MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella melitensis biovar Abortus 2308 chromosome I

Total Repeats: 351

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007618	CATGC	2	10	24615	24624	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_007618	CGAAA	2	10	24813	24822	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_007618	CGGAG	2	10	27791	27800	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_007618	AAAGC	2	10	32494	32503	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_007618	CCGTG	2	10	36945	36954	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_007618	GGCAT	2	10	45273	45282	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_007618	TAAAG	2	10	47090	47099	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007618	TGAAA	2	10	48021	48030	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007618	CGGAG	2	10	68821	68830	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_007618	TCGAT	2	10	86997	87006	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_007618	GGGCA	2	10	92585	92594	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_007618	TTCCA	2	10	93271	93280	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_007618	CGGTT	2	10	93643	93652	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_007618	GAACC	2	10	93695	93704	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_007618	GCACC	2	10	104578	104587	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_007618	TTTGT	2	10	105071	105080	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007618	GCCGC	2	10	112287	112296	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18	NC_007618	ATGGA	2	10	120619	120628	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007618	GCACG	2	10	144712	144721	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_007618	CGAAC	2	10	145008	145017	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_007618	GCTTC	2	10	145056	145065	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_007618	CGAAG	2	10	145193	145202	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_007618	CAATG	2	10	146433	146442	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_007618	CGCGC	2	10	146447	146456	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
25	NC_007618	ACAGC	2	10	160236	160245	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_007618	CGGAG	2	10	163571	163580	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_007618	ACAAA	2	10	163638	163647	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_007618	CTGCC	2	10	168202	168211	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_007618	TGAAA	2	10	169574	169583	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007618	CGTGT	2	10	170471	170480	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_007618	TTTTA	2	10	172279	172288	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007618	CGGGC	2	10	184359	184368	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
33	NC_007618	AAAGC	2	10	194166	194175	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_007618	ATCGC	2	10	211592	211601	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_007618	TTTCG	2	10	214804	214813	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_007618	TCAGG	2	10	217982	217991	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_007618	CTTGG	2	10	226027	226036	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_007618	CGGGC	2	10	228880	228889	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
39	NC_007618	CCGAT	2	10	230136	230145	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_007618	GGCAG	2	10	231204	231213	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_007618	TGCGG	2	10	235964	235973	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
42	NC_007618	GGGGC	2	10	239893	239902	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
43	NC_007618	CGCTG	2	10	240724	240733	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_007618	CACGT	2	10	242185	242194	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_007618	TGGGC	2	10	261371	261380	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
46	NC_007618	AAATC	2	10	277290	277299	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_007618	AAGGG	2	10	277320	277329	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007618	GGGGC	2	10	288267	288276	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
49	NC_007618	GCGCG	2	10	304389	304398	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
50	NC_007618	CGCGC	2	10	304955	304964	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
51	NC_007618	ATTCT	2	10	307309	307318	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_007618	TGGCT	2	10	323852	323861	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_007618	AAAAG	2	10	329828	329837	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007618	GTTTC	2	10	339750	339759	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_007618	CAGCT	2	10	345360	345369	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_007618	TCTTT	2	10	349181	349190	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_007618	CGTGG	2	10	365597	365606	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
58	NC_007618	GCCTT	2	10	366335	366344	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_007618	CCAAG	2	10	367677	367686	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_007618	CGATC	2	10	378112	378121	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_007618	TCTAT	2	10	378243	378252	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_007618	CCGCA	2	10	378341	378350	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
63	NC_007618	CTTCA	2	10	381251	381260	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_007618	CGTGC	2	10	381464	381473	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
65	NC_007618	AGGCG	2	10	381905	381914	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
66	NC_007618	GCGCG	2	10	397096	397105	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
67	NC_007618	CTTTC	2	10	397258	397267	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_007618	GCCTG	2	10	404513	404522	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
69	NC_007618	ACGCG	2	10	404527	404536	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_007618	CCGGC	2	10	404547	404556	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
71	NC_007618	CGAAA	2	10	422227	422236	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_007618	CCGGG	2	10	423321	423330	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
73	NC_007618	ACAAA	2	10	423532	423541	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_007618	GAAAA	2	10	431556	431565	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007618	AGGCT	2	10	440229	440238	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_007618	GGGTT	2	10	446046	446055	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007618	AATGT	2	10	446123	446132	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007618	AAAAG	2	10	450696	450705	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007618	ACCGC	2	10	451826	451835	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
80	NC_007618	GTTTT	2	10	451847	451856	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007618	AACGC	2	10	469662	469671	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_007618	CGGCA	2	10	486737	486746	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_007618	TGTTC	2	10	487384	487393	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_007618	TGGTG	2	10	487594	487603	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007618	GCCGG	2	10	488361	488370	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
86	NC_007618	CGATC	2	10	489826	489835	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_007618	CATTT	2	10	490057	490066	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_007618	AGGGC	2	10	494056	494065	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
