MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salinibacter ruber DSM 13855 plasmid pSR35

Total Repeats: 449

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007678	GAC	2	6	22	27	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816884
2	NC_007678	GTC	2	6	37	42	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816884
3	NC_007678	GAC	2	6	130	135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816884
4	NC_007678	GAG	2	6	145	150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83816884
5	NC_007678	GAG	2	6	220	225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83816884
6	NC_007678	ACT	2	6	237	242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83816884
7	NC_007678	CGA	2	6	273	278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816884
8	NC_007678	ACG	2	6	362	367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816884
9	NC_007678	GCT	2	6	468	473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816884
10	NC_007678	AGA	2	6	513	518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83816884
11	NC_007678	GTA	2	6	719	724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83816884
12	NC_007678	AGG	2	6	863	868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83816884
13	NC_007678	GAT	2	6	946	951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83816884
14	NC_007678	CAA	2	6	960	965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83816884
15	NC_007678	AAC	2	6	1602	1607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83816880
16	NC_007678	AGG	2	6	1633	1638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83816880
17	NC_007678	AGG	2	6	1642	1647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83816880
18	NC_007678	CCG	2	6	1751	1756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83816880
19	NC_007678	ATC	2	6	1767	1772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83816880
20	NC_007678	CGG	2	6	1875	1880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83816880
21	NC_007678	GGC	2	6	1888	1893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83816880
22	NC_007678	CGA	2	6	1927	1932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816880
23	NC_007678	GAG	2	6	2028	2033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83816880
24	NC_007678	CGG	2	6	2119	2124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83816880
25	NC_007678	CGT	2	6	2168	2173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816880
26	NC_007678	GGA	2	6	2348	2353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83816880
27	NC_007678	TTA	2	6	2383	2388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	83816880
28	NC_007678	CGC	2	6	2410	2415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83816880
29	NC_007678	CCG	2	6	2486	2491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83816880
30	NC_007678	AAG	2	6	2529	2534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83816880
31	NC_007678	GCC	2	6	2566	2571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83816880
32	NC_007678	AGA	2	6	2606	2611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83816880
33	NC_007678	GCG	2	6	2679	2684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83816880
34	NC_007678	CTC	2	6	3049	3054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83816872
35	NC_007678	TCA	2	6	3119	3124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83816872
36	NC_007678	CCT	2	6	3140	3145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83816872
37	NC_007678	CGA	2	6	3167	3172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816872
38	NC_007678	GGC	2	6	3175	3180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83816872
39	NC_007678	GAC	2	6	3225	3230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816872
40	NC_007678	TTC	2	6	3276	3281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83816872
41	NC_007678	AAC	3	9	3346	3354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83816872
42	NC_007678	ATG	2	6	3464	3469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83816872
43	NC_007678	TAG	2	6	3636	3641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83816872
44	NC_007678	TGA	2	6	3840	3845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83816872
45	NC_007678	ACG	2	6	4550	4555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816872
46	NC_007678	ATC	2	6	4657	4662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83816872
47	NC_007678	GAG	3	9	4663	4671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83816872
48	NC_007678	GGA	2	6	4788	4793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83816872
49	NC_007678	CGG	2	6	4874	4879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83816872
50	NC_007678	CCG	2	6	4934	4939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83816872
51	NC_007678	CCG	2	6	4946	4951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83816872
52	NC_007678	GAG	2	6	4972	4977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83816872
53	NC_007678	GCC	2	6	5038	5043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83816872
54	NC_007678	TGG	2	6	5063	5068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83816872
55	NC_007678	GCC	2	6	5087	5092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83816872
56	NC_007678	GAC	2	6	5161	5166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816872
57	NC_007678	TCC	2	6	5168	5173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83816872
58	NC_007678	ACG	2	6	5180	5185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816872
59	NC_007678	CTG	2	6	5291	5296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816872
60	NC_007678	GAC	2	6	5431	5436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816872
61	NC_007678	TAT	2	6	5467	5472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	83816872
62	NC_007678	ACG	2	6	5569	5574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816872
63	NC_007678	GGT	2	6	5676	5681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83816872
64	NC_007678	AGC	2	6	5738	5743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816872
65	NC_007678	CTT	2	6	5893	5898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83816872
66	NC_007678	CGA	2	6	5934	5939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816872
67	NC_007678	CGA	2	6	6009	6014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816872
68	NC_007678	CGA	2	6	6036	6041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816872
