MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salinibacter ruber DSM 13855 chromosome

Total Repeats: 10047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007677	CGCC	2	8	420	427	0 %	0 %	25 %	75 %	83815237
2	NC_007677	GCCC	2	8	443	450	0 %	0 %	25 %	75 %	83815237
3	NC_007677	GCAG	2	8	460	467	25 %	0 %	50 %	25 %	83815237
4	NC_007677	CTCG	2	8	605	612	0 %	25 %	25 %	50 %	83815237
5	NC_007677	GGAT	2	8	2013	2020	25 %	25 %	50 %	0 %	83814447
6	NC_007677	CGAC	2	8	2232	2239	25 %	0 %	25 %	50 %	83814447
7	NC_007677	CGGT	2	8	3168	3175	0 %	25 %	50 %	25 %	83816215
8	NC_007677	GGAG	2	8	3767	3774	25 %	0 %	75 %	0 %	83816215
9	NC_007677	CGAC	2	8	3805	3812	25 %	0 %	25 %	50 %	83816215
10	NC_007677	TCAT	2	8	3924	3931	25 %	50 %	0 %	25 %	83816215
11	NC_007677	TCGA	2	8	4448	4455	25 %	25 %	25 %	25 %	83815766
12	NC_007677	CGGA	2	8	4602	4609	25 %	0 %	50 %	25 %	83815766
13	NC_007677	TTCG	2	8	4729	4736	0 %	50 %	25 %	25 %	83815766
14	NC_007677	CGAT	2	8	4769	4776	25 %	25 %	25 %	25 %	83815766
15	NC_007677	GGCG	2	8	5145	5152	0 %	0 %	75 %	25 %	83814655
16	NC_007677	TCAG	2	8	5369	5376	25 %	25 %	25 %	25 %	83814655
17	NC_007677	CGGC	2	8	5489	5496	0 %	0 %	50 %	50 %	83814655
18	NC_007677	GGCG	2	8	6934	6941	0 %	0 %	75 %	25 %	83814221
19	NC_007677	GGAC	2	8	7206	7213	25 %	0 %	50 %	25 %	83815955
20	NC_007677	AGGC	2	8	7842	7849	25 %	0 %	50 %	25 %	83815955
21	NC_007677	GCTC	2	8	8097	8104	0 %	25 %	25 %	50 %	83815163
22	NC_007677	ATTC	2	8	8248	8255	25 %	50 %	0 %	25 %	83815163
23	NC_007677	CGTG	2	8	8312	8319	0 %	25 %	50 %	25 %	83815163
24	NC_007677	GACG	2	8	8511	8518	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_007677	TCCT	2	8	8649	8656	0 %	50 %	0 %	50 %	83814509
26	NC_007677	CACG	2	8	8719	8726	25 %	0 %	25 %	50 %	83814509
27	NC_007677	AGCA	2	8	8777	8784	50 %	0 %	25 %	25 %	83814509
28	NC_007677	CCGC	2	8	9332	9339	0 %	0 %	25 %	75 %	83816549
29	NC_007677	CGGG	2	8	9630	9637	0 %	0 %	75 %	25 %	83816549
30	NC_007677	CTCG	2	8	9666	9673	0 %	25 %	25 %	50 %	83816549
31	NC_007677	GAAG	2	8	11314	11321	50 %	0 %	50 %	0 %	83814252
32	NC_007677	GCCC	2	8	11531	11538	0 %	0 %	25 %	75 %	83814252
33	NC_007677	CCGG	2	8	11639	11646	0 %	0 %	50 %	50 %	83814252
34	NC_007677	GCGG	2	8	11788	11795	0 %	0 %	75 %	25 %	83814252
35	NC_007677	TCGT	2	8	12395	12402	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_007677	CTGG	2	8	12518	12525	0 %	25 %	50 %	25 %	83814077
37	NC_007677	GGCC	2	8	12535	12542	0 %	0 %	50 %	50 %	83814077
38	NC_007677	GGAT	2	8	13128	13135	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007677	ACGA	2	8	13452	13459	50 %	0 %	25 %	25 %	83816444
40	NC_007677	CGTA	2	8	13525	13532	25 %	25 %	25 %	25 %	83816444
41	NC_007677	GCCC	2	8	14189	14196	0 %	0 %	25 %	75 %	83816444
42	NC_007677	CGAC	2	8	14377	14384	25 %	0 %	25 %	50 %	83816444
43	NC_007677	ACCC	2	8	14385	14392	25 %	0 %	0 %	75 %	83816444
44	NC_007677	CGAC	2	8	14698	14705	25 %	0 %	25 %	50 %	83816444
45	NC_007677	GTAC	2	8	14980	14987	25 %	25 %	25 %	25 %	83816444
46	NC_007677	GATG	2	8	15439	15446	25 %	25 %	50 %	0 %	83816444
47	NC_007677	GACA	2	8	15739	15746	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_007677	ACGG	2	8	15782	15789	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_007677	TTTC	2	8	16420	16427	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_007677	TGAG	2	8	17713	17720	25 %	25 %	50 %	0 %	83815143
