MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus RF122

Total Repeats: 2465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007622	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	82749778
2	NC_007622	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	82749779
3	NC_007622	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	82749779
4	NC_007622	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	82749779
5	NC_007622	CAAAT	2	10	5224	5233	60 %	20 %	0 %	20 %	82749782
6	NC_007622	TGAAC	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_007622	TTCAA	2	10	7721	7730	40 %	40 %	0 %	20 %	82749783
8	NC_007622	GGTGT	2	10	10121	10130	0 %	40 %	60 %	0 %	82749784
9	NC_007622	CGTTG	2	10	11725	11734	0 %	40 %	40 %	20 %	82749785
10	NC_007622	GTAGG	2	10	14383	14392	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007622	TTATT	2	10	15426	15435	20 %	80 %	0 %	0 %	82749788
12	NC_007622	GCAAG	2	10	16600	16609	40 %	0 %	40 %	20 %	82749789
13	NC_007622	TTTGA	2	10	16759	16768	20 %	60 %	20 %	0 %	82749789
14	NC_007622	TCAAT	2	10	18896	18905	40 %	40 %	0 %	20 %	82749791
15	NC_007622	AGTTA	2	10	22074	22083	40 %	40 %	20 %	0 %	82749793
16	NC_007622	ATGTA	2	10	23634	23643	40 %	40 %	20 %	0 %	82749794
17	NC_007622	TCGAT	2	10	23798	23807	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_007622	ATATT	2	10	24336	24345	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007622	GCCCC	2	10	24695	24704	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
20	NC_007622	ATTTC	2	10	24726	24735	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_007622	ACCAA	2	10	26491	26500	60 %	0 %	0 %	40 %	82749796
22	NC_007622	ATCAA	2	10	27203	27212	60 %	20 %	0 %	20 %	82749796
23	NC_007622	GAAAC	2	10	27824	27833	60 %	0 %	20 %	20 %	82749797
24	NC_007622	GAAGT	2	10	27974	27983	40 %	20 %	40 %	0 %	82749797
25	NC_007622	ATTAT	2	10	29617	29626	40 %	60 %	0 %	0 %	82749798
26	NC_007622	AACGA	2	10	29690	29699	60 %	0 %	20 %	20 %	82749798
27	NC_007622	AAACG	2	10	31536	31545	60 %	0 %	20 %	20 %	82749800
28	NC_007622	AAGGT	2	10	32708	32717	40 %	20 %	40 %	0 %	82749800
29	NC_007622	GTTGT	2	10	33298	33307	0 %	60 %	40 %	0 %	82749800
30	NC_007622	CATTA	2	10	34136	34145	40 %	40 %	0 %	20 %	82749801
31	NC_007622	TTTTA	2	10	35979	35988	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007622	ATTAA	2	10	36827	36836	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007622	TATGA	2	10	37593	37602	40 %	40 %	20 %	0 %	82749803
34	NC_007622	TACTA	2	10	39060	39069	40 %	40 %	0 %	20 %	82749805
35	NC_007622	AGCAA	2	10	40067	40076	60 %	0 %	20 %	20 %	82749807
36	NC_007622	ATCAA	2	10	41813	41822	60 %	20 %	0 %	20 %	82749808
37	NC_007622	TAATA	2	10	43645	43654	60 %	40 %	0 %	0 %	82749809
38	NC_007622	GTGTT	2	10	43727	43736	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007622	TATCA	2	10	46813	46822	40 %	40 %	0 %	20 %	82749813
40	NC_007622	TACTA	2	10	49703	49712	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_007622	GATAT	2	10	49988	49997	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007622	ATATA	2	10	50811	50820	60 %	40 %	0 %	0 %	82749816
43	NC_007622	ATTGC	2	10	51738	51747	20 %	40 %	20 %	20 %	82749817
44	NC_007622	TCATT	2	10	51926	51935	20 %	60 %	0 %	20 %	82749817
45	NC_007622	TGAAA	2	10	53810	53819	60 %	20 %	20 %	0 %	82749818
46	NC_007622	TCAAT	2	10	54182	54191	40 %	40 %	0 %	20 %	82749818
47	NC_007622	GTATT	2	10	54671	54680	20 %	60 %	20 %	0 %	82749819
48	NC_007622	AGATA	2	10	60537	60546	60 %	20 %	20 %	0 %	82749822
49	NC_007622	TAAAA	2	10	61097	61106	80 %	20 %	0 %	0 %	82749822
50	NC_007622	ATACA	2	10	61528	61537	60 %	20 %	0 %	20 %	82749823
51	NC_007622	AAAGA	2	10	62731	62740	80 %	0 %	20 %	0 %	82749823
52	NC_007622	GTAAT	2	10	62950	62959	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007622	CAATT	2	10	63382	63391	40 %	40 %	0 %	20 %	82749824
