MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrosospira multiformis ATCC 25196 chromosome

Total Repeats: 1307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007614	CTCG	2	8	25	32	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007614	TTCC	2	8	42	49	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007614	TTTA	2	8	1560	1567	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007614	TCGG	2	8	2884	2891	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007614	GTGA	2	8	3010	3017	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007614	GCCG	2	8	7083	7090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_007614	TGCA	2	8	25411	25418	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_007614	CGAA	2	8	25445	25452	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_007614	ATTA	2	8	25729	25736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007614	TCCC	2	8	29092	29099	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_007614	TTTC	2	8	29245	29252	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_007614	GCTT	2	8	29823	29830	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_007614	ATTT	2	8	32492	32499	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007614	GAGC	2	8	33591	33598	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_007614	TTCA	2	8	34703	34710	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_007614	ACCC	2	8	35212	35219	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
17	NC_007614	TTTA	2	8	43831	43838	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007614	TAAG	2	8	49119	49126	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007614	GGTT	2	8	50053	50060	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007614	TTAT	2	8	60583	60590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007614	TACA	2	8	62180	62187	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_007614	ACAA	2	8	62585	62592	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_007614	GTTT	2	8	63286	63293	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007614	TCGT	2	8	65234	65241	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_007614	CTGG	2	8	65280	65287	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_007614	GAAA	2	8	67936	67943	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007614	GATT	2	8	67960	67967	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007614	CCCG	2	8	68154	68161	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
29	NC_007614	GCAA	2	8	68268	68275	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_007614	TGAA	2	8	68828	68835	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007614	CTTC	2	8	69546	69553	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_007614	TCGT	2	8	72158	72165	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_007614	TTTA	2	8	76984	76991	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007614	GCTT	2	8	78475	78482	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_007614	AGGG	2	8	85789	85796	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007614	ACGG	2	8	105537	105544	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_007614	CGGG	2	8	105573	105580	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38	NC_007614	TCCT	2	8	105776	105783	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_007614	GAAT	2	8	106785	106792	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007614	GAAC	2	8	111250	111257	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_007614	GCCA	2	8	111659	111666	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_007614	TCCT	2	8	112578	112585	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_007614	CAAA	2	8	116397	116404	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_007614	AGCA	2	8	116517	116524	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_007614	AACC	2	8	116628	116635	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_007614	ATCT	2	8	119262	119269	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007614	GGAT	2	8	119270	119277	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007614	AGTA	2	8	119315	119322	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007614	CTGT	2	8	119340	119347	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_007614	AAGA	2	8	119459	119466	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007614	TGCC	2	8	124362	124369	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_007614	TCAA	2	8	124374	124381	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_007614	AGTG	2	8	124492	124499	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007614	ATTA	2	8	129673	129680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007614	GAAT	2	8	130827	130834	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007614	TGCT	2	8	133180	133187	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_007614	CCGT	2	8	136277	136284	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_007614	GCCG	2	8	139529	139536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_007614	CTAC	2	8	142765	142772	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_007614	CCCG	2	8	142811	142818	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
61	NC_007614	TCCC	2	8	144325	144332	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
62	NC_007614	CTTG	2	8	145354	145361	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_007614	TGAA	2	8	145403	145410	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007614	GAAA	2	8	147022	147029	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007614	AGGG	2	8	147051	147058	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007614	CCAG	2	8	147364	147371	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_007614	ATTC	2	8	147376	147383	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_007614	ATTC	2	8	150550	150557	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_007614	CTGT	2	8	153239	153246	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_007614	CTTA	2	8	155087	155094	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_007614	TTTC	2	8	155205	155212	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_007614	CTCA	2	8	156945	156952	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_007614	AATG	2	8	157043	157050	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007614	AAAG	2	8	163469	163476	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007614	TATT	2	8	163741	163748	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007614	GTTA	2	8	163761	163768	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007614	TTTC	2	8	163775	163782	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_007614	GCAC	2	8	164024	164031	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_007614	AGGA	2	8	164078	164085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007614	CACC	2	8	165251	165258	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
81	NC_007614	TGTT	2	8	166479	166486	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007614	CTGC	2	8	166640	166647	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_007614	TGCC	2	8	167023	167030	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_007614	GTTT	2	8	167257	167264	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007614	TTCA	2	8	167804	167811	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_007614	TTCG	2	8	168817	168824	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_007614	GAAG	2	8	169379	169386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007614	GAAC	2	8	169430	169437	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_007614	AGCC	3	12	173079	173090	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_007614	CCGC	2	8	173091	173098	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
