MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rhodospirillum rubrum ATCC 11170 plasmid unnamed

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007641	G	6	6	515	520	0 %	0 %	100 %	0 %	83582731
2	NC_007641	A	6	6	1246	1251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007641	A	6	6	1271	1276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007641	T	6	6	1422	1427	0 %	100 %	0 %	0 %	83582733
5	NC_007641	A	6	6	2240	2245	100 %	0 %	0 %	0 %	83582733
6	NC_007641	A	7	7	2324	2330	100 %	0 %	0 %	0 %	83582733
7	NC_007641	T	6	6	3633	3638	0 %	100 %	0 %	0 %	83582735
8	NC_007641	T	6	6	3863	3868	0 %	100 %	0 %	0 %	83582735
9	NC_007641	A	6	6	4588	4593	100 %	0 %	0 %	0 %	83582735
10	NC_007641	T	6	6	5286	5291	0 %	100 %	0 %	0 %	83582736
11	NC_007641	T	6	6	5293	5298	0 %	100 %	0 %	0 %	83582736
12	NC_007641	A	6	6	6468	6473	100 %	0 %	0 %	0 %	83582737
13	NC_007641	T	8	8	6500	6507	0 %	100 %	0 %	0 %	83582737
14	NC_007641	T	6	6	6702	6707	0 %	100 %	0 %	0 %	83582737
15	NC_007641	A	7	7	6765	6771	100 %	0 %	0 %	0 %	83582737
16	NC_007641	T	6	6	6841	6846	0 %	100 %	0 %	0 %	83582737
17	NC_007641	A	6	6	6925	6930	100 %	0 %	0 %	0 %	83582737
18	NC_007641	C	6	6	6978	6983	0 %	0 %	0 %	100 %	83582737
19	NC_007641	T	6	6	8092	8097	0 %	100 %	0 %	0 %	83582737
20	NC_007641	G	6	6	8161	8166	0 %	0 %	100 %	0 %	83582737
21	NC_007641	C	6	6	10399	10404	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
22	NC_007641	A	6	6	12466	12471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007641	G	6	6	13960	13965	0 %	0 %	100 %	0 %	83582743
24	NC_007641	G	6	6	15452	15457	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007641	T	6	6	22516	22521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007641	G	6	6	22811	22816	0 %	0 %	100 %	0 %	83582754
27	NC_007641	T	6	6	25830	25835	0 %	100 %	0 %	0 %	83582757
28	NC_007641	T	6	6	26134	26139	0 %	100 %	0 %	0 %	83582757
29	NC_007641	C	6	6	27007	27012	0 %	0 %	0 %	100 %	83582758
30	NC_007641	G	6	6	27765	27770	0 %	0 %	100 %	0 %	83582759
31	NC_007641	T	6	6	28192	28197	0 %	100 %	0 %	0 %	83582759
32	NC_007641	T	7	7	28489	28495	0 %	100 %	0 %	0 %	83582759
33	NC_007641	A	8	8	28888	28895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007641	C	6	6	28960	28965	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35	NC_007641	C	6	6	29158	29163	0 %	0 %	0 %	100 %	83582760
36	NC_007641	G	6	6	29963	29968	0 %	0 %	100 %	0 %	83582760
37	NC_007641	A	6	6	30352	30357	100 %	0 %	0 %	0 %	83582760
38	NC_007641	C	6	6	31557	31562	0 %	0 %	0 %	100 %	83582761
39	NC_007641	G	6	6	32528	32533	0 %	0 %	100 %	0 %	83582763
40	NC_007641	G	6	6	32720	32725	0 %	0 %	100 %	0 %	83582763
41	NC_007641	G	6	6	33427	33432	0 %	0 %	100 %	0 %	83582764
42	NC_007641	A	6	6	35243	35248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007641	G	6	6	38070	38075	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007641	C	6	6	40792	40797	0 %	0 %	0 %	100 %	83582770
45	NC_007641	C	6	6	40808	40813	0 %	0 %	0 %	100 %	83582770
46	NC_007641	C	6	6	40848	40853	0 %	0 %	0 %	100 %	83582770
47	NC_007641	C	7	7	41312	41318	0 %	0 %	0 %	100 %	83582770
48	NC_007641	A	6	6	42361	42366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007641	A	7	7	43427	43433	100 %	0 %	0 %	0 %	83582772
50	NC_007641	C	6	6	44857	44862	0 %	0 %	0 %	100 %	83582774
51	NC_007641	A	6	6	46982	46987	100 %	0 %	0 %	0 %	83582775
52	NC_007641	G	6	6	47595	47600	0 %	0 %	100 %	0 %	83582775
53	NC_007641	G	6	6	48202	48207	0 %	0 %	100 %	0 %	83582776
54	NC_007641	A	6	6	48942	48947	100 %	0 %	0 %	0 %	83582776
55	NC_007641	A	6	6	49220	49225	100 %	0 %	0 %	0 %	83582776
56	NC_007641	T	6	6	50560	50565	0 %	100 %	0 %	0 %	83582777
57	NC_007641	A	7	7	50695	50701	100 %	0 %	0 %	0 %	83582777
58	NC_007641	T	6	6	50973	50978	0 %	100 %	0 %	0 %	83582778
59	NC_007641	T	6	6	51110	51115	0 %	100 %	0 %	0 %	83582778
60	NC_007641	C	6	6	51571	51576	0 %	0 %	0 %	100 %	83582778
61	NC_007641	C	6	6	52833	52838	0 %	0 %	0 %	100 %	83582780

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.