MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Shigella dysenteriae Sd197 plasmid pSD1_197

Total Repeats: 2329

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007607	TGA	2	6	5	10	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007607	CCG	2	6	289	294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524409
3	NC_007607	TTC	2	6	297	302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524409
4	NC_007607	CAA	2	6	307	312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524409
5	NC_007607	AAT	2	6	602	607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524408
6	NC_007607	TTG	2	6	648	653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524408
7	NC_007607	TCA	2	6	680	685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524408
8	NC_007607	GAT	2	6	802	807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524408
9	NC_007607	TAT	2	6	836	841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007607	AAT	2	6	886	891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007607	AAG	2	6	972	977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007607	ATG	2	6	1013	1018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007607	ATA	2	6	1131	1136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007607	TCA	2	6	1152	1157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007607	AGC	2	6	1172	1177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007607	ATG	2	6	1216	1221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007607	ACA	2	6	1238	1243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524410
18	NC_007607	AGT	2	6	1355	1360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524410
19	NC_007607	ATG	3	9	1369	1377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524410
20	NC_007607	TGC	3	9	1388	1396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524410
21	NC_007607	TAA	2	6	1457	1462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524410
22	NC_007607	TCA	2	6	1496	1501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524410
23	NC_007607	CTG	2	6	1645	1650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524410
24	NC_007607	CTG	2	6	1843	1848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524410
25	NC_007607	AAG	2	6	1868	1873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524410
26	NC_007607	TAT	2	6	1892	1897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524410
27	NC_007607	TAA	2	6	1898	1903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524410
28	NC_007607	TAG	2	6	1975	1980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007607	ATC	2	6	2012	2017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007607	ATA	2	6	2018	2023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007607	CAT	2	6	2058	2063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007607	ATT	2	6	2075	2080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007607	TTA	2	6	2104	2109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007607	ATC	2	6	2212	2217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007607	TCT	2	6	2261	2266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524411
36	NC_007607	CAA	2	6	2337	2342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524411
37	NC_007607	CCG	2	6	2370	2375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524411
38	NC_007607	AGT	2	6	2393	2398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524411
39	NC_007607	TAC	2	6	2481	2486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524411
40	NC_007607	GTT	2	6	2561	2566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524411
41	NC_007607	TAC	2	6	2575	2580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524411
42	NC_007607	GTT	2	6	2880	2885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524411
43	NC_007607	ATA	2	6	2896	2901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524411
44	NC_007607	GAA	2	6	2946	2951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524411
45	NC_007607	AGG	2	6	3047	3052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007607	CAC	2	6	3065	3070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_007607	TTA	2	6	3128	3133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007607	TGC	2	6	3134	3139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007607	GAT	2	6	3150	3155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007607	CAC	2	6	3213	3218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_007607	ATT	2	6	3471	3476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007607	CAT	2	6	3533	3538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007607	TTG	2	6	3556	3561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007607	TGA	2	6	3667	3672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007607	TCC	2	6	3733	3738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_007607	ATT	2	6	3915	3920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007607	TAA	3	9	3965	3973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007607	GAA	2	6	3997	4002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007607	TAT	2	6	4020	4025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007607	ATG	2	6	4080	4085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007607	GCT	2	6	4169	4174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_007607	AGA	3	9	4240	4248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007607	TTG	2	6	4286	4291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007607	TGA	2	6	4683	4688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524412
65	NC_007607	ACT	2	6	4809	4814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524412
66	NC_007607	CGA	2	6	4854	4859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524412
67	NC_007607	CTA	2	6	5052	5057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524412
68	NC_007607	CAA	2	6	5090	5095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007607	ATT	2	6	5103	5108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007607	TAT	2	6	5224	5229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007607	TGT	2	6	5253	5258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007607	CCT	2	6	5296	5301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_007607	ATT	2	6	5314	5319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007607	TAT	2	6	5327	5332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007607	CAT	2	6	5425	5430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007607	AAT	2	6	5441	5446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007607	AAT	2	6	5463	5468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007607	CAA	2	6	5479	5484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_007607	TAG	2	6	5511	5516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524413
80	NC_007607	AAC	2	6	5562	5567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524413
81	NC_007607	GTT	2	6	5669	5674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524413
82	NC_007607	GCT	2	6	5694	5699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524413
83	NC_007607	GCT	2	6	5711	5716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524413
84	NC_007607	CAC	3	9	5747	5755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82524413
85	NC_007607	TCC	2	6	5896	5901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_007607	CCG	2	6	5937	5942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_007607	CAG	2	6	6097	6102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524414
88	NC_007607	GCC	2	6	6249	6254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524414
89	NC_007607	TCA	2	6	6314	6319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524414
90	NC_007607	TAA	2	6	6359	6364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524414
