MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Hahella chejuensis KCTC 2396 chromosome

Total Repeats: 629

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007645	AAATT	2	10	77	86	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007645	GATTG	2	10	5087	5096	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007645	CTCTC	2	10	8675	8684	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
4	NC_007645	GATCA	2	10	49209	49218	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_007645	CTTTT	2	10	95456	95465	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_007645	GTTGT	2	10	109183	109192	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007645	CGGCT	2	10	110876	110885	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_007645	GGTTG	2	10	119299	119308	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007645	GTAAG	2	10	120154	120163	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007645	AAGTC	2	10	124184	124193	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_007645	TTTGC	2	10	124379	124388	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_007645	GTATG	2	10	176962	176971	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007645	TTTTA	2	10	181397	181406	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007645	CGCTG	2	10	184665	184674	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_007645	TCGCG	2	10	204811	204820	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_007645	AAGCG	2	10	262423	262432	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_007645	CGGTC	2	10	269427	269436	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_007645	AGCAT	2	10	295332	295341	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_007645	TAACC	2	10	302879	302888	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_007645	AGTGG	2	10	320402	320411	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007645	GCGAT	2	10	331743	331752	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_007645	TTAAT	2	10	348245	348254	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007645	GTTTC	2	10	359591	359600	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_007645	CAAAA	2	10	376996	377005	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_007645	AATCA	2	10	379367	379376	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_007645	CCGTA	2	10	383537	383546	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_007645	TGAAA	2	10	433619	433628	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007645	GCAAA	2	10	440108	440117	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_007645	AATAC	2	10	476346	476355	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_007645	CTTGA	2	10	492169	492178	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_007645	GAAGT	2	10	510151	510160	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007645	CCATG	2	10	514003	514012	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_007645	GAAAG	2	10	515731	515740	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007645	TCTGT	2	10	518976	518985	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_007645	GTGAA	2	10	522956	522965	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007645	GAGCT	2	10	523000	523009	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_007645	ACAGG	2	10	576485	576494	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_007645	AATAG	2	10	582894	582903	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007645	AATAG	2	10	595520	595529	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007645	TTTTC	2	10	626260	626269	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_007645	GCGGG	2	10	642546	642555	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
42	NC_007645	ATGCT	2	10	650043	650052	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_007645	TTTCG	2	10	661519	661528	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_007645	CGGCG	2	10	664357	664366	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
45	NC_007645	TCCTT	2	10	669413	669422	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_007645	TCCTT	2	10	684346	684355	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_007645	CCGGG	2	10	708210	708219	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
48	NC_007645	CGCTG	2	10	744350	744359	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_007645	AAGCG	2	10	766991	767000	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_007645	TTTGA	2	10	774620	774629	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007645	TTAGG	2	10	775145	775154	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007645	AGGGA	2	10	780015	780024	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007645	CTTGC	2	10	787005	787014	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_007645	GCAAA	2	10	802507	802516	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_007645	ATGCT	2	10	802631	802640	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_007645	GCTCA	2	10	813965	813974	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_007645	GGGTA	2	10	816995	817004	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007645	CGTGA	2	10	830429	830438	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_007645	TCCCT	2	10	846045	846054	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
60	NC_007645	CGCAC	2	10	853198	853207	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
61	NC_007645	ATTCG	2	10	857957	857966	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_007645	AGGAA	2	10	877922	877931	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007645	AGGAT	2	10	878172	878181	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007645	CGCTT	2	10	942061	942070	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_007645	TTGGA	2	10	951394	951403	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007645	TTTCA	2	10	952485	952494	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_007645	TTGCT	2	10	952845	952854	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_007645	GACTC	2	10	953543	953552	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_007645	TAAAA	2	10	968559	968568	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007645	CTGAT	2	10	985987	985996	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_007645	CCGCG	2	10	991954	991963	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
72	NC_007645	GTATT	2	10	992072	992081	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007645	TTCCA	2	10	992576	992585	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_007645	GTCTA	2	10	996830	996839	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_007645	TGAGG	2	10	1005687	1005696	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007645	TGGCG	2	10	1005700	1005709	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
77	NC_007645	CAAAA	2	10	1062575	1062584	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_007645	AGTTC	2	10	1114154	1114163	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_007645	GCCTG	2	10	1119478	1119487	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_007645	CGACT	2	10	1120515	1120524	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_007645	CGTCC	2	10	1125969	1125978	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
