MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhodospirillum rubrum ATCC 11170 chromosome

Total Repeats: 12300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007643	CGCT	2	8	474	481	0 %	25 %	25 %	50 %	83591341
2	NC_007643	CGGC	2	8	615	622	0 %	0 %	50 %	50 %	83591341
3	NC_007643	ATGC	2	8	897	904	25 %	25 %	25 %	25 %	83591341
4	NC_007643	ATCT	2	8	948	955	25 %	50 %	0 %	25 %	83591341
5	NC_007643	CATG	2	8	1664	1671	25 %	25 %	25 %	25 %	83591341
6	NC_007643	CGGT	2	8	1942	1949	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_007643	GCCC	2	8	1984	1991	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_007643	TGCC	2	8	2322	2329	0 %	25 %	25 %	50 %	83591342
9	NC_007643	GATC	2	8	2408	2415	25 %	25 %	25 %	25 %	83591342
10	NC_007643	ATCT	2	8	2466	2473	25 %	50 %	0 %	25 %	83591342
11	NC_007643	CCGA	2	8	2754	2761	25 %	0 %	25 %	50 %	83591342
12	NC_007643	CTCG	2	8	2948	2955	0 %	25 %	25 %	50 %	83591342
13	NC_007643	GCCC	2	8	3381	3388	0 %	0 %	25 %	75 %	83591343
14	NC_007643	GCGA	2	8	3596	3603	25 %	0 %	50 %	25 %	83591343
15	NC_007643	CGCC	2	8	3694	3701	0 %	0 %	25 %	75 %	83591343
16	NC_007643	GCTG	2	8	3729	3736	0 %	25 %	50 %	25 %	83591343
17	NC_007643	GATC	2	8	3856	3863	25 %	25 %	25 %	25 %	83591343
18	NC_007643	GGCT	2	8	3881	3888	0 %	25 %	50 %	25 %	83591343
19	NC_007643	CCGC	2	8	4098	4105	0 %	0 %	25 %	75 %	83591343
20	NC_007643	CGGG	2	8	4699	4706	0 %	0 %	75 %	25 %	83591344
21	NC_007643	CCAG	2	8	5368	5375	25 %	0 %	25 %	50 %	83591344
22	NC_007643	CGCC	2	8	6125	6132	0 %	0 %	25 %	75 %	83591344
23	NC_007643	CTTG	2	8	6179	6186	0 %	50 %	25 %	25 %	83591344
24	NC_007643	CGCC	2	8	6266	6273	0 %	0 %	25 %	75 %	83591344
25	NC_007643	TTTG	2	8	6935	6942	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007643	CCTT	2	8	7986	7993	0 %	50 %	0 %	50 %	83591346
27	NC_007643	CTCG	2	8	8449	8456	0 %	25 %	25 %	50 %	83591346
28	NC_007643	TTTG	2	8	8746	8753	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007643	GGCC	2	8	8894	8901	0 %	0 %	50 %	50 %	83591347
30	NC_007643	CGGG	2	8	9186	9193	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_007643	TTCC	2	8	10583	10590	0 %	50 %	0 %	50 %	83591350
32	NC_007643	TATT	2	8	10813	10820	25 %	75 %	0 %	0 %	83591350
33	NC_007643	CCAG	2	8	11120	11127	25 %	0 %	25 %	50 %	83591350
34	NC_007643	GAGC	2	8	11385	11392	25 %	0 %	50 %	25 %	83591350
35	NC_007643	CGGG	2	8	11405	11412	0 %	0 %	75 %	25 %	83591350
36	NC_007643	GGGC	2	8	12110	12117	0 %	0 %	75 %	25 %	83591351
37	NC_007643	GGCG	2	8	12538	12545	0 %	0 %	75 %	25 %	83591351
38	NC_007643	AGAT	2	8	12585	12592	50 %	25 %	25 %	0 %	83591351
39	NC_007643	TCCC	2	8	12918	12925	0 %	25 %	0 %	75 %	83591352
40	NC_007643	CGGC	2	8	13215	13222	0 %	0 %	50 %	50 %	83591352
41	NC_007643	GGTC	2	8	14360	14367	0 %	25 %	50 %	25 %	83591353
42	NC_007643	GATC	2	8	14408	14415	25 %	25 %	25 %	25 %	83591353
43	NC_007643	GCCG	2	8	14571	14578	0 %	0 %	50 %	50 %	83591353
44	NC_007643	ACCG	2	8	14741	14748	25 %	0 %	25 %	50 %	83591354
45	NC_007643	TGGC	2	8	15417	15424	0 %	25 %	50 %	25 %	83591354
46	NC_007643	GGCG	2	8	15640	15647	0 %	0 %	75 %	25 %	83591354
