MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salinibacter ruber DSM 13855 chromosome

Total Repeats: 2545

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007677	CCGGC	2	10	311	320	0 %	0 %	40 %	60 %	83815237
2	NC_007677	TCCAG	2	10	496	505	20 %	20 %	20 %	40 %	83815237
3	NC_007677	GCCCC	2	10	5157	5166	0 %	0 %	20 %	80 %	83814655
4	NC_007677	GTTCG	2	10	5185	5194	0 %	40 %	40 %	20 %	83814655
5	NC_007677	CCCAC	2	10	5711	5720	20 %	0 %	0 %	80 %	83814655
6	NC_007677	CAAGA	2	10	6623	6632	60 %	0 %	20 %	20 %	83814221
7	NC_007677	CTCGA	2	10	6702	6711	20 %	20 %	20 %	40 %	83814221
8	NC_007677	GGCCC	2	10	7751	7760	0 %	0 %	40 %	60 %	83815955
9	NC_007677	CTCGC	2	10	9704	9713	0 %	20 %	20 %	60 %	83816549
10	NC_007677	CGACG	2	10	15925	15934	20 %	0 %	40 %	40 %	83816060
11	NC_007677	GTCCT	2	10	18675	18684	0 %	40 %	20 %	40 %	83814512
12	NC_007677	TCGTT	2	10	20799	20808	0 %	60 %	20 %	20 %	83815798
13	NC_007677	GCCCG	2	10	26534	26543	0 %	0 %	40 %	60 %	83816180
14	NC_007677	CGCGC	2	10	27564	27573	0 %	0 %	40 %	60 %	83814400
15	NC_007677	GCCCG	2	10	27686	27695	0 %	0 %	40 %	60 %	83814400
16	NC_007677	GAGCG	2	10	29200	29209	20 %	0 %	60 %	20 %	83815961
17	NC_007677	GGCAA	2	10	38065	38074	40 %	0 %	40 %	20 %	83814585
18	NC_007677	CACCT	2	10	38878	38887	20 %	20 %	0 %	60 %	83814585
19	NC_007677	GCCGA	2	10	39693	39702	20 %	0 %	40 %	40 %	83816635
20	NC_007677	ACAGG	2	10	39822	39831	40 %	0 %	40 %	20 %	83816635
21	NC_007677	CGCCC	2	10	45093	45102	0 %	0 %	20 %	80 %	83816345
22	NC_007677	GCCCG	2	10	45820	45829	0 %	0 %	40 %	60 %	83814678
23	NC_007677	CGTTC	2	10	46167	46176	0 %	40 %	20 %	40 %	83816340
24	NC_007677	GCGCG	2	10	48176	48185	0 %	0 %	60 %	40 %	83815928
25	NC_007677	GGCCG	2	10	48701	48710	0 %	0 %	60 %	40 %	83815928
26	NC_007677	CCAGC	2	10	49635	49644	20 %	0 %	20 %	60 %	83814408
27	NC_007677	TCCGC	2	10	50422	50431	0 %	20 %	20 %	60 %	83816022
28	NC_007677	CGCAG	2	10	50745	50754	20 %	0 %	40 %	40 %	83816022
29	NC_007677	AGACG	2	10	53160	53169	40 %	0 %	40 %	20 %	83815382
30	NC_007677	GCGCC	2	10	53439	53448	0 %	0 %	40 %	60 %	83815382
31	NC_007677	TACGC	2	10	54817	54826	20 %	20 %	20 %	40 %	83814393
32	NC_007677	GCGCC	2	10	57987	57996	0 %	0 %	40 %	60 %	83815019
33	NC_007677	CCGGC	2	10	58707	58716	0 %	0 %	40 %	60 %	83815019
34	NC_007677	GCCTC	2	10	59063	59072	0 %	20 %	20 %	60 %	83815019
35	NC_007677	TCGCG	2	10	60978	60987	0 %	20 %	40 %	40 %	83815935
36	NC_007677	CTCGT	2	10	62647	62656	0 %	40 %	20 %	40 %	83816849
37	NC_007677	TCGCG	2	10	62663	62672	0 %	20 %	40 %	40 %	83816849
38	NC_007677	ACCCG	2	10	65604	65613	20 %	0 %	20 %	60 %	83814652
39	NC_007677	CGGGG	2	10	65800	65809	0 %	0 %	80 %	20 %	83814652
40	NC_007677	TCGCG	2	10	67077	67086	0 %	20 %	40 %	40 %	83815682
41	NC_007677	ACGAG	2	10	68894	68903	40 %	0 %	40 %	20 %	83814071
42	NC_007677	CCGCC	2	10	72049	72058	0 %	0 %	20 %	80 %	83814830
43	NC_007677	CGACG	2	10	72239	72248	20 %	0 %	40 %	40 %	83814830
44	NC_007677	GCACC	2	10	72401	72410	20 %	0 %	20 %	60 %	83814830
45	NC_007677	CGGCG	2	10	72716	72725	0 %	0 %	60 %	40 %	83814830
46	NC_007677	GGCCA	2	10	76310	76319	20 %	0 %	40 %	40 %	83814430