51	NC_007677	GGCT	2	8	18188	18195	0 %	25 %	50 %	25 %	83815143
52	NC_007677	CGAC	2	8	18343	18350	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_007677	ATTT	2	8	18476	18483	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007677	GGGC	2	8	18589	18596	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_007677	CGTT	2	8	18715	18722	0 %	50 %	25 %	25 %	83814512
56	NC_007677	GGGC	2	8	18762	18769	0 %	0 %	75 %	25 %	83814512
57	NC_007677	CGGC	2	8	19005	19012	0 %	0 %	50 %	50 %	83814512
58	NC_007677	GAGC	2	8	19093	19100	25 %	0 %	50 %	25 %	83814512
59	NC_007677	CCGC	2	8	19122	19129	0 %	0 %	25 %	75 %	83814512
60	NC_007677	CGGA	2	8	19419	19426	25 %	0 %	50 %	25 %	83814512
61	NC_007677	CGAC	2	8	19611	19618	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_007677	TCGC	2	8	19881	19888	0 %	25 %	25 %	50 %	83815798
63	NC_007677	GACC	2	8	20401	20408	25 %	0 %	25 %	50 %	83815798
64	NC_007677	CAAC	3	12	22311	22322	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_007677	ACCC	2	8	22745	22752	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
66	NC_007677	TCGA	2	8	23713	23720	25 %	25 %	25 %	25 %	83815576
67	NC_007677	GAGC	2	8	23838	23845	25 %	0 %	50 %	25 %	83815576
68	NC_007677	GCCG	2	8	24042	24049	0 %	0 %	50 %	50 %	83815576
69	NC_007677	CGTC	2	8	25234	25241	0 %	25 %	25 %	50 %	83815576
70	NC_007677	TGCT	2	8	25780	25787	0 %	50 %	25 %	25 %	83815576
71	NC_007677	GGAC	2	8	25862	25869	25 %	0 %	50 %	25 %	83815576
72	NC_007677	GGAA	2	8	26041	26048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007677	CGTC	2	8	26145	26152	0 %	25 %	25 %	50 %	83816180
74	NC_007677	TTCG	2	8	26157	26164	0 %	50 %	25 %	25 %	83816180
75	NC_007677	GAGG	2	8	26310	26317	25 %	0 %	75 %	0 %	83816180
76	NC_007677	CGGA	2	8	26373	26380	25 %	0 %	50 %	25 %	83816180
77	NC_007677	AGGG	2	8	26770	26777	25 %	0 %	75 %	0 %	83816180
78	NC_007677	GGCG	2	8	27056	27063	0 %	0 %	75 %	25 %	83814400
79	NC_007677	GCGG	2	8	27921	27928	0 %	0 %	75 %	25 %	83814400
80	NC_007677	CGGT	2	8	28314	28321	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_007677	GTCC	2	8	28423	28430	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007677	TGCC	2	8	28881	28888	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_007677	CGTC	2	8	29312	29319	0 %	25 %	25 %	50 %	83815961
84	NC_007677	GGGC	2	8	29326	29333	0 %	0 %	75 %	25 %	83815961
85	NC_007677	CGGC	2	8	30028	30035	0 %	0 %	50 %	50 %	83815150
86	NC_007677	GATC	2	8	30106	30113	25 %	25 %	25 %	25 %	83815150
87	NC_007677	GGGA	2	8	30556	30563	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007677	CGGG	2	8	30648	30655	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
89	NC_007677	CGAT	2	8	31501	31508	25 %	25 %	25 %	25 %	83816709
90	NC_007677	GTCG	2	8	31647	31654	0 %	25 %	50 %	25 %	83816709
91	NC_007677	GGGA	2	8	33131	33138	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007677	CTTC	2	8	33208	33215	0 %	50 %	0 %	50 %	83815455
93	NC_007677	TCGA	2	8	33276	33283	25 %	25 %	25 %	25 %	83815455
94	NC_007677	GAAC	2	8	34375	34382	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_007677	CCCG	2	8	34956	34963	0 %	0 %	25 %	75 %	83814640
96	NC_007677	TCGG	2	8	35319	35326	0 %	25 %	50 %	25 %	83814640
97	NC_007677	CTGA	2	8	35664	35671	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_007677	CCCT	2	8	36767	36774	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
99	NC_007677	TCCA	2	8	37095	37102	25 %	25 %	0 %	50 %	83814266
