MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Hahella chejuensis KCTC 2396 chromosome

Total Repeats: 3769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007645	GTTTT	2	10	265	274	0 %	80 %	20 %	0 %	83642914
2	NC_007645	AAACC	2	10	3363	3372	60 %	0 %	0 %	40 %	83642918
3	NC_007645	CTGAA	2	10	5703	5712	40 %	20 %	20 %	20 %	83642920
4	NC_007645	TAAAG	2	10	5899	5908	60 %	20 %	20 %	0 %	83642920
5	NC_007645	GGAGC	2	10	6044	6053	20 %	0 %	60 %	20 %	83642920
6	NC_007645	GCGCC	2	10	10916	10925	0 %	0 %	40 %	60 %	83642924
7	NC_007645	GAACA	2	10	13352	13361	60 %	0 %	20 %	20 %	83642925
8	NC_007645	CGAAT	2	10	15076	15085	40 %	20 %	20 %	20 %	83642926
9	NC_007645	TGCTC	2	10	17619	17628	0 %	40 %	20 %	40 %	83642929
10	NC_007645	GTTCA	2	10	19121	19130	20 %	40 %	20 %	20 %	83642931
11	NC_007645	CCTTC	2	10	20889	20898	0 %	40 %	0 %	60 %	83642932
12	NC_007645	CGGTG	2	10	21552	21561	0 %	20 %	60 %	20 %	83642932
13	NC_007645	GATCC	2	10	22377	22386	20 %	20 %	20 %	40 %	83642932
14	NC_007645	CGTGC	2	10	25715	25724	0 %	20 %	40 %	40 %	83642935
15	NC_007645	CGTCC	2	10	33781	33790	0 %	20 %	20 %	60 %	83642941
16	NC_007645	GCGCC	3	15	35326	35340	0 %	0 %	40 %	60 %	83642942
17	NC_007645	TGGCT	2	10	36208	36217	0 %	40 %	40 %	20 %	83642943
18	NC_007645	TGCTG	2	10	36925	36934	0 %	40 %	40 %	20 %	83642944
19	NC_007645	CCTGG	2	10	39021	39030	0 %	20 %	40 %	40 %	83642946
20	NC_007645	GTTTG	2	10	40100	40109	0 %	60 %	40 %	0 %	83642947
21	NC_007645	GGCGT	2	10	40635	40644	0 %	20 %	60 %	20 %	83642949
22	NC_007645	GCCTT	2	10	41396	41405	0 %	40 %	20 %	40 %	83642950
23	NC_007645	GGCTG	2	10	42820	42829	0 %	20 %	60 %	20 %	83642951
24	NC_007645	TACGG	2	10	45015	45024	20 %	20 %	40 %	20 %	83642955
25	NC_007645	TGATG	2	10	45497	45506	20 %	40 %	40 %	0 %	83642955
26	NC_007645	GTTCA	2	10	47638	47647	20 %	40 %	20 %	20 %	83642957
27	NC_007645	CAGAT	2	10	48116	48125	40 %	20 %	20 %	20 %	83642958
28	NC_007645	CAGAA	2	10	49007	49016	60 %	0 %	20 %	20 %	83642958
29	NC_007645	CCGTT	2	10	49473	49482	0 %	40 %	20 %	40 %	83642959
30	NC_007645	GGCGT	2	10	51392	51401	0 %	20 %	60 %	20 %	83642960
31	NC_007645	CCCGA	2	10	52660	52669	20 %	0 %	20 %	60 %	83642961
32	NC_007645	GCTTA	2	10	59251	59260	20 %	40 %	20 %	20 %	83642969
33	NC_007645	TGATG	2	10	59381	59390	20 %	40 %	40 %	0 %	83642970
34	NC_007645	GCGCG	2	10	59561	59570	0 %	0 %	60 %	40 %	83642970
35	NC_007645	TTGCG	2	10	61181	61190	0 %	40 %	40 %	20 %	83642971
36	NC_007645	GCCTG	2	10	65271	65280	0 %	20 %	40 %	40 %	83642974
37	NC_007645	CGCTT	2	10	66122	66131	0 %	40 %	20 %	40 %	83642974
38	NC_007645	CGATG	2	10	66910	66919	20 %	20 %	40 %	20 %	83642976
39	NC_007645	CCGGA	2	10	67703	67712	20 %	0 %	40 %	40 %	83642977
