MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus RF122

Total Repeats: 1197

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007622	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82749779
2	NC_007622	TGGCGG	2	12	5369	5380	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	82749782
3	NC_007622	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	82749783
4	NC_007622	CAGATA	2	12	8206	8217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	82749783
5	NC_007622	CAAGCT	2	12	8265	8276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	82749783
6	NC_007622	GTAATG	2	12	9253	9264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82749783
7	NC_007622	AGATGA	2	12	9647	9658	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	82749783
8	NC_007622	ACAATT	2	12	11249	11260	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	82749785
9	NC_007622	TAGCAT	2	12	11344	11355	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	82749785
10	NC_007622	GCTTTA	2	12	17426	17437	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	82749790
11	NC_007622	TTTGAA	2	12	18247	18258	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	82749790
12	NC_007622	TAAAGG	2	12	20294	20305	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	82749792
13	NC_007622	TTGAAG	2	12	20491	20502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82749792
14	NC_007622	TGATTG	2	12	21695	21706	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	82749793
15	NC_007622	AAGGAA	2	12	22466	22477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82749794
16	NC_007622	TGAATT	2	12	25641	25652	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	82749795
17	NC_007622	ATTTCA	2	12	28125	28136	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	82749797
18	NC_007622	GTTCTG	2	12	29424	29435	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	82749798
19	NC_007622	ATCAGC	2	12	31440	31451	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	82749800
20	NC_007622	AAAAGA	2	12	34082	34093	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	82749801
21	NC_007622	TTAATG	2	12	39245	39256	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	82749805
22	NC_007622	AAGTCA	2	12	40453	40464	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	82749807
23	NC_007622	AAAAAG	2	12	40567	40578	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	82749807
24	NC_007622	AATTAT	2	12	43119	43130	50 %	50 %	0 %	0 %	82749809
25	NC_007622	ACCCTT	2	12	44955	44966	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	82749810
26	NC_007622	GTAGAA	2	12	53595	53606	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	82749818
27	NC_007622	AACCAC	2	12	54430	54441	50 %	0 %	0 %	50 %	82749818
28	NC_007622	AACCGA	2	12	57746	57757	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	82749820
29	NC_007622	AGCAAA	2	12	62207	62218	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	82749823
30	NC_007622	ATAGAT	2	12	62647	62658	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	82749823
31	NC_007622	TATCAT	2	12	63414	63425	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	82749824
32	NC_007622	TTTATT	2	12	63822	63833	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	82749825
33	NC_007622	TATTTG	2	12	63908	63919	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	82749825
34	NC_007622	TAAATA	2	12	65341	65352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82749825
35	NC_007622	TAAGCC	2	12	68844	68855	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	82749827
36	NC_007622	ATCGCA	2	12	70059	70070	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	82749828
37	NC_007622	TTTGAA	2	12	71090	71101	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	82749829
38	NC_007622	TGAAGA	2	12	80882	80893	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	82749836
39	NC_007622	TTTCAT	2	12	81563	81574	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	82749837
40	NC_007622	TGTATA	2	12	86381	86392	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	82749841
41	NC_007622	AATTAT	2	12	86740	86751	50 %	50 %	0 %	0 %	82749842
42	NC_007622	TCGAAA	2	12	87882	87893	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	82749843
43	NC_007622	CTATTG	2	12	90468	90479	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	82749845
44	NC_007622	CATATG	2	12	91672	91683	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	82749846
45	NC_007622	CAGATT	2	12	97315	97326	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	82749851
46	NC_007622	GATATG	2	12	115320	115331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82749865
47	NC_007622	AAAATT	2	12	116478	116489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82749866
48	NC_007622	ATTTGA	2	12	119226	119237	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	82749868
49	NC_007622	TATAAA	2	12	119757	119768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82749869
50	NC_007622	GATTTT	2	12	123919	123930	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	82749873
51	NC_007622	ACAAAG	2	12	128439	128450	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	82749877
52	NC_007622	AAAGAT	2	12	130452	130463	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	82749879
53	NC_007622	CAATAT	2	12	132921	132932	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	82749880
54	NC_007622	GCGATT	2	12	136794	136805	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	82749885
55	NC_007622	AAATTT	2	12	136892	136903	50 %	50 %	0 %	0 %	82749885
56	NC_007622	TTTGGA	2	12	139458	139469	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	82749888
57	NC_007622	ACCTGC	2	12	139793	139804	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	82749888
58	NC_007622	AAGATA	2	12	139939	139950	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	82749888
59	NC_007622	CTATTA	2	12	144723	144734	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	82749890
60	NC_007622	TATGAT	2	12	146257	146268	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	82749890
61	NC_007622	ATTGAA	2	12	146708	146719	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	82749890