100	NC_007677	GACC	2	8	37358	37365	25 %	0 %	25 %	50 %	83814266
101	NC_007677	GTCG	2	8	37370	37377	0 %	25 %	50 %	25 %	83814266
102	NC_007677	CGGG	2	8	37858	37865	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
103	NC_007677	GCCT	2	8	38194	38201	0 %	25 %	25 %	50 %	83814585
104	NC_007677	CGGG	2	8	39936	39943	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
105	NC_007677	GAAC	2	8	40174	40181	50 %	0 %	25 %	25 %	83815821
106	NC_007677	GGCG	2	8	40608	40615	0 %	0 %	75 %	25 %	83815821
107	NC_007677	CGGG	2	8	40721	40728	0 %	0 %	75 %	25 %	83815821
108	NC_007677	CGAC	2	8	40902	40909	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_007677	GATC	2	8	41821	41828	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_007677	CCGG	2	8	41916	41923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_007677	TCGA	2	8	42959	42966	25 %	25 %	25 %	25 %	83816639
112	NC_007677	GACG	2	8	42999	43006	25 %	0 %	50 %	25 %	83816639
113	NC_007677	CCAC	2	8	43142	43149	25 %	0 %	0 %	75 %	83816639
114	NC_007677	GCCG	2	8	43215	43222	0 %	0 %	50 %	50 %	83816639
115	NC_007677	GTCA	2	8	44000	44007	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_007677	TCCG	2	8	45072	45079	0 %	25 %	25 %	50 %	83816345
117	NC_007677	GACG	2	8	45477	45484	25 %	0 %	50 %	25 %	83816345
118	NC_007677	GACG	2	8	45597	45604	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_007677	GCCC	2	8	45681	45688	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
120	NC_007677	GCCC	2	8	45951	45958	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
121	NC_007677	GGCT	2	8	45964	45971	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_007677	GACG	2	8	46278	46285	25 %	0 %	50 %	25 %	83816340
123	NC_007677	CGGC	2	8	46313	46320	0 %	0 %	50 %	50 %	83816340
124	NC_007677	CGGC	2	8	46832	46839	0 %	0 %	50 %	50 %	83816340
125	NC_007677	CGGG	2	8	47151	47158	0 %	0 %	75 %	25 %	83816340
126	NC_007677	GTGA	2	8	47338	47345	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007677	GCCG	2	8	47382	47389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_007677	GGCC	2	8	47738	47745	0 %	0 %	50 %	50 %	83815928
129	NC_007677	GGGC	2	8	47885	47892	0 %	0 %	75 %	25 %	83815928
130	NC_007677	CGAC	2	8	47932	47939	25 %	0 %	25 %	50 %	83815928
131	NC_007677	GCCG	2	8	48099	48106	0 %	0 %	50 %	50 %	83815928
132	NC_007677	GCCG	2	8	48424	48431	0 %	0 %	50 %	50 %	83815928
133	NC_007677	ACTC	2	8	49143	49150	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_007677	GAAG	2	8	49692	49699	50 %	0 %	50 %	0 %	83814408
135	NC_007677	TGCG	2	8	49927	49934	0 %	25 %	50 %	25 %	83816626
136	NC_007677	CTCG	2	8	50211	50218	0 %	25 %	25 %	50 %	83816626
137	NC_007677	GACC	2	8	50581	50588	25 %	0 %	25 %	50 %	83816022
138	NC_007677	GCGG	2	8	50882	50889	0 %	0 %	75 %	25 %	83816022
139	NC_007677	GGGC	2	8	51622	51629	0 %	0 %	75 %	25 %	83816022
140	NC_007677	TCCA	2	8	51929	51936	25 %	25 %	0 %	50 %	83816022
141	NC_007677	CGGC	2	8	52104	52111	0 %	0 %	50 %	50 %	83816022
142	NC_007677	GTCC	2	8	52435	52442	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_007677	GCCG	2	8	52650	52657	0 %	0 %	50 %	50 %	83815382
144	NC_007677	GACG	2	8	52737	52744	25 %	0 %	50 %	25 %	83815382
145	NC_007677	CACC	2	8	53016	53023	25 %	0 %	0 %	75 %	83815382
146	NC_007677	GCTC	2	8	53081	53088	0 %	25 %	25 %	50 %	83815382
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