MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Magnetospirillum magneticum AMB-1 chromosome

Total Repeats: 1581

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_007626	CCGC	2	8	4687045	4687052	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1502	NC_007626	CCCG	2	8	4692731	4692738	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1503	NC_007626	CCCG	2	8	4692924	4692931	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1504	NC_007626	TCCC	2	8	4693008	4693015	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1505	NC_007626	TTTG	2	8	4698487	4698494	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_007626	CATT	2	8	4703265	4703272	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1507	NC_007626	CCCG	2	8	4707150	4707157	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1508	NC_007626	ACAG	2	8	4709444	4709451	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1509	NC_007626	GATG	2	8	4710979	4710986	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_007626	GTTC	2	8	4712596	4712603	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1511	NC_007626	ACGG	2	8	4714029	4714036	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1512	NC_007626	GGGT	2	8	4717326	4717333	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_007626	GGGT	2	8	4728170	4728177	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_007626	GCCC	2	8	4729915	4729922	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1515	NC_007626	TTCA	2	8	4729940	4729947	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1516	NC_007626	CAGC	2	8	4736593	4736600	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1517	NC_007626	TGGG	2	8	4746452	4746459	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_007626	CCCA	2	8	4746465	4746472	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1519	NC_007626	GGAG	2	8	4750296	4750303	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_007626	TTCA	2	8	4751312	4751319	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1521	NC_007626	GGCC	2	8	4760115	4760122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1522	NC_007626	AATA	2	8	4761735	4761742	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_007626	TGCG	2	8	4763162	4763169	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1524	NC_007626	ATCG	2	8	4764141	4764148	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1525	NC_007626	CTAT	2	8	4764330	4764337	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1526	NC_007626	AATC	2	8	4764504	4764511	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1527	NC_007626	GCGT	2	8	4767187	4767194	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1528	NC_007626	GTGC	2	8	4769192	4769199	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1529	NC_007626	AGGG	2	8	4780242	4780249	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_007626	GCCC	2	8	4795231	4795238	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1531	NC_007626	TCGC	2	8	4801605	4801612	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1532	NC_007626	TGCG	2	8	4803140	4803147	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1533	NC_007626	CGAC	2	8	4808420	4808427	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1534	NC_007626	GCAT	2	8	4812742	4812749	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1535	NC_007626	GGCA	2	8	4815405	4815412	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1536	NC_007626	TGGC	2	8	4821096	4821103	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1537	NC_007626	CCAA	2	8	4838203	4838210	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1538	NC_007626	CTAA	2	8	4843552	4843559	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1539	NC_007626	ATAG	2	8	4843565	4843572	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_007626	GCGG	2	8	4843661	4843668	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1541	NC_007626	GATG	2	8	4850886	4850893	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_007626	GAGG	2	8	4852937	4852944	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_007626	CAAA	2	8	4854866	4854873	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1544	NC_007626	GCCC	2	8	4858460	4858467	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1545	NC_007626	GCCC	2	8	4858756	4858763	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1546	NC_007626	TGGA	2	8	4861275	4861282	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_007626	TGAA	2	8	4870788	4870795	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_007626	TTGG	2	8	4879645	4879652	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_007626	GCCC	2	8	4883321	4883328	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1550	NC_007626	TCCG	2	8	4884230	4884237	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1551	NC_007626	GGCG	2	8	4886004	4886011	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1552	NC_007626	ACCG	2	8	4890390	4890397	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1553	NC_007626	GTCC	2	8	4895237	4895244	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_007626	CCTG	2	8	4903988	4903995	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1555	NC_007626	CTTT	2	8	4904017	4904024	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1556	NC_007626	ATTT	2	8	4907830	4907837	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_007626	CACC	2	8	4913037	4913044	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1558	NC_007626	CGGC	2	8	4921049	4921056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1559	NC_007626	CCGG	2	8	4921287	4921294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1560	NC_007626	CGGT	2	8	4921443	4921450	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1561	NC_007626	GAAG	2	8	4923714	4923721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_007626	GCCC	2	8	4930055	4930062	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1563	NC_007626	TAGG	2	8	4930093	4930100	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_007626	ACTT	2	8	4931583	4931590	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1565	NC_007626	GGGT	2	8	4931726	4931733	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_007626	CCGG	2	8	4931738	4931745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1567	NC_007626	TGGC	2	8	4933910	4933917	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1568	NC_007626	CTTT	2	8	4933933	4933940	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1569	NC_007626	GGCG	2	8	4937939	4937946	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1570	NC_007626	CGGA	2	8	4938098	4938105	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1571	NC_007626	TCAA	2	8	4938378	4938385	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1572	NC_007626	AAGC	2	8	4940101	4940108	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1573	NC_007626	ATTT	2	8	4940121	4940128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_007626	CATT	2	8	4941839	4941846	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1575	NC_007626	TGCA	2	8	4945646	4945653	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1576	NC_007626	CTTT	2	8	4948807	4948814	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1577	NC_007626	GCGG	2	8	4954346	4954353	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1578	NC_007626	CCCG	2	8	4959519	4959526	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1579	NC_007626	CGAT	2	8	4961154	4961161	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1580	NC_007626	CATC	2	8	4961171	4961178	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1581	NC_007626	CGGG	2	8	4962534	4962541	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.