40	NC_007645	CCGTT	2	10	70310	70319	0 %	40 %	20 %	40 %	83642978
41	NC_007645	CTGAC	2	10	70716	70725	20 %	20 %	20 %	40 %	83642979
42	NC_007645	ATGCA	2	10	75236	75245	40 %	20 %	20 %	20 %	83642983
43	NC_007645	GACAA	2	10	75551	75560	60 %	0 %	20 %	20 %	83642983
44	NC_007645	AAGCG	2	10	78836	78845	40 %	0 %	40 %	20 %	83642986
45	NC_007645	TGCGC	2	10	81450	81459	0 %	20 %	40 %	40 %	83642989
46	NC_007645	CAGCG	2	10	81742	81751	20 %	0 %	40 %	40 %	83642989
47	NC_007645	CTGCG	2	10	82710	82719	0 %	20 %	40 %	40 %	83642990
48	NC_007645	CCGGC	2	10	83659	83668	0 %	0 %	40 %	60 %	83642991
49	NC_007645	TGCGC	2	10	83809	83818	0 %	20 %	40 %	40 %	83642991
50	NC_007645	TTTAC	2	10	84373	84382	20 %	60 %	0 %	20 %	83642992
51	NC_007645	TTGCT	2	10	85231	85240	0 %	60 %	20 %	20 %	83642993
52	NC_007645	TGCGC	2	10	85329	85338	0 %	20 %	40 %	40 %	83642994
53	NC_007645	TCCGT	2	10	85859	85868	0 %	40 %	20 %	40 %	83642994
54	NC_007645	GACCA	2	10	87842	87851	40 %	0 %	20 %	40 %	83642995
55	NC_007645	GTCCG	2	10	91294	91303	0 %	20 %	40 %	40 %	83642997
56	NC_007645	TCTGA	2	10	91893	91902	20 %	40 %	20 %	20 %	83642997
57	NC_007645	CTTTC	2	10	94909	94918	0 %	60 %	0 %	40 %	83642998
58	NC_007645	GGCCC	2	10	98109	98118	0 %	0 %	40 %	60 %	83643001
59	NC_007645	CCCTC	2	10	98424	98433	0 %	20 %	0 %	80 %	83643001
60	NC_007645	CCGAC	2	10	102127	102136	20 %	0 %	20 %	60 %	83643004
61	NC_007645	AATGG	2	10	103453	103462	40 %	20 %	40 %	0 %	83643005
62	NC_007645	CGCGC	2	10	106117	106126	0 %	0 %	40 %	60 %	83643005
63	NC_007645	GTCCA	2	10	107971	107980	20 %	20 %	20 %	40 %	83643007
64	NC_007645	AGCCG	2	10	108486	108495	20 %	0 %	40 %	40 %	83643007
65	NC_007645	AGTGG	2	10	113897	113906	20 %	20 %	60 %	0 %	83643014
66	NC_007645	TTGAG	2	10	114204	114213	20 %	40 %	40 %	0 %	83643015
67	NC_007645	TGTCC	2	10	114646	114655	0 %	40 %	20 %	40 %	83643016
68	NC_007645	CAGCG	2	10	119866	119875	20 %	0 %	40 %	40 %	83643020
69	NC_007645	TGGGC	2	10	119895	119904	0 %	20 %	60 %	20 %	83643020
70	NC_007645	GGCGG	2	10	121214	121223	0 %	0 %	80 %	20 %	83643022
71	NC_007645	CTTCG	2	10	126883	126892	0 %	40 %	20 %	40 %	83643026
72	NC_007645	CACCC	2	10	128105	128114	20 %	0 %	0 %	80 %	83643027
73	NC_007645	GGCGT	2	10	130264	130273	0 %	20 %	60 %	20 %	83643029
74	NC_007645	TTGTT	2	10	131948	131957	0 %	80 %	20 %	0 %	83643029
75	NC_007645	CATTT	2	10	132527	132536	20 %	60 %	0 %	20 %	83643029
76	NC_007645	CCGGC	2	10	134564	134573	0 %	0 %	40 %	60 %	83643031
77	NC_007645	CGGCG	2	10	137964	137973	0 %	0 %	60 %	40 %	83643034
78	NC_007645	GCGCT	2	10	143613	143622	0 %	20 %	40 %	40 %	83643041
79	NC_007645	GTATG	2	10	144523	144532	20 %	40 %	40 %	0 %	83643041
80	NC_007645	GGCAA	2	10	145727	145736	40 %	0 %	40 %	20 %	83643042
