MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Nitrosospira multiformis ATCC 25196 plasmid 1

Total Repeats: 199

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007615	GAT	2	6	913	918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703894
2	NC_007615	CCA	2	6	962	967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82703894
3	NC_007615	GCA	2	6	985	990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703894
4	NC_007615	CAG	2	6	1012	1017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703894
5	NC_007615	TGG	2	6	1101	1106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82703894
6	NC_007615	GTG	2	6	1153	1158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82703894
7	NC_007615	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703894
8	NC_007615	CCG	2	6	1189	1194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82703895
9	NC_007615	AGT	2	6	1213	1218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703895
10	NC_007615	CTA	2	6	1245	1250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703895
11	NC_007615	GTG	2	6	1267	1272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82703895
12	NC_007615	ATT	2	6	1413	1418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82703895
13	NC_007615	AGC	2	6	1455	1460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703895
14	NC_007615	CCA	2	6	1716	1721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82703895
15	NC_007615	GCA	2	6	1799	1804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703895
16	NC_007615	GGC	2	6	1847	1852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703895
17	NC_007615	TTG	2	6	1860	1865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703895
18	NC_007615	AAC	2	6	1999	2004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82703895
19	NC_007615	CAA	3	9	2104	2112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82703895
20	NC_007615	TCC	2	6	2113	2118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82703895
21	NC_007615	TCA	2	6	2141	2146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703895
22	NC_007615	AAT	2	6	2171	2176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82703895
23	NC_007615	TGG	2	6	2207	2212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82703895
24	NC_007615	AGC	2	6	2430	2435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703896
25	NC_007615	TTA	2	6	2447	2452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82703896
26	NC_007615	TGC	2	6	2501	2506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703896
27	NC_007615	CAG	2	6	2526	2531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703896
28	NC_007615	TGT	2	6	2658	2663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703896
29	NC_007615	CAG	2	6	2754	2759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703896
30	NC_007615	AGC	2	6	3078	3083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703897
31	NC_007615	ACT	2	6	3095	3100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703897
32	NC_007615	GGA	2	6	3162	3167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82703897
33	NC_007615	TTG	2	6	3408	3413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703897
34	NC_007615	GCC	2	6	3426	3431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82703897
35	NC_007615	GGA	2	6	3453	3458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82703897
36	NC_007615	CAT	2	6	3554	3559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703897
37	NC_007615	TGA	2	6	3602	3607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703897
38	NC_007615	ACT	2	6	3706	3711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703897
39	NC_007615	ATC	3	9	3864	3872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703897
40	NC_007615	CAG	2	6	3918	3923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703897
41	NC_007615	GAC	2	6	4041	4046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703897
42	NC_007615	TAC	2	6	4113	4118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703897
43	NC_007615	GAT	2	6	4229	4234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703897
44	NC_007615	GAA	2	6	4402	4407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82703897
45	NC_007615	AGG	2	6	4487	4492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82703897
46	NC_007615	GGC	2	6	4569	4574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703897
47	NC_007615	CTG	3	9	4652	4660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703898
48	NC_007615	TTC	2	6	4890	4895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703898
49	NC_007615	CTT	2	6	4922	4927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703898
50	NC_007615	CGT	2	6	5024	5029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703898
51	NC_007615	AGC	2	6	5104	5109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703898
52	NC_007615	CCA	2	6	5304	5309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82703899
53	NC_007615	AAT	2	6	5384	5389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82703899
54	NC_007615	ATT	2	6	5839	5844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82703900
55	NC_007615	GCA	2	6	5858	5863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703900
56	NC_007615	TGC	2	6	6424	6429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703901
57	NC_007615	CTG	2	6	6469	6474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703901
58	NC_007615	AGC	2	6	6506	6511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703901
59	NC_007615	CCG	2	6	6859	6864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82703902
60	NC_007615	TGC	2	6	7218	7223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703903
61	NC_007615	ACC	2	6	7332	7337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82703903
62	NC_007615	CAA	2	6	7448	7453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82703904
63	NC_007615	CAC	2	6	7542	7547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82703904
64	NC_007615	TCC	2	6	7689	7694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82703904
65	NC_007615	CTT	2	6	7785	7790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703904
