MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Salinibacter ruber DSM 13855 chromosome

Total Repeats: 164

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007677	TCGGCG	2	12	10222	10233	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007677	CCAAAT	2	12	15797	15808	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007677	CCGCGG	2	12	23330	23341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_007677	CCCGGC	2	12	50362	50373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_007677	CTCGTT	2	12	56184	56195	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007677	TTCCAC	2	12	57370	57381	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_007677	GGGGAG	2	12	65206	65217	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007677	CGTGCA	2	12	70848	70859	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007677	GTTGAG	2	12	77711	77722	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007677	AATCGG	2	12	81264	81275	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_007677	GAAAGA	2	12	81439	81450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007677	AGGGGA	2	12	88306	88317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007677	TCTGCT	2	12	146221	146232	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007677	CATTGC	2	12	179690	179701	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007677	GGCCGA	2	12	185748	185759	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007677	GAAGCT	2	12	187044	187055	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_007677	TCTCGT	2	12	192894	192905	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007677	GCGTTG	2	12	213005	213016	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_007677	CACGTG	2	12	220431	220442	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007677	CATGCA	2	12	235440	235451	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007677	AGCGAG	2	12	258072	258083	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_007677	TCTGGA	2	12	265695	265706	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_007677	CACAAA	2	12	292401	292412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007677	CCTCGA	2	12	302116	302127	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_007677	ACGCGC	2	12	306457	306468	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_007677	CTCGAC	2	12	309227	309238	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
27	NC_007677	TATAGT	2	12	313682	313693	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007677	CGGTCA	2	12	317304	317315	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007677	CGGCGC	2	12	319390	319401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_007677	CGCTGG	2	12	324249	324260	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007677	CCGATC	2	12	324301	324312	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_007677	TCGCTC	2	12	326306	326317	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007677	CCAGAG	2	12	333063	333074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007677	TGGGGA	2	12	340953	340964	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007677	CTTCCA	2	12	342635	342646	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_007677	TATTCA	2	12	351004	351015	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_007677	GCCCCC	2	12	352382	352393	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
38	NC_007677	GGGCCT	2	12	353361	353372	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007677	CTTCCA	2	12	360422	360433	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_007677	CCGTGA	2	12	367708	367719	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007677	CCGGGC	2	12	369455	369466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_007677	AGGCGC	2	12	374295	374306	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_007677	TGCCCC	2	12	374444	374455	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_007677	GGACGA	2	12	398228	398239	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_007677	TCAGCG	2	12	398461	398472	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007677	GGCGTG	2	12	472024	472035	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_007677	TCGCCT	2	12	490619	490630	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_007677	GGGGGA	2	12	562444	562455	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007677	CGCCCA	2	12	562594	562605	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_007677	TCGGGA	2	12	565795	565806	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_007677	CGTGTG	2	12	591244	591255	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_007677	GTGGCC	2	12	621103	621114	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007677	TGCTGT	2	12	668126	668137	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_007677	GGGCGG	2	12	695209	695220	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_007677	GATTTT	2	12	716947	716958	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007677	GCCGAC	2	12	724726	724737	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_007677	ACCCGC	2	12	729228	729239	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_007677	CCCACT	2	12	729799	729810	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_007677	AGGGCC	2	12	762002	762013	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007677	GATTTC	2	12	805437	805448	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_007677	AAGAGG	2	12	827049	827060	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007677	GGTGCA	2	12	839066	839077	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_007677	GGTATT	2	12	904161	904172	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007677	GTCCGG	2	12	904218	904229	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007677	CGTGCA	2	12	907164	907175	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_007677	CACAGG	2	12	910166	910177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_007677	GATTCC	2	12	913144	913155	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007677	GTCCGG	2	12	983620	983631	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007677	GTTCGG	2	12	985320	985331	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_007677	AGGGGG	2	12	1006395	1006406	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007677	AGCTCC	2	12	1023011	1023022	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_007677	TGGAGC	2	12	1060979	1060990	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_007677	GGGGGC	2	12	1068769	1068780	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_007677	CAGGAT	2	12	1076901	1076912	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_007677	CTTCGT	2	12	1079925	1079936	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007677	GAAATG	2	12	1133247	1133258	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007677	ACCGGG	2	12	1164029	1164040	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007677	GTCGGG	2	12	1193727	1193738	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_007677	GGGGCA	2	12	1206161	1206172	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_007677	GAAGGG	2	12	1299539	1299550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007677	GCCCTC	2	12	1327286	1327297	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_007677	CGCACG	2	12	1329462	1329473	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
