MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella melitensis biovar Abortus 2308 chromosome II

Total Repeats: 173

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007624	AAAAG	2	10	3050	3059	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007624	GCCGC	2	10	4432	4441	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3	NC_007624	AGCGG	2	10	21997	22006	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_007624	ACGGC	2	10	27105	27114	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_007624	GGCCT	2	10	37344	37353	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_007624	ATGAA	2	10	39915	39924	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007624	TTTGT	2	10	41076	41085	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007624	CGCTC	2	10	43285	43294	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_007624	TGCGG	2	10	60651	60660	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_007624	TATCT	2	10	72896	72905	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_007624	TCGGT	2	10	81581	81590	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_007624	TTCTC	2	10	81610	81619	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_007624	ACTTG	2	10	87139	87148	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_007624	CGGTA	2	10	97005	97014	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_007624	CCAAG	2	10	97180	97189	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_007624	ATGAA	2	10	103266	103275	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007624	CTTGC	2	10	107838	107847	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_007624	CCTGC	2	10	112512	112521	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_007624	CGGTG	2	10	114681	114690	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_007624	GCCCG	2	10	115705	115714	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
21	NC_007624	GCACA	2	10	116720	116729	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_007624	GTTCG	2	10	116741	116750	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_007624	CGATA	2	10	120826	120835	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_007624	GCCCG	2	10	121240	121249	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
25	NC_007624	AATCA	2	10	128601	128610	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_007624	AGATA	2	10	134021	134030	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007624	GCCGC	2	10	141127	141136	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
28	NC_007624	TTGGC	2	10	144661	144670	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_007624	CCGGG	2	10	151811	151820	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
30	NC_007624	ATACG	2	10	161660	161669	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_007624	CGGAT	2	10	162402	162411	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_007624	TGGGC	2	10	162533	162542	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_007624	TGTTT	2	10	162986	162995	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007624	CCCGT	2	10	163711	163720	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
35	NC_007624	GGCCG	2	10	172218	172227	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
36	NC_007624	GGATA	2	10	190821	190830	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007624	TGACG	2	10	194567	194576	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_007624	GATCA	2	10	196013	196022	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_007624	AGCAG	2	10	206365	206374	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_007624	TTTTG	2	10	211948	211957	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007624	ATCAA	2	10	212116	212125	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_007624	TGAAA	2	10	212126	212135	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007624	TGAAG	2	10	212572	212581	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007624	TTCGA	2	10	212882	212891	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_007624	CGCCT	2	10	213098	213107	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
46	NC_007624	CGGGC	2	10	213540	213549	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
47	NC_007624	GGCCG	2	10	214748	214757	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
48	NC_007624	TAAGT	2	10	217243	217252	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007624	GCGCA	2	10	222180	222189	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_007624	CGCAA	2	10	222819	222828	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_007624	GCGTG	2	10	224863	224872	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
52	NC_007624	GCCGT	2	10	225827	225836	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_007624	CCAGA	2	10	225856	225865	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_007624	ATCGC	2	10	226456	226465	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_007624	CGGGG	2	10	227879	227888	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
56	NC_007624	TGCCG	2	10	233144	233153	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_007624	ATTGT	2	10	239876	239885	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007624	AAGGG	2	10	243587	243596	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007624	TAGGG	2	10	247350	247359	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007624	GGCCT	2	10	248176	248185	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_007624	TGGTT	2	10	249608	249617	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007624	GGCAT	2	10	254762	254771	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_007624	CTGAA	2	10	254774	254783	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_007624	TTTCG	2	10	261588	261597	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_007624	AGATG	2	10	261714	261723	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007624	CAGGC	2	10	262362	262371	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_007624	CCGGC	4	20	262899	262918	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
68	NC_007624	GCCCG	2	10	291522	291531	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
69	NC_007624	TTTGT	2	10	295120	295129	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007624	TATCA	2	10	328464	328473	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_007624	AGGCG	2	10	333042	333051	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
72	NC_007624	AAACC	2	10	335430	335439	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_007624	CTTTT	2	10	343378	343387	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_007624	AATTG	2	10	348564	348573	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007624	TTGCC	2	10	376256	376265	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_007624	GGTGC	2	10	376695	376704	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
77	NC_007624	TTCAA	2	10	382179	382188	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_007624	ATGAA	2	10	410558	410567	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007624	GAATG	2	10	412532	412541	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007624	ATGGC	2	10	413623	413632	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_007624	TCCTC	2	10	418253	418262	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
