MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Magnetospirillum magneticum AMB-1 chromosome

Total Repeats: 217

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007626	CGGCGC	2	12	1340	1351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007626	GGGGCG	2	12	20218	20229	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_007626	GCAGAC	2	12	33023	33034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007626	GACCGG	2	12	110616	110627	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007626	GCCCCG	2	12	143756	143767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_007626	CCCGCG	2	12	145248	145259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_007626	CTCGGC	2	12	165938	165949	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007626	GTCGCC	2	12	239177	239188	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_007626	TTGGTC	2	12	310186	310197	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_007626	GTGGAG	2	12	328218	328229	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007626	TTGCGT	2	12	351743	351754	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_007626	ATCCCG	2	12	426361	426372	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_007626	TGCCCT	4	24	427976	427999	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14	NC_007626	TCTAAT	2	12	428857	428868	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_007626	AATCAA	2	12	429611	429622	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_007626	GGTTTG	2	12	430951	430962	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007626	GCTCGG	2	12	434266	434277	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007626	ATCGAG	2	12	434884	434895	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_007626	GCCCGC	2	12	439500	439511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_007626	TCCCTC	2	12	454716	454727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_007626	TCCCTC	2	12	456228	456239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_007626	GGACAA	2	12	517334	517345	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_007626	CCATCC	2	12	517557	517568	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_007626	AATCTC	2	12	517934	517945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007626	CGTCCT	2	12	519399	519410	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_007626	CGGGCG	2	12	538960	538971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007626	TGGACG	2	12	554937	554948	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_007626	TCGCCT	2	12	555051	555062	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_007626	CCGGGG	2	12	638196	638207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007626	GCGCCC	2	12	665265	665276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_007626	CCTTCG	2	12	703021	703032	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_007626	TAGATA	2	12	711803	711814	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007626	CTCGCT	2	12	727942	727953	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
34	NC_007626	CGCCCG	2	12	788346	788357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_007626	CCGGGG	2	12	830585	830596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007626	GGGGGA	2	12	891483	891494	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007626	GGCGGT	2	12	939776	939787	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_007626	TCGGCC	2	12	939921	939932	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_007626	GTAGGC	2	12	967530	967541	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_007626	GGATGT	2	12	968889	968900	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007626	CTTCGG	2	12	981573	981584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007626	GTTCAG	2	12	984590	984601	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_007626	TCGACC	2	12	988798	988809	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
44	NC_007626	ACGGCC	2	12	991252	991263	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45	NC_007626	GCCGGA	2	12	1009581	1009592	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007626	ATCCGA	2	12	1021439	1021450	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007626	GCTGAT	2	12	1048631	1048642	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_007626	TTTAAT	2	12	1048757	1048768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007626	ACCTGA	2	12	1050633	1050644	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007626	ATTCGG	2	12	1060043	1060054	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_007626	AACGCC	2	12	1086588	1086599	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_007626	GTGTCC	2	12	1102972	1102983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007626	ACGCAC	2	12	1167104	1167115	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_007626	TCCCCC	2	12	1185257	1185268	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
55	NC_007626	CCTGAT	2	12	1190664	1190675	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_007626	AGGTCG	2	12	1195572	1195583	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_007626	GCTCGG	2	12	1199565	1199576	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007626	CAGAGG	2	12	1208773	1208784	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_007626	GACCTC	2	12	1259777	1259788	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
60	NC_007626	TTTGTG	2	12	1268923	1268934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007626	CCGGGT	2	12	1269027	1269038	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_007626	CCAAAG	2	12	1279668	1279679	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007626	CTGTGT	2	12	1319949	1319960	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_007626	CCGGGG	2	12	1324893	1324904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007626	TGATCC	2	12	1338699	1338710	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_007626	CAGCGG	2	12	1353942	1353953	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_007626	CAACGG	2	12	1370879	1370890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007626	TGGACG	2	12	1370992	1371003	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_007626	CTCGCT	2	12	1401980	1401991	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_007626	GAGATC	2	12	1404175	1404186	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_007626	CGGGGC	2	12	1484777	1484788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007626	CGAAGG	2	12	1488271	1488282	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_007626	ACCATG	2	12	1530914	1530925	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_007626	CCTTAC	2	12	1631110	1631121	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_007626	ATGCCG	2	12	1642243	1642254	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007626	AGGGGG	2	12	1643569	1643580	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007626	TCGGCG	2	12	1653736	1653747	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007626	CCTTAC	2	12	1657743	1657754	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_007626	CCCGGG	2	12	1732759	1732770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_007626	GGCCGA	2	12	1732889	1732900	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_007626	GGTGCC	2	12	1732910	1732921	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_007626	CCAGAA	2	12	1750162	1750173	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007626	CAGGCC	2	12	1750271	1750282	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