83	NC_007677	GAAGCA	2	12	1354604	1354615	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_007677	ATCGGG	2	12	1355314	1355325	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_007677	AAAATT	2	12	1355516	1355527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007677	CTCGCC	2	12	1365997	1366008	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_007677	CTCATA	2	12	1380266	1380277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007677	ACGCCG	2	12	1406477	1406488	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_007677	TCCGCT	2	12	1411975	1411986	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_007677	TCGGCG	2	12	1429145	1429156	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007677	GCCCCC	2	12	1429816	1429827	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
92	NC_007677	GTCCGT	2	12	1429863	1429874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_007677	TGGGGC	2	12	1434252	1434263	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_007677	GGGGAG	2	12	1442760	1442771	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007677	GGGGTT	2	12	1449453	1449464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007677	GAGCCT	2	12	1519904	1519915	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_007677	CTCACG	2	12	1559725	1559736	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_007677	CCAGGC	2	12	1603464	1603475	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
99	NC_007677	CGAACG	2	12	1607172	1607183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007677	GACGAA	2	12	1611031	1611042	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_007677	GAAACT	2	12	1620167	1620178	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_007677	CTTTCG	2	12	1638023	1638034	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_007677	GGCCCA	2	12	1660083	1660094	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
104	NC_007677	GCTGGG	2	12	1740091	1740102	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_007677	CACGAG	2	12	1759600	1759611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_007677	AGTACG	2	12	1769891	1769902	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_007677	AGCGGC	2	12	1779287	1779298	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007677	CGCGTC	2	12	1785957	1785968	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
109	NC_007677	CCTGCG	2	12	1828853	1828864	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
110	NC_007677	CCCCAC	2	12	1915459	1915470	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
111	NC_007677	CCTGCG	2	12	1973372	1973383	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_007677	GCGGTG	2	12	1995325	1995336	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_007677	AGCATC	2	12	2051730	2051741	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_007677	CTCGTT	2	12	2060511	2060522	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_007677	GTCGCG	2	12	2063334	2063345	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007677	CCCACT	2	12	2089817	2089828	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_007677	CGGCAC	2	12	2142360	2142371	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
118	NC_007677	GGGCGA	2	12	2149870	2149881	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_007677	TCTCGC	2	12	2188987	2188998	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
120	NC_007677	CGGCGT	2	12	2194503	2194514	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007677	TGGGCG	2	12	2331974	2331985	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_007677	TCTCCA	2	12	2336373	2336384	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_007677	CGGGGC	2	12	2381868	2381879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_007677	CCTGCG	3	18	2460144	2460161	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
125	NC_007677	CCAGAT	2	12	2501580	2501591	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_007677	CACGAG	2	12	2503201	2503212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_007677	GACCGT	2	12	2530937	2530948	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_007677	GCAGGG	2	12	2572518	2572529	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_007677	CGGGCG	2	12	2639727	2639738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_007677	TCCGGA	2	12	2682531	2682542	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007677	GCTCCC	2	12	2693100	2693111	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_007677	AGGGAG	2	12	2699607	2699618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007677	GCCCCA	2	12	2743478	2743489	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_007677	CCCACA	2	12	2773989	2774000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_007677	TCCGTC	2	12	2797056	2797067	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
136	NC_007677	CCGCCA	2	12	2830486	2830497	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_007677	AAGCGC	2	12	2841518	2841529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_007677	CGCCCA	2	12	2854357	2854368	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_007677	CCTCAG	2	12	2865208	2865219	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
140	NC_007677	CGGGCG	2	12	2874797	2874808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_007677	AAAACT	2	12	2965996	2966007	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_007677	CCTCCC	2	12	2969705	2969716	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
143	NC_007677	TCGGCC	2	12	2988566	2988577	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
144	NC_007677	TCCTGC	2	12	3005423	3005434	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
145	NC_007677	GGGCCT	2	12	3016823	3016834	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_007677	CCCAAA	2	12	3029835	3029846	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_007677	CAGACG	2	12	3182446	3182457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_007677	CGCGAT	2	12	3212977	3212988	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_007677	TCCCGT	2	12	3215783	3215794	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
150	NC_007677	TCGAGG	2	12	3232249	3232260	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_007677	CCCCCG	2	12	3259160	3259171	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
152	NC_007677	CGGACC	2	12	3263932	3263943	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
153	NC_007677	GGGGAC	2	12	3269945	3269956	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_007677	TCCCCC	2	12	3278758	3278769	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
155	NC_007677	ACGCCC	2	12	3292039	3292050	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_007677	GAGGGC	2	12	3315133	3315144	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
157	NC_007677	TTCGAC	2	12	3327605	3327616	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_007677	CGTCCG	2	12	3395183	3395194	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
159	NC_007677	CAGGGG	2	12	3441297	3441308	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
160	NC_007677	ACCCCC	2	12	3443183	3443194	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
161	NC_007677	GCCTCC	2	12	3505083	3505094	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
162	NC_007677	CCCGCC	2	12	3526526	3526537	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
163	NC_007677	GGAGGG	2	12	3536875	3536886	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_007677	TCGTCT	2	12	3551763	3551774	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.