MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Nitrosospira multiformis ATCC 25196 plasmid 3

Total Repeats: 179

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007617	TCA	3	9	88	96	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007617	CCG	2	6	196	201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_007617	CTG	2	6	278	283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007617	ACG	2	6	285	290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007617	ATC	2	6	324	329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007617	GGA	2	6	436	441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007617	TTA	2	6	602	607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007617	TAT	2	6	620	625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007617	TAA	2	6	673	678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007617	GTA	2	6	680	685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007617	TAA	2	6	703	708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007617	CTG	2	6	845	850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007617	GAA	2	6	880	885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007617	CCA	2	6	1005	1010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82703929
15	NC_007617	CTG	2	6	1185	1190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703929
16	NC_007617	CAT	2	6	1210	1215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703929
17	NC_007617	GGC	2	6	1284	1289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703929
18	NC_007617	GAT	2	6	1351	1356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703929
19	NC_007617	AGG	2	6	1359	1364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82703929
20	NC_007617	GCT	2	6	1393	1398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703929
21	NC_007617	ATC	2	6	1462	1467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007617	TGC	2	6	1477	1482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007617	CAG	3	9	1493	1501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007617	GGT	2	6	1503	1508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007617	GTT	2	6	1554	1559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703930
26	NC_007617	CTT	2	6	1696	1701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703930
27	NC_007617	ATA	2	6	1906	1911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82703931
28	NC_007617	TCC	2	6	1918	1923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82703931
29	NC_007617	CAT	2	6	2027	2032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703931
30	NC_007617	ACT	2	6	2038	2043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703931
31	NC_007617	TCT	2	6	2203	2208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703931
32	NC_007617	TCA	2	6	2209	2214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703931
33	NC_007617	AGC	2	6	2310	2315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007617	AGC	2	6	2328	2333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007617	GCT	2	6	2356	2361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007617	TTG	2	6	2386	2391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703932
37	NC_007617	GGT	2	6	2463	2468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82703932
38	NC_007617	GGC	2	6	2675	2680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703932
39	NC_007617	GAT	2	6	2715	2720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703932
40	NC_007617	GGC	2	6	2825	2830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703932
41	NC_007617	AAT	2	6	3082	3087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007617	AGC	2	6	3336	3341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_007617	CAT	2	6	3357	3362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007617	GAA	2	6	3373	3378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007617	GAG	2	6	3499	3504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82703933
46	NC_007617	AGC	2	6	3609	3614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703933
47	NC_007617	ACG	2	6	3624	3629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703933
48	NC_007617	TGC	2	6	3645	3650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703933
49	NC_007617	TTG	2	6	3845	3850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703933
50	NC_007617	GAC	2	6	3877	3882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703933
51	NC_007617	AAC	2	6	4197	4202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82703933
52	NC_007617	AAG	2	6	4241	4246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82703933
53	NC_007617	TGA	2	6	4293	4298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703933
54	NC_007617	GCA	2	6	4445	4450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703933
55	NC_007617	TAC	2	6	4481	4486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703933
56	NC_007617	TCT	2	6	4639	4644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703933
57	NC_007617	AGC	2	6	5094	5099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007617	AGG	2	6	5252	5257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007617	GCA	2	6	5606	5611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007617	CAA	2	6	5616	5621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007617	GCA	2	6	5657	5662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_007617	CTG	2	6	5811	5816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007617	CAG	2	6	5842	5847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703934
64	NC_007617	CCA	2	6	5967	5972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82703934
65	NC_007617	ATC	2	6	5984	5989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703934
66	NC_007617	GCG	2	6	5996	6001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703934
67	NC_007617	GGC	2	6	6061	6066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703934
68	NC_007617	GCT	2	6	6095	6100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703934
69	NC_007617	CAG	3	9	6166	6174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703934