84	NC_007626	GGGCGA	2	12	1750297	1750308	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_007626	TCTGGC	2	12	1758837	1758848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_007626	GCCATC	2	12	1758893	1758904	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_007626	TCAAGT	2	12	1766297	1766308	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_007626	ATCGCA	2	12	1800583	1800594	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007626	GTAGGC	2	12	1829750	1829761	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_007626	GGATGT	2	12	1831109	1831120	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007626	GATTGC	2	12	1845480	1845491	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_007626	TTTGGC	2	12	1871204	1871215	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_007626	GGCCCC	2	12	1897367	1897378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_007626	AGGGCG	2	12	2023260	2023271	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_007626	CTGAAC	2	12	2069048	2069059	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_007626	GTGCGC	2	12	2120547	2120558	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_007626	GCCATG	2	12	2121369	2121380	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_007626	GGTGGC	2	12	2121704	2121715	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_007626	CCTGGC	2	12	2193190	2193201	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_007626	GCGCGG	2	12	2193322	2193333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007626	GAGGCA	2	12	2210937	2210948	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_007626	GTGTTG	2	12	2225745	2225756	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007626	CTGTTT	2	12	2235289	2235300	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_007626	GCAATG	2	12	2255004	2255015	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_007626	GACAAG	2	12	2289637	2289648	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_007626	AGCGTC	2	12	2300178	2300189	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007626	CGGGAA	2	12	2325857	2325868	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_007626	CTGTTG	2	12	2329723	2329734	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_007626	AGTCGT	2	12	2347442	2347453	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_007626	TGGCCG	2	12	2367725	2367736	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_007626	ACTGAA	2	12	2369349	2369360	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_007626	TGAAGC	2	12	2370934	2370945	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_007626	CCGAAG	2	12	2375136	2375147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_007626	GATTCG	2	12	2379002	2379013	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_007626	GTCTTG	2	12	2380169	2380180	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_007626	TCGAGA	2	12	2388607	2388618	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_007626	GAGGCC	2	12	2446581	2446592	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_007626	GCGAGT	2	12	2474515	2474526	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_007626	AGAAAA	2	12	2499911	2499922	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007626	TGCTGA	2	12	2552360	2552371	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_007626	TGCGGT	2	12	2621150	2621161	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_007626	GGGCCA	2	12	2712905	2712916	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_007626	GCCAAG	2	12	2747571	2747582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_007626	CCTTTT	2	12	2836953	2836964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_007626	CTTAAG	2	12	2854221	2854232	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_007626	CCCGTC	2	12	2854292	2854303	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_007626	GGGCCG	2	12	2858110	2858121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_007626	CGAAGC	2	12	2860202	2860213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_007626	TCCCCC	2	12	2942382	2942393	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
130	NC_007626	GCCCCC	2	12	2998734	2998745	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
131	NC_007626	CGGCGA	2	12	3024771	3024782	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_007626	CGCGGG	2	12	3094551	3094562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_007626	GCATCG	2	12	3211069	3211080	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_007626	CACGTC	2	12	3233381	3233392	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
135	NC_007626	CTTGTC	2	12	3233828	3233839	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_007626	CCCGCG	2	12	3354758	3354769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_007626	GCCCAG	2	12	3368385	3368396	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
138	NC_007626	GCCGAA	2	12	3377267	3377278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_007626	ATTGGA	2	12	3416748	3416759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007626	GAAGCG	2	12	3426885	3426896	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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142	NC_007626	AATGGC	2	12	3447159	3447170	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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144	NC_007626	TCAAGG	2	12	3463459	3463470	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_007626	TTCAGG	2	12	3491729	3491740	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_007626	CTGCGC	2	12	3503842	3503853	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
147	NC_007626	CGAGCC	2	12	3504381	3504392	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
148	NC_007626	GCCATC	2	12	3506874	3506885	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
149	NC_007626	GCCCTG	2	12	3510081	3510092	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
150	NC_007626	TCGCCA	2	12	3526588	3526599	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
151	NC_007626	CCGAGG	2	12	3531570	3531581	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_007626	ATGTTG	2	12	3533770	3533781	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_007626	GTTTGA	2	12	3534737	3534748	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_007626	CTATCG	2	12	3570672	3570683	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_007626	GAGTTG	2	12	3603791	3603802	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
156	NC_007626	CCTCGA	2	12	3628845	3628856	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
157	NC_007626	GGCAAG	2	12	3660348	3660359	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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161	NC_007626	GCCCCC	2	12	3784165	3784176	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
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166	NC_007626	CGATGC	2	12	3798439	3798450	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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168	NC_007626	GCGGCC	2	12	3859386	3859397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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174	NC_007626	ATTCTG	2	12	3983021	3983032	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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217	NC_007626	GCCCGG	2	12	4953606	4953617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.