69	NC_007678	ACG	2	6	6134	6139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816872
70	NC_007678	GGA	2	6	6165	6170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83816872
71	NC_007678	CGG	2	6	6255	6260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83816872
72	NC_007678	CGT	2	6	6285	6290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816872
73	NC_007678	TCT	2	6	6370	6375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83816885
74	NC_007678	GAA	2	6	6452	6457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83816885
75	NC_007678	TCC	2	6	6460	6465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83816885
76	NC_007678	GCC	2	6	6486	6491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83816885
77	NC_007678	TCT	2	6	6498	6503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83816885
78	NC_007678	GCG	3	9	6548	6556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83816885
79	NC_007678	GAG	2	6	6568	6573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83816885
80	NC_007678	GGT	2	6	6574	6579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83816885
81	NC_007678	GAT	2	6	6583	6588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83816885
82	NC_007678	GAT	2	6	6598	6603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83816885
83	NC_007678	GGA	2	6	6604	6609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83816885
84	NC_007678	CCT	2	6	6737	6742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83816885
85	NC_007678	AGC	2	6	6790	6795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816885
86	NC_007678	CCG	2	6	6809	6814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83816885
87	NC_007678	CGT	2	6	6837	6842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816885
88	NC_007678	CGG	2	6	6845	6850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83816885
89	NC_007678	CCG	2	6	6872	6877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83816885
90	NC_007678	GGC	2	6	6975	6980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83816885
91	NC_007678	TCT	2	6	7018	7023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83816885
92	NC_007678	CGA	2	6	7080	7085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816885
93	NC_007678	CGT	2	6	7116	7121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816885
94	NC_007678	CGG	2	6	7127	7132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83816885
95	NC_007678	CCT	2	6	7286	7291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83816885
96	NC_007678	TAC	3	9	7378	7386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83816885
97	NC_007678	GCG	2	6	7409	7414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83816885
98	NC_007678	TTC	2	6	7553	7558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83816867
99	NC_007678	GAC	2	6	7621	7626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816867
100	NC_007678	TCG	2	6	7686	7691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816867
101	NC_007678	CGG	2	6	7697	7702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83816867
102	NC_007678	TCA	2	6	7867	7872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83816867
103	NC_007678	GAA	2	6	7880	7885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83816867
104	NC_007678	GCC	2	6	7887	7892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83816867
105	NC_007678	TCC	2	6	8898	8903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83816868
106	NC_007678	CCG	2	6	8935	8940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83816868
107	NC_007678	CGG	2	6	8945	8950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83816868
108	NC_007678	CTC	2	6	9368	9373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83816860
109	NC_007678	CGA	2	6	9376	9381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816860
110	NC_007678	ATC	2	6	9393	9398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83816860
111	NC_007678	AAG	2	6	9469	9474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83816860
112	NC_007678	TCG	2	6	10034	10039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816869
113	NC_007678	TGG	4	12	10299	10310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83816869
114	NC_007678	TGG	2	6	10368	10373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83816869
115	NC_007678	CAG	2	6	10404	10409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816869
116	NC_007678	CAG	3	9	10566	10574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816882
117	NC_007678	TCG	2	6	10603	10608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816882
118	NC_007678	GGA	2	6	10842	10847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83816882
119	NC_007678	GTG	2	6	10893	10898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83816882
120	NC_007678	TGA	2	6	10949	10954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83816882
121	NC_007678	CCT	2	6	10972	10977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83816882
122	NC_007678	TCT	2	6	10998	11003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83816882
123	NC_007678	ACG	2	6	11200	11205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816861
124	NC_007678	ATC	2	6	11215	11220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83816861
125	NC_007678	CTT	2	6	11336	11341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83816861
126	NC_007678	GCC	2	6	11453	11458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83816861
127	NC_007678	TTC	2	6	11478	11483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83816861
128	NC_007678	TCA	2	6	11555	11560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83816861
129	NC_007678	TTC	2	6	11694	11699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83816861
130	NC_007678	TCT	2	6	12294	12299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83816862
131	NC_007678	GGA	2	6	12349	12354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83816862
132	NC_007678	ACG	2	6	12405	12410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816862
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256	NC_007678	CGT	2	6	21252	21257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816879
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260	NC_007678	TCG	2	6	21745	21750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816874
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