91	NC_007614	AGCC	2	8	173103	173110	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_007614	CGGG	2	8	173141	173148	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93	NC_007614	TTAA	2	8	173160	173167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007614	GATC	2	8	173181	173188	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_007614	AGGG	2	8	174166	174173	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007614	TGCT	2	8	177029	177036	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_007614	CAGC	2	8	177078	177085	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_007614	TGTT	2	8	177130	177137	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007614	AAGG	2	8	185072	185079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007614	AGTA	2	8	187750	187757	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007614	AGTC	2	8	187823	187830	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_007614	TTAT	2	8	188888	188895	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007614	CAGG	2	8	193049	193056	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_007614	TCAT	2	8	194307	194314	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_007614	GAAT	2	8	194346	194353	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007614	AGAA	2	8	197528	197535	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007614	GCAT	2	8	204800	204807	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_007614	GCCC	2	8	206599	206606	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
109	NC_007614	TAAT	2	8	208355	208362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007614	CGGT	2	8	208433	208440	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_007614	CTTT	2	8	208687	208694	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_007614	AATC	2	8	221277	221284	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_007614	CCTG	2	8	221431	221438	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_007614	TGAT	2	8	221465	221472	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007614	CAGG	2	8	224463	224470	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_007614	CTTC	2	8	230461	230468	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_007614	TCAT	3	12	231772	231783	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_007614	GCAA	2	8	231893	231900	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_007614	GAAC	2	8	235563	235570	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_007614	CTGC	2	8	240861	240868	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_007614	CGGC	2	8	241052	241059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_007614	AGGC	2	8	241147	241154	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_007614	AGCG	2	8	242112	242119	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_007614	CGCT	2	8	247266	247273	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_007614	CCGC	2	8	252117	252124	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
126	NC_007614	CTCC	2	8	252969	252976	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
127	NC_007614	CCAT	2	8	253463	253470	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_007614	TCAG	2	8	253670	253677	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_007614	TACG	2	8	253808	253815	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_007614	ACAG	2	8	254040	254047	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_007614	AGGA	2	8	254126	254133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007614	AGAA	2	8	254321	254328	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007614	GCCC	2	8	254356	254363	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
134	NC_007614	ATGG	2	8	262553	262560	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007614	TCAC	2	8	269067	269074	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_007614	AGCA	2	8	271421	271428	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_007614	GATA	2	8	271454	271461	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007614	TAAA	2	8	272989	272996	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007614	TAAA	2	8	274155	274162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007614	GGCT	2	8	274285	274292	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_007614	CATC	2	8	274310	274317	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_007614	AGTG	2	8	282153	282160	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007614	CTAG	2	8	283717	283724	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_007614	TTTC	2	8	283787	283794	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_007614	CTGG	2	8	284542	284549	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_007614	CTGA	2	8	284798	284805	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_007614	TTGA	2	8	284806	284813	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007614	AAGG	2	8	285054	285061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007614	TGGA	2	8	291190	291197	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_007614	GAAG	2	8	294408	294415	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_007614	GGCT	2	8	296681	296688	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_007614	ACAA	2	8	298373	298380	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_007614	TGGA	2	8	298476	298483	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_007614	ACGA	2	8	298648	298655	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
155	NC_007614	CCCA	2	8	298841	298848	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
156	NC_007614	TCCG	2	8	301574	301581	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
157	NC_007614	TAAA	2	8	302762	302769	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_007614	AACC	2	8	317176	317183	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
159	NC_007614	GCCT	2	8	317207	317214	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
160	NC_007614	GTTC	2	8	319129	319136	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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162	NC_007614	CGTT	2	8	322642	322649	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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166	NC_007614	GCCT	2	8	334531	334538	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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169	NC_007614	TGTC	2	8	356997	357004	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
170	NC_007614	GATG	2	8	367796	367803	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
171	NC_007614	GATT	2	8	368718	368725	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
172	NC_007614	TCGA	2	8	373338	373345	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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176	NC_007614	TGAG	2	8	387249	387256	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
177	NC_007614	GAAG	2	8	391152	391159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_007614	TTTA	2	8	406796	406803	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_007614	CAAT	2	8	695319	695326	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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284	NC_007614	CGCT	2	8	698716	698723	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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293	NC_007614	AGCC	2	8	705423	705430	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
294	NC_007614	CCCG	2	8	705451	705458	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
295	NC_007614	TTTA	2	8	705926	705933	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_007614	TTCA	2	8	705947	705954	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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499	NC_007614	TCTG	2	8	1256370	1256377	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
500	NC_007614	AATG	2	8	1274113	1274120	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

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