81	NC_007645	GCAAG	2	10	146970	146979	40 %	0 %	40 %	20 %	83643042
82	NC_007645	GCTGT	2	10	146986	146995	0 %	40 %	40 %	20 %	83643042
83	NC_007645	TTACT	2	10	151683	151692	20 %	60 %	0 %	20 %	83643046
84	NC_007645	GATTG	2	10	154958	154967	20 %	40 %	40 %	0 %	83643050
85	NC_007645	CCACC	2	10	157991	158000	20 %	0 %	0 %	80 %	83643053
86	NC_007645	GTGCG	2	10	159139	159148	0 %	20 %	60 %	20 %	83643053
87	NC_007645	CAGCG	2	10	159638	159647	20 %	0 %	40 %	40 %	83643054
88	NC_007645	CAGTC	2	10	164207	164216	20 %	20 %	20 %	40 %	83643059
89	NC_007645	TGCGC	2	10	165882	165891	0 %	20 %	40 %	40 %	83643061
90	NC_007645	GTTAA	2	10	167320	167329	40 %	40 %	20 %	0 %	83643063
91	NC_007645	AGAAA	2	10	171233	171242	80 %	0 %	20 %	0 %	83643067
92	NC_007645	AACGC	2	10	175323	175332	40 %	0 %	20 %	40 %	83643070
93	NC_007645	CGTGA	2	10	179038	179047	20 %	20 %	40 %	20 %	83643075
94	NC_007645	CGGGC	2	10	179757	179766	0 %	0 %	60 %	40 %	83643075
95	NC_007645	GAACG	2	10	181195	181204	40 %	0 %	40 %	20 %	83643076
96	NC_007645	GCGCC	2	10	183606	183615	0 %	0 %	40 %	60 %	83643078
97	NC_007645	ATCGC	2	10	185395	185404	20 %	20 %	20 %	40 %	83643079
98	NC_007645	GGATC	2	10	189492	189501	20 %	20 %	40 %	20 %	83643084
99	NC_007645	TCAGT	2	10	193039	193048	20 %	40 %	20 %	20 %	83643087
100	NC_007645	GATTG	2	10	194535	194544	20 %	40 %	40 %	0 %	83643088
101	NC_007645	TGACC	2	10	198299	198308	20 %	20 %	20 %	40 %	83643091
102	NC_007645	ATCGA	2	10	198916	198925	40 %	20 %	20 %	20 %	83643092
103	NC_007645	GGAAC	2	10	199336	199345	40 %	0 %	40 %	20 %	83643092
104	NC_007645	ACTGA	2	10	200252	200261	40 %	20 %	20 %	20 %	83643094
105	NC_007645	CCCAG	2	10	202581	202590	20 %	0 %	20 %	60 %	83643097
106	NC_007645	CGGCG	2	10	203073	203082	0 %	0 %	60 %	40 %	83643097
107	NC_007645	GCCGC	2	10	205574	205583	0 %	0 %	40 %	60 %	83643101
108	NC_007645	CAGAA	2	10	205995	206004	60 %	0 %	20 %	20 %	83643101
109	NC_007645	CGCGT	2	10	207597	207606	0 %	20 %	40 %	40 %	83643104
110	NC_007645	GACCA	2	10	209920	209929	40 %	0 %	20 %	40 %	83643106
111	NC_007645	CGGAT	2	10	210892	210901	20 %	20 %	40 %	20 %	83643106
112	NC_007645	CGCTG	2	10	213668	213677	0 %	20 %	40 %	40 %	83643109
113	NC_007645	TTTGA	2	10	213822	213831	20 %	60 %	20 %	0 %	83643109
114	NC_007645	TGCGT	2	10	215924	215933	0 %	40 %	40 %	20 %	83643111
115	NC_007645	TAGCG	2	10	219912	219921	20 %	20 %	40 %	20 %	83643115
116	NC_007645	TTGAG	2	10	220505	220514	20 %	40 %	40 %	0 %	83643116
117	NC_007645	CGAAT	2	10	221427	221436	40 %	20 %	20 %	20 %	83643116
118	NC_007645	CGCCA	2	10	222574	222583	20 %	0 %	20 %	60 %	83643118
119	NC_007645	TGATC	2	10	223104	223113	20 %	40 %	20 %	20 %	83643118
120	NC_007645	GGCGT	2	10	223375	223384	0 %	20 %	60 %	20 %	83643118