70	NC_007617	TGG	2	6	6185	6190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82703934
71	NC_007617	CCT	2	6	6257	6262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_007617	TTG	2	6	6265	6270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007617	GCA	2	6	6300	6305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_007617	GTT	2	6	6348	6353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007617	TGC	2	6	6508	6513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703935
76	NC_007617	GCA	2	6	6532	6537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703935
77	NC_007617	GCT	2	6	6616	6621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703935
78	NC_007617	GCA	2	6	6651	6656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703935
79	NC_007617	ACC	2	6	6662	6667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82703935
80	NC_007617	TCG	2	6	6738	6743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703935
81	NC_007617	AGC	2	6	7035	7040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703935
82	NC_007617	TCT	2	6	7093	7098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703935
83	NC_007617	GAA	2	6	7105	7110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82703935
84	NC_007617	CAT	2	6	7150	7155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703935
85	NC_007617	GCA	2	6	7204	7209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703935
86	NC_007617	TCA	2	6	7236	7241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703935
87	NC_007617	GAG	2	6	7280	7285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82703935
88	NC_007617	GAA	2	6	7580	7585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82703935
89	NC_007617	CGA	2	6	7621	7626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703935
90	NC_007617	GCC	2	6	7652	7657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82703935
91	NC_007617	GCA	2	6	7729	7734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703935
92	NC_007617	TGC	2	6	7758	7763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703935
93	NC_007617	GCA	2	6	7966	7971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703935
94	NC_007617	TAA	2	6	8155	8160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82703941
95	NC_007617	CCA	2	6	8193	8198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82703941
96	NC_007617	CAC	2	6	8218	8223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82703941
97	NC_007617	GCA	2	6	8244	8249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703941
98	NC_007617	ATC	2	6	8381	8386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703941
99	NC_007617	CTA	2	6	8479	8484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703941
100	NC_007617	GTT	2	6	8491	8496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703941
101	NC_007617	GTA	2	6	8517	8522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703941
102	NC_007617	ATT	2	6	8562	8567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82703941
103	NC_007617	CAA	2	6	8677	8682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82703941
104	NC_007617	TGG	2	6	8699	8704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82703941
105	NC_007617	TGA	2	6	8706	8711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703941
106	NC_007617	ACA	2	6	8804	8809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82703941
107	NC_007617	ACC	2	6	8840	8845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82703941
108	NC_007617	ATA	2	6	8847	8852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82703941
109	NC_007617	ATT	2	6	8885	8890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82703941
110	NC_007617	TCT	2	6	8969	8974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703941
111	NC_007617	CTC	2	6	8999	9004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82703941
112	NC_007617	TAA	2	6	9089	9094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007617	CCG	2	6	9105	9110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_007617	GCT	2	6	9114	9119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_007617	TTC	2	6	9149	9154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007617	CTC	2	6	9257	9262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_007617	TCT	2	6	9265	9270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_007617	GTT	2	6	9337	9342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007617	CTA	2	6	9490	9495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_007617	GTT	2	6	9673	9678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703942
121	NC_007617	AAG	2	6	9723	9728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82703942
122	NC_007617	TTA	2	6	9867	9872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82703942
123	NC_007617	CTC	2	6	9883	9888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82703942
124	NC_007617	CAG	2	6	10134	10139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703942
125	NC_007617	GAG	2	6	10223	10228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007617	GAA	2	6	10238	10243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82703936
127	NC_007617	ATT	2	6	10263	10268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82703936
128	NC_007617	GCC	2	6	10315	10320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82703936
129	NC_007617	CGT	2	6	10339	10344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703936
130	NC_007617	TGG	2	6	10367	10372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82703936
131	NC_007617	CTT	2	6	10452	10457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703936
132	NC_007617	CGT	2	6	10673	10678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703937
133	NC_007617	CTG	2	6	10703	10708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703937
134	NC_007617	TGA	2	6	10918	10923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703937
135	NC_007617	ACA	2	6	10972	10977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82703937
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.