MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Moorella thermoacetica ATCC 39073 chromosome

Total Repeats: 366

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007644	TTTAT	2	10	18842	18851	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007644	CGTAA	2	10	20102	20111	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_007644	AGTCA	2	10	20162	20171	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_007644	CTCGA	2	10	27105	27114	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_007644	AGTAT	2	10	27168	27177	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007644	GACCT	2	10	28782	28791	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_007644	AAAAT	2	10	36231	36240	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007644	TAATA	2	10	47322	47331	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007644	GATCA	2	10	55995	56004	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_007644	CCGCC	2	10	57387	57396	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
11	NC_007644	GGGGT	2	10	57411	57420	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007644	GGGCG	2	10	78907	78916	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
13	NC_007644	AATAT	2	10	80189	80198	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007644	TTCCT	2	10	85542	85551	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_007644	CCTCA	2	10	88754	88763	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
16	NC_007644	GGGGC	2	10	103346	103355	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
17	NC_007644	GGTAA	2	10	110129	110138	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007644	CCGCC	2	10	115866	115875	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
19	NC_007644	CTTTT	2	10	121555	121564	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_007644	TGGCT	2	10	130263	130272	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_007644	TTAAA	2	10	134923	134932	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007644	CAATA	2	10	139319	139328	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_007644	ATAAA	2	10	147840	147849	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007644	AGGAG	2	10	148667	148676	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007644	TCGTG	2	10	149080	149089	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_007644	GGGAG	2	10	150531	150540	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007644	GGAGA	2	10	156351	156360	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007644	TAATT	2	10	168315	168324	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007644	ATAAA	2	10	168376	168385	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007644	TAAAA	2	10	174496	174505	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007644	TGCTT	2	10	177959	177968	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_007644	TAATT	2	10	178128	178137	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007644	TAAAA	2	10	178190	178199	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007644	AAGGG	2	10	184590	184599	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007644	CTGCC	2	10	184602	184611	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
36	NC_007644	GGGCC	2	10	187769	187778	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
37	NC_007644	AAATA	2	10	189901	189910	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007644	CGGCG	2	10	196528	196537	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
39	NC_007644	AGTGA	2	10	214360	214369	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007644	CCACG	2	10	216529	216538	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
41	NC_007644	CGCAG	2	10	219036	219045	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_007644	GGAGA	2	10	221125	221134	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007644	AATTT	2	10	223565	223574	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007644	CCGGT	2	10	223599	223608	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_007644	AAGGA	2	10	224764	224773	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007644	TCCGG	2	10	233905	233914	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_007644	TCCGG	2	10	239594	239603	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_007644	ACTCA	2	10	275030	275039	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_007644	CCTGG	2	10	278545	278554	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_007644	TTCCT	2	10	279470	279479	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_007644	CCCGG	2	10	284453	284462	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
52	NC_007644	TTTTC	2	10	284902	284911	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_007644	GCCCG	2	10	285151	285160	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
54	NC_007644	ATGGT	2	10	286173	286182	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007644	AAAAG	2	10	287235	287244	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007644	TAGCA	2	10	288270	288279	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_007644	TATAA	2	10	289364	289373	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007644	CAAAA	2	10	289759	289768	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_007644	CCATA	2	10	290729	290738	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_007644	ACAGG	2	10	292558	292567	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_007644	CCAGG	2	10	292939	292948	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
62	NC_007644	ATAGC	2	10	296553	296562	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_007644	CCGCC	2	10	296787	296796	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
64	NC_007644	TAGCA	2	10	305675	305684	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_007644	TGGCT	2	10	307001	307010	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_007644	CTTTT	2	10	328280	328289	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_007644	CTTCC	2	10	328334	328343	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
68	NC_007644	GGGAA	2	10	355117	355126	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007644	CTTTT	2	10	367906	367915	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_007644	AAACA	2	10	370131	370140	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_007644	CTTGG	2	10	374198	374207	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_007644	CCTGG	2	10	374256	374265	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
73	NC_007644	AAAGC	2	10	379406	379415	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_007644	AAATA	2	10	379586	379595	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007644	TTTGC	2	10	379715	379724	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_007644	TAAAA	2	10	379749	379758	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007644	AGATT	2	10	379769	379778	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007644	TCTAG	2	10	394412	394421	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_007644	GCCCT	2	10	402742	402751	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
80	NC_007644	TTGCC	2	10	421527	421536	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_007644	AATAA	2	10	423900	423909	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007644	ATACT	2	10	434871	434880	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_007644	AGGTG	2	10	459281	459290	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007644	TTTTA	2	10	459339	459348	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007644	CCCGG	2	10	474267	474276	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
86	NC_007644	CCGCC	2	10	474908	474917	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
87	NC_007644	CTTTT	2	10	476833	476842	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_007644	GGTTG	2	10	497323	497332	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007644	CACGG	2	10	498781	498790	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_007644	TTTTG	2	10	506286	506295	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007644	TTTTC	2	10	527516	527525	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_007644	GAGGT	2	10	530012	530021	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007644	TTAAT	2	10	544215	544224	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007644	TTTCC	2	10	549495	549504	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_007644	CTATA	2	10	559871	559880	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_007644	GTGCC	2	10	566145	566154	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_007644	TATAA	2	10	566155	566164	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007644	GCCTG	2	10	569665	569674	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_007644	CTATA	2	10	572082	572091	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_007644	TAATA	2	10	588042	588051	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007644	TCGCC	2	10	603540	603549	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