121	NC_007645	TCCGC	2	10	225028	225037	0 %	20 %	20 %	60 %	83643121
122	NC_007645	TTGGG	2	10	229337	229346	0 %	40 %	60 %	0 %	83643127
123	NC_007645	GCTGC	2	10	231319	231328	0 %	20 %	40 %	40 %	83643128
124	NC_007645	CAGCG	2	10	232873	232882	20 %	0 %	40 %	40 %	83643128
125	NC_007645	GATCA	2	10	233665	233674	40 %	20 %	20 %	20 %	83643128
126	NC_007645	CCGCG	2	10	235187	235196	0 %	0 %	40 %	60 %	83643129
127	NC_007645	CGGGT	2	10	235510	235519	0 %	20 %	60 %	20 %	83643129
128	NC_007645	GCATC	2	10	236414	236423	20 %	20 %	20 %	40 %	83643129
129	NC_007645	TCCGC	2	10	238671	238680	0 %	20 %	20 %	60 %	83643130
130	NC_007645	CCCGG	2	10	242491	242500	0 %	0 %	40 %	60 %	83643131
131	NC_007645	AATCG	2	10	243426	243435	40 %	20 %	20 %	20 %	83643134
132	NC_007645	AACTC	2	10	246717	246726	40 %	20 %	0 %	40 %	83643136
133	NC_007645	GCGCC	2	10	251856	251865	0 %	0 %	40 %	60 %	83643140
134	NC_007645	AGGCG	2	10	252461	252470	20 %	0 %	60 %	20 %	83643141
135	NC_007645	ATGTC	2	10	252868	252877	20 %	40 %	20 %	20 %	83643141
136	NC_007645	TCAGA	2	10	260754	260763	40 %	20 %	20 %	20 %	83643150
137	NC_007645	CTTCA	2	10	266540	266549	20 %	40 %	0 %	40 %	83643155
138	NC_007645	TGTGT	2	10	270251	270260	0 %	60 %	40 %	0 %	83643159
139	NC_007645	GTCCG	2	10	271658	271667	0 %	20 %	40 %	40 %	83643161
140	NC_007645	GCGAG	2	10	272140	272149	20 %	0 %	60 %	20 %	83643161
141	NC_007645	GGCGC	2	10	274423	274432	0 %	0 %	60 %	40 %	83643163
142	NC_007645	CGGCG	2	10	274938	274947	0 %	0 %	60 %	40 %	83643163
143	NC_007645	CTTTT	2	10	276418	276427	0 %	80 %	0 %	20 %	83643165
144	NC_007645	TTTTG	2	10	283385	283394	0 %	80 %	20 %	0 %	83643171
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146	NC_007645	CGCAG	2	10	289649	289658	20 %	0 %	40 %	40 %	83643177
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148	NC_007645	TTCGA	2	10	294770	294779	20 %	40 %	20 %	20 %	83643180
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150	NC_007645	TGATC	2	10	297681	297690	20 %	40 %	20 %	20 %	83643184
151	NC_007645	AGGAC	2	10	300226	300235	40 %	0 %	40 %	20 %	83643185
152	NC_007645	GACGC	2	10	300979	300988	20 %	0 %	40 %	40 %	83643186
153	NC_007645	TGCGC	2	10	301858	301867	0 %	20 %	40 %	40 %	83643186
154	NC_007645	CCCAT	2	10	304933	304942	20 %	20 %	0 %	60 %	83643189
155	NC_007645	TCGAC	2	10	308824	308833	20 %	20 %	20 %	40 %	83643192
156	NC_007645	GCGAT	2	10	312264	312273	20 %	20 %	40 %	20 %	83643196
157	NC_007645	CGCCC	2	10	313230	313239	0 %	0 %	20 %	80 %	83643196
158	NC_007645	TCATC	2	10	314288	314297	20 %	40 %	0 %	40 %	83643197
159	NC_007645	ATCTC	2	10	319519	319528	20 %	40 %	0 %	40 %	83643200
160	NC_007645	CGGCG	2	10	320552	320561	0 %	0 %	60 %	40 %	83643201
161	NC_007645	CTTTA	2	10	322220	322229	20 %	60 %	0 %	20 %	83643203