47	NC_007643	TCAG	2	8	15975	15982	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_007643	CGGT	2	8	16058	16065	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_007643	CCTC	2	8	16079	16086	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_007643	ATGG	2	8	16829	16836	25 %	25 %	50 %	0 %	83591355
51	NC_007643	CGGA	2	8	17323	17330	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_007643	GGCA	2	8	17401	17408	25 %	0 %	50 %	25 %	83591356
53	NC_007643	CGGC	2	8	17610	17617	0 %	0 %	50 %	50 %	83591356
54	NC_007643	GATC	2	8	17934	17941	25 %	25 %	25 %	25 %	83591356
55	NC_007643	GCAT	2	8	20791	20798	25 %	25 %	25 %	25 %	83591358
56	NC_007643	GATC	2	8	20966	20973	25 %	25 %	25 %	25 %	83591358
57	NC_007643	CCGG	2	8	21510	21517	0 %	0 %	50 %	50 %	83591359
58	NC_007643	TGGC	2	8	21622	21629	0 %	25 %	50 %	25 %	83591359
59	NC_007643	CCGG	3	12	22167	22178	0 %	0 %	50 %	50 %	83591359
60	NC_007643	GTGG	2	8	22561	22568	0 %	25 %	75 %	0 %	83591359
61	NC_007643	TCAG	2	8	22809	22816	25 %	25 %	25 %	25 %	83591359
62	NC_007643	GCCA	2	8	22910	22917	25 %	0 %	25 %	50 %	83591359
63	NC_007643	CTGG	2	8	23305	23312	0 %	25 %	50 %	25 %	83591359
64	NC_007643	CGCT	2	8	23498	23505	0 %	25 %	25 %	50 %	83591359
65	NC_007643	CTGG	2	8	23555	23562	0 %	25 %	50 %	25 %	83591359
66	NC_007643	CGAC	2	8	23715	23722	25 %	0 %	25 %	50 %	83591359
67	NC_007643	TCGA	2	8	23822	23829	25 %	25 %	25 %	25 %	83591359
68	NC_007643	GGGC	2	8	24127	24134	0 %	0 %	75 %	25 %	83591359
69	NC_007643	TCGA	2	8	24233	24240	25 %	25 %	25 %	25 %	83591359
70	NC_007643	GCTC	2	8	24774	24781	0 %	25 %	25 %	50 %	83591359
71	NC_007643	GGCA	2	8	25873	25880	25 %	0 %	50 %	25 %	83591360
72	NC_007643	TCCT	2	8	27215	27222	0 %	50 %	0 %	50 %	83591362
73	NC_007643	CGGG	2	8	27493	27500	0 %	0 %	75 %	25 %	83591362
74	NC_007643	GCTG	2	8	27552	27559	0 %	25 %	50 %	25 %	83591362
75	NC_007643	CCGG	2	8	28523	28530	0 %	0 %	50 %	50 %	83591364
76	NC_007643	ACCA	2	8	28835	28842	50 %	0 %	0 %	50 %	83591364
77	NC_007643	CAGG	2	8	29736	29743	25 %	0 %	50 %	25 %	83591365
78	NC_007643	AGCG	2	8	30133	30140	25 %	0 %	50 %	25 %	83591365
79	NC_007643	CGCC	2	8	32364	32371	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
80	NC_007643	TGGG	2	8	33727	33734	0 %	25 %	75 %	0 %	83591368
81	NC_007643	GGGC	2	8	34564	34571	0 %	0 %	75 %	25 %	83591370
82	NC_007643	CGAC	2	8	35051	35058	25 %	0 %	25 %	50 %	83591371
83	NC_007643	GGCG	2	8	36806	36813	0 %	0 %	75 %	25 %	83591372
84	NC_007643	GCGG	2	8	37071	37078	0 %	0 %	75 %	25 %	83591372
85	NC_007643	GCGG	2	8	37208	37215	0 %	0 %	75 %	25 %	83591372
86	NC_007643	CGGC	2	8	37272	37279	0 %	0 %	50 %	50 %	83591373
87	NC_007643	CGGG	2	8	37291	37298	0 %	0 %	75 %	25 %	83591373
88	NC_007643	GATC	2	8	37920	37927	25 %	25 %	25 %	25 %	83591374
89	NC_007643	CGGG	2	8	38327	38334	0 %	0 %	75 %	25 %	83591374
90	NC_007643	GGCC	2	8	38791	38798	0 %	0 %	50 %	50 %	83591375
91	NC_007643	GCCG	2	8	39127	39134	0 %	0 %	50 %	50 %	83591375
92	NC_007643	TCCA	2	8	40296	40303	25 %	25 %	0 %	50 %	83591375
93	NC_007643	GCCC	2	8	40623	40630	0 %	0 %	25 %	75 %	83591376
94	NC_007643	CATC	2	8	40631	40638	25 %	25 %	0 %	50 %	83591376
95	NC_007643	TCGG	2	8	40831	40838	0 %	25 %	50 %	25 %	83591376
96	NC_007643	CCGG	2	8	40985	40992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_007643	CGGG	2	8	41064	41071	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
