MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Shigella boydii Sb227 plasmid pSB4_227

Total Repeats: 151

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007608	CT	3	6	1006	1011	0 %	50 %	0 %	50 %	161984778
2	NC_007608	TC	4	8	1281	1288	0 %	50 %	0 %	50 %	161984778
3	NC_007608	TG	3	6	1986	1991	0 %	50 %	50 %	0 %	82524668
4	NC_007608	GA	3	6	2653	2658	50 %	0 %	50 %	0 %	82524669
5	NC_007608	CT	3	6	3134	3139	0 %	50 %	0 %	50 %	82524669
6	NC_007608	AT	3	6	4788	4793	50 %	50 %	0 %	0 %	82524671
7	NC_007608	CT	3	6	6336	6341	0 %	50 %	0 %	50 %	161984779
8	NC_007608	TC	4	8	6611	6618	0 %	50 %	0 %	50 %	161984779
9	NC_007608	TG	3	6	7316	7321	0 %	50 %	50 %	0 %	82524674
10	NC_007608	TG	3	6	7864	7869	0 %	50 %	50 %	0 %	82524675
11	NC_007608	AT	3	6	8847	8852	50 %	50 %	0 %	0 %	82524677
12	NC_007608	TA	3	6	10122	10127	50 %	50 %	0 %	0 %	82524679
13	NC_007608	TG	3	6	10182	10187	0 %	50 %	50 %	0 %	82524679
14	NC_007608	TA	3	6	10584	10589	50 %	50 %	0 %	0 %	82524679
15	NC_007608	AT	3	6	10719	10724	50 %	50 %	0 %	0 %	82524679
16	NC_007608	AT	4	8	11277	11284	50 %	50 %	0 %	0 %	82524679
17	NC_007608	AT	3	6	12457	12462	50 %	50 %	0 %	0 %	82524680
18	NC_007608	AT	3	6	12532	12537	50 %	50 %	0 %	0 %	82524680
19	NC_007608	GC	3	6	13320	13325	0 %	0 %	50 %	50 %	82524681
20	NC_007608	TA	3	6	13696	13701	50 %	50 %	0 %	0 %	82524682
21	NC_007608	AT	3	6	13848	13853	50 %	50 %	0 %	0 %	82524682
22	NC_007608	AT	3	6	13980	13985	50 %	50 %	0 %	0 %	82524682
23	NC_007608	GT	3	6	14202	14207	0 %	50 %	50 %	0 %	82524682
24	NC_007608	TA	4	8	14215	14222	50 %	50 %	0 %	0 %	82524682
25	NC_007608	AC	3	6	17151	17156	50 %	0 %	0 %	50 %	82524686
26	NC_007608	TG	3	6	17709	17714	0 %	50 %	50 %	0 %	82524687
27	NC_007608	AT	3	6	21737	21742	50 %	50 %	0 %	0 %	82524694
28	NC_007608	AT	3	6	21745	21750	50 %	50 %	0 %	0 %	82524694
29	NC_007608	AG	3	6	22379	22384	50 %	0 %	50 %	0 %	82524695
30	NC_007608	AT	3	6	23459	23464	50 %	50 %	0 %	0 %	82524696
31	NC_007608	TC	4	8	26479	26486	0 %	50 %	0 %	50 %	82524699
32	NC_007608	CG	3	6	26708	26713	0 %	0 %	50 %	50 %	82524699
33	NC_007608	TC	3	6	26822	26827	0 %	50 %	0 %	50 %	82524699
34	NC_007608	AC	3	6	28067	28072	50 %	0 %	0 %	50 %	82524702
35	NC_007608	GT	3	6	29217	29222	0 %	50 %	50 %	0 %	82524704
36	NC_007608	CG	3	6	29994	29999	0 %	0 %	50 %	50 %	82524706
37	NC_007608	GT	3	6	30192	30197	0 %	50 %	50 %	0 %	82524706
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39	NC_007608	AG	3	6	31543	31548	50 %	0 %	50 %	0 %	82524707
40	NC_007608	AT	3	6	31694	31699	50 %	50 %	0 %	0 %	82524707
41	NC_007608	TA	3	6	38978	38983	50 %	50 %	0 %	0 %	82524715
42	NC_007608	CG	3	6	40025	40030	0 %	0 %	50 %	50 %	82524716
43	NC_007608	TG	3	6	40370	40375	0 %	50 %	50 %	0 %	82524717
44	NC_007608	TA	3	6	44707	44712	50 %	50 %	0 %	0 %	82524722
45	NC_007608	CA	3	6	45766	45771	50 %	0 %	0 %	50 %	82524723
46	NC_007608	AT	3	6	47291	47296	50 %	50 %	0 %	0 %	82524725
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48	NC_007608	TA	3	6	52273	52278	50 %	50 %	0 %	0 %	82524730