82	NC_007624	AGGGG	2	10	426580	426589	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007624	TTTGT	2	10	435373	435382	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007624	CGATG	2	10	435489	435498	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_007624	GGCAC	2	10	435589	435598	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_007624	TTTGA	2	10	438848	438857	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007624	TCATG	2	10	461841	461850	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_007624	TGCGC	2	10	464151	464160	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
89	NC_007624	GCTTT	2	10	490522	490531	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_007624	CCTGA	2	10	497150	497159	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_007624	CGTAA	2	10	508402	508411	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_007624	GATTA	2	10	513712	513721	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007624	GCTAT	2	10	531856	531865	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_007624	GGTGC	2	10	535161	535170	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
95	NC_007624	GTCCG	2	10	546762	546771	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
96	NC_007624	AGCGA	2	10	580770	580779	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_007624	TCGGG	2	10	585838	585847	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
98	NC_007624	TTTGT	2	10	587287	587296	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007624	CGATG	2	10	594629	594638	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_007624	CAAAA	2	10	599447	599456	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_007624	AAGGC	2	10	609843	609852	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_007624	TGCTC	2	10	611289	611298	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_007624	ATGAA	2	10	615185	615194	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007624	GCAAA	2	10	618019	618028	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_007624	TTTGT	2	10	641952	641961	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007624	CCGCT	2	10	644258	644267	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
107	NC_007624	TGCGA	2	10	682383	682392	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_007624	GGCCG	2	10	703807	703816	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
109	NC_007624	AGCAA	2	10	708320	708329	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_007624	CCAGT	2	10	712813	712822	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_007624	ATTTT	2	10	718614	718623	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007624	CGAGC	2	10	720145	720154	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
113	NC_007624	GGCTT	2	10	739664	739673	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_007624	TTCCA	2	10	747092	747101	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_007624	GCGAG	2	10	747382	747391	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
116	NC_007624	GGGAT	2	10	759511	759520	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007624	TCACT	2	10	764090	764099	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_007624	TTGCC	2	10	764697	764706	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_007624	CGGCG	2	10	766975	766984	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
120	NC_007624	GCTGG	2	10	771865	771874	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
121	NC_007624	TTCCG	2	10	772028	772037	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_007624	GGGCT	2	10	776060	776069	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_007624	ATGCC	2	10	776434	776443	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_007624	TGCGC	2	10	782079	782088	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
125	NC_007624	CGATC	2	10	798356	798365	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_007624	GCTTG	2	10	798464	798473	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_007624	GTGCG	2	10	798627	798636	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
128	NC_007624	ACGTC	2	10	818228	818237	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_007624	ACAAA	2	10	824538	824547	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_007624	ACAAA	2	10	848706	848715	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_007624	GCTTT	2	10	859118	859127	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_007624	AAAGC	2	10	866696	866705	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_007624	GTTCG	2	10	882179	882188	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_007624	GGCGG	2	10	888202	888211	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
135	NC_007624	GGCGA	2	10	891820	891829	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
136	NC_007624	CACAT	2	10	891904	891913	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_007624	CGCGC	2	10	892007	892016	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
138	NC_007624	CAGCG	2	10	913150	913159	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
139	NC_007624	TTGAC	2	10	930466	930475	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_007624	CGATG	2	10	944325	944334	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_007624	CGGCT	2	10	944905	944914	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
142	NC_007624	AGCGA	2	10	974337	974346	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_007624	CGCTT	2	10	984178	984187	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_007624	TGCGC	2	10	987889	987898	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
145	NC_007624	TTTCA	2	10	997133	997142	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_007624	CGCCT	2	10	1003535	1003544	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
147	NC_007624	ATTAA	2	10	1004943	1004952	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007624	AACCG	2	10	1006770	1006779	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
149	NC_007624	TTTTC	2	10	1016708	1016717	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_007624	CTATT	2	10	1045112	1045121	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_007624	TCGAC	2	10	1049525	1049534	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
152	NC_007624	TTCTG	2	10	1049597	1049606	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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155	NC_007624	CCTCT	2	10	1055346	1055355	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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163	NC_007624	ATCGC	2	10	1071493	1071502	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
164	NC_007624	TGCGG	2	10	1085804	1085813	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
165	NC_007624	TTCTG	2	10	1100476	1100485	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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170	NC_007624	GTTAC	2	10	1146862	1146871	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
171	NC_007624	GATCG	2	10	1150038	1150047	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
172	NC_007624	GCGCC	2	10	1150206	1150215	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
173	NC_007624	AGCCA	2	10	1151135	1151144	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.