98	NC_007643	CAAG	2	8	41153	41160	50 %	0 %	25 %	25 %	83591377
99	NC_007643	AGAA	2	8	41576	41583	75 %	0 %	25 %	0 %	83591378
100	NC_007643	CAGA	2	8	41665	41672	50 %	0 %	25 %	25 %	83591378
101	NC_007643	GCGG	2	8	41707	41714	0 %	0 %	75 %	25 %	83591378
102	NC_007643	ACAT	2	8	41813	41820	50 %	25 %	0 %	25 %	83591378
103	NC_007643	CGGG	2	8	41850	41857	0 %	0 %	75 %	25 %	83591378
104	NC_007643	GGCG	2	8	42944	42951	0 %	0 %	75 %	25 %	83591380
105	NC_007643	GCCG	2	8	43292	43299	0 %	0 %	50 %	50 %	83591380
106	NC_007643	GCAC	2	8	43433	43440	25 %	0 %	25 %	50 %	83591380
107	NC_007643	GGCG	2	8	43606	43613	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
108	NC_007643	GGCG	2	8	44011	44018	0 %	0 %	75 %	25 %	83591381
109	NC_007643	GGGC	3	12	44024	44035	0 %	0 %	75 %	25 %	83591381
110	NC_007643	GCGG	2	8	44096	44103	0 %	0 %	75 %	25 %	83591381
111	NC_007643	GATC	2	8	44295	44302	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_007643	CGCC	2	8	45095	45102	0 %	0 %	25 %	75 %	83591382
113	NC_007643	CGTC	2	8	45208	45215	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_007643	TTCC	2	8	45293	45300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_007643	CCGC	2	8	45621	45628	0 %	0 %	25 %	75 %	83591383
116	NC_007643	CATG	2	8	45674	45681	25 %	25 %	25 %	25 %	83591383
117	NC_007643	GCCC	2	8	45704	45711	0 %	0 %	25 %	75 %	83591383
118	NC_007643	CATC	2	8	45725	45732	25 %	25 %	0 %	50 %	83591383
119	NC_007643	CTGC	2	8	45881	45888	0 %	25 %	25 %	50 %	83591383
120	NC_007643	CCGG	2	8	46024	46031	0 %	0 %	50 %	50 %	83591383
121	NC_007643	ATCG	2	8	46122	46129	25 %	25 %	25 %	25 %	83591383
122	NC_007643	GGCC	2	8	46280	46287	0 %	0 %	50 %	50 %	83591383
123	NC_007643	ATCG	2	8	46599	46606	25 %	25 %	25 %	25 %	83591384
124	NC_007643	ACCG	2	8	47066	47073	25 %	0 %	25 %	50 %	83591385
125	NC_007643	CCAT	2	8	47679	47686	25 %	25 %	0 %	50 %	83591385
126	NC_007643	TGAC	2	8	48852	48859	25 %	25 %	25 %	25 %	83591387
127	NC_007643	TGGT	2	8	48927	48934	0 %	50 %	50 %	0 %	83591387
128	NC_007643	GCCG	2	8	49855	49862	0 %	0 %	50 %	50 %	83591387
129	NC_007643	CGGG	2	8	50025	50032	0 %	0 %	75 %	25 %	83591387
130	NC_007643	CAGC	2	8	50168	50175	25 %	0 %	25 %	50 %	83591387
131	NC_007643	GCGA	2	8	50487	50494	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_007643	GTTT	2	8	51218	51225	0 %	75 %	25 %	0 %	83591389
133	NC_007643	CGGG	2	8	51483	51490	0 %	0 %	75 %	25 %	83591389
134	NC_007643	GCGG	2	8	51502	51509	0 %	0 %	75 %	25 %	83591389
135	NC_007643	GTCC	2	8	51630	51637	0 %	25 %	25 %	50 %	83591390
136	NC_007643	TCCT	2	8	51728	51735	0 %	50 %	0 %	50 %	83591390
137	NC_007643	GCGG	2	8	52562	52569	0 %	0 %	75 %	25 %	83591391
138	NC_007643	ATCG	2	8	52799	52806	25 %	25 %	25 %	25 %	83591391
139	NC_007643	CCGG	2	8	53335	53342	0 %	0 %	50 %	50 %	83591391
140	NC_007643	CGAC	2	8	53934	53941	25 %	0 %	25 %	50 %	83591392
141	NC_007643	TCGA	2	8	54356	54363	25 %	25 %	25 %	25 %	83591392
142	NC_007643	TGGT	2	8	54380	54387	0 %	50 %	50 %	0 %	83591392
143	NC_007643	CGCC	2	8	54942	54949	0 %	0 %	25 %	75 %	83591392
144	NC_007643	CGAC	2	8	55371	55378	25 %	0 %	25 %	50 %	83591392
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