MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salinibacter ruber DSM 13855 plasmid pSR35

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007678	GAGG	2	8	480	487	25 %	0 %	75 %	0 %	83816884
2	NC_007678	GAGG	2	8	522	529	25 %	0 %	75 %	0 %	83816884
3	NC_007678	AGAC	2	8	614	621	50 %	0 %	25 %	25 %	83816884
4	NC_007678	GCGA	2	8	1549	1556	25 %	0 %	50 %	25 %	83816880
5	NC_007678	AGGC	2	8	1577	1584	25 %	0 %	50 %	25 %	83816880
6	NC_007678	TCGA	2	8	1803	1810	25 %	25 %	25 %	25 %	83816880
7	NC_007678	GTCG	2	8	2048	2055	0 %	25 %	50 %	25 %	83816880
8	NC_007678	CCTG	2	8	2209	2216	0 %	25 %	25 %	50 %	83816880
9	NC_007678	CGTC	2	8	2228	2235	0 %	25 %	25 %	50 %	83816880
10	NC_007678	ATTT	2	8	3337	3344	25 %	75 %	0 %	0 %	83816872
11	NC_007678	TCGA	2	8	3391	3398	25 %	25 %	25 %	25 %	83816872
12	NC_007678	TCAA	2	8	3623	3630	50 %	25 %	0 %	25 %	83816872
13	NC_007678	TCAA	2	8	3848	3855	50 %	25 %	0 %	25 %	83816872
14	NC_007678	GAGG	2	8	5310	5317	25 %	0 %	75 %	0 %	83816872
15	NC_007678	CAAG	2	8	5540	5547	50 %	0 %	25 %	25 %	83816872
16	NC_007678	CAGT	2	8	5705	5712	25 %	25 %	25 %	25 %	83816872
17	NC_007678	GGCC	2	8	6018	6025	0 %	0 %	50 %	50 %	83816872
18	NC_007678	CGGC	2	8	6240	6247	0 %	0 %	50 %	50 %	83816872
19	NC_007678	CTTC	2	8	6407	6414	0 %	50 %	0 %	50 %	83816885
20	NC_007678	GCCG	2	8	6633	6640	0 %	0 %	50 %	50 %	83816885
21	NC_007678	GACC	2	8	7486	7493	25 %	0 %	25 %	50 %	83816885
22	NC_007678	GGCC	2	8	7903	7910	0 %	0 %	50 %	50 %	83816867
23	NC_007678	CGCA	2	8	8981	8988	25 %	0 %	25 %	50 %	83816868
24	NC_007678	CGTG	2	8	9382	9389	0 %	25 %	50 %	25 %	83816860
25	NC_007678	GGCA	2	8	10053	10060	25 %	0 %	50 %	25 %	83816869
26	NC_007678	CTCC	2	8	10196	10203	0 %	25 %	0 %	75 %	83816869
27	NC_007678	GGCA	2	8	10622	10629	25 %	0 %	50 %	25 %	83816882
28	NC_007678	CGGT	2	8	10883	10890	0 %	25 %	50 %	25 %	83816882
29	NC_007678	GACC	2	8	11370	11377	25 %	0 %	25 %	50 %	83816861
30	NC_007678	TCCA	2	8	11461	11468	25 %	25 %	0 %	50 %	83816861
31	NC_007678	CGGT	2	8	11686	11693	0 %	25 %	50 %	25 %	83816861
32	NC_007678	CGGG	2	8	11727	11734	0 %	0 %	75 %	25 %	83816861
33	NC_007678	TCAG	2	8	12605	12612	25 %	25 %	25 %	25 %	83816862
34	NC_007678	ATAA	2	8	13814	13821	75 %	25 %	0 %	0 %	83816862
35	NC_007678	GAAG	2	8	13946	13953	50 %	0 %	50 %	0 %	83816862
36	NC_007678	TTGG	2	8	14300	14307	0 %	50 %	50 %	0 %	83816862
37	NC_007678	ACTG	2	8	14841	14848	25 %	25 %	25 %	25 %	83816886
38	NC_007678	CCCG	2	8	15022	15029	0 %	0 %	25 %	75 %	83816886
39	NC_007678	CCAT	2	8	15198	15205	25 %	25 %	0 %	50 %	83816886
40	NC_007678	CCGC	2	8	16154	16161	0 %	0 %	25 %	75 %	83816865
41	NC_007678	GCCA	2	8	16221	16228	25 %	0 %	25 %	50 %	83816865
42	NC_007678	TAGA	2	8	16787	16794	50 %	25 %	25 %	0 %	83816865
43	NC_007678	GCTG	2	8	17223	17230	0 %	25 %	50 %	25 %	83816864
