MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 6885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007613	TG	3	6	37	42	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007613	CT	3	6	443	448	0 %	50 %	0 %	50 %	82542619
3	NC_007613	GC	3	6	1331	1336	0 %	0 %	50 %	50 %	82542619
4	NC_007613	TG	3	6	1433	1438	0 %	50 %	50 %	0 %	82542619
5	NC_007613	CG	4	8	2524	2531	0 %	0 %	50 %	50 %	82542619
6	NC_007613	TG	3	6	3604	3609	0 %	50 %	50 %	0 %	82542620
7	NC_007613	GC	3	6	3959	3964	0 %	0 %	50 %	50 %	82542621
8	NC_007613	GC	3	6	4440	4445	0 %	0 %	50 %	50 %	82542621
9	NC_007613	AG	3	6	4880	4885	50 %	0 %	50 %	0 %	82542621
10	NC_007613	AT	3	6	5611	5616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007613	CG	3	6	8329	8334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_007613	CG	3	6	8521	8526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_007613	TA	3	6	8800	8805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007613	TC	3	6	9121	9126	0 %	50 %	0 %	50 %	82542626
15	NC_007613	CG	3	6	9208	9213	0 %	0 %	50 %	50 %	82542626
16	NC_007613	TG	3	6	10253	10258	0 %	50 %	50 %	0 %	82542627
17	NC_007613	AT	3	6	13280	13285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007613	CG	3	6	14697	14702	0 %	0 %	50 %	50 %	82542632
19	NC_007613	CG	3	6	15640	15645	0 %	0 %	50 %	50 %	82542633
20	NC_007613	CT	3	6	16695	16700	0 %	50 %	0 %	50 %	82542634
21	NC_007613	CT	3	6	16858	16863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_007613	CT	3	6	17823	17828	0 %	50 %	0 %	50 %	82542635
23	NC_007613	TG	3	6	17873	17878	0 %	50 %	50 %	0 %	82542635
24	NC_007613	GA	3	6	18497	18502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007613	GT	3	6	20820	20825	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007613	TC	3	6	20826	20831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_007613	GC	3	6	21139	21144	0 %	0 %	50 %	50 %	82542639
28	NC_007613	GT	3	6	21549	21554	0 %	50 %	50 %	0 %	82542641
29	NC_007613	CG	3	6	21595	21600	0 %	0 %	50 %	50 %	82542641
30	NC_007613	CG	3	6	22981	22986	0 %	0 %	50 %	50 %	82542642
31	NC_007613	GC	3	6	23654	23659	0 %	0 %	50 %	50 %	82542642
32	NC_007613	CG	3	6	23728	23733	0 %	0 %	50 %	50 %	82542642
33	NC_007613	CG	3	6	24456	24461	0 %	0 %	50 %	50 %	82542642
34	NC_007613	GC	3	6	25618	25623	0 %	0 %	50 %	50 %	82542643
35	NC_007613	AT	3	6	26409	26414	50 %	50 %	0 %	0 %	82542645
36	NC_007613	TG	3	6	26759	26764	0 %	50 %	50 %	0 %	82542645
37	NC_007613	CG	3	6	27033	27038	0 %	0 %	50 %	50 %	82542645
38	NC_007613	CT	3	6	29977	29982	0 %	50 %	0 %	50 %	82542648
39	NC_007613	CG	3	6	30127	30132	0 %	0 %	50 %	50 %	82542648
40	NC_007613	GC	3	6	30940	30945	0 %	0 %	50 %	50 %	82542649
41	NC_007613	CG	3	6	31280	31285	0 %	0 %	50 %	50 %	82542649
42	NC_007613	CA	3	6	31297	31302	50 %	0 %	0 %	50 %	82542649
43	NC_007613	TC	3	6	31442	31447	0 %	50 %	0 %	50 %	82542649
44	NC_007613	GC	5	10	32802	32811	0 %	0 %	50 %	50 %	82542649
45	NC_007613	CG	3	6	33912	33917	0 %	0 %	50 %	50 %	82542649
46	NC_007613	TC	3	6	36213	36218	0 %	50 %	0 %	50 %	161984994
47	NC_007613	AT	3	6	36256	36261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007613	CT	3	6	36406	36411	0 %	50 %	0 %	50 %	82542652
