MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 11148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007613	CAGA	2	8	156	163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007613	CAGG	2	8	418	425	25 %	0 %	50 %	25 %	82542619
3	NC_007613	ACCA	2	8	464	471	50 %	0 %	0 %	50 %	82542619
4	NC_007613	GCTG	2	8	973	980	0 %	25 %	50 %	25 %	82542619
5	NC_007613	GGAC	2	8	1011	1018	25 %	0 %	50 %	25 %	82542619
6	NC_007613	GCTG	2	8	1800	1807	0 %	25 %	50 %	25 %	82542619
7	NC_007613	CCAG	2	8	2001	2008	25 %	0 %	25 %	50 %	82542619
8	NC_007613	TGCC	2	8	2593	2600	0 %	25 %	25 %	50 %	82542619
9	NC_007613	GCAA	2	8	3028	3035	50 %	0 %	25 %	25 %	82542620
10	NC_007613	ATGA	2	8	3126	3133	50 %	25 %	25 %	0 %	82542620
11	NC_007613	CAGC	2	8	3281	3288	25 %	0 %	25 %	50 %	82542620
12	NC_007613	CTGG	2	8	3417	3424	0 %	25 %	50 %	25 %	82542620
13	NC_007613	TTCA	2	8	3426	3433	25 %	50 %	0 %	25 %	82542620
14	NC_007613	AGCG	2	8	3563	3570	25 %	0 %	50 %	25 %	82542620
15	NC_007613	CTGA	2	8	3849	3856	25 %	25 %	25 %	25 %	82542621
16	NC_007613	CAGT	2	8	5764	5771	25 %	25 %	25 %	25 %	82542623
17	NC_007613	AGCG	2	8	6268	6275	25 %	0 %	50 %	25 %	82542623
18	NC_007613	TCCT	2	8	6791	6798	0 %	50 %	0 %	50 %	82542624
19	NC_007613	GCTG	2	8	7131	7138	0 %	25 %	50 %	25 %	82542625
20	NC_007613	TGGC	2	8	7264	7271	0 %	25 %	50 %	25 %	82542625
21	NC_007613	GCCA	2	8	8002	8009	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_007613	GCAT	2	8	8731	8738	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_007613	GGCG	2	8	8862	8869	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_007613	CAAC	2	8	9110	9117	50 %	0 %	0 %	50 %	82542626
25	NC_007613	TTGA	2	8	9163	9170	25 %	50 %	25 %	0 %	82542626
26	NC_007613	CGAC	2	8	9230	9237	25 %	0 %	25 %	50 %	82542626
27	NC_007613	AAGA	2	8	9586	9593	75 %	0 %	25 %	0 %	82542626
28	NC_007613	GCTG	2	8	9765	9772	0 %	25 %	50 %	25 %	82542626
29	NC_007613	CTGT	2	8	10015	10022	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_007613	AGAT	2	8	10770	10777	50 %	25 %	25 %	0 %	82542628
31	NC_007613	AGAA	2	8	11044	11051	75 %	0 %	25 %	0 %	82542628
32	NC_007613	GAAT	2	8	11291	11298	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007613	GCAG	2	8	11447	11454	25 %	0 %	50 %	25 %	82542629
34	NC_007613	CATT	2	8	12125	12132	25 %	50 %	0 %	25 %	82542629
35	NC_007613	CAGT	2	8	12272	12279	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_007613	GCCA	2	8	12550	12557	25 %	0 %	25 %	50 %	82542630
37	NC_007613	CAGC	2	8	12683	12690	25 %	0 %	25 %	50 %	82542630
38	NC_007613	AGGA	2	8	13023	13030	50 %	0 %	50 %	0 %	82542631
39	NC_007613	AGTG	2	8	13192	13199	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007613	ATGG	2	8	13355	13362	25 %	25 %	50 %	0 %	82542632
41	NC_007613	TGGT	2	8	13446	13453	0 %	50 %	50 %	0 %	82542632
42	NC_007613	ACCG	2	8	13813	13820	25 %	0 %	25 %	50 %	82542632
43	NC_007613	AAGA	2	8	14033	14040	75 %	0 %	25 %	0 %	82542632
44	NC_007613	CCAT	2	8	14610	14617	25 %	25 %	0 %	50 %	82542632
45	NC_007613	ACTG	2	8	15004	15011	25 %	25 %	25 %	25 %	82542632
46	NC_007613	GACA	2	8	16822	16829	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007613	ATTA	2	8	17037	17044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007613	TAAT	2	8	17055	17062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007613	GGTT	2	8	17424	17431	0 %	50 %	50 %	0 %	82542635
