MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343 chromosome

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007633	TAGAAA	2	12	1439	1450	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007633	TGATAA	2	12	15943	15954	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007633	TTAATA	2	12	28214	28225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007633	TGAAAA	2	12	41948	41959	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007633	TGATTT	2	12	51272	51283	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007633	TTTTAC	2	12	55303	55314	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_007633	AGATAA	2	12	66525	66536	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007633	AATTTA	2	12	105441	105452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007633	TTTTAA	2	12	112417	112428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007633	ATTTTT	2	12	114906	114917	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007633	AAATAT	2	12	122498	122509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007633	TTTTTA	2	12	190939	190950	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007633	TTTCAT	2	12	191908	191919	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_007633	AAATTT	2	12	241732	241743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007633	AAATAG	2	12	269042	269053	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007633	ATAAAA	2	12	269398	269409	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007633	TTAAAA	2	12	283729	283740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007633	TGCAAA	2	12	309684	309695	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_007633	ATAAAA	2	12	324639	324650	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007633	ATAAAA	2	12	326275	326286	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007633	TAAAAA	2	12	331788	331799	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007633	AATGAA	2	12	339237	339248	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007633	CATTGT	3	18	342364	342381	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_007633	TTCTAA	2	12	365899	365910	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_007633	ATAAAA	2	12	407986	407997	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007633	ATAGTT	2	12	408052	408063	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007633	TTTAGT	2	12	409242	409253	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007633	GTAAAA	2	12	444001	444012	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007633	GTTTTT	2	12	457416	457427	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007633	TTTTAA	2	12	498364	498375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007633	ATTTTT	2	12	507450	507461	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007633	CTTAAA	2	12	514338	514349	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_007633	TAAATA	2	12	514754	514765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007633	TAGAAT	2	12	529185	529196	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007633	ATTTTT	2	12	529565	529576	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007633	TAAAAT	2	12	532468	532479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007633	ATATAA	2	12	536048	536059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007633	ATTAAA	2	12	548174	548185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007633	ATAAAA	2	12	551269	551280	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007633	ATAACA	2	12	568888	568899	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_007633	TATTTT	2	12	585421	585432	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007633	AAAGAA	2	12	615250	615261	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007633	TAAAAA	2	12	623406	623417	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007633	TAAAAA	2	12	631319	631330	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007633	AAAAAG	2	12	648079	648090	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007633	AATTTG	2	12	662371	662382	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007633	TAAAAA	2	12	663168	663179	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007633	GAAAAT	2	12	663370	663381	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007633	AAATAA	2	12	666028	666039	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007633	AAATAT	2	12	680998	681009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007633	TTTCTT	2	12	700572	700583	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_007633	TTCAAT	2	12	700671	700682	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_007633	CATTAC	2	12	700916	700927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007633	AATATT	2	12	701405	701416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007633	TAAATA	2	12	706061	706072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007633	TAAATA	2	12	708672	708683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007633	TCATAT	2	12	708815	708826	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_007633	TAAATA	2	12	711608	711619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007633	TAAAAA	2	12	726822	726833	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007633	GATTTT	2	12	739131	739142	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007633	CTAAAA	2	12	745142	745153	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_007633	CTAGTT	2	12	745292	745303	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_007633	TTTTTA	2	12	749033	749044	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007633	TAAAAA	2	12	775172	775183	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007633	TTTTTA	2	12	816609	816620	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007633	TAATTT	2	12	857276	857287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007633	TATAAA	2	12	858783	858794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007633	TATAAA	2	12	861794	861805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007633	AGATAA	2	12	885604	885615	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007633	TATTTT	2	12	885679	885690	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007633	TTTTAT	2	12	889970	889981	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007633	ATTAAA	2	12	909249	909260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007633	CAAATA	2	12	913764	913775	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_007633	TCAACT	2	12	932508	932519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007633	TTCCAC	2	12	933579	933590	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_007633	AAATAT	2	12	994796	994807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007633	TTTTAT	2	12	994822	994833	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007633	ATATTA	2	12	994896	994907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.