MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Nitrosospira multiformis ATCC 25196 plasmid 1

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007615	AAGA	2	8	443	450	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007615	GTCA	2	8	656	663	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_007615	ACTA	2	8	668	675	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_007615	AGCA	2	8	869	876	50 %	0 %	25 %	25 %	82703894
5	NC_007615	CAGG	2	8	949	956	25 %	0 %	50 %	25 %	82703894
6	NC_007615	TACT	2	8	1287	1294	25 %	50 %	0 %	25 %	82703895
7	NC_007615	GCAG	2	8	1774	1781	25 %	0 %	50 %	25 %	82703895
8	NC_007615	CCTG	2	8	2005	2012	0 %	25 %	25 %	50 %	82703895
9	NC_007615	CAGC	2	8	2063	2070	25 %	0 %	25 %	50 %	82703895
10	NC_007615	TGAA	2	8	2130	2137	50 %	25 %	25 %	0 %	82703895
11	NC_007615	ATGA	2	8	2189	2196	50 %	25 %	25 %	0 %	82703895
12	NC_007615	AGTC	2	8	2224	2231	25 %	25 %	25 %	25 %	82703895
13	NC_007615	TGAT	2	8	2372	2379	25 %	50 %	25 %	0 %	82703896
14	NC_007615	GGCA	2	8	3444	3451	25 %	0 %	50 %	25 %	82703897
15	NC_007615	CAGT	2	8	3544	3551	25 %	25 %	25 %	25 %	82703897
16	NC_007615	GCGG	2	8	3944	3951	0 %	0 %	75 %	25 %	82703897
17	NC_007615	AACC	2	8	4208	4215	50 %	0 %	0 %	50 %	82703897
18	NC_007615	CCAG	2	8	4282	4289	25 %	0 %	25 %	50 %	82703897
19	NC_007615	TATT	2	8	4744	4751	25 %	75 %	0 %	0 %	82703898
20	NC_007615	CAGT	2	8	5078	5085	25 %	25 %	25 %	25 %	82703898
21	NC_007615	CCAG	2	8	5168	5175	25 %	0 %	25 %	50 %	82703898
22	NC_007615	ATAA	2	8	5181	5188	75 %	25 %	0 %	0 %	82703898
23	NC_007615	CCTT	2	8	5433	5440	0 %	50 %	0 %	50 %	82703899
24	NC_007615	CCTT	2	8	5454	5461	0 %	50 %	0 %	50 %	82703899
25	NC_007615	GCCA	2	8	5499	5506	25 %	0 %	25 %	50 %	82703899
26	NC_007615	CGGC	2	8	5605	5612	0 %	0 %	50 %	50 %	82703899
27	NC_007615	GCAA	2	8	5928	5935	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_007615	CCAT	2	8	6870	6877	25 %	25 %	0 %	50 %	82703902
29	NC_007615	CACT	2	8	7338	7345	25 %	25 %	0 %	50 %	82703903
30	NC_007615	CTTG	2	8	7413	7420	0 %	50 %	25 %	25 %	82703904
31	NC_007615	CAAG	2	8	8705	8712	50 %	0 %	25 %	25 %	82703904
32	NC_007615	AGCA	2	8	8933	8940	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_007615	CTGC	2	8	9078	9085	0 %	25 %	25 %	50 %	82703905
34	NC_007615	GAAA	2	8	9369	9376	75 %	0 %	25 %	0 %	82703905
35	NC_007615	CTTG	2	8	9524	9531	0 %	50 %	25 %	25 %	82703905
36	NC_007615	CAAG	2	8	9775	9782	50 %	0 %	25 %	25 %	82703905
37	NC_007615	GTTA	2	8	10005	10012	25 %	50 %	25 %	0 %	82703905
38	NC_007615	TTAA	2	8	10335	10342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007615	TAAA	2	8	10426	10433	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007615	ATTT	2	8	10438	10445	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007615	TATT	2	8	10636	10643	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007615	CCCA	2	8	11064	11071	25 %	0 %	0 %	75 %	82703906
43	NC_007615	ATCA	2	8	11332	11339	50 %	25 %	0 %	25 %	82703906
44	NC_007615	AGCC	2	8	11776	11783	25 %	0 %	25 %	50 %	82703906
45	NC_007615	GCTG	2	8	13248	13255	0 %	25 %	50 %	25 %	82703906
46	NC_007615	TTCC	2	8	13470	13477	0 %	50 %	0 %	50 %	82703906
47	NC_007615	GGTA	2	8	13500	13507	25 %	25 %	50 %	0 %	82703906
48	NC_007615	TGCT	2	8	14171	14178	0 %	50 %	25 %	25 %	82703906
49	NC_007615	TGGC	4	16	14430	14445	0 %	25 %	50 %	25 %	82703906
50	NC_007615	TGTC	2	8	14671	14678	0 %	50 %	25 %	25 %	82703906
51	NC_007615	CTTG	2	8	14959	14966	0 %	50 %	25 %	25 %	82703906
52	NC_007615	CTTC	2	8	15510	15517	0 %	50 %	0 %	50 %	82703906
53	NC_007615	ATCC	2	8	15555	15562	25 %	25 %	0 %	50 %	82703906
54	NC_007615	GGAA	2	8	17032	17039	50 %	0 %	50 %	0 %	82703908
55	NC_007615	CTTG	2	8	17747	17754	0 %	50 %	25 %	25 %	82703909
56	NC_007615	AAGG	2	8	17766	17773	50 %	0 %	50 %	0 %	82703909
57	NC_007615	CAGC	2	8	18091	18098	25 %	0 %	25 %	50 %	82703910
58	NC_007615	TTAA	2	8	18562	18569	50 %	50 %	0 %	0 %	82703910

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.