47	NC_007677	GCGCC	2	10	76969	76978	0 %	0 %	40 %	60 %	83814430
48	NC_007677	GCCGT	2	10	82968	82977	0 %	20 %	40 %	40 %	83815139
49	NC_007677	CCGGC	2	10	83611	83620	0 %	0 %	40 %	60 %	83815139
50	NC_007677	GAAGG	2	10	84431	84440	40 %	0 %	60 %	0 %	83815139
51	NC_007677	GTTTC	2	10	85112	85121	0 %	60 %	20 %	20 %	83815858
52	NC_007677	GGACG	2	10	86081	86090	20 %	0 %	60 %	20 %	83815858
53	NC_007677	CTCCG	2	10	86513	86522	0 %	20 %	20 %	60 %	83815858
54	NC_007677	ATCGA	2	10	87058	87067	40 %	20 %	20 %	20 %	83815858
55	NC_007677	GGCGC	2	10	87978	87987	0 %	0 %	60 %	40 %	83815394
56	NC_007677	GTGGG	2	10	88442	88451	0 %	20 %	80 %	0 %	161986637
57	NC_007677	CTCGT	2	10	89072	89081	0 %	40 %	20 %	40 %	161986637
58	NC_007677	CGGCG	2	10	89595	89604	0 %	0 %	60 %	40 %	161986637
59	NC_007677	GGGAC	2	10	90088	90097	20 %	0 %	60 %	20 %	83814146
60	NC_007677	AGCTG	2	10	90119	90128	20 %	20 %	40 %	20 %	83814146
61	NC_007677	CGGCG	2	10	92036	92045	0 %	0 %	60 %	40 %	161986629
62	NC_007677	CGGTC	2	10	92566	92575	0 %	20 %	40 %	40 %	83815544
63	NC_007677	GTGGA	2	10	92730	92739	20 %	20 %	60 %	0 %	83815544
64	NC_007677	TCGGG	2	10	94129	94138	0 %	20 %	60 %	20 %	83815544
65	NC_007677	CTTCG	2	10	96956	96965	0 %	40 %	20 %	40 %	83814983
66	NC_007677	GGGCG	2	10	99895	99904	0 %	0 %	80 %	20 %	83816237
67	NC_007677	CGGGG	2	10	101345	101354	0 %	0 %	80 %	20 %	83814905
68	NC_007677	GCTCA	2	10	105708	105717	20 %	20 %	20 %	40 %	83814131
69	NC_007677	GAGCG	2	10	106698	106707	20 %	0 %	60 %	20 %	83814131
70	NC_007677	ACCGA	2	10	107271	107280	40 %	0 %	20 %	40 %	83814131
71	NC_007677	CGCCC	2	10	109019	109028	0 %	0 %	20 %	80 %	83816514
72	NC_007677	CAGTG	2	10	111114	111123	20 %	20 %	40 %	20 %	83815223
73	NC_007677	GCCGG	2	10	112579	112588	0 %	0 %	60 %	40 %	83816801
74	NC_007677	GGACG	2	10	116733	116742	20 %	0 %	60 %	20 %	83816233
75	NC_007677	CGGGC	2	10	116929	116938	0 %	0 %	60 %	40 %	83816233
76	NC_007677	CCCAC	2	10	118136	118145	20 %	0 %	0 %	80 %	83814357
77	NC_007677	ACGCC	2	10	118220	118229	20 %	0 %	20 %	60 %	83814357
78	NC_007677	CAGCA	2	10	118951	118960	40 %	0 %	20 %	40 %	83814357
79	NC_007677	GATCA	2	10	126158	126167	40 %	20 %	20 %	20 %	83816843
80	NC_007677	GGGCG	2	10	126751	126760	0 %	0 %	80 %	20 %	83816843
81	NC_007677	GGCTG	2	10	127093	127102	0 %	20 %	60 %	20 %	83816843
82	NC_007677	CAGCG	2	10	128090	128099	20 %	0 %	40 %	40 %	83814670
83	NC_007677	GCCGA	2	10	128982	128991	20 %	0 %	40 %	40 %	83814670
84	NC_007677	GCGAA	2	10	130366	130375	40 %	0 %	40 %	20 %	83815813
85	NC_007677	AGGAG	2	10	132141	132150	40 %	0 %	60 %	0 %	83816358
86	NC_007677	AAAAC	2	10	132896	132905	80 %	0 %	0 %	20 %	83814626
87	NC_007677	GGCAG	2	10	133759	133768	20 %	0 %	60 %	20 %	83814626
88	NC_007677	GGCGC	2	10	134549	134558	0 %	0 %	60 %	40 %	83816505
89	NC_007677	CGGTC	2	10	136184	136193	0 %	20 %	40 %	40 %	83814808
90	NC_007677	ACAGA	2	10	136325	136334	60 %	0 %	20 %	20 %	83814808
91	NC_007677	GCCGG	2	10	136809	136818	0 %	0 %	60 %	40 %	83814808
92	NC_007677	CGACG	2	10	137109	137118	20 %	0 %	40 %	40 %	83814808
