MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella melitensis biovar Abortus 2308 chromosome II

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007624	CTCGTC	2	12	27011	27022	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007624	TGGCTA	2	12	114302	114313	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_007624	GATGCC	2	12	144647	144658	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007624	TGCCGG	2	12	144955	144966	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007624	GGGGGC	3	18	155786	155803	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_007624	GCGGTG	2	12	155806	155817	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_007624	CTGGTC	2	12	155896	155907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007624	CCTCAC	2	12	156242	156253	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_007624	ACGCTG	2	12	156693	156704	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007624	GACGGG	2	12	156821	156832	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_007624	ACGGTG	2	12	157800	157811	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_007624	CTGGCG	2	12	159082	159093	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007624	CTGACG	2	12	160512	160523	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007624	GCCTAT	2	12	161199	161210	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007624	GAAAAG	2	12	171509	171520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007624	GCCGAC	2	12	171974	171985	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_007624	TGCGAA	2	12	195592	195603	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_007624	CGCAAG	2	12	196135	196146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007624	CTGGAA	2	12	213269	213280	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_007624	TGCTGG	2	12	213465	213476	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_007624	GGCAAG	2	12	233492	233503	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_007624	TCGATA	2	12	250872	250883	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_007624	AAGGTG	2	12	251545	251556	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007624	TGTCGC	2	12	291154	291165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007624	ATGCCG	2	12	291835	291846	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_007624	CCATAA	2	12	325288	325299	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007624	GATATC	2	12	376449	376460	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_007624	GCATAT	2	12	414717	414728	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_007624	CGACAA	2	12	415899	415910	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007624	CGGTCA	2	12	416144	416155	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007624	TCCTTT	2	12	469503	469514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007624	AAAGGC	2	12	474529	474540	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_007624	GTTGAT	2	12	490079	490090	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007624	AGGAGA	2	12	494312	494323	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007624	CCTTTT	2	12	509901	509912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007624	TTGTGA	2	12	531607	531618	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007624	TGCTTT	2	12	546518	546529	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_007624	CAGCGC	2	12	574692	574703	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_007624	GGCTGC	2	12	603247	603258	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007624	ATATCG	2	12	611702	611713	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_007624	CATACG	2	12	659799	659810	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007624	TTTTGA	2	12	677810	677821	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007624	TAGCTC	2	12	678052	678063	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007624	AGCAAC	2	12	776971	776982	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007624	CTTGCC	2	12	782898	782909	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46	NC_007624	AGCGGC	2	12	785004	785015	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007624	CCCAAT	2	12	785016	785027	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_007624	CAGGCG	2	12	785590	785601	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007624	TTTATT	2	12	791512	791523	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007624	TTGCCA	2	12	798585	798596	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007624	CAAGGC	2	12	848923	848934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007624	TCCTTC	2	12	849393	849404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_007624	CGCTGA	2	12	857642	857653	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007624	GCTTCA	2	12	858020	858031	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_007624	GGCTAT	2	12	858745	858756	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_007624	CGGATG	2	12	874480	874491	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_007624	AAAGGC	2	12	875325	875336	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_007624	TGGTCT	2	12	880774	880785	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_007624	GCCCGC	2	12	881203	881214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_007624	CCCGCA	2	12	881557	881568	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_007624	TCGGGA	2	12	944240	944251	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_007624	CGGAAA	2	12	977489	977500	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_007624	CTGCCG	2	12	1060019	1060030	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007624	AAATCG	2	12	1107508	1107519	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_007624	CATTGC	2	12	1131767	1131778	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_007624	GCTGAT	2	12	1144344	1144355	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_007624	TTCTCG	2	12	1147533	1147544	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007624	GAGGAA	2	12	1156932	1156943	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.