MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 52706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007613	CGG	2	6	352	357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542619
2	NC_007613	TGG	2	6	474	479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542619
3	NC_007613	GAT	2	6	481	486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542619
4	NC_007613	CGC	3	9	568	576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542619
5	NC_007613	TCG	2	6	612	617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542619
6	NC_007613	TTG	2	6	662	667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542619
7	NC_007613	CTG	2	6	794	799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542619
8	NC_007613	CCG	2	6	847	852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542619
9	NC_007613	TGG	2	6	930	935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542619
10	NC_007613	ACT	2	6	957	962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542619
11	NC_007613	CGG	2	6	966	971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542619
12	NC_007613	TTG	2	6	997	1002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542619
13	NC_007613	GTT	2	6	1066	1071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542619
14	NC_007613	TTC	2	6	1125	1130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542619
15	NC_007613	TGA	2	6	1231	1236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542619
16	NC_007613	AAT	2	6	1271	1276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82542619
17	NC_007613	GGC	2	6	1327	1332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542619
18	NC_007613	TGC	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542619
19	NC_007613	GTG	2	6	1370	1375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542619
20	NC_007613	ATC	2	6	1387	1392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542619
21	NC_007613	AAG	2	6	1482	1487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542619
22	NC_007613	GGT	2	6	1534	1539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542619
23	NC_007613	TCT	2	6	1634	1639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542619
24	NC_007613	GAT	2	6	1670	1675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542619
25	NC_007613	TCA	2	6	1699	1704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542619
26	NC_007613	GCT	2	6	1771	1776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542619
27	NC_007613	GCG	2	6	1836	1841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542619
28	NC_007613	GAA	2	6	1901	1906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542619
29	NC_007613	ATC	2	6	1965	1970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542619
30	NC_007613	TTG	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542619
31	NC_007613	CTT	2	6	2032	2037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542619
32	NC_007613	TCG	2	6	2084	2089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542619
33	NC_007613	TAC	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542619
34	NC_007613	GCG	2	6	2117	2122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542619
35	NC_007613	TGA	2	6	2212	2217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542619
36	NC_007613	TGA	2	6	2220	2225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542619
37	NC_007613	ACT	2	6	2303	2308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542619
38	NC_007613	GAT	2	6	2348	2353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542619
39	NC_007613	TGC	2	6	2445	2450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542619
40	NC_007613	CGA	2	6	2509	2514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542619
41	NC_007613	TGA	2	6	2545	2550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542619
42	NC_007613	TGA	2	6	2581	2586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542619
43	NC_007613	TAT	2	6	2684	2689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82542619
44	NC_007613	TGC	2	6	2706	2711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542619
45	NC_007613	GCG	2	6	2862	2867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542620
46	NC_007613	GGC	2	6	2915	2920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542620
47	NC_007613	CAA	2	6	2936	2941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82542620
48	NC_007613	GGT	2	6	3104	3109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542620
49	NC_007613	GCA	2	6	3205	3210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542620
50	NC_007613	TGG	2	6	3242	3247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542620
51	NC_007613	TGA	2	6	3256	3261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542620
52	NC_007613	GAA	2	6	3264	3269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542620
53	NC_007613	CAT	2	6	3275	3280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542620
54	NC_007613	TGA	2	6	3302	3307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542620
55	NC_007613	CGC	2	6	3384	3389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542620
56	NC_007613	TGA	2	6	3472	3477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542620
57	NC_007613	CGG	2	6	3703	3708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542620
58	NC_007613	TGA	2	6	3860	3865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542621
59	NC_007613	TGA	2	6	3923	3928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542621
60	NC_007613	CGG	2	6	4058	4063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542621
61	NC_007613	GGC	2	6	4251	4256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542621
62	NC_007613	TGA	3	9	4322	4330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542621
63	NC_007613	CTA	2	6	4403	4408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542621
64	NC_007613	CGG	2	6	4492	4497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542621
65	NC_007613	CTG	2	6	4500	4505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542621
66	NC_007613	TGC	2	6	4541	4546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542621
67	NC_007613	ACG	2	6	4582	4587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542621
68	NC_007613	AAC	2	6	4650	4655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82542621
69	NC_007613	GTT	2	6	4673	4678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542621
70	NC_007613	CCG	2	6	4679	4684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542621
71	NC_007613	GAT	2	6	4725	4730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542621
72	NC_007613	CCG	2	6	4972	4977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542621
73	NC_007613	TGC	2	6	4982	4987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542621
74	NC_007613	TGA	3	9	4999	5007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542621
75	NC_007613	ATC	2	6	5008	5013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542621
76	NC_007613	GCA	2	6	5289	5294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542622
77	NC_007613	TGG	2	6	5397	5402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542622
78	NC_007613	ACA	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82542622
79	NC_007613	CCG	2	6	5448	5453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542622
