MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Nitrosospira multiformis ATCC 25196 plasmid 2

Total Repeats: 199

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007616	AAC	2	6	74	79	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007616	GTC	2	6	221	226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007616	CCT	2	6	266	271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_007616	GCG	2	6	342	347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007616	GAA	2	6	393	398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007616	CTA	2	6	409	414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_007616	ATA	2	6	581	586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007616	TAA	3	9	639	647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007616	TTA	2	6	716	721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82703912
10	NC_007616	TGG	2	6	901	906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82703912
11	NC_007616	TTC	2	6	912	917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703912
12	NC_007616	CAA	2	6	1128	1133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82703912
13	NC_007616	TCA	2	6	1260	1265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703912
14	NC_007616	AGG	2	6	1298	1303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82703912
15	NC_007616	TCA	2	6	1577	1582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703912
16	NC_007616	GAA	2	6	1674	1679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82703913
17	NC_007616	ATT	2	6	1774	1779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82703913
18	NC_007616	AGG	2	6	1818	1823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82703913
19	NC_007616	TCG	2	6	1842	1847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703913
20	NC_007616	TGA	2	6	1881	1886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703913
21	NC_007616	CGG	2	6	1936	1941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703913
22	NC_007616	CAA	2	6	2067	2072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82703913
23	NC_007616	TTC	2	6	2285	2290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703913
24	NC_007616	TCA	2	6	2308	2313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703913
25	NC_007616	AGC	2	6	2502	2507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703913
26	NC_007616	CAT	2	6	2640	2645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703914
27	NC_007616	AGT	2	6	3010	3015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007616	AGG	2	6	3057	3062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007616	AGC	2	6	3065	3070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007616	CTT	2	6	3175	3180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007616	GTT	2	6	3554	3559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703915
32	NC_007616	GCC	2	6	3568	3573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82703915
33	NC_007616	TGA	2	6	3607	3612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703915
34	NC_007616	TCA	2	6	3633	3638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703915
35	NC_007616	AGC	2	6	3900	3905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703915
36	NC_007616	TTG	2	6	3970	3975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703915
37	NC_007616	GCG	2	6	4004	4009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703915
38	NC_007616	GCT	2	6	4174	4179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703915
39	NC_007616	ACG	2	6	4199	4204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703915
40	NC_007616	CAA	2	6	4347	4352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82703916
41	NC_007616	TCT	2	6	4353	4358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703916
42	NC_007616	TGT	2	6	4461	4466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703916
43	NC_007616	ACC	2	6	4490	4495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82703916
44	NC_007616	AAT	2	6	4525	4530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82703916
45	NC_007616	CTT	2	6	4549	4554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703916
46	NC_007616	GGT	2	6	4600	4605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007616	AAC	2	6	4701	4706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_007616	CGT	2	6	4717	4722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007616	AGA	2	6	4827	4832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007616	AAC	2	6	5301	5306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82703917
51	NC_007616	CGA	2	6	5362	5367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703917
52	NC_007616	CAA	2	6	5369	5374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82703917
53	NC_007616	AAG	2	6	5450	5455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82703917
54	NC_007616	AAT	2	6	5543	5548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82703917
55	NC_007616	TTG	2	6	6008	6013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703917
56	NC_007616	GAT	2	6	6038	6043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703917
57	NC_007616	GGT	2	6	6061	6066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82703917
58	NC_007616	GTT	2	6	6096	6101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703918
59	NC_007616	CAG	2	6	6135	6140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703918
60	NC_007616	TCA	2	6	6242	6247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703918
61	NC_007616	CTG	2	6	6291	6296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703918
62	NC_007616	ACG	2	6	6397	6402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703918
63	NC_007616	CTC	2	6	6406	6411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82703918
64	NC_007616	ACG	2	6	6424	6429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703918
65	NC_007616	AAC	2	6	6430	6435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82703918
66	NC_007616	ATC	2	6	6793	6798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703918
67	NC_007616	CAT	2	6	6873	6878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703918
68	NC_007616	CCT	2	6	6879	6884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82703918