66	NC_007615	ATG	2	6	7839	7844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703904
67	NC_007615	TCC	2	6	7952	7957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82703904
68	NC_007615	GTA	2	6	7965	7970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703904
69	NC_007615	ATA	2	6	7995	8000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82703904
70	NC_007615	GGC	2	6	8019	8024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703904
71	NC_007615	TGC	2	6	8058	8063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703904
72	NC_007615	ATC	2	6	8085	8090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703904
73	NC_007615	GAT	2	6	8120	8125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703904
74	NC_007615	TGC	2	6	8160	8165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703904
75	NC_007615	ATT	2	6	8359	8364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82703904
76	NC_007615	ATC	2	6	8428	8433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703904
77	NC_007615	AAT	2	6	8457	8462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82703904
78	NC_007615	GAA	2	6	8477	8482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82703904
79	NC_007615	TTC	2	6	8496	8501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703904
80	NC_007615	CTT	2	6	8610	8615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703904
81	NC_007615	AAG	2	6	8811	8816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82703904
82	NC_007615	CGG	2	6	9093	9098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703905
83	NC_007615	ATG	2	6	9169	9174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703905
84	NC_007615	CGC	2	6	9180	9185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82703905
85	NC_007615	ACA	2	6	9190	9195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82703905
86	NC_007615	TGA	2	6	9239	9244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703905
87	NC_007615	CGA	2	6	9284	9289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703905
88	NC_007615	CGC	2	6	9335	9340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82703905
89	NC_007615	GCT	2	6	9473	9478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703905
90	NC_007615	GCG	2	6	9554	9559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703905
91	NC_007615	CGA	2	6	9560	9565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703905
92	NC_007615	GGC	2	6	9639	9644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703905
93	NC_007615	GCC	2	6	9672	9677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82703905
94	NC_007615	TCA	2	6	9685	9690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703905
95	NC_007615	AGC	2	6	9704	9709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703905
96	NC_007615	TAA	2	6	9755	9760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82703905
97	NC_007615	TTC	2	6	9824	9829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703905
98	NC_007615	ACC	2	6	9964	9969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82703905
99	NC_007615	TCT	2	6	10940	10945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703906
100	NC_007615	GTT	2	6	10976	10981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703906
101	NC_007615	GGT	2	6	11141	11146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82703906
102	NC_007615	TCC	2	6	11353	11358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82703906
103	NC_007615	TCC	2	6	11380	11385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82703906
104	NC_007615	CTG	2	6	11467	11472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703906
105	NC_007615	GCC	2	6	11582	11587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82703906
106	NC_007615	TAA	2	6	11624	11629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82703906
107	NC_007615	GCC	2	6	11638	11643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82703906
108	NC_007615	GCG	2	6	11674	11679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703906
109	NC_007615	CTC	2	6	11754	11759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82703906
110	NC_007615	ATT	2	6	11761	11766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82703906
111	NC_007615	GCC	3	9	11781	11789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82703906
112	NC_007615	CGT	2	6	11913	11918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703906
113	NC_007615	GCG	2	6	12005	12010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703906
114	NC_007615	GAG	2	6	12055	12060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82703906
115	NC_007615	CAT	2	6	12072	12077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703906
116	NC_007615	GCT	2	6	12101	12106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703906
117	NC_007615	GTG	2	6	12149	12154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82703906
118	NC_007615	GGC	2	6	12201	12206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703906
119	NC_007615	CTG	2	6	12256	12261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703906
120	NC_007615	GGT	2	6	12502	12507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82703906
121	NC_007615	TGG	2	6	12525	12530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82703906
122	NC_007615	GTC	2	6	12616	12621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703906
123	NC_007615	GGC	2	6	12675	12680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703906
124	NC_007615	TCG	2	6	12713	12718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703906
125	NC_007615	GGC	2	6	12738	12743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703906
126	NC_007615	TGC	2	6	12792	12797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703906
127	NC_007615	TGG	2	6	12828	12833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82703906
128	NC_007615	CGT	2	6	12999	13004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703906
129	NC_007615	TGC	2	6	13079	13084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703906
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131	NC_007615	CGC	2	6	13219	13224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82703906
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.