MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Shigella boydii Sb227 plasmid pSB4_227

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007608	GCAGAA	2	12	4586	4597	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_007608	TCAGAT	2	12	5093	5104	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	82524672
3	NC_007608	ATGGAA	2	12	5667	5678	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007608	CGGCTT	2	12	9048	9059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524677
5	NC_007608	CCCTTC	2	12	16302	16313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82524686
6	NC_007608	GCCGGA	2	12	17840	17851	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	82524687
7	NC_007608	AGGGAA	2	12	21707	21718	50 %	0 %	50 %	0 %	82524694
8	NC_007608	TCAGAT	2	12	24970	24981	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	82524698
9	NC_007608	ATGGAA	2	12	25544	25555	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007608	CAGGAG	2	12	26494	26505	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	82524699
11	NC_007608	GCAGAA	2	12	28288	28299	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	82524702
12	NC_007608	TTTAAT	2	12	35264	35275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524711
13	NC_007608	GCAACA	2	12	36992	37003	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	82524714
14	NC_007608	ATGCCC	2	12	37632	37643	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	82524714
15	NC_007608	TCGATA	2	12	38986	38997	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	82524715
16	NC_007608	TTCTGC	2	12	40144	40155	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	82524717
17	NC_007608	TCAGAT	2	12	46222	46233	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	82524724
18	NC_007608	ATGGAA	2	12	46796	46807	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007608	AAGCCG	2	12	47084	47095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524725
20	NC_007608	TTATGC	2	12	51007	51018	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_007608	TTGAGT	2	12	52660	52671	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	82524730
22	NC_007608	AAATTA	2	12	53017	53028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007608	CTTCAT	2	12	54618	54629	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	82524732
24	NC_007608	CCCTTC	2	12	56678	56689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82524737
25	NC_007608	TCTTTT	2	12	68854	68865	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	82524746
26	NC_007608	GAAGGG	2	12	71899	71910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82524749
27	NC_007608	CGTAAA	2	12	73104	73115	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	82524751
28	NC_007608	CCGGTG	2	12	74219	74230	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	82524753
29	NC_007608	CATTTT	2	12	75648	75659	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	82524755
30	NC_007608	TTCCAT	2	12	77669	77680	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007608	AATCTG	2	12	78242	78253	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	82524757
32	NC_007608	GCAACA	2	12	79827	79838	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	82524759
33	NC_007608	ATGCCC	2	12	80467	80478	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	82524759
34	NC_007608	TTTACG	2	12	83080	83091	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	82524763
35	NC_007608	TCAGCA	2	12	83230	83241	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	82524764
36	NC_007608	ACATTT	2	12	83804	83815	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	82524764
37	NC_007608	GCAGAA	2	12	85225	85236	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	82524766
38	NC_007608	GAGATG	2	12	87220	87231	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007608	AAGCCG	2	12	87479	87490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524768
40	NC_007608	TTCTGC	2	12	89043	89054	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	82524770
41	NC_007608	GATGCG	2	12	94022	94033	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	82524776
42	NC_007608	TCAGAT	2	12	94970	94981	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	82524778
43	NC_007608	ATGGAA	2	12	95544	95555	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007608	CTTCAT	2	12	100783	100794	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	82524783
45	NC_007608	TCAGAT	2	12	101092	101103	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	82524784
46	NC_007608	ATGGAA	2	12	101666	101677	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007608	ATGTGG	2	12	105689	105700	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	82524789
48	NC_007608	TGGGGC	2	12	105995	106006	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	82524789
49	NC_007608	GCAGGT	2	12	106698	106709	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	82524789
50	NC_007608	TGCCCT	2	12	106788	106799	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	82524789
51	NC_007608	AACACG	2	12	108236	108247	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	82524790
52	NC_007608	TGGGGA	2	12	108503	108514	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	82524790
53	NC_007608	CTTCCG	2	12	109640	109651	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_007608	GATGTA	2	12	112110	112121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007608	GTTTTG	2	12	120850	120861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524804
56	NC_007608	AGTCTG	2	12	120899	120910	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	82524804
57	NC_007608	AAGCCG	2	12	121010	121021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524805

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.