MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Magnetospirillum magneticum AMB-1 chromosome

Total Repeats: 3840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007626	CGGGG	2	10	166	175	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
2	NC_007626	CGCGC	2	10	339	348	0 %	0 %	40 %	60 %	83309100
3	NC_007626	CCCGG	2	10	1984	1993	0 %	0 %	40 %	60 %	83309101
4	NC_007626	CGCGG	2	10	2548	2557	0 %	0 %	60 %	40 %	83309101
5	NC_007626	GACCT	2	10	5504	5513	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_007626	CGGCC	2	10	6758	6767	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7	NC_007626	GGGGT	2	10	6981	6990	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007626	TGGCG	2	10	9950	9959	0 %	20 %	60 %	20 %	83309111
9	NC_007626	GAGCC	2	10	10607	10616	20 %	0 %	40 %	40 %	83309111
10	NC_007626	TTTTG	2	10	11916	11925	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007626	GGTCA	2	10	13384	13393	20 %	20 %	40 %	20 %	83309113
12	NC_007626	TCCGC	2	10	13677	13686	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
13	NC_007626	CCGGC	2	10	13948	13957	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
14	NC_007626	CGGCC	2	10	14067	14076	0 %	0 %	40 %	60 %	83309114
15	NC_007626	CGGTT	2	10	14821	14830	0 %	40 %	40 %	20 %	83309114
16	NC_007626	TGGGG	2	10	15323	15332	0 %	20 %	80 %	0 %	83309115
17	NC_007626	CGTCG	2	10	15743	15752	0 %	20 %	40 %	40 %	83309115
18	NC_007626	CCGGC	2	10	15869	15878	0 %	0 %	40 %	60 %	83309115
19	NC_007626	TCCCG	2	10	18520	18529	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_007626	CTGCG	2	10	21031	21040	0 %	20 %	40 %	40 %	83309119
21	NC_007626	CCGCT	2	10	22922	22931	0 %	20 %	20 %	60 %	83309121
22	NC_007626	GCTGG	2	10	23609	23618	0 %	20 %	60 %	20 %	83309122
23	NC_007626	TTGCC	2	10	24320	24329	0 %	40 %	20 %	40 %	83309123
24	NC_007626	GCCCG	2	10	25634	25643	0 %	0 %	40 %	60 %	83309124
25	NC_007626	GAAGC	2	10	27797	27806	40 %	0 %	40 %	20 %	83309126
26	NC_007626	CTGGA	2	10	29705	29714	20 %	20 %	40 %	20 %	83309126
27	NC_007626	GTACG	2	10	30371	30380	20 %	20 %	40 %	20 %	83309127
28	NC_007626	GCGCC	2	10	31108	31117	0 %	0 %	40 %	60 %	83309128
29	NC_007626	AGCGG	2	10	31148	31157	20 %	0 %	60 %	20 %	83309128
30	NC_007626	GGCCC	2	10	31171	31180	0 %	0 %	40 %	60 %	83309128
31	NC_007626	GGGCC	2	10	32712	32721	0 %	0 %	60 %	40 %	83309129
32	NC_007626	ATTCG	2	10	32963	32972	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_007626	GGCGA	2	10	34939	34948	20 %	0 %	60 %	20 %	83309130
34	NC_007626	CCAAG	2	10	36194	36203	40 %	0 %	20 %	40 %	83309130
35	NC_007626	GCGGG	2	10	36457	36466	0 %	0 %	80 %	20 %	83309130
36	NC_007626	GCTGG	2	10	37547	37556	0 %	20 %	60 %	20 %	83309130
37	NC_007626	CGGCG	2	10	41950	41959	0 %	0 %	60 %	40 %	83309135
38	NC_007626	TCCAC	2	10	42129	42138	20 %	20 %	0 %	60 %	83309135
39	NC_007626	CGGGC	2	10	44183	44192	0 %	0 %	60 %	40 %	83309137
40	NC_007626	AGCCA	2	10	45853	45862	40 %	0 %	20 %	40 %	83309138
41	NC_007626	CGCGC	2	10	47908	47917	0 %	0 %	40 %	60 %	83309139
42	NC_007626	GCCTA	2	10	48760	48769	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_007626	CCAGC	2	10	49851	49860	20 %	0 %	20 %	60 %	83309141
44	NC_007626	GGGCT	2	10	50963	50972	0 %	20 %	60 %	20 %	83309142
45	NC_007626	TTTCC	2	10	51832	51841	0 %	60 %	0 %	40 %	83309143
46	NC_007626	CGGAT	2	10	51930	51939	20 %	20 %	40 %	20 %	83309143
47	NC_007626	CTCGG	2	10	52054	52063	0 %	20 %	40 %	40 %	83309143