91	NC_007607	TTG	2	6	6412	6417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007607	GCG	2	6	6592	6597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524415
93	NC_007607	ATT	2	6	6733	6738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524415
94	NC_007607	GGA	3	9	6952	6960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007607	GAC	2	6	6974	6979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_007607	CTC	2	6	7013	7018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_007607	CAA	2	6	7028	7033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_007607	GCC	2	6	7040	7045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_007607	ACC	2	6	7091	7096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_007607	GAT	2	6	7135	7140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007607	CGA	2	6	7167	7172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_007607	GAA	2	6	7223	7228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007607	ATC	2	6	7258	7263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_007607	GGT	2	6	7330	7335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007607	TTG	2	6	7371	7376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007607	TCT	2	6	7474	7479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524416
107	NC_007607	TAT	2	6	7526	7531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524416
108	NC_007607	TAC	2	6	7568	7573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524416
109	NC_007607	TTA	2	6	7602	7607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524416
110	NC_007607	ATA	2	6	7747	7752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524416
111	NC_007607	AAC	2	6	7845	7850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524416
112	NC_007607	AAT	2	6	7866	7871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524416
113	NC_007607	ACT	2	6	7886	7891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524416
114	NC_007607	TTA	2	6	7902	7907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524416
115	NC_007607	GCA	2	6	8124	8129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524416
116	NC_007607	AAT	2	6	8192	8197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524416
117	NC_007607	ATA	2	6	8323	8328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524416
118	NC_007607	TTC	2	6	8340	8345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524416
119	NC_007607	ATC	2	6	8483	8488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524416
120	NC_007607	AAC	2	6	8588	8593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524416
121	NC_007607	TGG	2	6	8643	8648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524416
122	NC_007607	TAA	2	6	8716	8721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524416
123	NC_007607	AAG	2	6	8828	8833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524416
124	NC_007607	ATA	2	6	9027	9032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524416
125	NC_007607	TAT	2	6	9049	9054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524416
126	NC_007607	AGA	2	6	9134	9139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524416
127	NC_007607	CCT	2	6	9192	9197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_007607	AGG	2	6	9202	9207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007607	GAT	2	6	9257	9262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007607	CAG	2	6	9442	9447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007607	TGC	2	6	9633	9638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986650
132	NC_007607	CCG	2	6	9734	9739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986650
133	NC_007607	TTC	2	6	9742	9747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161986650
134	NC_007607	GAC	2	6	9832	9837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986650
135	NC_007607	GCG	2	6	9855	9860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986650
136	NC_007607	GCC	2	6	9906	9911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986650
137	NC_007607	CAG	2	6	9946	9951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986650
138	NC_007607	CAG	2	6	9991	9996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986650
139	NC_007607	CAG	2	6	10079	10084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986650
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267	NC_007607	ATG	2	6	19429	19434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524429
268	NC_007607	CAT	2	6	19453	19458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524429
269	NC_007607	AAT	2	6	19498	19503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524429
270	NC_007607	ATT	2	6	19522	19527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524429
271	NC_007607	GTT	2	6	19545	19550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524429
272	NC_007607	TAC	2	6	19660	19665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_007607	CAT	2	6	19822	19827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_007607	GAC	2	6	19924	19929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_007607	TTG	2	6	20118	20123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524430
276	NC_007607	GTT	2	6	20178	20183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524430
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278	NC_007607	CAT	2	6	20441	20446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_007607	CAT	2	6	20559	20564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_007607	ATA	2	6	20621	20626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_007607	TAA	2	6	20679	20684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524431
282	NC_007607	ATC	2	6	20775	20780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524431
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284	NC_007607	GGT	2	6	20880	20885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524431
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288	NC_007607	TGT	2	6	21114	21119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524431
289	NC_007607	TGA	2	6	21226	21231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524431
290	NC_007607	TTG	2	6	21330	21335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
291	NC_007607	AAC	2	6	21572	21577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_007607	GCT	2	6	21647	21652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_007607	GTA	2	6	21712	21717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
294	NC_007607	TGC	2	6	21895	21900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524432
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299	NC_007607	GCG	2	6	22197	22202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524433
300	NC_007607	CAG	2	6	22222	22227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524433
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391	NC_007607	CCG	2	6	29361	29366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
392	NC_007607	GCT	2	6	29429	29434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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395	NC_007607	GTA	2	6	29663	29668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524440
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399	NC_007607	TTC	2	6	29979	29984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524440
400	NC_007607	TTG	2	6	29989	29994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524440
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499	NC_007607	AAG	2	6	39139	39144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
500	NC_007607	AAC	2	6	39150	39155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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