MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salinibacter ruber DSM 13855 plasmid pSR35

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007678	AT	3	6	622	627	50 %	50 %	0 %	0 %	83816884
2	NC_007678	AG	3	6	1237	1242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007678	TC	3	6	1256	1261	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_007678	CT	3	6	1836	1841	0 %	50 %	0 %	50 %	83816880
5	NC_007678	GC	3	6	2327	2332	0 %	0 %	50 %	50 %	83816880
6	NC_007678	AG	3	6	2579	2584	50 %	0 %	50 %	0 %	83816880
7	NC_007678	TC	3	6	3486	3491	0 %	50 %	0 %	50 %	83816872
8	NC_007678	TC	3	6	4493	4498	0 %	50 %	0 %	50 %	83816872
9	NC_007678	CT	3	6	5388	5393	0 %	50 %	0 %	50 %	83816872
10	NC_007678	GC	3	6	6764	6769	0 %	0 %	50 %	50 %	83816885
11	NC_007678	GA	3	6	6866	6871	50 %	0 %	50 %	0 %	83816885
12	NC_007678	AG	4	8	7144	7151	50 %	0 %	50 %	0 %	83816885
13	NC_007678	AG	3	6	7416	7421	50 %	0 %	50 %	0 %	83816885
14	NC_007678	AG	3	6	9738	9743	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007678	TC	3	6	10146	10151	0 %	50 %	0 %	50 %	83816869
16	NC_007678	TC	4	8	10534	10541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_007678	GT	3	6	11314	11319	0 %	50 %	50 %	0 %	83816861
18	NC_007678	GA	3	6	11677	11682	50 %	0 %	50 %	0 %	83816861
19	NC_007678	AC	3	6	14031	14036	50 %	0 %	0 %	50 %	83816862
20	NC_007678	TC	3	6	15458	15463	0 %	50 %	0 %	50 %	83816886
21	NC_007678	GC	3	6	15687	15692	0 %	0 %	50 %	50 %	83816886
22	NC_007678	TC	3	6	16082	16087	0 %	50 %	0 %	50 %	83816865
23	NC_007678	CG	3	6	17024	17029	0 %	0 %	50 %	50 %	83816864
24	NC_007678	CT	3	6	17597	17602	0 %	50 %	0 %	50 %	83816864
25	NC_007678	TC	3	6	17975	17980	0 %	50 %	0 %	50 %	83816866
26	NC_007678	GC	3	6	18058	18063	0 %	0 %	50 %	50 %	83816858
27	NC_007678	CG	3	6	18389	18394	0 %	0 %	50 %	50 %	83816858
28	NC_007678	GA	3	6	18456	18461	50 %	0 %	50 %	0 %	83816858
29	NC_007678	GC	3	6	18753	18758	0 %	0 %	50 %	50 %	83816858
30	NC_007678	GC	3	6	19113	19118	0 %	0 %	50 %	50 %	83816858
31	NC_007678	GA	3	6	19907	19912	50 %	0 %	50 %	0 %	83816859
32	NC_007678	GC	4	8	20052	20059	0 %	0 %	50 %	50 %	83816859
33	NC_007678	TC	3	6	20408	20413	0 %	50 %	0 %	50 %	83816883
34	NC_007678	TC	3	6	20420	20425	0 %	50 %	0 %	50 %	83816883
35	NC_007678	CG	3	6	20745	20750	0 %	0 %	50 %	50 %	83816883
36	NC_007678	CT	3	6	21365	21370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_007678	CT	3	6	21521	21526	0 %	50 %	0 %	50 %	83816874
38	NC_007678	TC	3	6	21587	21592	0 %	50 %	0 %	50 %	83816874
39	NC_007678	AT	3	6	21763	21768	50 %	50 %	0 %	0 %	83816874
40	NC_007678	GA	3	6	22077	22082	50 %	0 %	50 %	0 %	83816874
41	NC_007678	CG	3	6	22331	22336	0 %	0 %	50 %	50 %	83816876
42	NC_007678	GC	3	6	22351	22356	0 %	0 %	50 %	50 %	83816876
43	NC_007678	GA	3	6	22358	22363	50 %	0 %	50 %	0 %	83816876
44	NC_007678	CG	3	6	22442	22447	0 %	0 %	50 %	50 %	83816876
45	NC_007678	TG	3	6	23562	23567	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007678	GC	3	6	23928	23933	0 %	0 %	50 %	50 %	83816881
47	NC_007678	TA	3	6	25434	25439	50 %	50 %	0 %	0 %	83816871
48	NC_007678	TC	3	6	26252	26257	0 %	50 %	0 %	50 %	83816871
49	NC_007678	CT	3	6	26525	26530	0 %	50 %	0 %	50 %	83816871
50	NC_007678	GA	3	6	26809	26814	50 %	0 %	50 %	0 %	83816871
51	NC_007678	GA	3	6	26899	26904	50 %	0 %	50 %	0 %	83816871
52	NC_007678	CA	3	6	27071	27076	50 %	0 %	0 %	50 %	83816871
53	NC_007678	AT	3	6	27302	27307	50 %	50 %	0 %	0 %	83816871
54	NC_007678	GT	3	6	27403	27408	0 %	50 %	50 %	0 %	83816871
55	NC_007678	CT	3	6	30016	30021	0 %	50 %	0 %	50 %	83816877
56	NC_007678	TG	3	6	30366	30371	0 %	50 %	50 %	0 %	83816877
57	NC_007678	GC	3	6	30448	30453	0 %	0 %	50 %	50 %	83816877
58	NC_007678	CT	3	6	31099	31104	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_007678	GT	3	6	31119	31124	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007678	GA	3	6	31347	31352	50 %	0 %	50 %	0 %	83816878
61	NC_007678	CT	3	6	31503	31508	0 %	50 %	0 %	50 %	83816878
62	NC_007678	CG	3	6	31695	31700	0 %	0 %	50 %	50 %	83816878
63	NC_007678	GC	3	6	31724	31729	0 %	0 %	50 %	50 %	83816878
64	NC_007678	TC	3	6	31970	31975	0 %	50 %	0 %	50 %	83816878
65	NC_007678	TC	3	6	32657	32662	0 %	50 %	0 %	50 %	83816878
66	NC_007678	TG	5	10	33796	33805	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007678	GA	3	6	34922	34927	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007678	TC	3	6	34962	34967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_007678	TC	3	6	35063	35068	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_007678	TC	3	6	35085	35090	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_007678	TC	3	6	35107	35112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_007678	TC	3	6	35129	35134	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_007678	TC	3	6	35150	35155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_007678	GA	3	6	35203	35208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007678	GA	3	6	35343	35348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007678	TC	3	6	35439	35444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.