MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella melitensis biovar Abortus 2308 chromosome I

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007618	ACGGTT	2	12	31103	31114	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_007618	TCGGCG	2	12	44286	44297	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007618	GGCATG	2	12	44462	44473	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_007618	GATCTG	2	12	44641	44652	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_007618	CCTGGC	2	12	79080	79091	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6	NC_007618	TTTTGC	2	12	92239	92250	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_007618	CTATGC	2	12	92501	92512	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007618	CGGCGA	2	12	92668	92679	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007618	GCTTTT	2	12	101016	101027	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_007618	CTGGCG	2	12	144438	144449	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007618	GCCGAG	2	12	160288	160299	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_007618	GGGGAA	2	12	167501	167512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007618	TCTGGC	2	12	183980	183991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007618	TTCCGA	2	12	216203	216214	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007618	GCCGGA	2	12	216605	216616	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007618	CAGCGA	2	12	217589	217600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007618	TGGTCG	2	12	228951	228962	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_007618	CTGATC	2	12	229070	229081	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007618	TGCGGC	2	12	230667	230678	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007618	AGCCGG	2	12	239999	240010	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007618	CGGTGC	2	12	240789	240800	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007618	CAAGGC	2	12	240909	240920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007618	GGTGTA	2	12	266249	266260	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007618	CTCCCG	2	12	271684	271695	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_007618	TTCTGC	2	12	274405	274416	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_007618	CACGCG	2	12	277231	277242	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_007618	ACGCGC	2	12	277352	277363	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_007618	CTGATG	2	12	293780	293791	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_007618	GGCACA	2	12	304226	304237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007618	CTGAAA	2	12	349865	349876	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_007618	CTTTTT	2	12	356394	356405	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_007618	TGATTT	2	12	356413	356424	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007618	GTCTCT	2	12	360628	360639	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007618	TTGCCT	2	12	360931	360942	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007618	TTCCTC	2	12	366055	366066	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_007618	GCTGGT	2	12	370259	370270	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_007618	ATCGAC	2	12	379334	379345	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007618	TTTAAC	2	12	451195	451206	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_007618	GGCGCG	2	12	487049	487060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007618	TCGCGC	2	12	487894	487905	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_007618	AAGCCG	2	12	488540	488551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007618	TCATCC	2	12	489975	489986	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_007618	CGTTTT	2	12	524661	524672	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_007618	CGTCAC	2	12	532472	532483	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_007618	ACGGTC	2	12	544742	544753	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007618	CTTGGC	2	12	574323	574334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007618	TTACGT	2	12	574845	574856	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_007618	GCCTAT	2	12	605684	605695	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007618	CAGTTC	2	12	606727	606738	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007618	CGGGAT	2	12	747894	747905	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_007618	ATTGAA	2	12	770160	770171	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007618	CTTTTC	2	12	786146	786157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007618	TCGCGC	2	12	825982	825993	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54	NC_007618	CGCCCA	2	12	850237	850248	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_007618	GGCAGG	2	12	859593	859604	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_007618	GAAATT	2	12	918880	918891	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007618	GCGCAG	2	12	933008	933019	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007618	GCCAAA	2	12	948050	948061	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007618	AGACGC	2	12	950528	950539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007618	GCCGGT	2	12	952220	952231	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007618	CGCTGG	2	12	958205	958216	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_007618	GGATGA	2	12	968627	968638	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007618	GCTGAT	2	12	1014463	1014474	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_007618	GACCTC	2	12	1021199	1021210	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
65	NC_007618	TATTTT	2	12	1033803	1033814	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007618	TGGCGG	2	12	1036234	1036245	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_007618	ATTTCG	2	12	1036626	1036637	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_007618	GAGGAA	2	12	1046365	1046376	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007618	TTTTCC	2	12	1156817	1156828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007618	CAAAAA	2	12	1195286	1195297	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_007618	ACCGCC	2	12	1246339	1246350	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_007618	TGAATT	2	12	1250812	1250823	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007618	GTCAGC	2	12	1268368	1268379	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_007618	GCCTGC	2	12	1295310	1295321	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_007618	CGTTTC	2	12	1307689	1307700	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007618	CACCGC	2	12	1308742	1308753	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_007618	AAAACA	2	12	1308931	1308942	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_007618	CAACCT	2	12	1326405	1326416	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_007618	CCGCGC	2	12	1399675	1399686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_007618	GTAAAA	2	12	1417869	1417880	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007618	GCATTT	2	12	1423846	1423857	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_007618	CATTGC	2	12	1433417	1433428	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007618	GCGCAT	2	12	1441947	1441958	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_007618	CATCGG	2	12	1449499	1449510	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_007618	ATGCCA	2	12	1451914	1451925	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_007618	AAGGAA	2	12	1484179	1484190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007618	GCTCTG	2	12	1486260	1486271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007618	AAAAGC	2	12	1558791	1558802	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_007618	CTTCCC	2	12	1581094	1581105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_007618	ACTTTC	2	12	1582587	1582598	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007618	TGAAAA	2	12	1588463	1588474	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007618	TCGCCG	2	12	1590710	1590721	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
93	NC_007618	CTGCCG	2	12	1605583	1605594	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
94	NC_007618	AATGCC	2	12	1664367	1664378	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_007618	CAGCAA	2	12	1702132	1702143	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_007618	TCAGCG	2	12	1762818	1762829	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_007618	ATGAAA	2	12	1763525	1763536	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007618	ATGGCG	2	12	1763798	1763809	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_007618	CAAAAA	2	12	1792534	1792545	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_007618	CTGCCG	2	12	1809661	1809672	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
101	NC_007618	CATCCA	2	12	1831215	1831226	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_007618	ATTGGC	2	12	1844750	1844761	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_007618	AGCCCC	2	12	1845068	1845079	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_007618	AGAAAC	2	12	1856097	1856108	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_007618	AACTCA	2	12	1872228	1872239	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_007618	TCCTGC	2	12	1893419	1893430	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
107	NC_007618	GAAACG	2	12	1915539	1915550	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_007618	ATCTCG	2	12	1931716	1931727	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007618	CCAACA	2	12	1952836	1952847	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_007618	CCTGGC	2	12	2031052	2031063	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_007618	AGCGTG	2	12	2053396	2053407	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_007618	TTCTTT	2	12	2075842	2075853	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_007618	GGAAAC	2	12	2099840	2099851	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_007618	TCTTTG	2	12	2113574	2113585	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.