MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Magnetospirillum magneticum AMB-1 chromosome

Total Repeats: 538

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007626	CGGGG	2	10	166	175	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
2	NC_007626	GACCT	2	10	5504	5513	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_007626	CGGCC	2	10	6758	6767	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4	NC_007626	GGGGT	2	10	6981	6990	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007626	TTTTG	2	10	11916	11925	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007626	TCCGC	2	10	13677	13686	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_007626	CCGGC	2	10	13948	13957	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8	NC_007626	TCCCG	2	10	18520	18529	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_007626	ATTCG	2	10	32963	32972	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_007626	GCCTA	2	10	48760	48769	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_007626	GCGCT	2	10	78039	78048	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_007626	CATTG	2	10	78264	78273	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_007626	CTGGT	2	10	78682	78691	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_007626	CAAAT	2	10	83353	83362	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_007626	CCGAC	2	10	99001	99010	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_007626	GAAAT	2	10	122345	122354	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007626	CTTCT	2	10	130293	130302	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_007626	CCCGG	2	10	165575	165584	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19	NC_007626	GCCGC	2	10	191070	191079	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
20	NC_007626	TGGGC	2	10	222297	222306	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_007626	CCCGT	2	10	236154	236163	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_007626	CGGAT	2	10	236265	236274	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_007626	GGCGG	2	10	252050	252059	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
24	NC_007626	GCATT	2	10	276967	276976	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_007626	TGAGG	2	10	278821	278830	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007626	TGAAG	2	10	298999	299008	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007626	CTTCG	2	10	302316	302325	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_007626	ACTCG	2	10	310168	310177	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_007626	GACGG	2	10	322592	322601	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
30	NC_007626	GGCGG	2	10	332564	332573	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
31	NC_007626	TGACC	2	10	352098	352107	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_007626	GGAAC	2	10	374749	374758	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_007626	TGGCC	2	10	379716	379725	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_007626	TCTCT	2	10	380643	380652	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_007626	CGTGC	2	10	380867	380876	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_007626	TTGCC	2	10	381062	381071	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_007626	GGTTC	2	10	400793	400802	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_007626	TGTAC	2	10	429630	429639	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_007626	TCGCC	2	10	430644	430653	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_007626	GGGCA	2	10	431125	431134	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_007626	ATGGG	2	10	433135	433144	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007626	CAAAT	2	10	433529	433538	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_007626	GTTCG	2	10	443577	443586	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_007626	ATTCA	2	10	446435	446444	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_007626	GAAAT	2	10	447448	447457	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007626	CCGGC	2	10	451972	451981	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
47	NC_007626	CGCCC	2	10	452226	452235	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
48	NC_007626	GCCGC	2	10	452392	452401	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
49	NC_007626	CGCCT	2	10	452893	452902	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
50	NC_007626	GGCGG	2	10	456300	456309	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
51	NC_007626	CGCGG	2	10	463299	463308	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
52	NC_007626	GAAAT	2	10	468929	468938	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007626	CGGGG	2	10	473541	473550	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
54	NC_007626	TTTCC	2	10	474659	474668	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_007626	ATTGT	2	10	512831	512840	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007626	GAATT	2	10	515303	515312	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007626	GAGCG	2	10	531459	531468	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
58	NC_007626	GGGGC	2	10	554268	554277	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
59	NC_007626	GCGCC	2	10	555232	555241	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
60	NC_007626	CGCCA	2	10	555323	555332	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
61	NC_007626	TCATC	2	10	555577	555586	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_007626	CCGGC	2	10	564123	564132	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
63	NC_007626	CAAAA	2	10	579797	579806	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_007626	GGGGC	2	10	584513	584522	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
65	NC_007626	TTTTC	2	10	597995	598004	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_007626	GGTCG	2	10	598050	598059	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_007626	GGGTC	2	10	604460	604469	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
68	NC_007626	GCCCG	2	10	605641	605650	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
69	NC_007626	GTTCG	2	10	608011	608020	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_007626	GGCTT	2	10	631834	631843	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_007626	GGAAG	2	10	632956	632965	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007626	GAGAA	2	10	635284	635293	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007626	GCCGC	2	10	638928	638937	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
74	NC_007626	CCAGG	2	10	665285	665294	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_007626	AGCCA	2	10	665513	665522	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_007626	CGAAG	2	10	669397	669406	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_007626	TCGCT	2	10	678257	678266	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_007626	AGTAG	2	10	690769	690778	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007626	TAGAT	2	10	706863	706872	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007626	CACGT	2	10	711287	711296	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_007626	AATAA	2	10	711936	711945	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007626	GGCGC	2	10	721765	721774	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