62	NC_007622	AGCAAC	2	12	152658	152669	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	82749894
63	NC_007622	CACCTT	2	12	154710	154721	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	82749895
64	NC_007622	ACCTTT	2	12	155215	155226	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	82749895
65	NC_007622	GTAAAT	2	12	158947	158958	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	82749898
66	NC_007622	ATTTTA	2	12	160541	160552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82749899
67	NC_007622	TATCTT	2	12	165156	165167	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	82749902
68	NC_007622	ATTTGG	2	12	166169	166180	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	82749903
69	NC_007622	GAGTTT	2	12	169514	169525	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	82749905
70	NC_007622	TATACA	2	12	173513	173524	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	82749909
71	NC_007622	TTATTT	2	12	175546	175557	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	82749911
72	NC_007622	ATTTAT	2	12	176125	176136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82749911
73	NC_007622	TCAATT	2	12	181840	181851	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	82749915
74	NC_007622	AATATG	2	12	183140	183151	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	82749916
75	NC_007622	AAAGGA	2	12	187768	187779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82749919
76	NC_007622	ACATTT	2	12	188106	188117	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	82749919
77	NC_007622	TTCTTG	2	12	193034	193045	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	82749923
78	NC_007622	GGACGT	2	12	203823	203834	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	82749933
79	NC_007622	ATATGA	2	12	206574	206585	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	82749935
80	NC_007622	TATAGA	2	12	236278	236289	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	82749956
81	NC_007622	ACGATG	2	12	242908	242919	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	82749960
82	NC_007622	AGAATC	2	12	250467	250478	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	82749965
83	NC_007622	AAGTAA	2	12	253890	253901	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	82749970
84	NC_007622	ATAAAG	2	12	254871	254882	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	82749971
85	NC_007622	GACATT	2	12	256594	256605	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	82749973
86	NC_007622	GATTTC	2	12	258412	258423	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	82749975
87	NC_007622	TTCATA	2	12	258982	258993	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	82749976
88	NC_007622	GATTAT	2	12	263388	263399	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	82749980
89	NC_007622	ATGGTG	2	12	263521	263532	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	82749980
90	NC_007622	CAGCAA	2	12	263908	263919	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	82749980
91	NC_007622	TAATGG	2	12	265110	265121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82749981
92	NC_007622	TCTTCA	2	12	269481	269492	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	82749985
93	NC_007622	TTATCT	2	12	269577	269588	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	82749985
94	NC_007622	ATTTTA	2	12	269682	269693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82749985
95	NC_007622	TTATTT	2	12	270645	270656	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	82749986
96	NC_007622	GAAAAA	2	12	273195	273206	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	82749989
97	NC_007622	GATACA	2	12	274360	274371	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	82749989
98	NC_007622	TAATTA	2	12	276686	276697	50 %	50 %	0 %	0 %	82749990
99	NC_007622	ACAAGA	2	12	277526	277537	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	82749991
100	NC_007622	AGGACA	2	12	277904	277915	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	82749991
101	NC_007622	AAAGCA	2	12	278127	278138	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	82749991
102	NC_007622	ATTATC	2	12	279214	279225	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	82749992
103	NC_007622	TAAATT	2	12	280754	280765	50 %	50 %	0 %	0 %	82749992
104	NC_007622	TGAAGA	2	12	281015	281026	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	82749992
105	NC_007622	TAAAAC	2	12	287463	287474	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	82749998
106	NC_007622	CTGAAT	2	12	293226	293237	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	82750006
107	NC_007622	GAAAAA	2	12	297420	297431	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	82750009
108	NC_007622	TTTATT	2	12	298005	298016	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	82750010
109	NC_007622	ACGAAT	2	12	298483	298494	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	82750010
110	NC_007622	GAAACA	2	12	300088	300099	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	82750011
111	NC_007622	CAGGTG	2	12	300275	300286	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	82750011
112	NC_007622	AAAATT	2	12	300653	300664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82750012
113	NC_007622	AAAATA	2	12	313367	313378	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	82750022
114	NC_007622	AGACAA	2	12	313734	313745	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	82750022
115	NC_007622	TACCTA	2	12	322560	322571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82750032
116	NC_007622	AATGCA	2	12	324113	324124	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	82750033
117	NC_007622	AATGAC	2	12	327167	327178	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	82750037
118	NC_007622	GTAATG	2	12	327179	327190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82750037
119	NC_007622	AAAATG	2	12	328648	328659	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	82750038
120	NC_007622	AATAAG	2	12	330313	330324	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	82750040
121	NC_007622	TGCAAT	2	12	331875	331886	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	82750042