50	NC_007613	GTGG	2	8	18048	18055	0 %	25 %	75 %	0 %	82542635
51	NC_007613	CGTT	2	8	18420	18427	0 %	50 %	25 %	25 %	82542635
52	NC_007613	TTTA	2	8	18592	18599	25 %	75 %	0 %	0 %	82542636
53	NC_007613	CCAC	2	8	18895	18902	25 %	0 %	0 %	75 %	82542636
54	NC_007613	AATA	2	8	19525	19532	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007613	CTTC	2	8	19547	19554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_007613	TCCT	2	8	19999	20006	0 %	50 %	0 %	50 %	82542637
57	NC_007613	GCTG	2	8	20339	20346	0 %	25 %	50 %	25 %	82542638
58	NC_007613	TGGC	2	8	20472	20479	0 %	25 %	50 %	25 %	82542638
59	NC_007613	CATA	2	8	21516	21523	50 %	25 %	0 %	25 %	82542641
60	NC_007613	TGCG	2	8	21772	21779	0 %	25 %	50 %	25 %	82542641
61	NC_007613	GCGT	2	8	21980	21987	0 %	25 %	50 %	25 %	82542641
62	NC_007613	CCGC	2	8	22403	22410	0 %	0 %	25 %	75 %	82542641
63	NC_007613	CTGG	2	8	22760	22767	0 %	25 %	50 %	25 %	82542642
64	NC_007613	CTGC	2	8	23221	23228	0 %	25 %	25 %	50 %	82542642
65	NC_007613	TGCG	2	8	23771	23778	0 %	25 %	50 %	25 %	82542642
66	NC_007613	TGGT	2	8	24183	24190	0 %	50 %	50 %	0 %	82542642
67	NC_007613	GTGG	2	8	24976	24983	0 %	25 %	75 %	0 %	82542642
68	NC_007613	GCTG	2	8	25330	25337	0 %	25 %	50 %	25 %	82542643
69	NC_007613	ATGG	2	8	26171	26178	25 %	25 %	50 %	0 %	82542644
70	NC_007613	TTGA	2	8	27042	27049	25 %	50 %	25 %	0 %	82542645
71	NC_007613	TGGC	2	8	27585	27592	0 %	25 %	50 %	25 %	82542646
72	NC_007613	CTGG	2	8	28045	28052	0 %	25 %	50 %	25 %	82542646
73	NC_007613	TCAT	2	8	28269	28276	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_007613	TCCC	2	8	28299	28306	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
75	NC_007613	TGGC	2	8	28340	28347	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_007613	GCTG	2	8	28562	28569	0 %	25 %	50 %	25 %	82542647
77	NC_007613	CGTG	2	8	29039	29046	0 %	25 %	50 %	25 %	82542647
78	NC_007613	CATG	2	8	29508	29515	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_007613	AGTG	2	8	29658	29665	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007613	TCCT	2	8	29820	29827	0 %	50 %	0 %	50 %	82542648
81	NC_007613	CTTA	2	8	29848	29855	25 %	50 %	0 %	25 %	82542648
82	NC_007613	AGCC	2	8	30750	30757	25 %	0 %	25 %	50 %	82542648
83	NC_007613	GACC	2	8	31016	31023	25 %	0 %	25 %	50 %	82542649
84	NC_007613	CGCA	2	8	32016	32023	25 %	0 %	25 %	50 %	82542649
85	NC_007613	CTGT	2	8	32190	32197	0 %	50 %	25 %	25 %	82542649
86	NC_007613	GGCG	2	8	32366	32373	0 %	0 %	75 %	25 %	82542649
87	NC_007613	ACCG	2	8	32520	32527	25 %	0 %	25 %	50 %	82542649
88	NC_007613	CGTC	2	8	32994	33001	0 %	25 %	25 %	50 %	82542649
89	NC_007613	GGCG	2	8	33203	33210	0 %	0 %	75 %	25 %	82542649
90	NC_007613	TGGC	2	8	33457	33464	0 %	25 %	50 %	25 %	82542649
91	NC_007613	GCTG	2	8	33470	33477	0 %	25 %	50 %	25 %	82542649
92	NC_007613	GCCA	2	8	34388	34395	25 %	0 %	25 %	50 %	82542650
93	NC_007613	CAGC	2	8	34521	34528	25 %	0 %	25 %	50 %	82542650
94	NC_007613	AGGA	2	8	34861	34868	50 %	0 %	50 %	0 %	161984994
95	NC_007613	TGTT	2	8	35169	35176	0 %	75 %	25 %	0 %	161984994
