MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum ATCC 11170 plasmid unnamed

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007641	GCAGG	2	10	1519	1528	20 %	0 %	60 %	20 %	83582733
2	NC_007641	GCAAC	2	10	1738	1747	40 %	0 %	20 %	40 %	83582733
3	NC_007641	TCCAA	2	10	2704	2713	40 %	20 %	0 %	40 %	83582734
4	NC_007641	CCGAA	2	10	3734	3743	40 %	0 %	20 %	40 %	83582735
5	NC_007641	CCGCC	2	10	3755	3764	0 %	0 %	20 %	80 %	83582735
6	NC_007641	ATATT	2	10	4684	4693	40 %	60 %	0 %	0 %	83582735
7	NC_007641	GCCCC	2	10	5699	5708	0 %	0 %	20 %	80 %	83582736
8	NC_007641	GAAAA	2	10	6546	6555	80 %	0 %	20 %	0 %	83582737
9	NC_007641	CCTGG	2	10	9213	9222	0 %	20 %	40 %	40 %	83582737
10	NC_007641	ACCAA	2	10	9636	9645	60 %	0 %	0 %	40 %	83582737
11	NC_007641	CCGGG	2	10	10755	10764	0 %	0 %	60 %	40 %	83582738
12	NC_007641	CCGAA	2	10	13606	13615	40 %	0 %	20 %	40 %	83582742
13	NC_007641	GCTTC	2	10	13664	13673	0 %	40 %	20 %	40 %	83582742
14	NC_007641	CCCGG	2	10	15092	15101	0 %	0 %	40 %	60 %	83582745
15	NC_007641	CGGCG	2	10	16521	16530	0 %	0 %	60 %	40 %	83582747
16	NC_007641	CACGC	2	10	16635	16644	20 %	0 %	20 %	60 %	83582747
17	NC_007641	CGATG	2	10	16908	16917	20 %	20 %	40 %	20 %	83582747
18	NC_007641	GGCGC	2	10	18348	18357	0 %	0 %	60 %	40 %	83582749
19	NC_007641	TCGCC	2	10	18964	18973	0 %	20 %	20 %	60 %	83582750
20	NC_007641	GCTGG	2	10	19628	19637	0 %	20 %	60 %	20 %	83582750
21	NC_007641	TCCTG	2	10	20084	20093	0 %	40 %	20 %	40 %	83582750
22	NC_007641	CTTGC	2	10	22032	22041	0 %	40 %	20 %	40 %	83582753
23	NC_007641	CCGCT	2	10	22956	22965	0 %	20 %	20 %	60 %	83582754
24	NC_007641	CGCCT	2	10	22991	23000	0 %	20 %	20 %	60 %	83582754
25	NC_007641	CGGCG	2	10	23536	23545	0 %	0 %	60 %	40 %	83582754
26	NC_007641	CGCTC	2	10	24617	24626	0 %	20 %	20 %	60 %	83582756
27	NC_007641	CGGAG	2	10	31190	31199	20 %	0 %	60 %	20 %	83582761
28	NC_007641	GCCCC	2	10	40001	40010	0 %	0 %	20 %	80 %	83582769
29	NC_007641	ATCCG	2	10	43353	43362	20 %	20 %	20 %	40 %	83582772
30	NC_007641	GCCGC	2	10	43445	43454	0 %	0 %	40 %	60 %	83582772
31	NC_007641	GCAAG	2	10	43774	43783	40 %	0 %	40 %	20 %	83582773
32	NC_007641	CCCCG	2	10	44443	44452	0 %	0 %	20 %	80 %	83582774
33	NC_007641	GCCCT	2	10	45430	45439	0 %	20 %	20 %	60 %	83582774
34	NC_007641	TGGCT	2	10	46130	46139	0 %	40 %	40 %	20 %	83582774
35	NC_007641	CAAGC	2	10	50931	50940	40 %	0 %	20 %	40 %	83582778
36	NC_007641	CCAGC	2	10	51794	51803	20 %	0 %	20 %	60 %	83582779
37	NC_007641	GCCGA	2	10	52547	52556	20 %	0 %	40 %	40 %	83582780
38	NC_007641	CTTCC	2	10	52955	52964	0 %	40 %	0 %	60 %	83582780
39	NC_007641	GATCC	2	10	53086	53095	20 %	20 %	20 %	40 %	83582780

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.