MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007613	ATTTA	2	10	29266	29275	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007613	TAGTG	2	10	63198	63207	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007613	ATTTT	2	10	64914	64923	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007613	ATGTT	2	10	72795	72804	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007613	AAAAC	2	10	73210	73219	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_007613	AATGC	2	10	104856	104865	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_007613	GGCAT	2	10	130195	130204	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_007613	GTAAG	2	10	130959	130968	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007613	TCCTC	2	10	132679	132688	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
10	NC_007613	TACAA	2	10	133242	133251	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_007613	CGGGC	2	10	133425	133434	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12	NC_007613	ACCGC	2	10	138091	138100	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
13	NC_007613	GCGGT	2	10	138110	138119	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_007613	TTTGC	2	10	142057	142066	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_007613	AAATT	2	10	142498	142507	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007613	TTATC	2	10	153625	153634	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_007613	TACGT	2	10	168446	168455	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_007613	AAATA	2	10	178766	178775	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007613	GTCTG	2	10	178851	178860	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_007613	CGGTT	2	10	209501	209510	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_007613	GATGC	2	10	229512	229521	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_007613	CACGC	2	10	234908	234917	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_007613	ATCAA	2	10	235649	235658	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_007613	TAACA	2	10	236539	236548	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_007613	CTGCG	2	10	240602	240611	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_007613	GAGAA	2	10	242506	242515	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007613	CACTT	2	10	244784	244793	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_007613	CCTGA	2	10	257072	257081	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_007613	CCATG	2	10	267897	267906	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_007613	GTAGC	2	10	271676	271685	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_007613	TATGA	2	10	271888	271897	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007613	CTTCT	2	10	288527	288536	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_007613	CAAAG	2	10	311626	311635	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_007613	TGGCT	2	10	312362	312371	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_007613	CCTGG	2	10	312903	312912	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_007613	GTTTC	2	10	321098	321107	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_007613	CTTTT	2	10	324574	324583	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_007613	GGAGT	2	10	327146	327155	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007613	AATAA	2	10	340688	340697	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007613	GTTTT	2	10	343708	343717	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007613	GAAGA	2	10	350289	350298	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007613	TCAGG	2	10	357700	357709	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_007613	TGAGT	2	10	365492	365501	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007613	CAGGT	2	10	366779	366788	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_007613	TCAGG	2	10	398818	398827	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_007613	CAGCG	2	10	411307	411316	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_007613	GCTGG	2	10	415496	415505	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
48	NC_007613	TTGCG	2	10	415653	415662	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_007613	TATTT	2	10	416091	416100	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007613	ATTTT	2	10	417019	417028	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007613	TAAAT	2	10	421674	421683	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007613	GAAAC	2	10	430687	430696	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_007613	GGCGT	2	10	442929	442938	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
54	NC_007613	GTCAG	2	10	457852	457861	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_007613	GCAGT	2	10	461076	461085	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_007613	GTTAA	2	10	478253	478262	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007613	GAAAT	2	10	485100	485109	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007613	TGCTA	2	10	506920	506929	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_007613	ATTTG	2	10	508362	508371	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007613	TCAAT	2	10	510667	510676	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_007613	GGAAC	2	10	511856	511865	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_007613	CGTAA	2	10	513064	513073	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_007613	GCATA	2	10	525259	525268	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_007613	AGCAA	2	10	525366	525375	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_007613	ATATT	2	10	526988	526997	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007613	CAGGG	2	10	553676	553685	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_007613	ATAAA	2	10	558904	558913	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007613	TCGCG	2	10	559091	559100	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
69	NC_007613	CGTGA	2	10	560580	560589	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_007613	GGCCG	2	10	567657	567666	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
71	NC_007613	ACGTT	2	10	568504	568513	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_007613	AGGCG	2	10	596022	596031	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
