MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Shigella boydii Sb227 plasmid pSB4_227

Total Repeats: 1165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007608	TGC	2	6	314	319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524666
2	NC_007608	CCG	2	6	415	420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524666
3	NC_007608	TTC	2	6	423	428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524666
4	NC_007608	CAA	2	6	433	438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524666
5	NC_007608	AAT	2	6	727	732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524665
6	NC_007608	TGC	2	6	939	944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161984778
7	NC_007608	CCG	2	6	1040	1045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161984778
8	NC_007608	TTC	2	6	1048	1053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161984778
9	NC_007608	GAC	2	6	1138	1143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984778
10	NC_007608	GCG	2	6	1161	1166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161984778
11	NC_007608	GCC	2	6	1212	1217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161984778
12	NC_007608	CAG	2	6	1252	1257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984778
13	NC_007608	CAG	2	6	1297	1302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984778
14	NC_007608	ACA	2	6	1384	1389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161984778
15	NC_007608	AGC	2	6	1486	1491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984778
16	NC_007608	CGA	2	6	1501	1506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984778
17	NC_007608	ATC	2	6	1563	1568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161984778
18	NC_007608	GAC	2	6	1574	1579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984778
19	NC_007608	GCG	2	6	1581	1586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161984778
20	NC_007608	CTT	2	6	1735	1740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524668
21	NC_007608	GAG	2	6	1742	1747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82524668
22	NC_007608	GGC	2	6	1805	1810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524668
23	NC_007608	AAC	2	6	1829	1834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524668
24	NC_007608	CGG	2	6	1843	1848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524668
25	NC_007608	CAG	2	6	1852	1857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524668
26	NC_007608	CTG	2	6	1961	1966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524668
27	NC_007608	ATA	2	6	2592	2597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524669
28	NC_007608	TCA	2	6	2613	2618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524669
29	NC_007608	AGC	2	6	2633	2638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524669
30	NC_007608	ATG	2	6	2677	2682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524669
31	NC_007608	ACA	2	6	2699	2704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524669
32	NC_007608	TAA	2	6	2821	2826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524669
33	NC_007608	ATG	3	9	2830	2838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524669
34	NC_007608	TGC	3	9	2849	2857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524669
35	NC_007608	TAA	2	6	2918	2923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524669
36	NC_007608	TCA	2	6	2957	2962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524669
37	NC_007608	CTG	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524669
38	NC_007608	CTG	2	6	3304	3309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524669
39	NC_007608	AAG	2	6	3329	3334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524669
40	NC_007608	TAT	2	6	3353	3358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524669
41	NC_007608	TAA	2	6	3359	3364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524669
42	NC_007608	TCT	2	6	3724	3729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524670
43	NC_007608	CAA	2	6	3800	3805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524670
44	NC_007608	CCG	2	6	3833	3838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524670
45	NC_007608	AGT	2	6	3856	3861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524670
46	NC_007608	TAC	2	6	3944	3949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524670
47	NC_007608	GTT	2	6	4024	4029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524670
48	NC_007608	TAC	2	6	4038	4043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524670
49	NC_007608	GTT	2	6	4343	4348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524670
50	NC_007608	ATA	2	6	4359	4364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524670
51	NC_007608	GAA	2	6	4409	4414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524670
52	NC_007608	TGT	2	6	5086	5091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524672
53	NC_007608	CAG	2	6	5220	5225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524672
54	NC_007608	AGA	2	6	5230	5235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524672
55	NC_007608	TCC	2	6	5285	5290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82524672
56	NC_007608	TGC	2	6	6269	6274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161984779
57	NC_007608	CCG	2	6	6370	6375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161984779
58	NC_007608	TTC	2	6	6378	6383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161984779
59	NC_007608	GAC	2	6	6468	6473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984779
60	NC_007608	GCG	2	6	6491	6496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161984779
61	NC_007608	GCC	2	6	6542	6547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161984779
62	NC_007608	CAG	2	6	6582	6587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984779
63	NC_007608	CAG	2	6	6627	6632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984779
64	NC_007608	CAG	2	6	6715	6720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984779
65	NC_007608	AGC	2	6	6816	6821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984779
66	NC_007608	CGA	2	6	6831	6836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984779
67	NC_007608	ATC	2	6	6893	6898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161984779
68	NC_007608	GAC	2	6	6904	6909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984779
69	NC_007608	GCG	2	6	6911	6916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161984779
70	NC_007608	CTT	2	6	7065	7070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524674
71	NC_007608	GAG	2	6	7072	7077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82524674
72	NC_007608	GGC	2	6	7135	7140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524674
73	NC_007608	AAC	2	6	7159	7164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524674
74	NC_007608	CGG	2	6	7173	7178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524674
75	NC_007608	CAG	2	6	7182	7187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524674
76	NC_007608	CTG	2	6	7291	7296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524674
77	NC_007608	TAG	2	6	7873	7878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524675
78	NC_007608	AAC	2	6	7924	7929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524675
79	NC_007608	GTT	2	6	8031	8036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524675
