MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Nitrosospira multiformis ATCC 25196 chromosome

Total Repeats: 35073

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007614	GAC	2	6	177	182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701136
2	NC_007614	TCC	2	6	226	231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82701136
3	NC_007614	GGA	2	6	355	360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82701136
4	NC_007614	CTT	2	6	596	601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82701136
5	NC_007614	GTA	2	6	723	728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701136
6	NC_007614	CTA	2	6	767	772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701136
7	NC_007614	CTG	3	9	786	794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701136
8	NC_007614	CGA	2	6	797	802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701136
9	NC_007614	TCA	3	9	886	894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701136
10	NC_007614	GAA	2	6	930	935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701136
11	NC_007614	CCT	2	6	981	986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82701136
12	NC_007614	GAA	2	6	1016	1021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701136
13	NC_007614	TAC	2	6	1251	1256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701136
14	NC_007614	GTT	2	6	1299	1304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82701136
15	NC_007614	ACC	2	6	1398	1403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82701136
16	NC_007614	TAC	2	6	1880	1885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701137
17	NC_007614	CCA	2	6	1888	1893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82701137
18	NC_007614	TGC	2	6	1934	1939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701137
19	NC_007614	GTC	2	6	2008	2013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701137
20	NC_007614	CTG	2	6	2059	2064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701137
21	NC_007614	CAG	2	6	2118	2123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701137
22	NC_007614	CTA	2	6	2183	2188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701137
23	NC_007614	GCT	2	6	2198	2203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701137
24	NC_007614	TGA	2	6	2269	2274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701137
25	NC_007614	CAT	2	6	2284	2289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701137
26	NC_007614	TTC	2	6	2308	2313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82701137
27	NC_007614	GTG	2	6	2322	2327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701137
28	NC_007614	TTC	2	6	2380	2385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82701137
29	NC_007614	TAC	2	6	2512	2517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701137
30	NC_007614	CCG	2	6	2584	2589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701137
31	NC_007614	GAA	2	6	2625	2630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701137
32	NC_007614	GAA	2	6	2637	2642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701137
33	NC_007614	CAG	2	6	2759	2764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701137
34	NC_007614	GCA	2	6	3180	3185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701138
35	NC_007614	CCG	2	6	3200	3205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701138
36	NC_007614	TGA	2	6	3363	3368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701138
37	NC_007614	GCT	2	6	3469	3474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701138
38	NC_007614	GGC	2	6	3538	3543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701138
39	NC_007614	ACG	2	6	3684	3689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701138
40	NC_007614	CAA	2	6	3789	3794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82701138
41	NC_007614	GAA	2	6	3835	3840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701138
42	NC_007614	TCT	2	6	3917	3922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82701138
43	NC_007614	CGA	2	6	4134	4139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701138
44	NC_007614	GAA	2	6	4246	4251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701138
45	NC_007614	ATC	2	6	4306	4311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701138
46	NC_007614	ATC	2	6	4321	4326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701138
47	NC_007614	TGG	2	6	4463	4468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701138
48	NC_007614	CCG	2	6	4478	4483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701138
49	NC_007614	CAT	2	6	4524	4529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701138
50	NC_007614	TCA	2	6	4607	4612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701138
51	NC_007614	CAT	4	12	4674	4685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701138
52	NC_007614	TGC	2	6	4724	4729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701138
53	NC_007614	GCC	2	6	4791	4796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701138
54	NC_007614	CTG	2	6	4864	4869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701138
55	NC_007614	CGC	2	6	4916	4921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701138
56	NC_007614	GTT	2	6	5022	5027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82701138
57	NC_007614	GAG	2	6	5056	5061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82701138
58	NC_007614	GGC	2	6	5088	5093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701138
59	NC_007614	CCG	2	6	5252	5257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701138
60	NC_007614	GAA	2	6	5307	5312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701138
61	NC_007614	GCT	2	6	5349	5354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701138
62	NC_007614	GGA	2	6	5355	5360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82701138
63	NC_007614	CTG	2	6	5458	5463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701138
64	NC_007614	CGC	2	6	5487	5492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701138
65	NC_007614	CAC	2	6	5505	5510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82701138
66	NC_007614	AAC	2	6	5554	5559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82701138
67	NC_007614	GAA	2	6	5808	5813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701139
68	NC_007614	CTA	2	6	5918	5923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701139
69	NC_007614	CGG	2	6	5924	5929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701139
70	NC_007614	CTG	2	6	6075	6080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701139
71	NC_007614	CGA	2	6	6302	6307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701139
72	NC_007614	CAC	2	6	6407	6412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82701139
73	NC_007614	ATC	2	6	6444	6449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701139
74	NC_007614	GCC	2	6	6531	6536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701139
75	NC_007614	GCC	2	6	6558	6563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701139
76	NC_007614	TGG	2	6	6682	6687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701139
77	NC_007614	GCC	2	6	6720	6725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701139
78	NC_007614	CAA	2	6	6755	6760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82701139
79	NC_007614	CAC	2	6	6830	6835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82701139
80	NC_007614	AAC	2	6	6862	6867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82701139
81	NC_007614	CGC	3	9	7185	7193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701140
82	NC_007614	CAC	2	6	7223	7228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82701140
83	NC_007614	CGT	2	6	7379	7384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701140
84	NC_007614	GCT	2	6	7391	7396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701140
85	NC_007614	GGC	2	6	7517	7522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701140
86	NC_007614	CGA	2	6	7529	7534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701140
87	NC_007614	GGT	2	6	7820	7825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701141
