MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia thailandensis E264 chromosome I

Total Repeats: 205

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007651	CCGCCC	2	12	31880	31891	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
2	NC_007651	CGCCGA	2	12	52696	52707	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007651	TCGCGG	2	12	64073	64084	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007651	TGCCGC	2	12	80328	80339	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_007651	GTGTCT	2	12	80868	80879	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_007651	CGCTCG	2	12	96005	96016	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_007651	GATCCG	2	12	105467	105478	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007651	ATCGGA	2	12	125462	125473	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_007651	GAGCGT	2	12	130578	130589	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_007651	CAAAAG	2	12	153161	153172	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_007651	CGCACG	2	12	210734	210745	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_007651	CGCCGG	2	12	246292	246303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_007651	ACGCGC	2	12	249068	249079	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_007651	GCGCCT	2	12	292258	292269	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_007651	GACAGT	2	12	302171	302182	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_007651	CGCGAG	2	12	310277	310288	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007651	CGGTTC	2	12	385012	385023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007651	CGATGC	2	12	390215	390226	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007651	TCCGGC	2	12	396738	396749	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_007651	GCAAGC	2	12	404702	404713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007651	TCACCG	2	12	412467	412478	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
22	NC_007651	CGGCTA	2	12	420674	420685	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007651	CGGGCG	2	12	449620	449631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007651	CGCAGG	2	12	484761	484772	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007651	GAAGCG	2	12	503360	503371	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_007651	CGCGGG	2	12	533924	533935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007651	TGGCGG	2	12	561633	561644	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_007651	AATCGA	2	12	585246	585257	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_007651	GCCGCG	2	12	617666	617677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_007651	GGGCGC	2	12	618582	618593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007651	TCGGCC	2	12	625633	625644	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_007651	GCGTCG	4	24	706727	706750	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007651	CAGCCG	2	12	710801	710812	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_007651	CGCGCC	2	12	719134	719145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_007651	CGTTCG	2	12	722581	722592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007651	TCGGCA	8	48	728061	728108	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007651	TCGGCA	3	18	728115	728132	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007651	GTTGCT	6	36	732965	733000	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_007651	CGGGTG	2	12	756292	756303	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_007651	ATGGCG	2	12	757720	757731	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_007651	CGGCAG	3	18	790902	790919	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007651	GCGCGG	2	12	811053	811064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_007651	ACCCCG	2	12	816805	816816	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_007651	GGGCGG	2	12	826418	826429	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_007651	CTCCTT	2	12	848933	848944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_007651	CGTCGA	2	12	854064	854075	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007651	GGTCTC	2	12	858333	858344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_007651	GGCCGC	2	12	861182	861193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_007651	AAACAA	2	12	871786	871797	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_007651	CAGCGC	2	12	904438	904449	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
51	NC_007651	GTTTCG	2	12	959736	959747	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_007651	GCGGAG	2	12	972586	972597	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_007651	ACGTCG	2	12	1028825	1028836	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007651	CTCGCG	2	12	1032888	1032899	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_007651	ACGATG	2	12	1033162	1033173	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_007651	CGCGCA	2	12	1051510	1051521	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_007651	GTGCGG	2	12	1069452	1069463	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_007651	GGCCGG	2	12	1087894	1087905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007651	AACCGG	2	12	1089203	1089214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007651	GAATGC	2	12	1096276	1096287	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_007651	CGCTCG	2	12	1098854	1098865	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_007651	GGGCGC	2	12	1134058	1134069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007651	CGGCCG	2	12	1151875	1151886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007651	ATGGGC	2	12	1166288	1166299	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_007651	CGGCGA	2	12	1175686	1175697	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_007651	GAACGG	2	12	1345814	1345825	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_007651	TCGGCG	2	12	1361934	1361945	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007651	TGCGTG	3	18	1362075	1362092	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_007651	CTTTTT	2	12	1381665	1381676	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_007651	ACGGGG	2	12	1397462	1397473	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_007651	CGGGCG	2	12	1415816	1415827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007651	GCTGCC	4	24	1416093	1416116	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
73	NC_007651	GGGCGC	2	12	1437456	1437467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_007651	GTAAAA	2	12	1449543	1449554	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007651	CGTCAT	2	12	1463430	1463441	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007651	CGGTTG	2	12	1478785	1478796	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_007651	GATTTC	2	12	1487019	1487030	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_007651	CCGCGC	2	12	1543307	1543318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_007651	ATCCGT	2	12	1548118	1548129	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007651	TCGCGG	2	12	1558243	1558254	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_007651	GGAGGG	2	12	1610029	1610040	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007651	GCATCG	2	12	1614353	1614364	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007651	ATCGCG	2	12	1619687	1619698	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_007651	TCGGCC	2	12	1630906	1630917	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
