MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343 chromosome

Total Repeats: 199

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007633	TTAAT	2	10	1464	1473	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007633	TTAAA	2	10	1474	1483	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007633	ATATA	2	10	5214	5223	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007633	TAATA	3	15	22175	22189	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007633	TTAAT	2	10	22227	22236	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007633	ATTTT	2	10	27570	27579	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007633	TTTAT	2	10	28202	28211	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007633	ATTTT	2	10	28279	28288	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007633	AATTG	2	10	30116	30125	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007633	TAAAA	2	10	48770	48779	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007633	TTTTA	2	10	60489	60498	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007633	AATTT	2	10	61563	61572	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007633	ATATT	2	10	67204	67213	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007633	TAAAA	2	10	67343	67352	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007633	AATTA	2	10	72591	72600	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007633	TAAAA	2	10	74249	74258	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007633	GTTTT	2	10	74425	74434	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007633	ACTAA	2	10	77235	77244	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_007633	ATTAA	2	10	77279	77288	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007633	TAGTT	2	10	79811	79820	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007633	AATTA	2	10	95161	95170	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007633	CTATA	2	10	100792	100801	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_007633	TATAG	2	10	100817	100826	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007633	TTTTA	2	10	102151	102160	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007633	TTAAT	2	10	102179	102188	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007633	ATAAA	2	10	105221	105230	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007633	AAATT	2	10	105283	105292	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007633	TTTGT	2	10	105383	105392	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007633	AGTAA	2	10	105817	105826	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007633	TAAAA	2	10	111248	111257	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007633	TGTTT	2	10	114881	114890	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007633	TAAAA	2	10	114945	114954	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007633	TATAA	2	10	118726	118735	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007633	TGTAT	2	10	126548	126557	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007633	ATTTT	2	10	132343	132352	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007633	TTTTA	2	10	156842	156851	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007633	ATGCT	2	10	159084	159093	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_007633	TTTTA	2	10	161800	161809	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007633	ATAAA	2	10	178286	178295	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007633	TATTT	2	10	191530	191539	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007633	CAAAT	2	10	195676	195685	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_007633	TAATA	2	10	207294	207303	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007633	GTTTT	2	10	207337	207346	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007633	TAATT	2	10	207380	207389	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007633	CAATA	2	10	207548	207557	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_007633	TTTGC	2	10	213284	213293	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_007633	ATGAA	2	10	214441	214450	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007633	GAAAA	2	10	216304	216313	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007633	TTAAT	2	10	219315	219324	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007633	ATATT	2	10	219332	219341	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007633	CAATA	2	10	219482	219491	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_007633	ATTAT	2	10	222677	222686	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007633	TACTC	2	10	225869	225878	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_007633	TAAAT	2	10	225910	225919	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007633	TTTTG	2	10	227294	227303	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007633	TTAAA	2	10	227357	227366	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007633	ATTTT	2	10	227962	227971	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007633	ATAAA	2	10	240103	240112	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007633	TAAAA	2	10	249584	249593	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007633	TAAAA	2	10	249639	249648	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007633	TAATA	2	10	256942	256951	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007633	CTTTT	2	10	260267	260276	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_007633	TTTTG	2	10	268968	268977	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007633	ATTTA	2	10	269093	269102	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007633	TAGAA	2	10	269343	269352	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007633	AAAAT	2	10	271837	271846	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007633	TTATT	2	10	295961	295970	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007633	ATTTT	2	10	303559	303568	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007633	AATTT	2	10	324536	324545	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007633	TAAAA	2	10	331703	331712	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007633	ATTTT	2	10	371175	371184	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007633	TTTAA	2	10	371204	371213	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007633	TTAAA	2	10	380065	380074	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007633	TATTT	2	10	380171	380180	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007633	TTTAA	2	10	380433	380442	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007633	TAAAC	2	10	389810	389819	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_007633	TTTAG	2	10	407962	407971	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007633	ATATT	3	15	409210	409224	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007633	TAAAT	2	10	412765	412774	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007633	TATTT	2	10	417844	417853	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007633	TAATT	2	10	427812	427821	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007633	TATAA	2	10	427862	427871	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007633	CATAA	2	10	444068	444077	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_007633	TAAAA	2	10	455562	455571	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007633	GAAAA	2	10	466395	466404	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007633	TGGGG	2	10	466461	466470	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007633	TTGAA	2	10	468072	468081	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007633	TTTAA	2	10	478685	478694	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007633	TATTT	2	10	484237	484246	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007633	TTAAT	2	10	484282	484291	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007633	TAATT	2	10	484483	484492	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007633	AGATT	2	10	490160	490169	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007633	TAAAA	2	10	498663	498672	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007633	TTAAT	2	10	501096	501105	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007633	TAAGA	2	10	501132	501141	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007633	ATATT	2	10	501145	501154	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007633	AATTA	2	10	505189	505198	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007633	GTTTT	2	10	505202	505211	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007633	ATTTG	2	10	506050	506059	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007633	ATCCA	2	10	514547	514556	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_007633	ATGAT	2	10	514686	514695	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007633	AATTA	2	10	514709	514718	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007633	TTTAA	2	10	526191	526200	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007633	GAAAA	2	10	526929	526938	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007633	TATCA	2	10	548198	548207	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_007633	CTTTT	2	10	554202	554211	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_007633	TAATT	2	10	556046	556055	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007633	ATCTC	2	10	560360	560369	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_007633	CTAAT	2	10	572175	572184	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_007633	ATTTA	2	10	580494	580503	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007633	AGTAA	2	10	584407	584416	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007633	TAAAA	2	10	614939	614948	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007633	AAATT	2	10	615113	615122	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007633	ACCAA	2	10	615510	615519	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_007633	TAATT	2	10	615525	615534	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007633	ATGAG	2	10	615756	615765	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007633	GTTTT	2	10	616073	616082	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007633	TCAAG	2	10	616144	616153	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_007633	AATTA	2	10	617445	617454	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007633	ATTAT	2	10	623444	623453	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007633	TTAAC	2	10	661139	661148	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_007633	AAAAC	2	10	662511	662520	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_007633	AGAAA	2	10	663085	663094	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007633	AAATA	2	10	663612	663621	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007633	GTATT	2	10	665450	665459	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007633	AACTA	2	10	665841	665850	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_007633	TTGAT	2	10	665942	665951	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007633	TATAA	2	10	682108	682117	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007633	ATAAA	2	10	692043	692052	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007633	TAAAT	2	10	693470	693479	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007633	TCCTT	2	10	695781	695790	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_007633	TCCTT	2	10	695948	695957	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_007633	AATTA	2	10	695993	696002	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007633	TCTTT	2	10	700741	700750	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_007633	TATAA	2	10	707062	707071	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007633	TACCA	2	10	707447	707456	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_007633	TCTAC	2	10	709534	709543	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_007633	AAATA	2	10	714728	714737	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007633	TTCTT	2	10	718648	718657	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_007633	TTAAT	2	10	718729	718738	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007633	AAAAC	2	10	719287	719296	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_007633	TAAAA	2	10	729176	729185	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007633	AGTTA	2	10	730761	730770	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007633	TTAGT	2	10	730771	730780	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007633	AATTA	2	10	737590	737599	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007633	ATTTT	2	10	737855	737864	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007633	ATTTT	2	10	738652	738661	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007633	ATTTC	2	10	739101	739110	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_007633	AAAAT	2	10	739163	739172	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_007633	CTTTA	2	10	1009994	1010003	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.