69	NC_007616	CTT	2	6	6896	6901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703918
70	NC_007616	CTA	2	6	7002	7007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703918
71	NC_007616	CCA	2	6	7013	7018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82703918
72	NC_007616	CGA	2	6	7044	7049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703918
73	NC_007616	ACC	2	6	7067	7072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82703918
74	NC_007616	GAG	2	6	7106	7111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82703918
75	NC_007616	TAA	2	6	7197	7202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82703918
76	NC_007616	CTG	2	6	7335	7340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703918
77	NC_007616	AAG	2	6	7393	7398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82703918
78	NC_007616	GGA	2	6	7421	7426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82703918
79	NC_007616	GCG	2	6	7519	7524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703918
80	NC_007616	GAT	2	6	7730	7735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007616	GCG	2	6	7871	7876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703919
82	NC_007616	ATC	2	6	7902	7907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703919
83	NC_007616	TTA	2	6	7929	7934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82703919
84	NC_007616	TGA	2	6	7965	7970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703919
85	NC_007616	GCT	2	6	7996	8001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703919
86	NC_007616	CGG	2	6	8035	8040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703919
87	NC_007616	ATG	2	6	8061	8066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703919
88	NC_007616	GCT	2	6	8128	8133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703920
89	NC_007616	CCG	2	6	8137	8142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82703920
90	NC_007616	TGG	2	6	8174	8179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82703920
91	NC_007616	ACG	2	6	8209	8214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703920
92	NC_007616	GGC	2	6	8283	8288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703920
93	NC_007616	CTG	2	6	8441	8446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703920
94	NC_007616	TAC	2	6	8523	8528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703920
95	NC_007616	GTT	3	9	8647	8655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703920
96	NC_007616	GAT	2	6	8679	8684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703920
97	NC_007616	GGC	2	6	8917	8922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_007616	GAT	2	6	8936	8941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007616	AGT	2	6	9034	9039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007616	ATG	2	6	9191	9196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007616	TTG	2	6	9271	9276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703921
102	NC_007616	CGA	2	6	9458	9463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703921
103	NC_007616	GCG	2	6	9593	9598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703921
104	NC_007616	GAG	2	6	9676	9681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82703921
105	NC_007616	GTT	2	6	9718	9723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703921
106	NC_007616	ATT	2	6	9824	9829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82703921
107	NC_007616	CGG	2	6	9853	9858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703921
108	NC_007616	CAG	2	6	9942	9947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703921
109	NC_007616	TAT	2	6	10150	10155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82703921
110	NC_007616	TGC	2	6	10299	10304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_007616	ATT	2	6	10372	10377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82703922
112	NC_007616	GTT	2	6	10408	10413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703922
113	NC_007616	CTT	2	6	10477	10482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703922
114	NC_007616	CGG	2	6	10502	10507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703922
115	NC_007616	GCC	2	6	10520	10525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82703922
116	NC_007616	TCT	2	6	10550	10555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703922
117	NC_007616	CTG	2	6	10558	10563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703922
118	NC_007616	CTT	2	6	10771	10776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703922
119	NC_007616	GAA	2	6	10777	10782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82703922
120	NC_007616	CTT	2	6	10785	10790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703922
121	NC_007616	GCA	2	6	10820	10825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703922
122	NC_007616	GAT	2	6	10875	10880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703922
123	NC_007616	TCG	2	6	10911	10916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703922
124	NC_007616	AAG	2	6	11003	11008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82703922
125	NC_007616	TCT	2	6	11027	11032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703922
126	NC_007616	TCC	2	6	11222	11227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82703922
127	NC_007616	GCC	3	9	11345	11353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82703922
128	NC_007616	TGC	2	6	11393	11398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703922
129	NC_007616	CTT	2	6	11403	11408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703922
130	NC_007616	ACG	2	6	11416	11421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703922
131	NC_007616	CTT	2	6	11431	11436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703922
132	NC_007616	GTC	2	6	11536	11541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703922
133	NC_007616	GAT	2	6	11587	11592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703922
134	NC_007616	CAT	2	6	11686	11691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703922
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.