48	NC_007626	CCTGC	2	10	53158	53167	0 %	20 %	20 %	60 %	83309144
49	NC_007626	TGGCC	2	10	55007	55016	0 %	20 %	40 %	40 %	83309146
50	NC_007626	GGGAA	2	10	57469	57478	40 %	0 %	60 %	0 %	83309150
51	NC_007626	CGGCC	2	10	58055	58064	0 %	0 %	40 %	60 %	83309150
52	NC_007626	CTGGC	2	10	60051	60060	0 %	20 %	40 %	40 %	83309152
53	NC_007626	GCCTC	2	10	60419	60428	0 %	20 %	20 %	60 %	83309152
54	NC_007626	CAGCT	2	10	62900	62909	20 %	20 %	20 %	40 %	83309155
55	NC_007626	CAGTT	2	10	63244	63253	20 %	40 %	20 %	20 %	83309156
56	NC_007626	GGGTT	2	10	63726	63735	0 %	40 %	60 %	0 %	83309156
57	NC_007626	ATCGG	2	10	64130	64139	20 %	20 %	40 %	20 %	83309157
58	NC_007626	CGGCG	2	10	64450	64459	0 %	0 %	60 %	40 %	83309157
59	NC_007626	CTGGA	2	10	65015	65024	20 %	20 %	40 %	20 %	83309157
60	NC_007626	CATGG	2	10	66911	66920	20 %	20 %	40 %	20 %	83309159
61	NC_007626	CCGCT	2	10	67039	67048	0 %	20 %	20 %	60 %	83309159
62	NC_007626	GGCGA	2	10	68853	68862	20 %	0 %	60 %	20 %	83309160
63	NC_007626	AGCCA	2	10	69832	69841	40 %	0 %	20 %	40 %	83309161
64	NC_007626	AGGCG	2	10	73079	73088	20 %	0 %	60 %	20 %	83309164
65	NC_007626	GCGCT	2	10	78039	78048	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_007626	CATTG	2	10	78264	78273	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_007626	CTGGT	2	10	78682	78691	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_007626	GATCA	2	10	79689	79698	40 %	20 %	20 %	20 %	83309171
69	NC_007626	GCACG	2	10	80316	80325	20 %	0 %	40 %	40 %	83309172
70	NC_007626	CGGGG	2	10	81357	81366	0 %	0 %	80 %	20 %	83309172
71	NC_007626	GGGCC	2	10	82657	82666	0 %	0 %	60 %	40 %	83309173
72	NC_007626	CAAAT	2	10	83353	83362	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_007626	CGGAC	2	10	86949	86958	20 %	0 %	40 %	40 %	83309177
74	NC_007626	CCCTG	2	10	87079	87088	0 %	20 %	20 %	60 %	83309177
75	NC_007626	GCCAT	2	10	87567	87576	20 %	20 %	20 %	40 %	83309178
76	NC_007626	CGGCG	2	10	88218	88227	0 %	0 %	60 %	40 %	83309178
77	NC_007626	CCGTG	2	10	89333	89342	0 %	20 %	40 %	40 %	83309179
78	NC_007626	GCCGG	2	10	89501	89510	0 %	0 %	60 %	40 %	83309180
79	NC_007626	GCGCC	2	10	90091	90100	0 %	0 %	40 %	60 %	83309180
80	NC_007626	TGAAC	2	10	92064	92073	40 %	20 %	20 %	20 %	83309182
81	NC_007626	TGCCC	2	10	92253	92262	0 %	20 %	20 %	60 %	83309182
82	NC_007626	CGTGG	2	10	92396	92405	0 %	20 %	60 %	20 %	83309183
83	NC_007626	CCGGC	2	10	92950	92959	0 %	0 %	40 %	60 %	83309183
84	NC_007626	TCGGG	2	10	93110	93119	0 %	20 %	60 %	20 %	83309183
85	NC_007626	CCGCG	2	10	93904	93913	0 %	0 %	40 %	60 %	83309184
86	NC_007626	GGAGA	2	10	95598	95607	40 %	0 %	60 %	0 %	83309185
87	NC_007626	GGCAA	2	10	95941	95950	40 %	0 %	40 %	20 %	83309185
88	NC_007626	GGCGG	2	10	96106	96115	0 %	0 %	80 %	20 %	83309185
89	NC_007626	GGAGT	2	10	96364	96373	20 %	20 %	60 %	0 %	83309186
90	NC_007626	CCGAC	2	10	99001	99010	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
91	NC_007626	ACGGC	2	10	100644	100653	20 %	0 %	40 %	40 %	83309189
92	NC_007626	GGGAA	2	10	100733	100742	40 %	0 %	60 %	0 %	83309189
93	NC_007626	CGCCA	2	10	101876	101885	20 %	0 %	20 %	60 %	83309191
94	NC_007626	GACGG	2	10	104391	104400	20 %	0 %	60 %	20 %	83309192
95	NC_007626	GGATG	2	10	104452	104461	20 %	20 %	60 %	0 %	83309192
96	NC_007626	CGTGG	2	10	105896	105905	0 %	20 %	60 %	20 %	83309193
97	NC_007626	CCAGG	2	10	106796	106805	20 %	0 %	40 %	40 %	83309194
98	NC_007626	TCGCC	2	10	110154	110163	0 %	20 %	20 %	60 %	83309196