96	NC_007613	TGTT	2	8	35414	35421	0 %	75 %	25 %	0 %	161984994
97	NC_007613	TGTT	2	8	35604	35611	0 %	75 %	25 %	0 %	161984994
98	NC_007613	CTGG	2	8	35869	35876	0 %	25 %	50 %	25 %	161984994
99	NC_007613	TGCG	2	8	37075	37082	0 %	25 %	50 %	25 %	82542653
100	NC_007613	ATGA	2	8	37230	37237	50 %	25 %	25 %	0 %	82542653
101	NC_007613	GGCG	2	8	37571	37578	0 %	0 %	75 %	25 %	82542653
102	NC_007613	GGAT	2	8	38185	38192	25 %	25 %	50 %	0 %	82542653
103	NC_007613	AACC	2	8	38255	38262	50 %	0 %	0 %	50 %	82542653
104	NC_007613	CAGG	2	8	38352	38359	25 %	0 %	50 %	25 %	82542653
105	NC_007613	TGGC	2	8	38618	38625	0 %	25 %	50 %	25 %	82542653
106	NC_007613	TGTT	2	8	38728	38735	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007613	CCTG	2	8	38953	38960	0 %	25 %	25 %	50 %	82542654
108	NC_007613	TAAA	2	8	38991	38998	75 %	25 %	0 %	0 %	82542654
109	NC_007613	AATC	2	8	39027	39034	50 %	25 %	0 %	25 %	82542654
110	NC_007613	GCAG	2	8	39516	39523	25 %	0 %	50 %	25 %	82542655
111	NC_007613	AATG	2	8	40293	40300	50 %	25 %	25 %	0 %	82542656
112	NC_007613	GGCA	2	8	41741	41748	25 %	0 %	50 %	25 %	82542658
113	NC_007613	CGGT	2	8	42342	42349	0 %	25 %	50 %	25 %	82542658
114	NC_007613	GTCA	2	8	42865	42872	25 %	25 %	25 %	25 %	82542659
115	NC_007613	GCTT	2	8	44034	44041	0 %	50 %	25 %	25 %	82542660
116	NC_007613	ACCT	2	8	44114	44121	25 %	25 %	0 %	50 %	82542660
117	NC_007613	CACC	2	8	45508	45515	25 %	0 %	0 %	75 %	82542660
118	NC_007613	CTAC	2	8	45618	45625	25 %	25 %	0 %	50 %	82542660
119	NC_007613	GCCA	2	8	46663	46670	25 %	0 %	25 %	50 %	82542661
120	NC_007613	GATG	2	8	47704	47711	25 %	25 %	50 %	0 %	82542662
121	NC_007613	CTGC	2	8	47846	47853	0 %	25 %	25 %	50 %	82542662
122	NC_007613	AACC	2	8	47973	47980	50 %	0 %	0 %	50 %	82542662
123	NC_007613	CCTG	2	8	48075	48082	0 %	25 %	25 %	50 %	82542663
124	NC_007613	ATCA	2	8	48224	48231	50 %	25 %	0 %	25 %	82542663
125	NC_007613	TACC	2	8	48499	48506	25 %	25 %	0 %	50 %	82542663
126	NC_007613	TGAT	2	8	48747	48754	25 %	50 %	25 %	0 %	82542663
127	NC_007613	TGGC	2	8	49206	49213	0 %	25 %	50 %	25 %	82542663
128	NC_007613	CAGC	2	8	50407	50414	25 %	0 %	25 %	50 %	82542663
129	NC_007613	TGCG	2	8	50800	50807	0 %	25 %	50 %	25 %	82542663
130	NC_007613	TCAA	2	8	51847	51854	50 %	25 %	0 %	25 %	82542664
131	NC_007613	GGCA	2	8	52051	52058	25 %	0 %	50 %	25 %	82542664
132	NC_007613	ATCA	2	8	52149	52156	50 %	25 %	0 %	25 %	82542664
133	NC_007613	GCGG	2	8	52844	52851	0 %	0 %	75 %	25 %	82542664
134	NC_007613	GGCG	2	8	53119	53126	0 %	0 %	75 %	25 %	82542664
135	NC_007613	GCCA	2	8	53374	53381	25 %	0 %	25 %	50 %	82542664
136	NC_007613	CCTG	2	8	53437	53444	0 %	25 %	25 %	50 %	82542664
137	NC_007613	GTGG	2	8	53867	53874	0 %	25 %	75 %	0 %	82542665
138	NC_007613	ATCA	2	8	54492	54499	50 %	25 %	0 %	25 %	82542666
139	NC_007613	ATCA	2	8	54729	54736	50 %	25 %	0 %	25 %	82542666
140	NC_007613	GCTG	2	8	55874	55881	0 %	25 %	50 %	25 %	82542666
141	NC_007613	CTGG	2	8	56521	56528	0 %	25 %	50 %	25 %	82542667
142	NC_007613	CAGG	2	8	56844	56851	25 %	0 %	50 %	25 %	82542667
143	NC_007613	CTGG	2	8	56972	56979	0 %	25 %	50 %	25 %	82542667
144	NC_007613	GCGG	2	8	57051	57058	0 %	0 %	75 %	25 %	82542667
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