73	NC_007613	ATTTT	2	10	596905	596914	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007613	ATACA	2	10	609757	609766	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_007613	GAAGA	2	10	614649	614658	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007613	TATAA	2	10	615446	615455	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007613	GTCGT	2	10	624994	625003	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_007613	CTTCA	2	10	642840	642849	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_007613	ATTTC	2	10	645671	645680	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_007613	TTCCG	2	10	658662	658671	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_007613	TGATG	2	10	660938	660947	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007613	GATGC	2	10	671923	671932	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_007613	TTTCT	2	10	686649	686658	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_007613	CACAT	2	10	690868	690877	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_007613	ACATA	2	10	703116	703125	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_007613	CGCCC	2	10	707282	707291	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
87	NC_007613	GATGC	2	10	709820	709829	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_007613	CCTGA	2	10	715066	715075	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_007613	CAAAA	2	10	718011	718020	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_007613	TATAT	2	10	722744	722753	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007613	TGATG	2	10	728826	728835	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007613	CAGGG	2	10	747387	747396	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
93	NC_007613	ACCGC	2	10	753730	753739	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
94	NC_007613	AGTAA	2	10	792757	792766	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007613	AGCGC	2	10	802606	802615	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
96	NC_007613	CGGCG	2	10	854518	854527	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
97	NC_007613	GTGTT	2	10	895393	895402	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007613	GCCGC	2	10	895588	895597	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
99	NC_007613	GCGGT	2	10	896414	896423	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
100	NC_007613	GCATC	2	10	904341	904350	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_007613	ATCGA	2	10	905591	905600	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_007613	ACAGG	2	10	910613	910622	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_007613	TGCCC	2	10	914171	914180	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
104	NC_007613	GTGAT	2	10	917372	917381	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007613	ACGCT	2	10	918379	918388	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_007613	CTTTT	2	10	940101	940110	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_007613	CGTTG	2	10	941011	941020	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_007613	CAAAG	4	20	946056	946075	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_007613	CCCGG	2	10	967081	967090	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
110	NC_007613	AAAAT	2	10	982337	982346	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007613	ATTTT	2	10	984342	984351	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007613	GCGCA	2	10	1005623	1005632	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
113	NC_007613	AACGA	2	10	1007404	1007413	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_007613	ACACC	2	10	1015078	1015087	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
115	NC_007613	AGATG	2	10	1020070	1020079	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007613	CTGGG	2	10	1020719	1020728	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
117	NC_007613	CCTGA	2	10	1021600	1021609	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_007613	ATCAC	2	10	1023542	1023551	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_007613	TTTTA	2	10	1037896	1037905	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007613	TAAAA	2	10	1040022	1040031	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007613	TAAAA	2	10	1046018	1046027	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007613	AAATA	2	10	1051928	1051937	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007613	CTTTT	2	10	1060380	1060389	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_007613	TTCAT	2	10	1060483	1060492	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_007613	TCACT	2	10	1066703	1066712	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_007613	GCATT	2	10	1067496	1067505	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_007613	GCGCG	2	10	1075147	1075156	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
128	NC_007613	GCTGT	2	10	1075510	1075519	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_007613	AGGAG	2	10	1077130	1077139	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007613	CAGGG	2	10	1084099	1084108	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
131	NC_007613	CGCTA	2	10	1106931	1106940	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_007613	TTATT	2	10	1107788	1107797	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007613	TGCCG	2	10	1110507	1110516	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
134	NC_007613	CAAAA	2	10	1119170	1119179	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_007613	CTTAT	2	10	1120545	1120554	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_007613	TTGCC	2	10	1145711	1145720	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_007613	AGGTA	2	10	1154922	1154931	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007613	CAATC	2	10	1164247	1164256	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
139	NC_007613	TAATA	2	10	1164433	1164442	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007613	TATAA	2	10	1165680	1165689	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007613	GTGAT	2	10	1178443	1178452	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007613	GTCAG	2	10	1185901	1185910	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_007613	TCACT	2	10	1188663	1188672	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_007613	CATCT	2	10	1189570	1189579	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_007613	TGTTC	2	10	1208947	1208956	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_007613	GTTAC	2	10	1213324	1213333	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_007613	ACCCA	2	10	1216119	1216128	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