54	NC_007622	ATGTT	2	10	64216	64225	20 %	60 %	20 %	0 %	82749825
55	NC_007622	TTGCG	2	10	64787	64796	0 %	40 %	40 %	20 %	82749825
56	NC_007622	AGTTA	2	10	66127	66136	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007622	AGATG	2	10	69494	69503	40 %	20 %	40 %	0 %	82749827
58	NC_007622	GAAAA	2	10	73527	73536	80 %	0 %	20 %	0 %	82749831
59	NC_007622	AATCA	2	10	76716	76725	60 %	20 %	0 %	20 %	82749833
60	NC_007622	AGAAA	2	10	76837	76846	80 %	0 %	20 %	0 %	82749834
61	NC_007622	ATTTT	2	10	77414	77423	20 %	80 %	0 %	0 %	82749834
62	NC_007622	ATCAA	2	10	77441	77450	60 %	20 %	0 %	20 %	82749834
63	NC_007622	ATCAC	2	10	78674	78683	40 %	20 %	0 %	40 %	82749835
64	NC_007622	AACGA	2	10	79351	79360	60 %	0 %	20 %	20 %	82749835
65	NC_007622	ACACA	2	10	81407	81416	60 %	0 %	0 %	40 %	82749837
66	NC_007622	GACAA	2	10	82558	82567	60 %	0 %	20 %	20 %	82749838
67	NC_007622	TCTTA	2	10	83341	83350	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_007622	ATTAC	2	10	85339	85348	40 %	40 %	0 %	20 %	82749840
69	NC_007622	ATTTT	2	10	85642	85651	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007622	TATCT	2	10	86000	86009	20 %	60 %	0 %	20 %	82749841
71	NC_007622	ATACG	2	10	88433	88442	40 %	20 %	20 %	20 %	82749843
72	NC_007622	TTATA	2	10	89091	89100	40 %	60 %	0 %	0 %	82749844
73	NC_007622	TTTTA	2	10	89889	89898	20 %	80 %	0 %	0 %	82749844
74	NC_007622	GTATT	2	10	90402	90411	20 %	60 %	20 %	0 %	82749845
75	NC_007622	AATAA	2	10	90995	91004	80 %	20 %	0 %	0 %	82749845
76	NC_007622	TACGC	2	10	91262	91271	20 %	20 %	20 %	40 %	82749845
77	NC_007622	TCCCT	2	10	94071	94080	0 %	40 %	0 %	60 %	82749848
78	NC_007622	GCTTT	2	10	96305	96314	0 %	60 %	20 %	20 %	82749850
79	NC_007622	TAATT	2	10	96390	96399	40 %	60 %	0 %	0 %	82749850
80	NC_007622	ATACT	2	10	97571	97580	40 %	40 %	0 %	20 %	82749852
81	NC_007622	TTAAT	2	10	99601	99610	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007622	AATGT	2	10	99619	99628	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007622	TAATA	2	10	100061	100070	60 %	40 %	0 %	0 %	82749855
84	NC_007622	ATTTT	2	10	101052	101061	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007622	TAAAA	2	10	101251	101260	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007622	TTGTA	2	10	103274	103283	20 %	60 %	20 %	0 %	82749857
87	NC_007622	TGCAA	2	10	104280	104289	40 %	20 %	20 %	20 %	82749858
88	NC_007622	ATATG	2	10	106298	106307	40 %	40 %	20 %	0 %	82749859
89	NC_007622	TATGA	2	10	107977	107986	40 %	40 %	20 %	0 %	82749860
90	NC_007622	AATAT	2	10	108983	108992	60 %	40 %	0 %	0 %	82749860
91	NC_007622	CGAAC	2	10	110973	110982	40 %	0 %	20 %	40 %	82749861
92	NC_007622	TTCAA	2	10	113000	113009	40 %	40 %	0 %	20 %	82749862
93	NC_007622	ACATC	2	10	113843	113852	40 %	20 %	0 %	40 %	82749864
94	NC_007622	TAATT	2	10	116066	116075	40 %	60 %	0 %	0 %	82749865
95	NC_007622	AGAGA	2	10	119092	119101	60 %	0 %	40 %	0 %	82749868
96	NC_007622	AATCC	2	10	119448	119457	40 %	20 %	0 %	40 %	82749868
97	NC_007622	TTGGA	2	10	122477	122486	20 %	40 %	40 %	0 %	82749871
98	NC_007622	TTATT	2	10	122892	122901	20 %	80 %	0 %	0 %	82749872
99	NC_007622	ATTTT	2	10	122958	122967	20 %	80 %	0 %	0 %	82749872
100	NC_007622	TATGG	2	10	123359	123368	20 %	40 %	40 %	0 %	82749872
101	NC_007622	ATCGT	2	10	123800	123809	20 %	40 %	20 %	20 %	82749872
102	NC_007622	TATAT	2	10	125622	125631	40 %	60 %	0 %	0 %	82749874
103	NC_007622	TGAAT	2	10	128386	128395	40 %	40 %	20 %	0 %	82749877
104	NC_007622	CAAAA	2	10	129770	129779	80 %	0 %	0 %	20 %	82749878
105	NC_007622	AAAGC	2	10	132230	132239	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_007622	TTCAT	2	10	132621	132630	20 %	60 %	0 %	20 %	82749880
107	NC_007622	TTTAC	2	10	133004	133013	20 %	60 %	0 %	20 %	82749880
108	NC_007622	GTTTT	2	10	133449	133458	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007622	TTATT	2	10	133984	133993	20 %	80 %	0 %	0 %	82749882