49	NC_007608	GT	3	6	52700	52705	0 %	50 %	50 %	0 %	82524730
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51	NC_007608	CA	3	6	54737	54742	50 %	0 %	0 %	50 %	82524732
52	NC_007608	GT	3	6	55096	55101	0 %	50 %	50 %	0 %	82524732
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61	NC_007608	CT	3	6	60237	60242	0 %	50 %	0 %	50 %	82524739
62	NC_007608	AT	3	6	61631	61636	50 %	50 %	0 %	0 %	82524740
63	NC_007608	TA	4	8	61891	61898	50 %	50 %	0 %	0 %	82524740
64	NC_007608	AT	3	6	62375	62380	50 %	50 %	0 %	0 %	82524740
65	NC_007608	AT	3	6	62715	62720	50 %	50 %	0 %	0 %	82524740
66	NC_007608	GA	3	6	62823	62828	50 %	0 %	50 %	0 %	82524740
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69	NC_007608	TG	3	6	64267	64272	0 %	50 %	50 %	0 %	82524742
70	NC_007608	CG	3	6	64334	64339	0 %	0 %	50 %	50 %	82524742
71	NC_007608	TG	3	6	65022	65027	0 %	50 %	50 %	0 %	82524744
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87	NC_007608	TG	3	6	72182	72187	0 %	50 %	50 %	0 %	82524750
88	NC_007608	CG	3	6	72249	72254	0 %	0 %	50 %	50 %	82524750
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104	NC_007608	TG	3	6	89269	89274	0 %	50 %	50 %	0 %	82524770
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106	NC_007608	AG	3	6	93065	93070	50 %	0 %	50 %	0 %	82524776
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108	NC_007608	TA	3	6	96911	96916	50 %	50 %	0 %	0 %	82524779
109	NC_007608	AT	3	6	98454	98459	50 %	50 %	0 %	0 %	82524781
110	NC_007608	GA	3	6	98561	98566	50 %	0 %	50 %	0 %	82524781
111	NC_007608	CA	3	6	100902	100907	50 %	0 %	0 %	50 %	82524783
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114	NC_007608	TC	3	6	102710	102715	0 %	50 %	0 %	50 %	82524786
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116	NC_007608	AG	3	6	104718	104723	50 %	0 %	50 %	0 %	82524789
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123	NC_007608	TG	3	6	109425	109430	0 %	50 %	50 %	0 %	82524791
124	NC_007608	AT	3	6	110180	110185	50 %	50 %	0 %	0 %	82524793
125	NC_007608	AC	3	6	111874	111879	50 %	0 %	0 %	50 %	82524796
126	NC_007608	GA	4	8	111937	111944	50 %	0 %	50 %	0 %	82524796
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128	NC_007608	CA	3	6	114277	114282	50 %	0 %	0 %	50 %	82524798
129	NC_007608	CA	3	6	114349	114354	50 %	0 %	0 %	50 %	82524798
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132	NC_007608	CA	3	6	114880	114885	50 %	0 %	0 %	50 %	82524799
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136	NC_007608	AT	3	6	117478	117483	50 %	50 %	0 %	0 %	82524801
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140	NC_007608	CA	3	6	118624	118629	50 %	0 %	0 %	50 %	82524802
141	NC_007608	GC	3	6	118847	118852	0 %	0 %	50 %	50 %	82524802
142	NC_007608	AT	3	6	121217	121222	50 %	50 %	0 %	0 %	82524805
143	NC_007608	TG	3	6	121810	121815	0 %	50 %	50 %	0 %	82524807
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151	NC_007608	AT	3	6	126281	126286	50 %	50 %	0 %	0 %	82524812

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.