MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum ATCC 11170 plasmid unnamed

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007641	CG	3	6	1115	1120	0 %	0 %	50 %	50 %	83582732
2	NC_007641	AT	3	6	2114	2119	50 %	50 %	0 %	0 %	83582733
3	NC_007641	GA	3	6	2282	2287	50 %	0 %	50 %	0 %	83582733
4	NC_007641	AG	3	6	3409	3414	50 %	0 %	50 %	0 %	83582735
5	NC_007641	CG	3	6	3470	3475	0 %	0 %	50 %	50 %	83582735
6	NC_007641	CG	3	6	3578	3583	0 %	0 %	50 %	50 %	83582735
7	NC_007641	GC	3	6	3773	3778	0 %	0 %	50 %	50 %	83582735
8	NC_007641	AG	3	6	4645	4650	50 %	0 %	50 %	0 %	83582735
9	NC_007641	AT	3	6	4709	4714	50 %	50 %	0 %	0 %	83582735
10	NC_007641	AT	3	6	4721	4726	50 %	50 %	0 %	0 %	83582735
11	NC_007641	GA	3	6	5102	5107	50 %	0 %	50 %	0 %	83582735
12	NC_007641	CT	3	6	6139	6144	0 %	50 %	0 %	50 %	83582736
13	NC_007641	GA	3	6	6688	6693	50 %	0 %	50 %	0 %	83582737
14	NC_007641	AT	3	6	7100	7105	50 %	50 %	0 %	0 %	83582737
15	NC_007641	TC	3	6	7382	7387	0 %	50 %	0 %	50 %	83582737
16	NC_007641	CA	3	6	7774	7779	50 %	0 %	0 %	50 %	83582737
17	NC_007641	CG	3	6	8788	8793	0 %	0 %	50 %	50 %	83582737
18	NC_007641	CA	3	6	9657	9662	50 %	0 %	0 %	50 %	83582737
19	NC_007641	AC	3	6	9739	9744	50 %	0 %	0 %	50 %	83582737
20	NC_007641	CG	3	6	9921	9926	0 %	0 %	50 %	50 %	83582737
21	NC_007641	AT	3	6	16091	16096	50 %	50 %	0 %	0 %	83582746
22	NC_007641	CG	3	6	16989	16994	0 %	0 %	50 %	50 %	83582747
23	NC_007641	GC	3	6	17921	17926	0 %	0 %	50 %	50 %	83582748
24	NC_007641	AC	3	6	22804	22809	50 %	0 %	0 %	50 %	83582754
25	NC_007641	GC	3	6	23015	23020	0 %	0 %	50 %	50 %	83582754
26	NC_007641	CA	3	6	24928	24933	50 %	0 %	0 %	50 %	83582756
27	NC_007641	AC	3	6	25657	25662	50 %	0 %	0 %	50 %	83582757
28	NC_007641	AG	3	6	25715	25720	50 %	0 %	50 %	0 %	83582757
29	NC_007641	GC	3	6	28383	28388	0 %	0 %	50 %	50 %	83582759
30	NC_007641	AG	3	6	29658	29663	50 %	0 %	50 %	0 %	83582760
31	NC_007641	GC	3	6	30516	30521	0 %	0 %	50 %	50 %	83582761
32	NC_007641	CG	4	8	31013	31020	0 %	0 %	50 %	50 %	83582761
33	NC_007641	GC	3	6	31044	31049	0 %	0 %	50 %	50 %	83582761
34	NC_007641	GC	3	6	31464	31469	0 %	0 %	50 %	50 %	83582761
35	NC_007641	GC	3	6	31497	31502	0 %	0 %	50 %	50 %	83582761
36	NC_007641	CG	3	6	31598	31603	0 %	0 %	50 %	50 %	83582761
37	NC_007641	CG	3	6	31669	31674	0 %	0 %	50 %	50 %	83582761