83	NC_007626	TGTTT	2	10	735976	735985	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007626	CTCTT	2	10	737859	737868	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_007626	CGGGC	2	10	743419	743428	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
86	NC_007626	GGCGG	2	10	749467	749476	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
87	NC_007626	GAGGG	2	10	751239	751248	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007626	AGAAA	2	10	757460	757469	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007626	GCCGC	2	10	764025	764034	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
90	NC_007626	GAATT	2	10	769239	769248	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007626	AGCGA	2	10	772728	772737	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_007626	TTTAC	2	10	839222	839231	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_007626	GCTCC	2	10	872350	872359	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
94	NC_007626	GGGGA	2	10	880441	880450	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007626	AAGCG	2	10	901651	901660	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_007626	TGGGC	2	10	939154	939163	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
97	NC_007626	TCCGG	2	10	939467	939476	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_007626	CCGGC	2	10	940275	940284	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
99	NC_007626	CGGGC	2	10	944461	944470	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
100	NC_007626	TTTCA	2	10	962473	962482	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_007626	CGGGT	2	10	964670	964679	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
102	NC_007626	TCGTG	2	10	965916	965925	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_007626	GGGCT	2	10	966060	966069	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
104	NC_007626	GTATC	2	10	968346	968355	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_007626	AAGCT	2	10	969641	969650	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_007626	ATCCC	2	10	969805	969814	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
107	NC_007626	GTGAG	2	10	979619	979628	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007626	TGGTG	2	10	981312	981321	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007626	CAGCC	2	10	985151	985160	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
110	NC_007626	GAACC	2	10	988452	988461	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_007626	GTCTG	2	10	991639	991648	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_007626	CCATC	2	10	1010058	1010067	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
113	NC_007626	GGGCG	2	10	1010712	1010721	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
114	NC_007626	GTTTC	2	10	1017550	1017559	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_007626	GGAGC	2	10	1017699	1017708	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
116	NC_007626	GGGAC	2	10	1037216	1037225	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
117	NC_007626	CGGGC	2	10	1040011	1040020	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
118	NC_007626	CCATT	2	10	1047891	1047900	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_007626	CGAGC	2	10	1048560	1048569	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
120	NC_007626	AGGGA	2	10	1050496	1050505	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007626	CGCCA	2	10	1050596	1050605	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
122	NC_007626	CGTGG	2	10	1050647	1050656	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_007626	CCACC	2	10	1058644	1058653	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
124	NC_007626	CATCC	2	10	1060197	1060206	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
125	NC_007626	TCACA	2	10	1060324	1060333	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_007626	TGCCT	2	10	1062682	1062691	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_007626	AGGCG	2	10	1063510	1063519	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
128	NC_007626	GCGTG	2	10	1063541	1063550	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
129	NC_007626	TGCCG	2	10	1069736	1069745	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_007626	GGAAT	2	10	1078507	1078516	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007626	CGGCG	2	10	1086623	1086632	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
132	NC_007626	AGGGG	2	10	1115321	1115330	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007626	GACGC	2	10	1130235	1130244	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
134	NC_007626	CTTGC	2	10	1135062	1135071	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
135	NC_007626	GGAGT	2	10	1158051	1158060	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007626	CCCGG	2	10	1164258	1164267	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
137	NC_007626	GGGGT	2	10	1166127	1166136	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007626	CCTTG	2	10	1213363	1213372	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_007626	ACGTC	2	10	1229028	1229037	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_007626	GGAAA	2	10	1229140	1229149	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007626	CGGTT	2	10	1229866	1229875	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_007626	GCAAT	2	10	1237516	1237525	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_007626	AGGCG	2	10	1239087	1239096	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
144	NC_007626	AAGGC	2	10	1279762	1279771	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
145	NC_007626	CCCGG	2	10	1304281	1304290	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
146	NC_007626	TGCCG	2	10	1304401	1304410	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
147	NC_007626	GTGAT	2	10	1324792	1324801	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007626	ATGGA	2	10	1353507	1353516	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_007626	GCCGC	2	10	1405259	1405268	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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170	NC_007626	TCGGT	2	10	1561814	1561823	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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194	NC_007626	ACTGA	2	10	1759513	1759522	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
195	NC_007626	CATTT	2	10	1762352	1762361	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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282	NC_007626	AATGC	2	10	2342020	2342029	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
283	NC_007626	CGGGC	2	10	2358484	2358493	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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285	NC_007626	CATTT	2	10	2371435	2371444	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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