80	NC_007613	CCG	2	6	5457	5462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542622
81	NC_007613	CCA	2	6	5465	5470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542622
82	NC_007613	CTC	2	6	5479	5484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82542622
83	NC_007613	ATC	2	6	5488	5493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542622
84	NC_007613	CGG	2	6	5495	5500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542622
85	NC_007613	GCT	2	6	5686	5691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542623
86	NC_007613	GGA	2	6	5723	5728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82542623
87	NC_007613	TCA	2	6	5733	5738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542623
88	NC_007613	AAG	2	6	5739	5744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542623
89	NC_007613	AAT	2	6	5798	5803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82542623
90	NC_007613	TCA	2	6	5812	5817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542623
91	NC_007613	TGA	2	6	5845	5850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542623
92	NC_007613	TTC	2	6	5865	5870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542623
93	NC_007613	TTC	2	6	5910	5915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542623
94	NC_007613	CAC	2	6	5957	5962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542623
95	NC_007613	TGC	2	6	5975	5980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542623
96	NC_007613	TTG	2	6	5997	6002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542623
97	NC_007613	TGA	2	6	6004	6009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542623
98	NC_007613	CTG	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542623
99	NC_007613	GTG	2	6	6399	6404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542623
100	NC_007613	TGC	2	6	6718	6723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542624
101	NC_007613	ATG	2	6	6743	6748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542624
102	NC_007613	GTG	2	6	6816	6821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542624
103	NC_007613	GGA	2	6	7161	7166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82542625
104	NC_007613	TCT	2	6	7216	7221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542625
105	NC_007613	CTG	2	6	7226	7231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542625
106	NC_007613	ACA	2	6	7360	7365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82542625
107	NC_007613	ACC	2	6	9046	9051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542626
108	NC_007613	CAG	2	6	9193	9198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542626
109	NC_007613	CAG	2	6	9214	9219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542626
110	NC_007613	TGC	2	6	9435	9440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542626
111	NC_007613	AAG	2	6	9455	9460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542626
112	NC_007613	CTG	2	6	9481	9486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542626
113	NC_007613	TTG	2	6	9545	9550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542626
114	NC_007613	AGA	2	6	9606	9611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542626
115	NC_007613	TAC	2	6	9646	9651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542626
116	NC_007613	CTG	2	6	9754	9759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542626
117	NC_007613	GCA	2	6	9861	9866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542626
118	NC_007613	CTG	2	6	9958	9963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542626
119	NC_007613	TGA	2	6	10079	10084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542627
120	NC_007613	GCG	2	6	10130	10135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542627
121	NC_007613	GAA	2	6	10165	10170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542627
122	NC_007613	ATC	2	6	10237	10242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542627
123	NC_007613	CAC	2	6	10293	10298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542627
124	NC_007613	CGT	2	6	10318	10323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542627
125	NC_007613	TGC	2	6	10623	10628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542627
126	NC_007613	CAC	2	6	10786	10791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542628
127	NC_007613	GAT	2	6	10820	10825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542628
128	NC_007613	GCG	2	6	10827	10832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542628
129	NC_007613	CAG	2	6	10856	10861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542628
130	NC_007613	GAA	2	6	10925	10930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542628
131	NC_007613	CAG	2	6	11018	11023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542628
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251	NC_007613	ACA	2	6	20568	20573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82542638
252	NC_007613	TTG	2	6	20917	20922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542639
253	NC_007613	AGC	2	6	20982	20987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542639
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256	NC_007613	CAT	2	6	21087	21092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542639
257	NC_007613	GCA	2	6	21357	21362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542640
258	NC_007613	TTC	2	6	21373	21378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542640
259	NC_007613	CTT	2	6	21410	21415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542640
260	NC_007613	AAG	2	6	21542	21547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542641
261	NC_007613	GAA	2	6	21619	21624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542641
262	NC_007613	TCA	2	6	21818	21823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542641
263	NC_007613	TCT	2	6	21828	21833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542641
264	NC_007613	GAT	2	6	21871	21876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542641
265	NC_007613	TTA	2	6	21913	21918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82542641
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272	NC_007613	TGA	2	6	22481	22486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542642
273	NC_007613	TGA	3	9	22581	22589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542642
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281	NC_007613	TGC	2	6	23390	23395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542642
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284	NC_007613	GCT	2	6	23637	23642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542642
285	NC_007613	TGC	2	6	23660	23665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542642
286	NC_007613	GCA	2	6	23679	23684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542642
287	NC_007613	TGC	2	6	23695	23700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542642
288	NC_007613	ATC	2	6	23719	23724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542642
289	NC_007613	CGC	2	6	23735	23740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542642
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