44	NC_007678	GGGC	2	8	18187	18194	0 %	0 %	75 %	25 %	83816858
45	NC_007678	AGGC	2	8	18198	18205	25 %	0 %	50 %	25 %	83816858
46	NC_007678	TACC	2	8	18812	18819	25 %	25 %	0 %	50 %	83816858
47	NC_007678	GACC	2	8	19099	19106	25 %	0 %	25 %	50 %	83816858
48	NC_007678	CGGC	2	8	19270	19277	0 %	0 %	50 %	50 %	83816858
49	NC_007678	AGGG	2	8	19328	19335	25 %	0 %	75 %	0 %	83816858
50	NC_007678	GATC	2	8	20520	20527	25 %	25 %	25 %	25 %	83816883
51	NC_007678	ATCG	2	8	20844	20851	25 %	25 %	25 %	25 %	83816883
52	NC_007678	GCCA	2	8	21527	21534	25 %	0 %	25 %	50 %	83816874
53	NC_007678	TGAG	2	8	22202	22209	25 %	25 %	50 %	0 %	83816874
54	NC_007678	TCAA	2	8	22432	22439	50 %	25 %	0 %	25 %	83816876
55	NC_007678	TTCG	2	8	23124	23131	0 %	50 %	25 %	25 %	83816863
56	NC_007678	CTCG	2	8	23588	23595	0 %	25 %	25 %	50 %	83816881
57	NC_007678	CTCG	2	8	23819	23826	0 %	25 %	25 %	50 %	83816881
58	NC_007678	TGGT	2	8	23985	23992	0 %	50 %	50 %	0 %	83816881
59	NC_007678	ATGG	2	8	24950	24957	25 %	25 %	50 %	0 %	83816887
60	NC_007678	ACCT	2	8	24975	24982	25 %	25 %	0 %	50 %	83816871
61	NC_007678	ACCG	2	8	24994	25001	25 %	0 %	25 %	50 %	83816871
62	NC_007678	AGGT	2	8	25492	25499	25 %	25 %	50 %	0 %	83816871
63	NC_007678	TGGA	2	8	25817	25824	25 %	25 %	50 %	0 %	83816871
64	NC_007678	CTTG	2	8	25877	25884	0 %	50 %	25 %	25 %	83816871
65	NC_007678	CAGT	2	8	25943	25950	25 %	25 %	25 %	25 %	83816871
66	NC_007678	GGAT	2	8	26905	26912	25 %	25 %	50 %	0 %	83816871
67	NC_007678	TCCC	2	8	27241	27248	0 %	25 %	0 %	75 %	83816871
68	NC_007678	CAAG	2	8	28031	28038	50 %	0 %	25 %	25 %	83816871
69	NC_007678	TTGA	2	8	28077	28084	25 %	50 %	25 %	0 %	83816871
70	NC_007678	ACCC	2	8	28182	28189	25 %	0 %	0 %	75 %	83816871
71	NC_007678	CGGC	2	8	28281	28288	0 %	0 %	50 %	50 %	83816888
72	NC_007678	GAGC	2	8	28614	28621	25 %	0 %	50 %	25 %	83816889
73	NC_007678	ACTC	2	8	29277	29284	25 %	25 %	0 %	50 %	83816873
74	NC_007678	GCCA	2	8	29700	29707	25 %	0 %	25 %	50 %	83816877
75	NC_007678	CCGC	2	8	30006	30013	0 %	0 %	25 %	75 %	83816877
76	NC_007678	CGAG	2	8	30269	30276	25 %	0 %	50 %	25 %	83816877
77	NC_007678	GCCA	2	8	31303	31310	25 %	0 %	25 %	50 %	83816878
78	NC_007678	CCGG	2	8	31843	31850	0 %	0 %	50 %	50 %	83816878
79	NC_007678	TCGA	2	8	31912	31919	25 %	25 %	25 %	25 %	83816878
80	NC_007678	GTCG	2	8	32031	32038	0 %	25 %	50 %	25 %	83816878
81	NC_007678	TAAG	2	8	32742	32749	50 %	25 %	25 %	0 %	83816878
82	NC_007678	AAGG	2	8	33003	33010	50 %	0 %	50 %	0 %	83816878
83	NC_007678	TTGC	2	8	33051	33058	0 %	50 %	25 %	25 %	83816878
84	NC_007678	TGAG	2	8	34367	34374	25 %	25 %	50 %	0 %	83816870
85	NC_007678	GCTT	2	8	34763	34770	0 %	50 %	25 %	25 %	83816870
86	NC_007678	TCCG	2	8	34772	34779	0 %	25 %	25 %	50 %	83816870

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.