99	NC_007626	CAGGT	2	10	110340	110349	20 %	20 %	40 %	20 %	83309196
100	NC_007626	TCGGC	2	10	112736	112745	0 %	20 %	40 %	40 %	83309198
101	NC_007626	CGGCC	2	10	113588	113597	0 %	0 %	40 %	60 %	83309198
102	NC_007626	GATCA	2	10	118486	118495	40 %	20 %	20 %	20 %	83309202
103	NC_007626	CTCGG	2	10	119400	119409	0 %	20 %	40 %	40 %	83309203
104	NC_007626	TGCCG	2	10	119423	119432	0 %	20 %	40 %	40 %	83309203
105	NC_007626	CCCCG	2	10	120395	120404	0 %	0 %	20 %	80 %	83309204
106	NC_007626	GGCCG	2	10	121579	121588	0 %	0 %	60 %	40 %	83309204
107	NC_007626	TGGGC	2	10	122095	122104	0 %	20 %	60 %	20 %	83309204
108	NC_007626	GAAAT	2	10	122345	122354	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007626	GCGCC	2	10	122727	122736	0 %	0 %	40 %	60 %	83309205
110	NC_007626	GGCCC	2	10	123258	123267	0 %	0 %	40 %	60 %	83309206
111	NC_007626	AGGAC	2	10	124705	124714	40 %	0 %	40 %	20 %	83309207
112	NC_007626	CACGC	2	10	126209	126218	20 %	0 %	20 %	60 %	83309208
113	NC_007626	CCCAG	2	10	126788	126797	20 %	0 %	20 %	60 %	83309208
114	NC_007626	CGGTC	2	10	126884	126893	0 %	20 %	40 %	40 %	83309208
115	NC_007626	CAGGA	2	10	127593	127602	40 %	0 %	40 %	20 %	83309209
116	NC_007626	AAATC	2	10	129520	129529	60 %	20 %	0 %	20 %	83309211
117	NC_007626	CTTCT	2	10	130293	130302	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_007626	GCTCT	2	10	130675	130684	0 %	40 %	20 %	40 %	83309212
119	NC_007626	CGGCA	2	10	130890	130899	20 %	0 %	40 %	40 %	83309212
120	NC_007626	CGCGG	2	10	131529	131538	0 %	0 %	60 %	40 %	83309212
121	NC_007626	GCCGG	2	10	135053	135062	0 %	0 %	60 %	40 %	83309216
122	NC_007626	CCTGG	2	10	137801	137810	0 %	20 %	40 %	40 %	83309218
123	NC_007626	GGCCT	2	10	138054	138063	0 %	20 %	40 %	40 %	83309218
124	NC_007626	GGGTG	2	10	138279	138288	0 %	20 %	80 %	0 %	83309218
125	NC_007626	CCACG	2	10	138968	138977	20 %	0 %	20 %	60 %	83309218
126	NC_007626	GCGCC	2	10	139552	139561	0 %	0 %	40 %	60 %	83309219
127	NC_007626	GACGT	2	10	140304	140313	20 %	20 %	40 %	20 %	83309219
128	NC_007626	GGCCG	2	10	143160	143169	0 %	0 %	60 %	40 %	83309222
129	NC_007626	TACCG	2	10	146125	146134	20 %	20 %	20 %	40 %	83309225
130	NC_007626	GCCGC	2	10	149490	149499	0 %	0 %	40 %	60 %	83309228
131	NC_007626	TCGCC	2	10	150211	150220	0 %	20 %	20 %	60 %	83309229
132	NC_007626	GCCGG	2	10	150610	150619	0 %	0 %	60 %	40 %	83309229
133	NC_007626	CGGCC	2	10	152002	152011	0 %	0 %	40 %	60 %	83309230
134	NC_007626	GGCTG	2	10	156281	156290	0 %	20 %	60 %	20 %	83309235
135	NC_007626	GCCGC	2	10	156881	156890	0 %	0 %	40 %	60 %	83309235
136	NC_007626	ACGGC	2	10	157998	158007	20 %	0 %	40 %	40 %	83309236
137	NC_007626	GCCCC	2	10	159658	159667	0 %	0 %	20 %	80 %	83309237
138	NC_007626	CCAGG	2	10	160844	160853	20 %	0 %	40 %	40 %	83309239
139	NC_007626	GCGAA	2	10	162294	162303	40 %	0 %	40 %	20 %	83309240
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387	NC_007626	CGCCC	2	10	464568	464577	0 %	0 %	20 %	80 %	83309523
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389	NC_007626	GCCGA	2	10	465602	465611	20 %	0 %	40 %	40 %	83309524
390	NC_007626	GAAAT	2	10	468929	468938	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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397	NC_007626	TTCCA	2	10	474510	474519	20 %	40 %	0 %	40 %	83309531
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403	NC_007626	GCCCG	2	10	485837	485846	0 %	0 %	40 %	60 %	83309540
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