148	NC_007613	TCGAT	2	10	1226410	1226419	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_007613	TTCAT	2	10	1251555	1251564	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_007613	TTTCA	2	10	1253586	1253595	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_007613	GTATG	2	10	1270275	1270284	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_007613	GCGCT	2	10	1312238	1312247	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
157	NC_007613	TGGTT	2	10	1324682	1324691	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
158	NC_007613	TTTTC	2	10	1331736	1331745	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
159	NC_007613	GTAAT	2	10	1350126	1350135	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
160	NC_007613	CGAAT	2	10	1350708	1350717	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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162	NC_007613	CATGC	2	10	1371479	1371488	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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164	NC_007613	CAGGT	2	10	1372103	1372112	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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167	NC_007613	CCCAT	2	10	1398782	1398791	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
168	NC_007613	ATTTT	2	10	1400944	1400953	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_007613	CATTT	2	10	1400966	1400975	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
170	NC_007613	ATGCG	2	10	1407134	1407143	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
171	NC_007613	TTCAG	2	10	1410020	1410029	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
172	NC_007613	GGATA	2	10	1416571	1416580	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
173	NC_007613	TTCAC	2	10	1430619	1430628	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
174	NC_007613	GATTT	2	10	1431092	1431101	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_007613	CGCCA	2	10	1486194	1486203	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
179	NC_007613	GAACT	2	10	1496565	1496574	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
180	NC_007613	AATGT	2	10	1497478	1497487	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
181	NC_007613	TGTGC	2	10	1497528	1497537	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
182	NC_007613	AACCA	2	10	1503811	1503820	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
183	NC_007613	TTAAT	2	10	1513986	1513995	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_007613	GCCAC	2	10	1522058	1522067	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
187	NC_007613	TGCTT	2	10	1522424	1522433	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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189	NC_007613	CCTCT	2	10	1539705	1539714	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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191	NC_007613	AAACA	2	10	1547828	1547837	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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250	NC_007613	CATCG	2	10	1968972	1968981	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
251	NC_007613	ACATG	2	10	1975988	1975997	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
252	NC_007613	GAAAC	2	10	1982484	1982493	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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255	NC_007613	CGATC	2	10	1990094	1990103	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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264	NC_007613	TTGAA	2	10	2042749	2042758	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_007613	GAAAT	2	10	2061608	2061617	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_007613	AGCGT	2	10	2094419	2094428	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
272	NC_007613	GTGAT	2	10	2102315	2102324	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
273	NC_007613	GCTTT	2	10	2105929	2105938	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
274	NC_007613	ATTGC	2	10	2106425	2106434	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
275	NC_007613	TTTAT	2	10	2116527	2116536	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_007613	GAAAT	2	10	2131287	2131296	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
277	NC_007613	TTTAC	2	10	2135592	2135601	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
278	NC_007613	AAACC	2	10	2136966	2136975	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
279	NC_007613	ATTTT	2	10	2139683	2139692	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_007613	ATTTT	2	10	2148654	2148663	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_007613	CTGGA	2	10	2150406	2150415	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
282	NC_007613	CTGCC	2	10	2155041	2155050	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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284	NC_007613	TCCAT	2	10	2158974	2158983	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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286	NC_007613	TTCAC	2	10	2187555	2187564	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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303	NC_007613	GTTAT	2	10	2313893	2313902	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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403	NC_007613	GGGGC	2	10	3062762	3062771	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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418	NC_007613	GCGTT	2	10	3242604	3242613	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
419	NC_007613	TGGCA	2	10	3242981	3242990	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
420	NC_007613	TTTTC	2	10	3253634	3253643	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
421	NC_007613	TACGC	2	10	3269317	3269326	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
422	NC_007613	TTGAT	2	10	3271520	3271529	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
423	NC_007613	TCGGT	2	10	3274319	3274328	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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496	NC_007613	GCCAG	2	10	3897556	3897565	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
497	NC_007613	CTGAA	2	10	3904225	3904234	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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499	NC_007613	CGTGT	2	10	3917778	3917787	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
500	NC_007613	CGTCA	2	10	3921514	3921523	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding

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