93	NC_007677	CGACG	2	10	141613	141622	20 %	0 %	40 %	40 %	83815585
94	NC_007677	GCGCC	2	10	142399	142408	0 %	0 %	40 %	60 %	83815585
95	NC_007677	CGGGC	2	10	143006	143015	0 %	0 %	60 %	40 %	83815585
96	NC_007677	CGGCC	2	10	143932	143941	0 %	0 %	40 %	60 %	83815585
97	NC_007677	TGCCC	2	10	145076	145085	0 %	20 %	20 %	60 %	83814934
98	NC_007677	CGATT	2	10	147160	147169	20 %	40 %	20 %	20 %	83814475
99	NC_007677	GCAGT	2	10	151044	151053	20 %	20 %	40 %	20 %	83815760
100	NC_007677	CGGAT	2	10	152282	152291	20 %	20 %	40 %	20 %	83816200
101	NC_007677	CGTCC	2	10	152374	152383	0 %	20 %	20 %	60 %	83816200
102	NC_007677	GACCG	2	10	152429	152438	20 %	0 %	40 %	40 %	83816200
103	NC_007677	CGACA	2	10	153489	153498	40 %	0 %	20 %	40 %	83814604
104	NC_007677	GGACG	2	10	154613	154622	20 %	0 %	60 %	20 %	83814604
105	NC_007677	GACCT	2	10	155395	155404	20 %	20 %	20 %	40 %	83814604
106	NC_007677	CGGAA	2	10	158600	158609	40 %	0 %	40 %	20 %	83815899
107	NC_007677	GATCG	2	10	158618	158627	20 %	20 %	40 %	20 %	83815899
108	NC_007677	GGACG	2	10	163076	163085	20 %	0 %	60 %	20 %	83816090
109	NC_007677	CTTCG	2	10	164038	164047	0 %	40 %	20 %	40 %	83816695
110	NC_007677	TCGAG	2	10	164223	164232	20 %	20 %	40 %	20 %	83816695
111	NC_007677	CGGGA	2	10	167623	167632	20 %	0 %	60 %	20 %	83814867
112	NC_007677	CGAAA	2	10	169153	169162	60 %	0 %	20 %	20 %	83815452
113	NC_007677	AATCG	2	10	170636	170645	40 %	20 %	20 %	20 %	83816088
114	NC_007677	CAAAA	2	10	171057	171066	80 %	0 %	0 %	20 %	83816088
115	NC_007677	GCCCC	2	10	171790	171799	0 %	0 %	20 %	80 %	83814239
116	NC_007677	CGTTC	2	10	171862	171871	0 %	40 %	20 %	40 %	83814239
117	NC_007677	CGGTC	2	10	171991	172000	0 %	20 %	40 %	40 %	83814239
118	NC_007677	CGCGG	2	10	175238	175247	0 %	0 %	60 %	40 %	83816554
119	NC_007677	GGCCG	2	10	178151	178160	0 %	0 %	60 %	40 %	83814671
120	NC_007677	CGTGG	2	10	182397	182406	0 %	20 %	60 %	20 %	83815335
121	NC_007677	CGGAC	2	10	182530	182539	20 %	0 %	40 %	40 %	83815335
122	NC_007677	TGGGT	2	10	183103	183112	0 %	40 %	60 %	0 %	83815625
123	NC_007677	GGCCG	2	10	183408	183417	0 %	0 %	60 %	40 %	83815625
124	NC_007677	ACGGC	2	10	183847	183856	20 %	0 %	40 %	40 %	83815571
125	NC_007677	CGGTC	2	10	188535	188544	0 %	20 %	40 %	40 %	83816481
126	NC_007677	TGAGC	2	10	188565	188574	20 %	20 %	40 %	20 %	83816481
127	NC_007677	AGCGA	2	10	188641	188650	40 %	0 %	40 %	20 %	83816481
128	NC_007677	CCGCG	2	10	189554	189563	0 %	0 %	40 %	60 %	83814134
129	NC_007677	TCCGG	2	10	192338	192347	0 %	20 %	40 %	40 %	83814894
130	NC_007677	CCTGG	2	10	193243	193252	0 %	20 %	40 %	40 %	83815477
131	NC_007677	GCGCC	2	10	194683	194692	0 %	0 %	40 %	60 %	83815477
132	NC_007677	GGCCG	2	10	196753	196762	0 %	0 %	60 %	40 %	83816430
133	NC_007677	GCTCG	2	10	196891	196900	0 %	20 %	40 %	40 %	83816430
134	NC_007677	GCGGT	2	10	200382	200391	0 %	20 %	60 %	20 %	83816430
135	NC_007677	CTGGG	2	10	200538	200547	0 %	20 %	60 %	20 %	83816430
136	NC_007677	CACCG	2	10	201408	201417	20 %	0 %	20 %	60 %	83814797
137	NC_007677	GCCCC	2	10	201842	201851	0 %	0 %	20 %	80 %	83814797
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