49	NC_007613	CT	3	6	37375	37380	0 %	50 %	0 %	50 %	82542653
50	NC_007613	CG	3	6	38532	38537	0 %	0 %	50 %	50 %	82542653
51	NC_007613	GA	3	6	38766	38771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007613	TA	3	6	39563	39568	50 %	50 %	0 %	0 %	82542655
53	NC_007613	CG	4	8	39873	39880	0 %	0 %	50 %	50 %	82542655
54	NC_007613	CG	4	8	40161	40168	0 %	0 %	50 %	50 %	82542655
55	NC_007613	AC	3	6	40645	40650	50 %	0 %	0 %	50 %	82542656
56	NC_007613	AC	3	6	40865	40870	50 %	0 %	0 %	50 %	82542657
57	NC_007613	GA	3	6	42777	42782	50 %	0 %	50 %	0 %	82542659
58	NC_007613	GC	4	8	43163	43170	0 %	0 %	50 %	50 %	82542659
59	NC_007613	AT	3	6	44181	44186	50 %	50 %	0 %	0 %	82542660
60	NC_007613	GC	4	8	44635	44642	0 %	0 %	50 %	50 %	82542660
61	NC_007613	GT	3	6	46405	46410	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007613	AT	3	6	46422	46427	50 %	50 %	0 %	0 %	82542661
63	NC_007613	CG	3	6	49465	49470	0 %	0 %	50 %	50 %	82542663
64	NC_007613	AG	3	6	50345	50350	50 %	0 %	50 %	0 %	82542663
65	NC_007613	CG	3	6	50419	50424	0 %	0 %	50 %	50 %	82542663
66	NC_007613	CG	4	8	50538	50545	0 %	0 %	50 %	50 %	82542663
67	NC_007613	GC	3	6	54578	54583	0 %	0 %	50 %	50 %	82542666
68	NC_007613	TG	3	6	55192	55197	0 %	50 %	50 %	0 %	82542666
69	NC_007613	CG	3	6	55507	55512	0 %	0 %	50 %	50 %	82542666
70	NC_007613	CG	3	6	56246	56251	0 %	0 %	50 %	50 %	82542667
71	NC_007613	GC	3	6	57401	57406	0 %	0 %	50 %	50 %	82542667
72	NC_007613	AG	3	6	57674	57679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007613	GA	3	6	58201	58206	50 %	0 %	50 %	0 %	82542668
74	NC_007613	CG	3	6	58270	58275	0 %	0 %	50 %	50 %	82542668
75	NC_007613	CG	3	6	59573	59578	0 %	0 %	50 %	50 %	82542669
76	NC_007613	GC	3	6	60736	60741	0 %	0 %	50 %	50 %	82542671
77	NC_007613	AC	3	6	61347	61352	50 %	0 %	0 %	50 %	82542671
78	NC_007613	AG	3	6	61896	61901	50 %	0 %	50 %	0 %	82542671
79	NC_007613	GA	3	6	61909	61914	50 %	0 %	50 %	0 %	82542671
80	NC_007613	TC	3	6	63542	63547	0 %	50 %	0 %	50 %	82542673
81	NC_007613	CG	3	6	64124	64129	0 %	0 %	50 %	50 %	82542673
82	NC_007613	GC	3	6	65338	65343	0 %	0 %	50 %	50 %	82542674
83	NC_007613	TC	3	6	66470	66475	0 %	50 %	0 %	50 %	82542675
84	NC_007613	GC	3	6	66818	66823	0 %	0 %	50 %	50 %	82542675
85	NC_007613	TG	3	6	66915	66920	0 %	50 %	50 %	0 %	82542675
86	NC_007613	CG	3	6	67282	67287	0 %	0 %	50 %	50 %	82542676
87	NC_007613	CG	3	6	67402	67407	0 %	0 %	50 %	50 %	82542676
88	NC_007613	GC	3	6	68113	68118	0 %	0 %	50 %	50 %	82542676
89	NC_007613	GC	3	6	68216	68221	0 %	0 %	50 %	50 %	82542676
90	NC_007613	AT	3	6	68273	68278	50 %	50 %	0 %	0 %	82542676
91	NC_007613	GC	3	6	69164	69169	0 %	0 %	50 %	50 %	161984993
92	NC_007613	TC	3	6	73234	73239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_007613	TG	3	6	73392	73397	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007613	CT	3	6	73400	73405	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_007613	GC	4	8	73816	73823	0 %	0 %	50 %	50 %	82542681
96	NC_007613	GC	3	6	74703	74708	0 %	0 %	50 %	50 %	82542681
97	NC_007613	TC	3	6	75185	75190	0 %	50 %	0 %	50 %	82542681
98	NC_007613	GA	3	6	75346	75351	50 %	0 %	50 %	0 %	82542681
