25960	20 %	0 %	40 %	40 %	83816871
20	NC_007678	TGGAG	2	10	29673	29682	20 %	20 %	60 %	0 %	83816877
21	NC_007678	CGCGG	2	10	29951	29960	0 %	0 %	60 %	40 %	83816877
22	NC_007678	GGGTC	2	10	30689	30698	0 %	20 %	60 %	20 %	83816877
23	NC_007678	CCATC	2	10	31382	31391	20 %	20 %	0 %	60 %	83816878
24	NC_007678	ATCTT	2	10	31759	31768	20 %	60 %	0 %	20 %	83816878
25	NC_007678	GTGGG	2	10	32591	32600	0 %	20 %	80 %	0 %	83816878
26	NC_007678	GGGCA	2	10	33213	33222	20 %	0 %	60 %	20 %	83816878
27	NC_007678	CAGCT	2	10	33905	33914	20 %	20 %	20 %	40 %	83816870
28	NC_007678	GCGTG	2	10	33991	34000	0 %	20 %	60 %	20 %	83816870

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.