122	NC_007622	TTGTAA	2	12	334046	334057	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	82750044
123	NC_007622	AATTTT	2	12	335318	335329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82750046
124	NC_007622	TAATAT	2	12	342296	342307	50 %	50 %	0 %	0 %	82750053
125	NC_007622	GATGCT	2	12	345985	345996	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	82750056
126	NC_007622	TTTATT	2	12	346750	346761	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	82750056
127	NC_007622	TTTAAA	2	12	346930	346941	50 %	50 %	0 %	0 %	82750056
128	NC_007622	AAGTAC	2	12	348287	348298	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	82750059
129	NC_007622	ATTAAA	2	12	349775	349786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82750061
130	NC_007622	AGGACA	2	12	353512	353523	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	82750065
131	NC_007622	CTAAAC	2	12	356852	356863	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	82750067
132	NC_007622	GCAAAA	2	12	360373	360384	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	82750069
133	NC_007622	GAAGAC	2	12	366376	366387	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	82750077
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136	NC_007622	GAAAGT	2	12	376593	376604	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	82750091
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139	NC_007622	TGGTAT	2	12	384273	384284	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	82750099
140	NC_007622	AACAGG	2	12	384581	384592	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	82750100
141	NC_007622	ATCGAA	2	12	387817	387828	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	82750102
142	NC_007622	ATTTCA	2	12	390685	390696	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	82750104
143	NC_007622	TTGATA	2	12	391158	391169	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	82750105
144	NC_007622	AACATA	2	12	392173	392184	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	82750109
145	NC_007622	AATGGT	2	12	394143	394154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82750112
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149	NC_007622	AAGCAA	2	12	398045	398056	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	82750117
150	NC_007622	CTAATC	2	12	399546	399557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82750120
151	NC_007622	CTTTAC	2	12	403834	403845	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	82750125
152	NC_007622	CATATT	2	12	404230	404241	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	82750125
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156	NC_007622	ATTACA	2	12	412279	412290	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	82750136
157	NC_007622	ATGAAA	2	12	412692	412703	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	82750137
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160	NC_007622	CATTAG	2	12	419438	419449	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	82750143
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220	NC_007622	TTGTAC	2	12	556241	556252	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	82750253
221	NC_007622	ACGACT	2	12	557108	557119	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	82750255
222	NC_007622	AACGTG	2	12	558081	558092	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	82750255
223	NC_007622	TTCGAA	2	12	558602	558613	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	82750255
224	NC_007622	TACAGC	2	12	560848	560859	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	82750257
225	NC_007622	TTGCTA	2	12	561129	561140	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	82750257
226	NC_007622	AAATCA	2	12	562252	562263	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	82750258
227	NC_007622	TTATGA	2	12	567892	567903	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	82750262
228	NC_007622	TTGGTG	2	12	568230	568241	0 %	50 %	50 %	0 %	82750262
229	NC_007622	TTTCTT	2	12	571087	571098	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	82750265
230	NC_007622	AAGCAC	2	12	572016	572027	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	82750266
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232	NC_007622	ATTAAA	2	12	578413	578424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82750268
233	NC_007622	GATTCA	2	12	579953	579964	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	82750268
234	NC_007622	GACTCA	2	12	579971	579982	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	82750268
235	NC_007622	GATTCA	2	12	579989	580000	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	82750268
236	NC_007622	GACTCA	2	12	580007	580018	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	82750268
237	NC_007622	TCAGAC	2	12	580028	580039	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	82750268
238	NC_007622	TCAGAC	2	12	580046	580057	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	82750268
239	NC_007622	GATTCA	2	12	580061	580072	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	82750268
240	NC_007622	GATTCA	2	12	580097	580108	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	82750268
241	NC_007622	GACTCA	2	12	580115	580126	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	82750268
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243	NC_007622	GACTCA	2	12	580151	580162	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	82750268
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348	NC_007622	TAATCG	2	12	795108	795119	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	82750475
349	NC_007622	ATCAAT	2	12	798664	798675	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	82750478
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351	NC_007622	GAAGTA	2	12	805533	805544	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	82750484
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462	NC_007622	GAAAAA	2	12	1039080	1039091	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	82750702
463	NC_007622	TAGTTG	2	12	1043725	1043736	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	82750706
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