88	NC_007614	GCC	2	6	7884	7889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701141
89	NC_007614	GTC	2	6	8146	8151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701141
90	NC_007614	CAA	2	6	8201	8206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82701141
91	NC_007614	GCG	2	6	8232	8237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701141
92	NC_007614	GTG	2	6	8367	8372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701141
93	NC_007614	TGC	2	6	8407	8412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701141
94	NC_007614	GCT	2	6	8439	8444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701141
95	NC_007614	GCT	2	6	8529	8534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701141
96	NC_007614	ATG	2	6	8535	8540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701141
97	NC_007614	TGG	2	6	8575	8580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701141
98	NC_007614	TGG	2	6	8623	8628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701141
99	NC_007614	GCG	2	6	8670	8675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701141
100	NC_007614	ATT	2	6	8769	8774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82701141
101	NC_007614	CCG	2	6	8933	8938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701142
102	NC_007614	GCC	2	6	9019	9024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701142
103	NC_007614	CGC	2	6	9083	9088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701142
104	NC_007614	TCA	2	6	9390	9395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701142
105	NC_007614	ATC	2	6	9419	9424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701142
106	NC_007614	GTT	2	6	9444	9449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82701142
107	NC_007614	GCC	2	6	9496	9501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701143
108	NC_007614	GCC	2	6	9526	9531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701143
109	NC_007614	GTG	2	6	9596	9601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701143
110	NC_007614	GCC	2	6	9626	9631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701143
111	NC_007614	TGA	2	6	9680	9685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701143
112	NC_007614	CCG	2	6	9726	9731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701143
113	NC_007614	ATT	2	6	9733	9738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82701143
114	NC_007614	TCG	2	6	10004	10009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701143
115	NC_007614	GCG	2	6	10076	10081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701143
116	NC_007614	CGG	2	6	10083	10088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701143
117	NC_007614	TTC	2	6	10270	10275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82701143
118	NC_007614	ATA	2	6	10297	10302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82701143
119	NC_007614	GCC	2	6	10426	10431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701143
120	NC_007614	AGC	2	6	10442	10447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701143
121	NC_007614	CCA	2	6	10467	10472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82701143
122	NC_007614	CAC	2	6	10543	10548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82701143
123	NC_007614	AGC	2	6	11260	11265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701144
124	NC_007614	GCT	2	6	11292	11297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701144
125	NC_007614	CCT	2	6	11484	11489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82701144
126	NC_007614	GAC	2	6	11500	11505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701144
127	NC_007614	ATC	2	6	11538	11543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701144
128	NC_007614	TCG	2	6	11596	11601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701145
129	NC_007614	GGC	2	6	11639	11644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701145
130	NC_007614	GGA	2	6	11717	11722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82701145
131	NC_007614	GCC	2	6	11728	11733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701145
132	NC_007614	TGG	2	6	11752	11757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701145
133	NC_007614	GCT	2	6	11835	11840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701145
134	NC_007614	CGG	2	6	11936	11941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701145
135	NC_007614	TGG	2	6	12148	12153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701145
136	NC_007614	CGA	2	6	12269	12274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701145
137	NC_007614	GGA	2	6	12329	12334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82701145
138	NC_007614	CAT	2	6	12371	12376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701145
139	NC_007614	GCC	2	6	12649	12654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701145
140	NC_007614	GGA	2	6	12832	12837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82701146
141	NC_007614	GGA	2	6	12907	12912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82701146
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153	NC_007614	GGC	2	6	13827	13832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701147
154	NC_007614	CAT	2	6	13957	13962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701148
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156	NC_007614	GGC	2	6	14155	14160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701148
157	NC_007614	AGT	2	6	14212	14217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701148
158	NC_007614	GGC	2	6	14297	14302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701148
159	NC_007614	ACC	2	6	14306	14311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82701148
160	NC_007614	GCG	2	6	14379	14384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701148
161	NC_007614	GAT	2	6	14396	14401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701148
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163	NC_007614	GGC	2	6	14656	14661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701148
164	NC_007614	TGT	2	6	14662	14667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82701148
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243	NC_007614	TTC	2	6	21478	21483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82701157
244	NC_007614	TGG	2	6	21491	21496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701157
245	NC_007614	CGG	2	6	21560	21565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701157
246	NC_007614	CCG	2	6	21713	21718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701157
247	NC_007614	AGC	3	9	21776	21784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701157
248	NC_007614	CAC	2	6	21798	21803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82701157
249	NC_007614	TCA	2	6	21812	21817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701157
250	NC_007614	CGA	2	6	21848	21853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701157
251	NC_007614	AGG	2	6	21908	21913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82701157
252	NC_007614	GGC	2	6	21991	21996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701157
253	NC_007614	TGC	2	6	22094	22099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701157
254	NC_007614	TGG	2	6	22250	22255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701157
255	NC_007614	GCG	2	6	22357	22362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701157
256	NC_007614	ATG	2	6	22375	22380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701157
257	NC_007614	ATG	2	6	22411	22416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701157
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259	NC_007614	GCG	2	6	22481	22486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701157
260	NC_007614	GCC	2	6	22549	22554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701157
261	NC_007614	GCG	2	6	22560	22565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701157
262	NC_007614	CGG	2	6	22640	22645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701157
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