102	NC_007644	CGGGC	2	10	604780	604789	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
103	NC_007644	GCCCG	2	10	604795	604804	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
104	NC_007644	GCTTT	2	10	624003	624012	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_007644	AGCCA	2	10	625796	625805	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_007644	AGGGG	2	10	629147	629156	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007644	AACAA	2	10	633552	633561	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_007644	AAGAG	2	10	635270	635279	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007644	ATTTC	2	10	640997	641006	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_007644	TATAA	2	10	649535	649544	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007644	GCAGG	2	10	651793	651802	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
112	NC_007644	TTGAA	2	10	653011	653020	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007644	TAAGT	2	10	655660	655669	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007644	ATGGG	2	10	655716	655725	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007644	GAGGG	2	10	655759	655768	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007644	ATTTT	2	10	689582	689591	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007644	GCCTT	2	10	689842	689851	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_007644	GTTAA	2	10	693926	693935	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007644	CAGTA	2	10	698520	698529	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_007644	TGCAG	2	10	699819	699828	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_007644	AATAT	2	10	704592	704601	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007644	GGCCT	2	10	708026	708035	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
123	NC_007644	CCTAC	2	10	712281	712290	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
124	NC_007644	GGCCT	2	10	715119	715128	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
125	NC_007644	CCTGC	2	10	721947	721956	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
126	NC_007644	ATTCG	2	10	722628	722637	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_007644	CGGTA	2	10	723840	723849	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_007644	TTTTA	2	10	724952	724961	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007644	AGGGG	2	10	724974	724983	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007644	ATTTT	2	10	725721	725730	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007644	GAATT	2	10	728218	728227	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007644	GCTGA	2	10	733512	733521	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_007644	TAATT	2	10	736226	736235	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007644	GGGGT	2	10	741755	741764	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007644	AAAAG	2	10	744672	744681	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007644	CCTGG	2	10	763076	763085	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
137	NC_007644	GATTT	2	10	768174	768183	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007644	ATACT	2	10	803941	803950	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_007644	AAGTT	2	10	804005	804014	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007644	TGGGA	2	10	805145	805154	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007644	TGTAT	2	10	832185	832194	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007644	CGTGA	2	10	861295	861304	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_007644	GGTCC	2	10	896057	896066	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
144	NC_007644	GGCAA	2	10	898138	898147	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
145	NC_007644	GGCCG	2	10	914752	914761	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
146	NC_007644	GGAAG	2	10	914788	914797	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007644	TGGCT	2	10	919115	919124	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_007644	TTCTT	2	10	919225	919234	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_007644	TAAAA	2	10	922119	922128	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_007644	TAAAA	2	10	1194659	1194668	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_007644	ATAAA	2	10	1194720	1194729	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_007644	CTGGA	2	10	1858554	1858563	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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273	NC_007644	TCCGG	2	10	1946705	1946714	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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283	NC_007644	GTAAA	2	10	2030320	2030329	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
284	NC_007644	GAACA	2	10	2044692	2044701	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
285	NC_007644	TATAT	2	10	2047335	2047344	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_007644	TAAAC	2	10	2051761	2051770	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
287	NC_007644	AATAA	2	10	2060448	2060457	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_007644	GTTTT	2	10	2070141	2070150	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
289	NC_007644	CCTTC	2	10	2073640	2073649	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
290	NC_007644	CCTTC	2	10	2074979	2074988	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
291	NC_007644	GGAAG	2	10	2074995	2075004	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
292	NC_007644	AAAGG	2	10	2075195	2075204	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
293	NC_007644	TAAAA	2	10	2079246	2079255	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_007644	AATGT	2	10	2087704	2087713	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
295	NC_007644	ATTAT	2	10	2097529	2097538	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_007644	TCTCC	2	10	2102790	2102799	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
297	NC_007644	GTGCC	2	10	2128687	2128696	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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302	NC_007644	CGGCC	2	10	2156557	2156566	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
303	NC_007644	GGAAG	2	10	2177230	2177239	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
304	NC_007644	ACTAT	2	10	2185003	2185012	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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312	NC_007644	TCCCC	2	10	2242814	2242823	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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323	NC_007644	GCGGA	2	10	2295954	2295963	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
324	NC_007644	TCTGG	2	10	2295999	2296008	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
325	NC_007644	TACAT	2	10	2296241	2296250	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
326	NC_007644	TAATA	2	10	2302141	2302150	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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330	NC_007644	CATTT	2	10	2315777	2315786	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
331	NC_007644	AACGC	2	10	2316008	2316017	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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345	NC_007644	TAATT	2	10	2439853	2439862	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
346	NC_007644	CTTTA	2	10	2443032	2443041	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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350	NC_007644	CTGCT	2	10	2514380	2514389	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
351	NC_007644	GACCT	2	10	2523985	2523994	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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357	NC_007644	TCAAG	2	10	2535949	2535958	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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362	NC_007644	TTTAG	2	10	2582778	2582787	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
363	NC_007644	TGTTT	2	10	2585678	2585687	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
364	NC_007644	TTTAT	2	10	2586591	2586600	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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366	NC_007644	TTAAC	2	10	2628214	2628223	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.