110	NC_007622	GGATT	2	10	134971	134980	20 %	40 %	40 %	0 %	82749883
111	NC_007622	CACAA	2	10	135623	135632	60 %	0 %	0 %	40 %	82749884
112	NC_007622	TAACT	2	10	138011	138020	40 %	40 %	0 %	20 %	82749886
113	NC_007622	TGCAT	2	10	140688	140697	20 %	40 %	20 %	20 %	82749889
114	NC_007622	ACATT	2	10	140780	140789	40 %	40 %	0 %	20 %	82749889
115	NC_007622	TATTT	2	10	141237	141246	20 %	80 %	0 %	0 %	82749889
116	NC_007622	TATCA	2	10	142020	142029	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_007622	ATGCA	2	10	142519	142528	40 %	20 %	20 %	20 %	82749890
118	NC_007622	GTGAA	2	10	149796	149805	40 %	20 %	40 %	0 %	82749891
119	NC_007622	ATCAT	2	10	150150	150159	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_007622	ATATA	2	10	153092	153101	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007622	AAGAT	2	10	156817	156826	60 %	20 %	20 %	0 %	82749896
122	NC_007622	CGTTT	2	10	157263	157272	0 %	60 %	20 %	20 %	82749897
123	NC_007622	AAATG	2	10	159741	159750	60 %	20 %	20 %	0 %	82749899
124	NC_007622	GTAAA	2	10	159905	159914	60 %	20 %	20 %	0 %	82749899
125	NC_007622	TTTAA	2	10	159925	159934	40 %	60 %	0 %	0 %	82749899
126	NC_007622	TTTGC	2	10	160441	160450	0 %	60 %	20 %	20 %	82749899
127	NC_007622	TTGTT	2	10	161447	161456	0 %	80 %	20 %	0 %	82749899
128	NC_007622	AAAAG	2	10	162163	162172	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007622	CAACT	2	10	162297	162306	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_007622	CAAAA	2	10	164660	164669	80 %	0 %	0 %	20 %	82749902
131	NC_007622	AGTTT	2	10	165196	165205	20 %	60 %	20 %	0 %	82749902
132	NC_007622	CAACA	2	10	165426	165435	60 %	0 %	0 %	40 %	82749902
133	NC_007622	AAAAT	2	10	166054	166063	80 %	20 %	0 %	0 %	82749903
134	NC_007622	AAATG	2	10	166463	166472	60 %	20 %	20 %	0 %	82749903
135	NC_007622	GCTTT	2	10	166810	166819	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_007622	TGAAG	2	10	167013	167022	40 %	20 %	40 %	0 %	82749904
137	NC_007622	AAAAT	2	10	167084	167093	80 %	20 %	0 %	0 %	82749904
138	NC_007622	TGATT	2	10	167157	167166	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007622	TTGAA	2	10	167739	167748	40 %	40 %	20 %	0 %	82749905
140	NC_007622	ATTAT	2	10	169695	169704	40 %	60 %	0 %	0 %	82749905
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270	NC_007622	TTAAA	2	10	317287	317296	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_007622	GAAGA	2	10	317625	317634	60 %	0 %	40 %	0 %	82750028
272	NC_007622	ACTAT	2	10	318435	318444	40 %	40 %	0 %	20 %	82750028
273	NC_007622	TCAAT	2	10	320015	320024	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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275	NC_007622	AATAT	2	10	320606	320615	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_007622	TTATT	2	10	320695	320704	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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407	NC_007622	TGGTG	2	10	472376	472385	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
408	NC_007622	GGTAA	2	10	473414	473423	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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411	NC_007622	AAGGT	2	10	480471	480480	40 %	20 %	40 %	0 %	82750189
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443	NC_007622	GTTAT	2	10	515892	515901	20 %	60 %	20 %	0 %	82750224
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445	NC_007622	TCGTG	2	10	518573	518582	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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470	NC_007622	GTATA	2	10	543503	543512	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_007622	ATCAT	2	10	581473	581482	40 %	40 %	0 %	20 %	82750269
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