89	NC_007618	TGCCG	2	10	494117	494126	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_007618	CGGAA	2	10	502569	502578	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_007618	TTTTA	2	10	503282	503291	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007618	AAATT	2	10	505249	505258	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007618	ATGAA	2	10	505270	505279	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007618	ACAGG	2	10	512339	512348	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_007618	TGCCG	2	10	517231	517240	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
96	NC_007618	GCCGT	2	10	517347	517356	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_007618	ACCGC	2	10	534301	534310	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
98	NC_007618	TGCCA	2	10	539932	539941	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_007618	TGCAT	2	10	545542	545551	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_007618	GAATA	2	10	550688	550697	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007618	TGCGT	2	10	551091	551100	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_007618	GCCGA	2	10	564293	564302	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NC_007618	GACAT	2	10	564371	564380	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_007618	AGTTT	2	10	564504	564513	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007618	ATAGT	2	10	564631	564640	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007618	AGGGC	2	10	574130	574139	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
107	NC_007618	AAAAC	2	10	574406	574415	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_007618	TTTGC	2	10	578713	578722	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_007618	AAAGA	2	10	578736	578745	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007618	ACTGA	2	10	583138	583147	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_007618	TGGGC	2	10	587629	587638	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
112	NC_007618	ATCAG	2	10	592153	592162	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_007618	TGCGA	2	10	605316	605325	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_007618	CGGGC	2	10	606988	606997	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
115	NC_007618	CGGGC	2	10	608512	608521	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
116	NC_007618	AGGCG	2	10	608592	608601	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
117	NC_007618	GGGCA	2	10	608713	608722	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
118	NC_007618	TGCCA	2	10	609106	609115	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_007618	TTGGA	2	10	609539	609548	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007618	TAAAA	2	10	636097	636106	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007618	GAACG	2	10	642857	642866	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_007618	ACCGG	2	10	644581	644590	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
123	NC_007618	TTTGC	2	10	647140	647149	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_007618	CAATC	2	10	653316	653325	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_007618	GGCGC	2	10	653383	653392	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
126	NC_007618	CGGCG	2	10	654402	654411	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
127	NC_007618	GGGGC	2	10	655129	655138	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
128	NC_007618	CCGAT	2	10	707686	707695	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_007618	ACAAA	2	10	713246	713255	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_007618	AAGAT	2	10	720539	720548	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007618	GGTTT	2	10	720949	720958	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007618	CAAAG	2	10	721109	721118	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_007618	TCTTT	2	10	723851	723860	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_007618	CTGAA	2	10	733208	733217	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_007618	TCACA	2	10	738253	738262	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_007618	CATGC	2	10	750295	750304	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_007618	ACAAA	2	10	761631	761640	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_007618	CAAGA	2	10	761659	761668	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_007618	ATGCC	2	10	768426	768435	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_007618	TTTGT	2	10	779259	779268	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007618	GAAAA	2	10	781014	781023	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007618	ACAAA	2	10	781146	781155	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_007618	CTTGT	2	10	786426	786435	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_007618	CTTGA	2	10	790739	790748	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_007618	GCCGG	2	10	793101	793110	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
146	NC_007618	ATGCC	2	10	797099	797108	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_007618	ATTGG	2	10	806085	806094	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_007618	ATTCA	2	10	887200	887209	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
158	NC_007618	GACAG	2	10	930639	930648	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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264	NC_007618	GAACG	2	10	1594955	1594964	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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266	NC_007618	CCTCT	2	10	1600909	1600918	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
267	NC_007618	GCTGT	2	10	1602519	1602528	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
268	NC_007618	CGAAG	2	10	1603333	1603342	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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274	NC_007618	CCGAA	2	10	1629005	1629014	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
275	NC_007618	GCCGA	2	10	1629267	1629276	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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281	NC_007618	CGGAG	2	10	1688113	1688122	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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283	NC_007618	CCCGC	2	10	1691170	1691179	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
284	NC_007618	AGCCG	2	10	1692469	1692478	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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286	NC_007618	GCCTG	2	10	1732058	1732067	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
287	NC_007618	CTGGC	2	10	1732079	1732088	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
288	NC_007618	CATGT	2	10	1732554	1732563	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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342	NC_007618	GCCAA	2	10	2089085	2089094	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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345	NC_007618	CCTGT	2	10	2099794	2099803	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
346	NC_007618	TGTGC	2	10	2102935	2102944	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
347	NC_007618	CCCGG	2	10	2104553	2104562	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
348	NC_007618	ACCCG	2	10	2104941	2104950	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
349	NC_007618	CGGAT	2	10	2104966	2104975	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
350	NC_007618	GGCTT	2	10	2115515	2115524	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
351	NC_007618	GGATG	2	10	2120598	2120607	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.