82	NC_007645	AATAA	2	10	1128073	1128082	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007645	GACGG	2	10	1154615	1154624	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
84	NC_007645	GCCGG	2	10	1157598	1157607	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
85	NC_007645	CATTT	2	10	1162678	1162687	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_007645	AGAAT	2	10	1162695	1162704	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007645	CGCTG	2	10	1168106	1168115	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
88	NC_007645	CCGGA	2	10	1177340	1177349	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
89	NC_007645	TTGTG	2	10	1179944	1179953	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007645	TGTAG	2	10	1193257	1193266	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007645	TGTTT	2	10	1194370	1194379	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007645	CGGGG	2	10	1217583	1217592	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
93	NC_007645	TGTTT	2	10	1230506	1230515	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007645	GAGTG	2	10	1267062	1267071	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007645	TTTTA	2	10	1267137	1267146	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007645	TGTCT	2	10	1298287	1298296	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_007645	CTGTG	2	10	1298325	1298334	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_007645	GAGGT	2	10	1298487	1298496	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007645	GAAAT	2	10	1298656	1298665	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007645	CAGCA	2	10	1319954	1319963	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_007645	GTTAT	2	10	1321720	1321729	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007645	GTCCG	2	10	1341528	1341537	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NC_007645	ACCTG	2	10	1344040	1344049	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_007645	ATCAT	2	10	1345598	1345607	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_007645	ACCAA	2	10	1349209	1349218	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_007645	ATTTT	2	10	1349837	1349846	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007645	TATCT	2	10	1350019	1350028	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_007645	TGGAA	2	10	1350749	1350758	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007645	AAAGC	2	10	1352894	1352903	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_007645	TAAAG	2	10	1358749	1358758	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007645	TTTCT	2	10	1384491	1384500	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_007645	CCCTG	2	10	1396489	1396498	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
113	NC_007645	AGGGG	2	10	1410606	1410615	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007645	CGGCG	2	10	1414178	1414187	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
115	NC_007645	CTTGA	2	10	1422447	1422456	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_007645	TTGCG	2	10	1435418	1435427	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_007645	CGACG	2	10	1435453	1435462	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
118	NC_007645	GGTTT	2	10	1441081	1441090	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007645	CCGTC	2	10	1442143	1442152	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
120	NC_007645	AAGTT	2	10	1442643	1442652	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007645	GGCGT	2	10	1449414	1449423	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
122	NC_007645	TCTGG	2	10	1452481	1452490	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_007645	GCAAT	2	10	1453113	1453122	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_007645	TTGAT	2	10	1453231	1453240	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007645	TTCGC	2	10	1455007	1455016	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_007645	TCCAC	2	10	1455037	1455046	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
127	NC_007645	ATTTG	2	10	1455788	1455797	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007645	ATGCT	2	10	1456446	1456455	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_007645	GTTTA	2	10	1458933	1458942	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007645	TGGGT	2	10	1502325	1502334	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007645	GCGTT	2	10	1512864	1512873	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_007645	ATGTT	2	10	1568656	1568665	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007645	GAAGG	2	10	1576432	1576441	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007645	TGCGC	2	10	1576907	1576916	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
135	NC_007645	CCGAA	2	10	1591231	1591240	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_007645	AGTCG	2	10	1591605	1591614	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_007645	AAGAT	2	10	1593274	1593283	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007645	GCGAA	2	10	1640090	1640099	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_007645	GCATT	2	10	1656937	1656946	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_007645	CAGCC	2	10	1657245	1657254	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
141	NC_007645	AACAA	2	10	1683348	1683357	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_007645	ACTTA	2	10	1688149	1688158	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_007645	GATAT	2	10	1728743	1728752	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007645	TTAAA	2	10	1734537	1734546	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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263	NC_007645	TGCGG	2	10	3079399	3079408	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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273	NC_007645	GTGGC	2	10	3156823	3156832	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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278	NC_007645	TTACA	2	10	3193702	3193711	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
279	NC_007645	AGCGC	2	10	3195507	3195516	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
280	NC_007645	GTATT	2	10	3196678	3196687	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
281	NC_007645	GTTAA	2	10	3205900	3205909	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_007645	CGCCA	2	10	3212208	3212217	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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472	NC_007645	TGAAC	2	10	5286134	5286143	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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474	NC_007645	GGCGG	2	10	5295098	5295107	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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500	NC_007645	TCCGG	2	10	5751855	5751864	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding

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