38	NC_007641	CG	3	6	32519	32524	0 %	0 %	50 %	50 %	83582763
39	NC_007641	GC	3	6	32806	32811	0 %	0 %	50 %	50 %	83582763
40	NC_007641	GC	3	6	33516	33521	0 %	0 %	50 %	50 %	83582764
41	NC_007641	GC	3	6	33723	33728	0 %	0 %	50 %	50 %	83582765
42	NC_007641	GC	3	6	34493	34498	0 %	0 %	50 %	50 %	83582766
43	NC_007641	GC	3	6	34675	34680	0 %	0 %	50 %	50 %	83582766
44	NC_007641	GC	3	6	34838	34843	0 %	0 %	50 %	50 %	83582766
45	NC_007641	GC	4	8	34845	34852	0 %	0 %	50 %	50 %	83582766
46	NC_007641	AG	3	6	36157	36162	50 %	0 %	50 %	0 %	83582767
47	NC_007641	TG	3	6	36361	36366	0 %	50 %	50 %	0 %	83582767
48	NC_007641	AC	3	6	36710	36715	50 %	0 %	0 %	50 %	83582767
49	NC_007641	GC	3	6	37609	37614	0 %	0 %	50 %	50 %	83582767
50	NC_007641	GA	3	6	37857	37862	50 %	0 %	50 %	0 %	83582767
51	NC_007641	GC	3	6	39930	39935	0 %	0 %	50 %	50 %	83582769
52	NC_007641	CG	3	6	40675	40680	0 %	0 %	50 %	50 %	83582769
53	NC_007641	GC	3	6	40926	40931	0 %	0 %	50 %	50 %	83582770
54	NC_007641	GC	3	6	42140	42145	0 %	0 %	50 %	50 %	83582770
55	NC_007641	TC	3	6	42496	42501	0 %	50 %	0 %	50 %	83582771
56	NC_007641	CG	3	6	44599	44604	0 %	0 %	50 %	50 %	83582774
57	NC_007641	GC	3	6	44754	44759	0 %	0 %	50 %	50 %	83582774
58	NC_007641	GC	3	6	45234	45239	0 %	0 %	50 %	50 %	83582774
59	NC_007641	GC	3	6	45726	45731	0 %	0 %	50 %	50 %	83582774
60	NC_007641	CG	4	8	46048	46055	0 %	0 %	50 %	50 %	83582774
61	NC_007641	GC	3	6	46317	46322	0 %	0 %	50 %	50 %	83582774
62	NC_007641	CG	4	8	46432	46439	0 %	0 %	50 %	50 %	83582774
63	NC_007641	GC	3	6	46495	46500	0 %	0 %	50 %	50 %	83582774
64	NC_007641	GC	3	6	47880	47885	0 %	0 %	50 %	50 %	83582775
65	NC_007641	GC	3	6	47964	47969	0 %	0 %	50 %	50 %	83582775
66	NC_007641	GC	3	6	48174	48179	0 %	0 %	50 %	50 %	83582776
67	NC_007641	CG	3	6	48576	48581	0 %	0 %	50 %	50 %	83582776
68	NC_007641	AT	3	6	49800	49805	50 %	50 %	0 %	0 %	83582777
69	NC_007641	GA	3	6	49813	49818	50 %	0 %	50 %	0 %	83582777
70	NC_007641	AG	4	8	50671	50678	50 %	0 %	50 %	0 %	83582777
71	NC_007641	CT	3	6	51603	51608	0 %	50 %	0 %	50 %	83582779
72	NC_007641	CG	3	6	52095	52100	0 %	0 %	50 %	50 %	83582779
73	NC_007641	AG	3	6	52209	52214	50 %	0 %	50 %	0 %	83582779
74	NC_007641	GC	4	8	52744	52751	0 %	0 %	50 %	50 %	83582780
75	NC_007641	AG	3	6	53457	53462	50 %	0 %	50 %	0 %	83582780

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.