99	NC_007613	GC	3	6	75595	75600	0 %	0 %	50 %	50 %	82542682
100	NC_007613	CG	3	6	75826	75831	0 %	0 %	50 %	50 %	82542682
101	NC_007613	GC	3	6	76587	76592	0 %	0 %	50 %	50 %	82542684
102	NC_007613	CG	3	6	76656	76661	0 %	0 %	50 %	50 %	82542684
103	NC_007613	CA	3	6	77309	77314	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_007613	CG	3	6	77475	77480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_007613	AG	3	6	79020	79025	50 %	0 %	50 %	0 %	82542686
106	NC_007613	AG	3	6	80645	80650	50 %	0 %	50 %	0 %	82542688
107	NC_007613	GA	3	6	81236	81241	50 %	0 %	50 %	0 %	82542689
108	NC_007613	AT	3	6	81318	81323	50 %	50 %	0 %	0 %	82542689
109	NC_007613	CG	3	6	82167	82172	0 %	0 %	50 %	50 %	82542689
110	NC_007613	GT	3	6	82311	82316	0 %	50 %	50 %	0 %	82542689
111	NC_007613	GC	3	6	82950	82955	0 %	0 %	50 %	50 %	82542690
112	NC_007613	CG	3	6	85011	85016	0 %	0 %	50 %	50 %	82542691
113	NC_007613	CG	3	6	85946	85951	0 %	0 %	50 %	50 %	82542692
114	NC_007613	GC	3	6	86158	86163	0 %	0 %	50 %	50 %	82542692
115	NC_007613	TC	3	6	86415	86420	0 %	50 %	0 %	50 %	82542693
116	NC_007613	CG	3	6	87378	87383	0 %	0 %	50 %	50 %	82542693
117	NC_007613	TG	3	6	89453	89458	0 %	50 %	50 %	0 %	82542695
118	NC_007613	CG	3	6	89864	89869	0 %	0 %	50 %	50 %	82542695
119	NC_007613	CG	3	6	89927	89932	0 %	0 %	50 %	50 %	82542695
120	NC_007613	TC	3	6	90883	90888	0 %	50 %	0 %	50 %	82542696
121	NC_007613	CG	3	6	91739	91744	0 %	0 %	50 %	50 %	82542697
122	NC_007613	GC	3	6	93060	93065	0 %	0 %	50 %	50 %	82542698
123	NC_007613	GA	3	6	93298	93303	50 %	0 %	50 %	0 %	82542700
124	NC_007613	CT	3	6	93781	93786	0 %	50 %	0 %	50 %	82542700
125	NC_007613	GC	4	8	94074	94081	0 %	0 %	50 %	50 %	82542700
126	NC_007613	TG	3	6	95305	95310	0 %	50 %	50 %	0 %	82542699
127	NC_007613	CT	3	6	95522	95527	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_007613	AC	3	6	95910	95915	50 %	0 %	0 %	50 %	161984992
129	NC_007613	GC	3	6	96075	96080	0 %	0 %	50 %	50 %	161984992
130	NC_007613	GC	3	6	97223	97228	0 %	0 %	50 %	50 %	82542702
131	NC_007613	AC	3	6	97295	97300	50 %	0 %	0 %	50 %	82542702
132	NC_007613	GC	3	6	100373	100378	0 %	0 %	50 %	50 %	82542706
133	NC_007613	CG	3	6	100627	100632	0 %	0 %	50 %	50 %	82542707
134	NC_007613	TA	3	6	101102	101107	50 %	50 %	0 %	0 %	82542707
135	NC_007613	TG	3	6	101828	101833	0 %	50 %	50 %	0 %	82542708
136	NC_007613	AG	3	6	102084	102089	50 %	0 %	50 %	0 %	82542708
137	NC_007613	CG	3	6	102249	102254	0 %	0 %	50 %	50 %	82542708
138	NC_007613	CT	3	6	102762	102767	0 %	50 %	0 %	50 %	82542710
139	NC_007613	CT	3	6	103539	103544	0 %	50 %	0 %	50 %	82542710
140	NC_007613	GT	3	6	104041	104046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007613	GC	3	6	105067	105072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_007613	GC	3	6	106038	106043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_007613	GC	4	8	107421	107428	0 %	0 %	50 %	50 %	82542713
144	NC_007613	TC	3	6	107688	107693	0 %	50 %	0 %	50 %	82542713
145	NC_007613	TC	3	6	108055	108060	0 %	50 %	0 %	50 %	82542714
146	NC_007613	TC	3	6	108665	108670	0 %	50 %	0 %	50 %	82542714
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