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164	NC_007645	AAGCC	2	10	323247	323256	40 %	0 %	20 %	40 %	83643204
165	NC_007645	CAATT	2	10	325735	325744	40 %	40 %	0 %	20 %	83643206
166	NC_007645	AGGGA	2	10	326423	326432	40 %	0 %	60 %	0 %	83643207
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168	NC_007645	GCGGA	2	10	330026	330035	20 %	0 %	60 %	20 %	83643211
169	NC_007645	CTTGG	2	10	330716	330725	0 %	40 %	40 %	20 %	83643211
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171	NC_007645	TTTGG	2	10	335899	335908	0 %	60 %	40 %	0 %	83643219
172	NC_007645	GCCGG	2	10	342205	342214	0 %	0 %	60 %	40 %	83643225
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177	NC_007645	AGTCC	2	10	351734	351743	20 %	20 %	20 %	40 %	83643233
178	NC_007645	TGGAA	2	10	351926	351935	40 %	20 %	40 %	0 %	83643234
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181	NC_007645	ATCGC	2	10	356267	356276	20 %	20 %	20 %	40 %	83643240
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239	NC_007645	GTCCA	2	10	489472	489481	20 %	20 %	20 %	40 %	83643375
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248	NC_007645	ACACC	2	10	501019	501028	40 %	0 %	0 %	60 %	83643384
249	NC_007645	TGGTC	2	10	510661	510670	0 %	40 %	40 %	20 %	83643396
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251	NC_007645	ATGAA	2	10	514684	514693	60 %	20 %	20 %	0 %	83643400
252	NC_007645	GTCAG	2	10	515346	515355	20 %	20 %	40 %	20 %	83643400
253	NC_007645	GCTTG	2	10	517811	517820	0 %	40 %	40 %	20 %	83643402
254	NC_007645	ATGAC	2	10	518849	518858	40 %	20 %	20 %	20 %	83643403
255	NC_007645	GATGA	2	10	519165	519174	40 %	20 %	40 %	0 %	83643404
256	NC_007645	GGGGC	2	10	519852	519861	0 %	0 %	80 %	20 %	83643406
257	NC_007645	GGTTT	2	10	520046	520055	0 %	60 %	40 %	0 %	83643406
258	NC_007645	AGAGG	2	10	526770	526779	40 %	0 %	60 %	0 %	83643412
259	NC_007645	CGGGG	2	10	526975	526984	0 %	0 %	80 %	20 %	83643412
260	NC_007645	AACGA	2	10	527610	527619	60 %	0 %	20 %	20 %	83643413
261	NC_007645	TTCCG	2	10	530870	530879	0 %	40 %	20 %	40 %	83643416
262	NC_007645	TCGCC	2	10	536443	536452	0 %	20 %	20 %	60 %	83643423
263	NC_007645	AACGC	2	10	536755	536764	40 %	0 %	20 %	40 %	83643423
264	NC_007645	GCTTT	2	10	538818	538827	0 %	60 %	20 %	20 %	83643427
265	NC_007645	TTGGT	2	10	539926	539935	0 %	60 %	40 %	0 %	83643428
266	NC_007645	TCTCC	2	10	540032	540041	0 %	40 %	0 %	60 %	83643428
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383	NC_007645	GCGAG	2	10	781226	781235	20 %	0 %	60 %	20 %	83643672
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397	NC_007645	CCACG	2	10	798816	798825	20 %	0 %	20 %	60 %	83643689
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