MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Magnetospirillum magneticum AMB-1 chromosome

Total Repeats: 3554

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_007626	TCACCT	2	12	4897109	4897120	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	83313583
3502	NC_007626	CCACCG	2	12	4898115	4898126	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	83313585
3503	NC_007626	GGCCAG	2	12	4898525	4898536	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	83313586
3504	NC_007626	CCTTGA	2	12	4899274	4899285	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	83313586
3505	NC_007626	CAGGGC	2	12	4899856	4899867	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	83313587
3506	NC_007626	GCCGAA	2	12	4900009	4900020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83313587
3507	NC_007626	GCGTTC	2	12	4900264	4900275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83313587
3508	NC_007626	GGCGCC	2	12	4900402	4900413	0 %	0 %	50 %	50 %	83313587
3509	NC_007626	ACCGAC	2	12	4901079	4901090	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	83313588
3510	NC_007626	ATCCTG	2	12	4902503	4902514	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	83313589
3511	NC_007626	GGCCAA	2	12	4902875	4902886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83313590
3512	NC_007626	CGACGG	3	18	4907524	4907541	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	83313592
3513	NC_007626	CTGGGC	2	12	4910640	4910651	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	83313593
3514	NC_007626	TCCATC	2	12	4911392	4911403	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	83313595
3515	NC_007626	TCTCGG	2	12	4911675	4911686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83313595
3516	NC_007626	ACCGGC	2	12	4913669	4913680	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	83313597
3517	NC_007626	GGGCCG	2	12	4914095	4914106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83313598
3518	NC_007626	TTCGCC	2	12	4914115	4914126	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	83313598
3519	NC_007626	CCTGGG	2	12	4916750	4916761	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	83313600
3520	NC_007626	CATCGA	2	12	4919901	4919912	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	83313605
3521	NC_007626	CATGCG	2	12	4921086	4921097	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_007626	AGCGCT	2	12	4921509	4921520	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_007626	CAGGTG	2	12	4921632	4921643	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	83313606
3524	NC_007626	CGAGGT	2	12	4922018	4922029	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	83313606
3525	NC_007626	GGGCCG	2	12	4924384	4924395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83313608
3526	NC_007626	TCGGCC	2	12	4926412	4926423	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	83313610
3527	NC_007626	TGGCGG	2	12	4929205	4929216	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	83313610
3528	NC_007626	AGCCAG	2	12	4932714	4932725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83313617
3529	NC_007626	TCAATT	2	12	4934133	4934144	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3530	NC_007626	AATACT	2	12	4934174	4934185	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3531	NC_007626	CGTGCT	2	12	4935642	4935653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83313620
3532	NC_007626	TCAAGA	2	12	4935960	4935971	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	83313620
3533	NC_007626	CGATGC	2	12	4938229	4938240	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_007626	GCCGCG	2	12	4942533	4942544	0 %	0 %	50 %	50 %	83313629
3535	NC_007626	ATCGAC	2	12	4947320	4947331	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	83313635
3536	NC_007626	CTCGCC	2	12	4950837	4950848	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	83313640
3537	NC_007626	GACCTG	2	12	4951200	4951211	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	83313640
3538	NC_007626	TGCCGA	2	12	4951819	4951830	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	83313641
3539	NC_007626	GGGAGC	2	12	4952456	4952467	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	83313641
3540	NC_007626	GCGCAG	2	12	4953121	4953132	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	83313642
3541	NC_007626	GCCCGG	2	12	4953606	4953617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3542	NC_007626	GGCGTC	2	12	4955676	4955687	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	83313645
3543	NC_007626	CTTCCT	2	12	4957379	4957390	0 %	50 %	0 %	50 %	83313648
3544	NC_007626	GCGGCA	2	12	4957490	4957501	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	83313648
3545	NC_007626	GAGGTG	2	12	4958010	4958021	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	83313648
3546	NC_007626	GCCAAG	2	12	4958914	4958925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83313649
3547	NC_007626	TCGTCA	2	12	4960954	4960965	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	83313651
3548	NC_007626	ACGGCG	2	12	4961342	4961353	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	83313652
3549	NC_007626	GAAGCT	2	12	4961622	4961633	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	83313652
3550	NC_007626	GTCCAT	2	12	4965434	4965445	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	83313656
3551	NC_007626	CCTCGC	2	12	4965490	4965501	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	83313656
3552	NC_007626	TGGCCT	2	12	4966348	4966359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83313656
3553	NC_007626	CGTGGA	2	12	4966561	4966572	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	83313657
3554	NC_007626	GGTGAT	2	12	4967013	4967024	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	83313658

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.