80	NC_007608	GCT	2	6	8056	8061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524675
81	NC_007608	GCT	2	6	8073	8078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524675
82	NC_007608	CAC	3	9	8109	8117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82524675
83	NC_007608	CAG	2	6	8459	8464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524676
84	NC_007608	GCC	2	6	8611	8616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524676
85	NC_007608	TCA	2	6	8676	8681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524676
86	NC_007608	TAA	2	6	8721	8726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524676
87	NC_007608	GCG	2	6	8954	8959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524677
88	NC_007608	ATT	2	6	9095	9100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524677
89	NC_007608	CAA	2	6	9390	9395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524678
90	NC_007608	GCC	2	6	9402	9407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524678
91	NC_007608	ACC	2	6	9453	9458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82524678
92	NC_007608	GAT	2	6	9497	9502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524678
93	NC_007608	CGA	2	6	9529	9534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524678
94	NC_007608	GAA	2	6	9585	9590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524678
95	NC_007608	ATC	2	6	9620	9625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524678
96	NC_007608	GGT	2	6	9692	9697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524678
97	NC_007608	TCT	2	6	9836	9841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524679
98	NC_007608	TAT	2	6	9888	9893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524679
99	NC_007608	TAC	2	6	9930	9935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524679
100	NC_007608	TTA	2	6	9964	9969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524679
101	NC_007608	ATA	2	6	10109	10114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524679
102	NC_007608	AAC	2	6	10207	10212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524679
103	NC_007608	AAT	2	6	10228	10233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524679
104	NC_007608	ACT	2	6	10248	10253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524679
105	NC_007608	TTA	2	6	10264	10269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524679
106	NC_007608	GCA	2	6	10486	10491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524679
107	NC_007608	AAT	2	6	10554	10559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524679
108	NC_007608	ATA	2	6	10685	10690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524679
109	NC_007608	ATC	2	6	10845	10850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524679
110	NC_007608	AAC	2	6	10950	10955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524679
111	NC_007608	TGG	2	6	11005	11010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524679
112	NC_007608	TAA	2	6	11078	11083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524679
113	NC_007608	AAG	2	6	11190	11195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524679
114	NC_007608	ATA	2	6	11389	11394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524679
115	NC_007608	TAT	2	6	11411	11416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524679
116	NC_007608	ATC	2	6	11934	11939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524680
117	NC_007608	CTT	2	6	12084	12089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524680
118	NC_007608	TAA	2	6	12137	12142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524680
119	NC_007608	ATA	2	6	12277	12282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524680
120	NC_007608	CAA	2	6	12349	12354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524680
121	NC_007608	CAG	2	6	12858	12863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524681
122	NC_007608	TTC	2	6	12964	12969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524681
123	NC_007608	GCC	2	6	12991	12996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524681
124	NC_007608	TGC	2	6	13162	13167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524681
125	NC_007608	GAC	3	9	13193	13201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524681
126	NC_007608	CCA	2	6	13244	13249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82524681
127	NC_007608	GTT	2	6	13259	13264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524681
128	NC_007608	TCA	2	6	13776	13781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524682
129	NC_007608	TGC	2	6	13861	13866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524682
130	NC_007608	TAT	2	6	13894	13899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524682
131	NC_007608	TGA	2	6	13901	13906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524682
132	NC_007608	TTG	2	6	14024	14029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524682
133	NC_007608	TAT	2	6	14063	14068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524682
134	NC_007608	CTG	2	6	15243	15248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524683
135	NC_007608	CGC	2	6	15328	15333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524683
136	NC_007608	TCG	2	6	15410	15415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524683
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139	NC_007608	TGT	2	6	15456	15461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524683
140	NC_007608	GGC	2	6	15501	15506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524683
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154	NC_007608	CAG	2	6	16690	16695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524686
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157	NC_007608	ATC	2	6	16862	16867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524686
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159	NC_007608	TTC	2	6	16997	17002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524686
160	NC_007608	CAG	2	6	17026	17031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524686
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162	NC_007608	GCG	2	6	17196	17201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524686
163	NC_007608	CGG	2	6	17240	17245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524686
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243	NC_007608	TCA	2	6	27905	27910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524702
244	NC_007608	GAC	2	6	27963	27968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524702
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247	NC_007608	TTA	2	6	28305	28310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524702
248	NC_007608	GAT	2	6	28327	28332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524702
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250	NC_007608	TCA	2	6	28492	28497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524703
251	NC_007608	CGG	2	6	28536	28541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524703
252	NC_007608	CAG	3	9	28740	28748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524703
253	NC_007608	ACG	2	6	28796	28801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524703
254	NC_007608	TCA	2	6	28833	28838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524703
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