85	NC_007651	CGGTTC	2	12	1657011	1657022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_007651	CGTGCG	2	12	1697563	1697574	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_007651	GCTCAA	2	12	1713942	1713953	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007651	TCGTTT	2	12	1721070	1721081	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_007651	TGCAAT	2	12	1724115	1724126	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_007651	ATGCGG	2	12	1778067	1778078	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_007651	TTTTAT	2	12	1792768	1792779	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007651	CGGCGC	2	12	1810228	1810239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_007651	ACGGCG	2	12	1853294	1853305	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007651	CATCGG	2	12	1855040	1855051	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_007651	CTTCGT	2	12	1886892	1886903	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_007651	AGCCCA	2	12	1902371	1902382	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
97	NC_007651	CGGCCG	2	12	1946597	1946608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_007651	CCGCGC	4	24	1953576	1953599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_007651	TCGGGC	2	12	1973159	1973170	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007651	TCGGAC	2	12	1978615	1978626	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007651	GCCATT	2	12	1978668	1978679	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_007651	GCCATC	3	18	1978692	1978709	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
103	NC_007651	CCGTGT	2	12	2021601	2021612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_007651	GTAATC	2	12	2064021	2064032	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_007651	GCCCGC	2	12	2071824	2071835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_007651	GTTTTT	2	12	2095123	2095134	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007651	CCCGCT	2	12	2109256	2109267	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_007651	CAGCTT	2	12	2114301	2114312	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007651	GGGTTT	2	12	2122448	2122459	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007651	TCGGTG	4	24	2133187	2133210	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_007651	CGTCAT	2	12	2172267	2172278	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007651	TGGTTA	2	12	2177960	2177971	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007651	ACGGGA	2	12	2203500	2203511	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_007651	GGCCAT	2	12	2203793	2203804	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_007651	GCTTTT	2	12	2249521	2249532	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_007651	CAGACG	4	24	2250984	2251007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007651	GGCCGA	2	12	2257003	2257014	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_007651	TGGTCT	2	12	2261434	2261445	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_007651	TTTCTC	2	12	2314436	2314447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_007651	GTTTCG	2	12	2323587	2323598	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_007651	GACGCC	2	12	2329301	2329312	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
122	NC_007651	GACAAG	2	12	2342437	2342448	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_007651	GCGGCA	2	12	2350303	2350314	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_007651	GGCGCG	2	12	2356619	2356630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_007651	ACGATG	2	12	2374821	2374832	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_007651	TCGCGC	2	12	2377206	2377217	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
127	NC_007651	ATCGCG	2	12	2399829	2399840	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_007651	GCCGGT	2	12	2443336	2443347	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_007651	GATGTC	2	12	2475771	2475782	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_007651	ACGTTC	2	12	2492679	2492690	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007651	GCGCCG	2	12	2530642	2530653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_007651	ATCGCA	2	12	2541388	2541399	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_007651	CTGTTT	2	12	2541429	2541440	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_007651	TCGCGC	2	12	2544286	2544297	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
135	NC_007651	GGCGCG	2	12	2549136	2549147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_007651	GCCCGC	2	12	2556477	2556488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_007651	ATGCGC	2	12	2561774	2561785	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_007651	ACGAGC	2	12	2595896	2595907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_007651	CGACGC	2	12	2604609	2604620	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
140	NC_007651	TCGATG	2	12	2649851	2649862	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_007651	GCCGCT	3	18	2715294	2715311	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
142	NC_007651	ATCGGC	2	12	2715354	2715365	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_007651	GCGCAC	2	12	2737255	2737266	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
144	NC_007651	GGCGCG	2	12	2820420	2820431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_007651	TGCTTC	2	12	2845433	2845444	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_007651	TGCAGT	2	12	2853720	2853731	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_007651	ATCGCG	2	12	2861630	2861641	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_007651	TCGGCG	2	12	2871147	2871158	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_007651	CTTTTT	2	12	2874911	2874922	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_007651	GCGTGC	2	12	2914685	2914696	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_007651	CGTTTT	2	12	2925149	2925160	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_007651	ACGCGC	2	12	2940667	2940678	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
153	NC_007651	GCATCG	2	12	2940687	2940698	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_007651	CGCCGA	2	12	2968803	2968814	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
155	NC_007651	AAACGG	2	12	2976530	2976541	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_007651	CGTTTC	2	12	2976555	2976566	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_007651	GCTTCG	2	12	2977904	2977915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_007651	CGCGGC	2	12	2996217	2996228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
159	NC_007651	TCGCCG	2	12	3029289	3029300	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
160	NC_007651	AAGCAA	2	12	3034243	3034254	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
161	NC_007651	CGCCAA	2	12	3034340	3034351	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
162	NC_007651	CGATGA	2	12	3066921	3066932	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
163	NC_007651	ATAAAA	2	12	3076861	3076872	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_007651	GCGCTC	2	12	3089150	3089161	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
165	NC_007651	CCTCCC	2	12	3133122	3133133	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
166	NC_007651	GGACGC	2	12	3168416	3168427	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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168	NC_007651	CGGATG	2	12	3207274	3207285	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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171	NC_007651	GCGCCG	2	12	3237470	3237481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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174	NC_007651	GTCCTC	2	12	3303729	3303740	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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196	NC_007651	TGCCAG	2	12	3679912	3679923	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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199	NC_007651	TTCAGC	2	12	3703390	3703401	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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202	NC_007651	CTCAAG	2	12	3733828	3733839	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.